BACKGROUND: Marfan syndrome (MFS) is a rare autosomal dominantly inherited connective tissue disorder with an estimated prevalence of 1:5,000. More than 1000 variants have been previously reported to be associated with MFS. However, the disease-causing effect of these variants may be questionable as many of the original studies used low number of controls. To study whether there are possible false-positive variants associated with MFS, four in silico prediction tools (SIFT, Polyphen-2, Grantham score, and conservation across species) were used to predict the pathogenicity of these variant.
RE
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Molecular diagnosis of the distal spinal muscular atrophies or distal hereditary motor neuropathies remains challenging because of clinical and genetic heterogeneity. Next generation sequencing offers potential for identifying de novo mutations of causative genes in isolated cases.
PATIENT DESCRIPTION: We present a 3.6-year-old girl with congenital scoliosis, equinovarus, and L5/S1 left hemivertebra who demonstrated delayed walking and lower extremities atrophy. She was negative for SMN1 deletion testing, and parents show no sign of disease.
RESULTS: Whole exome sequencing of the…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using exome sequencing we identify a homozygous splice site mutation in the PIGN gene in a foetus with multiple congenital anomalies including bilateral diaphragmatic hernia, cardiovascular anomalies, segmental renal dysplasia, facial dysmorphism, cleft palate, and oligodactyly. This finding expands the phenotypic spectrum associated with homozygous loss of function mutations in PIGN, and adds further support for defective GPI anchor biosynthesis as a cause of developmental abnormalities. We demonstrate that exome sequencing is a valuable approach for the identification of a genetic cause in s…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Due to high genetic heterogeneity, to exclude known mutations and map novel mutations in autosomal dominant congenital cataract (ADCC) using conventional candidate gene screening requires laborious laboratory work. We attempted to use a cost-effective exome sequencing strategy to identify disease-causing mutations in an ADCC pedigree.
METHODS: An ADCC pedigree affected by nuclear cataract and 200 unrelated senile cataract controls were recruited and given comprehensive ophthalmic examination. Whole exome of the proband of the family was captured by the Illumina TruSeq Exome Enrichmen…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-onset Alzheimer's disease (EOAD) represents 1%-2% of the Alzheimer's disease (AD) cases, and it is generally characterized by a positive family history and a rapidly progressive symptomatology. Rare coding and fully penetrant variants in amyloid precursor protein (APP), presenilin 1 (PSEN1), and presenilin 2 (PSEN2) are the only causative mutations reported for autosomal dominant AD. Thus, in this study we used exome sequencing data to rapidly screen rare coding variability in APP, PSEN1, and PSEN2, in a British cohort composed of 47 unrelated EOAD cases and 179 elderly controls, neuropa…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genetic complexity of infantile cardiomyopathies is remarkable, and the importance of mitochondrial translation defects as a causative factor is only starting to be recognised. We investigated the genetic basis for infantile onset recessive hypertrophic cardiomyopathy in two siblings.
METHODS AND RESULTS: Analysis of respiratory chain enzymes revealed a combined deficiency of complexes I and IV in the heart and skeletal muscle. Exome sequencing uncovered a homozygous mutation (L156R) in MRPL44 of both siblings. MRPL44 encodes a protein in the large subunit of the mitochondrial…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exome sequencing offers an efficient and affordable method to interrogate genetic factors involved in human disease. Performing exome sequencing of monozygotic twins discordant for VACTERL (Vertebral anomalies, Anal atresia, Cardiac malformations, Tracheo-Esophageal fistula, Renal anomalies, and Limb abnormalities) association-type congenital malformations was hypothesized to potentially reveal discordant variants that could demonstrate disease cause(s). After demonstrating monozygosity, we applied high-density microarrays and exome sequencing to 2 twin pairs in which 1 twin had features of VA…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibromyalgia syndrome (FMS) is a chronic musculoskeletal pain disorder affecting 2% to 5% of the general population. Both genetic and environmental factors may be involved. To ascertain in an unbiased manner which genes play a role in the disorder, we performed complete exome sequencing on a subset of FMS patients. Out of 150 nuclear families (trios) DNA from 19 probands was subjected to complete exome sequencing. Since >80,000 SNPs were found per proband, the data were further filtered, including analysis of those with stop codons, a rare frequency (<2.5%) in the 1000 Genomes database, and pr…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial diseases comprise a diverse set of clinical disorders that affect multiple organ systems with varying severity and age of onset. Due to their clinical and genetic heterogeneity, these diseases are difficult to diagnose. We have developed a targeted exome sequencing approach to improve our ability to properly diagnose mitochondrial diseases and apply it here to an individual patient. Our method targets mitochondrial DNA (mtDNA) and the exons of 1,600 nuclear genes involved in mitochondrial biology or Mendelian disorders with multi-system phenotypes, thereby allowing fo…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital stationary night blindness (CSNB) is a clinically and genetically heterogeneous retinal disorder. Two forms can be distinguished … , and the dysfunction of four genes (NYX, GRM6, TRPM1, and GPR179) has been described so far. Whole-exome sequencing in one simplex cCSNB case lacking mutations in the known genes led to the identification of a missense mutation (c.983G>A [p.Cys328Tyr]) and a nonsense mutation (c.1318C>T [p.Arg440(∗)]) in LRIT3, encoding leucine-rich-repeat (LRR), immun …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Familial dyskinesia with facial myokymia (FDFM) is an autosomal dominant disorder that is exacerbated by anxiety. In a 5-generation family of German ancestry, we previously mapped FDFM to chromosome band 3p21-3q21. The 72.5-Mb linkage region was too large for traditional positional mutation identification.
OBJECTIVE: To identify the gene responsible for FDFM by exome resequencing of a single affected individual.
PARTICIPANTS: We performed whole exome sequencing in 1 affected individual and used a series of bioinformatic filters, including functional significance and presence in d…
Клинический случайСтатьяResearch Support, American Recovery and Reinvestment ActПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hearing loss is one of the most common sensory disorders caused by genetic and environmental factors. Autosomal recessive non-syndromic hearing loss (ARNSHL) is extremely heterogeneous, with over 100 genes known to be involved. Hearing loss can result from mutations in the LOXHD1 gene, which codes a highly conserved protein known as lipoxygenase and is located at 18q21.1. Despite the association between LOXHD1 mutations and ARNSHL, there are still few documented cases.
METHODS: We examined a case of non-syndromic hearing loss in an Iranian family with a history of consanguinity an
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary bronchiectasis comprises a group of rare monogenic disorders, with cystic fibrosis (CF) and primary ciliary dyskinesia (PCD) representing the major subtypes. Exome sequencing (ES) remains a central modality for molecular diagnosis; however, it leaves more than half of clinically suspected cases unresolved, largely because it cannot reliably detect copy number variations, deep intronic variants, pseudogene-associated variants, and frequent identification of variants of uncertain significance (VUS). This case series describes five hereditary bronchiectasis cases with initial ES-negati…
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital heart disease is among the most prevalent birth defects. This study aims to evaluate the clinical utility of chromosome microarray analysis (CMA) and whole-exome sequencing (WES) in prenatal diagnosis of genetic disorders in fetuses with cardiac ultrasound abnormalities.
METHODS: A retrospective cohort study analyzed 469 cases exhibiting fetal cardiac anomalies identified through prenatal ultrasound from November 2022 to July 2024. The study retrospectively assessed the patients' clinical features, observations, and pregnancy outcomes.
RESULTS: Out of the 469 cases mee…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Autism spectrum disorder (ASD) is a clinically and genetically heterogeneous neurodevelopmental condition. Whole‑exome sequencing (WES) is a pivotal diagnostic tool, though its yield varies across populations. This study aimed to determine the diagnostic yield and characterize the genetic spectrum identified by WES in a pediatric ASD cohort from Saudi Arabia.
METHODS: We conducted a retrospective cohort study of 288 children (< 14 years) with DSM‑5‑confirmed ASD who underwent clinical WES at a tertiary center between 2021 and 2024. Variants were classified according to ACMG/AMP guide…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a rare genetic disorder affecting approximately 1:15,000 to 1:30,000 individuals. It is characterized by upper and lower respiratory diseases, otitis media, congenital heart defects, situs inversus, infertility in males, and hydrocephalus. Whole-exome sequencing (WES) has become an important tool for identifying novel pathogenic variants associated with PCD.
METHODS: Trio-based WES was performed in two Turkish siblings with clinically suspected PCD born to healthy consanguineous parents. Candidate variants were validated by Sanger sequencing a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is the most common endocrinopathy and is both phenotypically and genotypically heterogeneous. A large number of genetic variants have been found in different genes, so far. Based on the literature, we identified 7 genes and aimed to find new causative variants in these genes. We created a targeted PCOS panel including major genes in the steroidogenezis, WNT, MAPK, and TGFβ pathways and analyzed whole-exome sequencing results. We compared the minor allele frequency (MAF) values of different variants with our results and calculated deleterious scores of newly fou…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the application of whole exome sequencing (WES) in the prenatal diagnosis of isolated fetal growth restriction (FGR) with a normal result by chromosomal microarray analysis (CMA).
METHODS: This retrospective study included singleton fetuses with isolated FGR in Guangdong Women and Children Hospital between July 2018 and August 2023. All fetuses were subjected to invasive prenatal testing with CMA and WES. Only cases with negative CMA results were included.
RESULTS: r A total of 135 fetuses were included. Ultrasonography identified short long bones in 39 fetuses and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Joubert syndrome (JS) is a rare autosomal recessive genetic disease characterized by molar tooth sign, hypotonia during infancy, developmental delay, and/or intellectual disability. Over 40 genes have been associated with the syndrome, and population-specific founder variants have been defined.
METHODS: In our study, we evaluated 34 patients with clinical, radiological, and laboratory findings. Whole exome sequencing (WES) analysis was performed on all patients to explain the underlying genetic causes. Optical genome mapping (OGM) was performed to elucidate the genetic mechanism i…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: KBG syndrome is a rare, autosomal dominant neurodevelopmental disorder characterized by developmental delay, macrodontia, distinc … erited 3p26 duplication, which did not fully account for the patient's clinical presentation. Whole exome sequencing (WES) was subsequently performed and identified a pathogenic frameshift mutation in ANKRD11, confirming a diagnosis of KBG syndrome. Additional genetic variants were found in CDH23, potentially explaining the patient's profound hearing lo …
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.