DNA gyrases are enzymes that control the topology of DNA in bacteria cells. This is a vital function for bacteria. For this reason, DNA gyrases are targeted by widely used antibiotics such as quinolones. Recently, structural and biochemical investigations identified a new class of DNA gyrase inhibitors called NBTIs (i.e., novel bacterial topoisomerase inhibitors). NBTIs are particularly promising because they are active against multi-drug resistant bacteria, an alarming clinical issue. Structural data recently demonstrated that these NBTIs bind tightly to a newly identified pocket at the dimer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In response to UV irradiation, translesion DNA synthesis (TLS) utilizes specialized DNA polymerases to bypass replication-blocking lesions. In a well-established polymerase switch model, Polη is thought to be a preferred TLS polymerase to insert correct nucleotides across from the thymine dimer, and Rev1 plays a scaffold role through physical interaction with Polη and the Rev7 subunit of Polζ for continual DNA synthesis. Defective Polη causes a variant form of xeroderma pigmentosum (XPV), a disease with predisposition to sunlight-induced skin cancer. Previous studies revealed that expression o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytosol estradiol receptor from MTW9-D (ovarian dependent) and MTW9-MtT (ovarian independent) rat mammary tumors were fractionated by chromatofocusing, a procedure which separates proteins on an ion-exchange column as a function of isoelectric point. Receptor from MTW9-D usually fractionated as three peaks with mean pH at peak height of 7.5, 6.8, and 6.0. The intermediate peak at pH 6.8 was present in 90% of MTW9-D tumors examined but in only 20% of MTW9-MtT tumors. Treatment of cytosols with 20 mM sodium molybdate or 50 mM leupeptin did not change the chromatofocusing profiles. The pI 6.8 fra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Covalently closed circular DNA (cccDNA) is a stable episomal form of the hepatitis B virus (HBV) genome that serves as the template for viral transcription and replication and represents a major barrier to HBV cure. Here, we investigated chromatin accessibility patterns of cccDNA in HBV-infected hepatocyte cells at single-molecule resolution. We found that most cccDNA copies exhibited limited accessibility around nucleotides 800-1000, a region overlapping the polymerase open reading frame and the pregenomic RNA transcriptional region. Notably, a small subset of cccDNA showed detectable accessi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the most fundamental internal causes for many genetic diseases. However, the location information on SNPs in a specific DNA sequence is not well acquired through current SNPs detection methods, except for accurate DNA sequencing. Here we report a fluorescence enhancement phenomenon in the process of two silver nanoclusters (AgNCs) approaching closely to form a nanocluster dimer (NCD). The fluorescence intensity is sensitive to the distance between two AgNCs; therefore, the NCD lights into different fluorescence intensities upon binding SNPs targets wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biofilms are a preferred mode of survival for many microorganisms including Vibrio cholerae, the causative agent of the severe secretory diarrhoeal disease cholera. The ability of the facultative human pathogen V. cholerae to form biofilms is a key factor for persistence in aquatic ecosystems and biofilms act as a source for new outbreaks. Thus, a better understanding of biofilm formation and transmission of V. cholerae is an important target to control the disease. So far the Vibrio exopolysaccharide was the only known constituent of the biofilm matrix. In this study we identify and character
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria-causing parasites proliferate within erythrocytes through schizogony, forming multinucleated stages before cellularization. Nuclear multiplication does not follow a strict geometric 2n progression, and each proliferative cycle produces a variable number of progeny. Here, by tracking nuclei and DNA replication, we show that individual nuclei replicate their DNA at different times, despite residing in a shared cytoplasm. Extrapolating from experimental data using mathematical modeling, we provide strong indication that a limiting factor exists, which slows down the nuclear multiplication
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small molecule double-stranded DNA intercalators have significant potential for therapeutic applications. However, screening for and confirming a drug candidate's intercalative behavior remains labor-intensive and costly. To address this, we investigated the sequence and biophysical parameters that affect the performance of electrochemical DNA hairpin sensors for streamlined identification of structural intercalators. These sensors utilize oligonucleotide (oligo) sequences that form hairpins upon intercalator binding. The 3' end of the oligo is modified with alkylthiol linkers for gold electro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work concerns an analysis of the binding mechanism of a copper phthalocyanine (Alcian Blue-tetrakis(methylpyridinium) chloride, ABTP) to natural calf thymus DNA, G-quadruplexes (G4) and synthetic RNA polynucleotides in the form of double polyriboadenylic·polyribouridylic acid (poly(A)·poly(U)) or triple strands polyriboadenylic·2polyribouridylic acid (poly(A)·2poly(U)). ABTP is a well know dye that might undergo novel applications, but its interaction with DNA is scarcely studied and we lack information on possible RNA or G4 binding. This might be related to system complexity due to the p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene duplication with sub- and/or neo-functionalization is a key pathway in plant adaptive evolution. The duplication-degeneration-complementation (DDC) model explains sub-functionalization of paralogs, yet the relative contributions of coding sequence versus cis-regulatory changes remain contested. In this study, we show that a single amino acid substitution (Met30/Ile30) in the WRC domain drives sub-functionalization of poplar paralogs PagGRF29 and PagGRF10, demonstrating a key role for coding changes. Met30 confers high DNA-binding capacity and represents the ancestral state, whereas Ile30
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expansion of CAG and CTG (CWG) triplet repeats causes several inherited neurological diseases. The CWG repeat diseases are thought to involve complex pathogenic mechanisms through expanded CWG repeat-derived RNAs in a noncoding region and polypeptides in a coding region, respectively. However, an effective therapeutic approach has not been established for the CWG repeat diseases. Here, we show that a CWG repeat DNA-targeting compound, cyclic pyrrole-imidazole polyamide (CWG-cPIP), suppressed the pathogenesis of coding and noncoding CWG repeat diseases. CWG-cPIP bound to the hairpin form of mis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene vectors for oral delivery encounter harsh conditions throughout the gastrointestinal tract, and the continuous peristaltic activity can quickly remove the vectors, leading to inefficient intestinal permeation. Therefore, vectors have demanding property requirements, such as stability under various pH and, more importantly, efficient uptake in different intestinal segments. In this study, a functional polymer, cholesterol-grafted poly(β-amino ester) (poly[hexamethylene diacrylate-β-(5-amino-1-pentanol)] (CH-PHP)), is synthesized and electrostatically interacted with plasmid DNA to form a C
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strong evidence supports the idea that specific metabolites of estrogens, mainly catechol estrogen-3,4-quinones, can react with DNA to become endogenous initiators of breast, prostate, and other human cancers. Oxidation of the catechol estrogen metabolites 4-hydroxyestradiol (4-OHE2) and 2-OHE2 leads to the quinones, estradiol-3,4-quinone (E2-3,4-Q) and estradiol-2,3-quinone (E2-2,3-Q), respectively. The reaction of E2-3,4-Q with DNA affords predominantly the depurinating adducts 4-OHE2-1-N3Ade and 4-OHE2-1-N7Gua, whereas the reaction of E2-2,3-Q with DNA yields the newly synthesized depurinat
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precision modulation of mitochondrial function has emerged as a novel strategy in the field of cancer therapy. Herein, we proposed a DNA logic circuit-equipped redox imbalance amplifier that can enable precise mitochondrial disruption and efficient cancer therapy. This proposed redox imbalance amplifier consisting of metal phenolic-network (MPN)-coated metal-organic framework, hydrogen peroxide (H2O2)-supplier vitamin k3 (Vk3), and DNA logic circuit. The protective MPN shell of this nanoamplifier can be specifically disintegrated by tumor microenvironments to release Cu2+, Fe3+, and Vk3 and cy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic changes have been described in trauma patients in the form of histone acetylation events, but whether DNA-methylation occurs remains unknown. We hypothesized that the combination of hemorrhage and saline resuscitation would alter DNA-methylation and associated proteomic profiles in the rat lung.
METHODS: Ten rats were subjected to a pressure-controlled hemorrhage and resuscitation model consisting of hemorrhage to a mean arterial pressure (MAP) of 35mmHg for 90 minutes, followed by saline resuscitation to a MAP >70mmHg for 90 minutes (n=5) or sham (only anesthesia and c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: More than 50% of patients with synovitis involving 1-4 joints remain classified as having undifferentiated oligoarthritis (UOA) after 1 year of disease. The clinical presentation is often similar to that of reactive arthritis (ReA) and other spondylarthropathies or to Lyme arthritis. We therefore determined how often Chlamydia trachomatis (Ct) and Borrelia burgdorferi (Bb) can be identified in patients with UOA, by using an extensive laboratory approach.
METHODS: We prospectively studied 52 patients with UOA who presented at an early synovitis clinic in a region highly endemic for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinalizarin, an analogue of anthracycline anticancer agents, is an anticancer agent itself. A CuII complex was prepared and characterized by elemental analysis, UV-Vis & IR spectroscopy, mass spectrometry, EPR and DFT. The intention behind the preparation of the complex was to increase cellular uptake, compare its binding with DNA against that of quinalizarin, modulation of semiquinone formation, realization of human DNA topoisomerase I & human DNA topoisomerase II inhibition and observation of anticancer activity. While the first two attributes of complex formation lead to increased efficacy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new double photosystems-based 'Z-scheme' photoelectrochemical (PEC) sensing platform is designed for ultrasensitive detection of prostate-specific antigen (PSA) by coupling with a three-dimensional (3D) DNA walker. Two photosystems consist of CdS quantum dots (photosystem I; PS I) and BiVO4 photoactive materials (photosystem II; PS II), whereas gold nanoparticles (AuNPs) photodeposited on high-active {010} facets of BiVO4 are used as the electron mediators to promote electron transfer from conduction band of PS II to valence band of PS I. 3D DNA walker-based amplification strategy is carried
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure of humans to toxic compounds occurs mostly in the form of complex mixtures. Leachates, consisting of mixtures of many chemicals, are a potential risk to human health. In the present study, leachates of solid wastes from a polyfiber factory (PFL), an aeronautical plant (AEL), and a municipal sludge leachate (MSL) were assessed for their ability to induce DNA damage in human peripheral blood lymphocytes using the alkaline Comet assay. The leachates also were examined for their physical and chemical properties. Lymphocytes were incubated with 0.5-15.0% concentrations (pH range 7.1-7.4) o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ciprofloxacin (CFX) is a broad-spectrum antibiotic belonging to the fluoroquinolone class, widely used to treat bacterial infections by inhibiting bacterial DNA replication. Ferroptosis, a form of regulated cell death, is characterized by lipid peroxidation on cellular and organelle membranes. Our previous studies demonstrated that CFX inhibits erastin-induced ferroptosis by enhancing glutathione peroxidase 4 protein stability. In contrast, we report here a distinct role of CFX in potentiating RSL3-induced ferroptosis in various cancer cells. Mechanistically, CFX inhibits topoisomerase 2β, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования