In eukaryotic RNA, N6-methyladenosine (m6A) is a prevalent form of methylation modification. The m6A modification process is reversible and dynamic, written by m6A methyltransferase complex, erased by m6A demethylase, and recognized by m6A binding proteins. Through mediating RNA stability, decay, alternative splicing, and translation processes, m6A modification regulates gene expression at the post-transcriptional level. Erythropoiesis is the process of hematopoietic stem cells undergoing proliferation, a series of differentiation and maturation to form red blood cells (RBCs). Thalassemia is a
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the molecular mechanisms underlying frontotemporal dementia (FTD) is essential for the development of successful therapies. Systematic studies on human post-mortem brain tissue of patients with genetic subtypes of FTD are currently lacking. The Risk and Modyfing Factors of Frontotemporal Dementia (RiMod-FTD) consortium therefore has generated a multi-omics dataset for genetic subtypes of FTD to identify common and distinct molecular mechanisms disturbed in disease. Here, we present multi-omics datasets generated from the frontal lobe of post-mortem human brain tissue from patient
DatasetСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hibernation consists of alternating torpor-arousal phases, during which animals cope with repetitive hypothermia and ischaemia-reperfusion. Due to limited transcriptomic and methylomic information for facultative hibernators, we here conducted RNA and whole-genome bisulfide sequencing in liver of hibernating Syrian hamster (Mesocricetus auratus). Gene ontology analysis was performed on 844 differentially expressed genes and confirmed the shift in metabolic fuel utilization, inhibition of RNA transcription and cell cycle regulation as found in seasonal hibernators. Additionally, we showed a so
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mechanisms of implantation such as determination of the attachment pole, fetal-maternal communication, and underlying causes of implantation failure are largely unexplored. Here, we performed single-cell RNA sequencing on peri-implantation embryos from both humans and mice to explore trophectoderm (TE) development and embryo-endometrium cross-talk. We found that the transcriptomes of polar and mural TE diverged after embryos hatched from the zona pellucida in both species, with polar TE being more mature than mural TE. The implantation poles show similarities in cell cycle activities, as well
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylation, the most common chemical modification of cellular components such as DNA, RNA, and proteins, impacts biological processes including transcription, RNA processing, and protein dynamics. Although abnormal expression of methyltransferase can lead to various diseases including cancers, little is known about the relationship between methyltransferase and cancers. Here we aimed to understand the role of methyltransferase in cancer metastasis. We found that elevated methyltransferase-like 9 (METTL9) is closely associated with the acquisition of metastatic activity in human scirrhous gast
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cockayne syndrome (CS) is a devastating autosomal recessive genetic disorder, mainly characterized by photosensitivity, growth failure, neurological abnormalities, and premature aging. Mutations in CSB (ERCC6) are associated with almost all clinical phenotypes resembling classic CS. Using RNA-seq approach in multiple cell types, we identified Necdin (NDN) as a target of the CSB protein. Supportive of the RNA-seq results, CSB directly binds to NDN and manipulates the remodeling of active histone marks and DNA 5mC methylation on the regulatory elements of the NDN gene. Intriguingly, hyperactivat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formaldehyde (FA) is a highly reactive substance that is ubiquitous in the environment and is usually considered as a pollutant. In the human body, FA is a product of various metabolic pathways and participates in one-carbon cycle, which provides carbon for the synthesis and modification of bio-compounds, such as DNA, RNA, and amino acids. Endogenous FA plays a role in epigenetic regulation, especially in the methylation and demethylation of DNA, histones, and RNA. Recently, epigenetic alterations associated with FA dysmetabolism have been considered as one of the important features in age-rel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic variation is considered to affect the N6 -methyladenosine (m6A) RNA transcript modification, which is the most prevalent posttranscriptional messenger RNA modification. This study aimed to identify m6A-associated single-nucleotide polymorphisms (m6A-SNPs) that may affect m6A methylation from numerous periodontitis (PD) SNPs. We identified an abundance of m6A-SNPs by analyzing raw data of published PD genome-wide association studies and m6A-SNPs list from the m6AVar database. Other evidence was found in public databases for expression quantitative trait loci (eQTL) and differential gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed transcriptomes (n = 211), whole exomes (n = 99) and targeted exomes (n = 103) from 216 malignant pleural mesothelioma (MPM) tumors. Using RNA-seq data, we identified four distinct molecular subtypes: sarcomatoid, epithelioid, biphasic-epithelioid (biphasic-E) and biphasic-sarcomatoid (biphasic-S). Through exome analysis, we found BAP1, NF2, TP53, SETD2, DDX3X, ULK2, RYR2, CFAP45, SETDB1 and DDX51 to be significantly mutated (q-score ≥ 0.8) in MPMs. We identified recurrent mutations in several genes, including SF3B1 (∼2%; 4/216) and TRAF7 (∼2%; 5/216). SF3B1-mutant samples showed a
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neural stem cell (NSC) state and fate depend on spatially and temporally synchronized transcriptional and epigenetic regulation of the expression of extrinsic signaling factors and intrinsic cell-specific genes, but the functional roles for chromatin-modifying enzymes in neural differentiation remain poorly understood. Here we show that the histone demethylases KDM4A (JMJD2A) and KDM4C (JMJD2C) are essential for proper differentiation of NSCs in vitro and in vivo. KDM4A/C were required for neuronal differentiation, survival and expression of the neurotrophic signaling factor BDNF in associatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upon gene activation, we found that RNA polymerase II transcription machinery assembles sequentially with the nucleotide excision repair (NER) factors at the promoter. This recruitment occurs in absence of exogenous genotoxic attack, is sensitive to transcription inhibitors, and depends on the XPC protein. The presence of these repair proteins at the promoter of activated genes is necessary in order to achieve optimal DNA demethylation and histone posttranslational modifications (H3K4/H3K9 methylation, H3K9/14 acetylation) and thus efficient RNA synthesis. Deficiencies in some NER factors impe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertension is a leading global cause of cardiovascular, renal, and cerebrovascular morbidity. Beyond classical genetic and environmental determinants, accumulating evidence highlights epigenetic regulation as a key contributor to blood pressure control and vascular pathology. Epigenetic mechanisms, including DNA methylation, histone post-translational modifications, and non-coding RNAs, govern gene expression without altering the underlying DNA sequence, thereby linking environmental and physiological stimuli to stable transcriptional changes. Aberrant epigenetic signatures have been identif
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alterations in biological rhythms are a common feature of aging, and disruption of circadian rhythms can exacerbate age-associated pathologies. The retina is critical for detecting light for both vision and for transmitting time-of-day information to the brain, synchronizing rhythms throughout the body. Disruption of circadian rhythms by manipulating the molecular clock leads to premature retinal degeneration in flies and mice, and gene expression rhythms are disrupted in models of age-associated ocular disease. Despite this, it is unknown how or why the gene expression rhythms of the retina c
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic manipulations have the potential to improve traits in farmed fish. To explore this opportunity in the gilthead seabream (Sparus aurata), the catalytic domains of five DNA methyltransferases (DNMTs) were predicted by homology modeling, and their interaction with the inhibitor 5-aza-2'-deoxycytidine (DAC) was assessed by docking, revealing that the inhibitor can bind all DNMTs with similar energy. Then, pituitary and liver explants from gilthead seabream were exposed to DAC for 24 h, and changes in genome-wide DNA methylation (RRBS) and gene expression (RNA-seq) were assessed. In the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing evidence has highlighted the significant role of histone modifications in pathogenesis of systemic lupus erythematosus (SLE). However, few studies have comprehensively analyzed trimethylation of histone H3 lysine 4 (H3K4me3) features at specific immune gene loci in SLE patients.
METHODS: We conducted H3K4me3 chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) on CD4+ T cells from SLE patients and healthy controls (HC). Differential H3K4me3 peaks were identified, followed by enrichment analysis. We integrated online RNA-seq and DNA methylation datasets to explore the rel
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Degeneration of intervertebral discs is considered one of the most important causes of low back pain and disability. The intervertebral disc (IVD) is characterized by its susceptibility to various stressors that accelerate the senescence and apoptosis of nucleus pulposus cells, resulting in the loss of these cells and dysfunction of the intervertebral disc. Therefore, how to reduce the loss of nucleus pulposus cells under stress environment is the main problem in treating intervertebral disc degeneration. Autophagy is a kind of programmed cell death, which can provide energy by recycling subst
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a lethal malignancy. Differentiation from chronic pancreatitis (CP) is currently inaccurate in about one-third of cases. Misdiagnoses in both directions, however, have severe consequences for patients. We set out to identify molecular markers for a clear distinction between PDAC and CP.
DESIGN: Genome-wide variations of DNA-methylation, messenger RNA and microRNA level as well as combinations thereof were analysed in 345 tissue samples for marker identification. To improve diagnostic performance, we established a random-forest machine-lear
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: More than 75% of ovarian cancer patients are diagnosed at advanced stages and die of tumor cell metastasis. This study aimed to identify new epigenetic and transcriptomic alterations associated with ovarian cancer metastasis.
METHODS: Two cell sublines with low- and high-metastasis potentials were derived from the ovarian cancer cell line A2780. Genome-wide DNA methylome and transcriptome profiling were carried out in these two sublines by Reduced Representation Bisulfite Sequencing and RNA-seq technologies. Cell-based assays were conducted to support the clinical findings.
RESULT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Review of the clinicopathologic and genetic features of early ependymal tumor with MN1-BEND2 fusion (EET MN1-BEND2), classical astroblastomas, and recently described related pediatric CNS tumors. I also briefly review general mechanisms of gene expression silencing by DNA methylation and chromatin remodeling, and genomic DNA methylation profiling as a powerful new tool for CNS tumor classification.
METHODS: Literature review and illustration of tumor histopathologic features and prenatal gene expression timelines.
RESULTS: Astroblastoma, originally descried by Bailey and Cushing in
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Household air pollution caused by inefficient cooking practices causes 4 million deaths a year worldwide. In Nepal, 86% of the rural population use solid fuels for cooking. Over 25% of premature deaths associated with air pollution are respiratory in nature. Here we aimed to identify molecular signatures of different cookstove and fuel type exposures in human airway epithelial cells, to understand the mechanisms mediating cook stove smoke induced lung disease. Primary human airway epithelial cells in submerged culture were exposed to traditional cook stove (TCS), improved cook stove (ICS) and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования