Late onset Alzheimer's disease (LOAD) is a progressive neurodegenerative disease with four well-established risk factors: age, APOE4 genotype, female chromosomal sex, and maternal history of AD. Each risk factor impacts multiple systems, making LOAD a complex systems biology challenge. To investigate interactions between LOAD risk factors, we performed multiple scale analyses, including metabolomics, transcriptomics, brain magnetic resonance imaging (MRI), and beta-amyloid assessment, in 16 months old male and female mice with humanized human APOE3 (hAPOE3) or APOE4 (hAPOE4) genes. Metabolomic…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In metabolomics studies, biological data are highly complex, requiring robust computational tools to detect biological variation in the organism under investigation. Despite this, comparative studies of data processing software for GC-MS data are scarce. This work evaluated the performance of two open-source software programs, XCMS and MS-DIAL, on three datasets: cells, serum, and tissue, acquired by GC-MS.
RESULTS: Software performance was assessed based on the quality of the raw data matrix, the number of extracted features, the presence of missing values, and the number of anno…
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vestibular migraine (VM) is an underrecognized disorder characterized by episodic vertigo, often accompanied by headache. Despite its substantial prevalence and disease burden, its metabolic features remain poorly characterized, and serum biomarkers for diagnosis or activity assessment are lacking. We performed untargeted metabolomics in discovery (33 VM vs 30 healthy controls [HCs]) and replication (37 VM vs 27 HCs) cohorts, applying machine learning solely in the discovery cohort for marker selection. In the discovery cohort, 510 metabolites exhibited differential abundance (197 upregulated,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Public repositories now accumulate an unprecedented amount of metabolomics data. Despite the opportunities for large-scale meta-analyses opened by these repositories, the deposited data rarely becomes systematically re-analyzed. We conducted a systematic metadata-based re-analysis of all human blood metabolomics studies in the Metabolomics Workbench performed using Orbitrap or QTOF mass spectrometry, encompassing 44 165 samples. After harmonizing metabolites with PubChem identifiers and embedding them using SMILES representations, we generated a map of 6752 blood metabolites forming 25 structu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Post-stroke dementia is a severe long-term stroke complication with heavy medical burdens, and early risk identification is critical. This study explored the association of muscle quality index (MQI) and plasma metabolomics with dementia among stroke survivors.
METHODS: This study included 7,047 UK Biobank participants with a history of stroke who were free of dementia at the baseline assessment. MQI was defined as dominant handgrip strength (HGS) divided by corresponding arm fat-free mass. Plasma metabolomics was analyzed via high-throughput nuclear magnetic resonance (NMR). Metab…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epilepsy is a neurological disorder with heterogeneous anti-seizure medication responses and a lack of peripheral biomarkers for diagnosis and drug resistance assessment. This study aims to explore metabolic alterations and candidate metabolite panels associated with epilepsy and anti-seizure medication responsiveness.
METHODS: Untargeted metabolomic analysis was performed on plasma samples from 42 patients with epilepsy (PWE), including 20 patients with drug-resistant epilepsy (DRE) and 22 patients with drug-sensitive epilepsy (DSE), as well as 20 healthy controls (HCs). Multivar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Calcific aortic valve stenosis (CAVS) is the most prevalent valvular heart disease in the elderly, yet no pharmacological therap … with severe CAVS and matched controls without aortic valve disease were enrolled. Untargeted serum metabolomics was performed to characterize metabolic profiles. Differential metabolites, pathway enrichment analysis, and machine-learning-based feature prioritization were conducted. Based on pathway-level metabolic annotation, biological evidence, and feasibil …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
[This corrects the article DOI: 10.3389/fonc.2026.1855583.].
Опубликованное исправлениеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elucidating the effects of pollutants at the level of primary single cells is of great significance for an in-depth understanding of their health risks and toxicological mechanisms. N,N'-bis (1,4-dimethylpentyl)-p-phenylenediamine quinone (77PDQ) is an emerging environmental contaminant with multiple biological toxicities; however, its toxic effects at the primary single-cell level remain unexplored. In this study, we established a high-throughput single-cell metabolomics platform based on label-free CyESI-MS and applied it to the analysis of freshly isolated primary mouse liver cells for toxi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyperuricemia, characterized by elevated serum uric acid (SUA) levels, is increasingly recognized as a significant contributor to cardiometa … ther, multi-omics approaches that integrate genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics, along with expression quantitative trait locus (eQTL) mapping, causal modeling, network biology, and AI analysis, now provide powerful tools for biomarker discovery and mechanistic interpretation. This review summarizes current insights into uric a …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Arachidonic Acid (AA)-NMDA Receptor Axis describes a crucial neurochemical pathway where glutamate activation of NMDA receptors releases AA. AA binds directly to NMDA receptor subunits, increasing their open probability and also affecting other receptors and cellular processes, linking neuronal activity to lipid signalling.
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lack of universal cross-species sampling and quality control methods has limited the potential of breath metabolomics to advance from clinical discovery to mechanistic validation. To address this challenge, this study developed and systematically validated an integrated cross-species breath analysis platform, with its core components comprising a high-sensitivity mouse breath sampling system (FaunaScope) and a quality control (QC) strategy incorporating behavioral monitoring. By identifying ethyl acetate and dimethyl sulfide as characteristic interference markers, the platform exhibited hi…
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Gliomas exhibit an inherent metabolic reprogramming driven by the tumor heterogeneity and bioenergetic requirements. The resulting perturbations in systemic circulation can be captured through serum metabolomics, while tissue metabolomics can help decode the tumor-intrinsic changes. Integrating these two can reveal co-ordinated changes, potentially aiding biomarker discovery. Our pilot study aims to investigate the metabolic alterations in gliomas by combining and correlating serum and tissue metabolomics in a North Indian cohort.
METHOD: Serum (n = 50) samples from human glioma pati…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry imaging (MSI)-based spatial metabolomics exhibits extensive missing values; yet, practical guidance on how imputation choices affect both imputation accuracy and downstream spatial analyses remains limited. In this study, we evaluated eight imputation methods, including both existing approaches and a graph convolutional network (GCN)-based method specifically designed for spatial metabolomics data, to identify suitable approaches for spatial metabolomics. To enable comprehensive assessment, we developed an evaluation framework focusing on two objective criteria: (a) imputatio…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is currently one of the most prominent and global chronic conditions. Cognitive decline is one of the major complications of T2DM, but its precise molecular mechanism remains unclear. Metabolomics and proteomics were combined in this study to investigate alterations in metabolites and proteins in the hippocampus of T2DM rats. KEGG Markup Language (KGML) network analysis was conducted to integrate underlying relationships among differentially expressed metabolites and proteins. 58 significantly differentially expressed metabolites and 61 differentially expressed …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serum metabolomic profiling in Parkinson's disease (PD) remains underexplored. This study characterized alterations in serum amino acid and neurotransmitter levels in PD using targeted metabolomics and identified associated dysregulated metabolic pathways. A validated ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry (UPLC-MS/MS) method was employed to quantify 23 amino acids and 3 neurotransmitters in PD patients and controls. Logistic regression models assessed the relationship between motor phenotype and metabolomic profiles. An OPLS-DA model incorporating variable impor…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To characterize tear metabolomic differences between active blepharokeratoconjunctivitis (BKC) and herpes simplex keratitis (HSK; epithelial type) and identify diagnostic biomarkers.
METHODS: Tear samples were collected from 24 HSK patients, 19 BKC patients, and 15 healthy controls from October 2020 to 2021. Diagnoses were confirmed by clinical manifestations, medical history, and nested PCR (nPCR). Metabolomic profiling was performed via LC-MS/MS, and data were analyzed using MetaboAnalyst 5.0.
RESULTS: Compared to healthy controls, HSK exhibited 21 altered metabolites, while BKC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Feeding intolerance (FI) is one of the most common clinical issues in preterm infants, and there are currently no internationa … he gut microbiota, along with metabolites including Arg-Pro, Glu-Arg and lactaldehyde identified in metabolomics, can serve as diagnostic criteria for feeding tolerance in preterm infants. Klebsiella shows a certain degree of diagnostic efficacy but falls into the category of 'low accuracy', requiring comprehensive evaluation considering the research backgroun …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Crohn's disease (CD) is a chronic inflammatory condition that affects the gastrointestinal tract. Currently, the diagnosis of CD is predominantly dependent on endoscopic procedures and histopathological tissue analysis. Endoscopy is an invasive procedure, patient compliance is poor, and the results are subject to the operator's subjective judgment. Infliximab (IFX) and ustekinumab (UST) are two new biologics used for the treatment of CD, which are effective in reducing inflammatory markers. However, the correlation between blood metabolites and inflammatory markers has rarely been
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke is a leading cause of death and disability, yet effective pharmacological interventions remain limited. Ginsenoside Rb1, a principal bioactive compound of Panax ginseng, has demonstrated neuroprotective activity, but its metabolic mechanisms remain incompletely defined. Here, we combined lipid metabolomics with matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) to investigate the spatially resolved metabolic effects of Rb1 in a rat model of cerebral ischemia/reperfusion injury. Rb1 treatment significantly reduced infarct volume and improved neurol…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования