Deuteration of cellulose is one of the most attractive approaches for clarifying its crystal structure, dissolving behavior in ionic liquids, and hydrogen bonding systems. However, current deuteration methods for cellulose have critical disadvantages in terms of the cost and efficiency of deuteration, large-scale production, and selectivity of the deuteration positions. Therefore, in this study, we aimed to produce deuterated bacterial cellulose (D-BC) using Komagaeibacter xylinum in culture media containing D2O as the only source of deuterium. In addition, the physical properties of the D-BC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acidic methine-containing compounds are prone to racemization driven by keto-enol tautomerization, which can lead to products with distinct pharmacological and toxicological properties. Glutarimide, a core structural component of cereblon binders, and thiazolidinediones, a class of antidiabetic agents, are particularly susceptible to this instability. In this study, we developed an H/D exchange method to investigate the racemization or epimerization kinetics of 28 compounds, including 3 thiazolidinediones, as well as 13 molecular glues and 12 proteolysis targeting chimeras (PROTACs), both cont
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hydrogen/deuterium (H/D) exchange rate is an optimal measure for studying the structures and dynamics of hydrogen bonding systems, as it reflects the molecular contact environment and the strength of the hydrogen bonds. A method for rapid measurement of the H/D exchange reaction rates is required to examine the intermolecular environments of molecules in solutions. We developed a droplet collision atmospheric pressure infrared laser ablation mass spectrometry technique for this purpose. We obtained the H/D exchange reaction rate of cytochrome c in a methanol/H2O·D2O solution. We revealed t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid fibrils are common in many diseases. Here, we present a protocol that uses α-synuclein fibrils, a Parkinson's disease hallmark, to demonstrate hydrogen-deuterium exchange (HDX) mass spectrometry (HDX-MS) for amyloid protein structural analysis. We describe steps for fibril preparation, quality assessment, HDX labeling, digestion, and mass spectrometry. We then detail procedures for peptide mapping and data interpretation. This protocol serves as a practical guide for new and experienced researchers to study insoluble protein aggregates with distinct conformations. For complete details
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrogen/Deuterium eXchange (HDX) methods for studying protein dynamics would benefit from millisecond-scale incubations to probe intrinsically disordered proteins, highly dynamic regions, and conformation changes. Here, we investigate droplet microfluidics for rapid mixing to trigger D2O labeling, uniform incubations, and rapid droplet merging for acid quenching in advance of mass spectrometry. A surfactant-free merging approach combining expansion elements for synchronized droplet collision proved robust. The high diffusive flux of D2O and protons enables microsecond mixing to trigger and ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deuteration at C-4 and C-5 of sphingosine was achieved via a hydrogen-deuterium exchange reaction of a β-ketophosphonate intermediate catalyzed by ND₄Cl in D₂O/tetrahydrofuran. To install deuterium at C-3 of sphingosine and sphingomyelin, sodium borodeuteride reduction/cerium(III) chloride reduction of an α,β-enone in perdeuteromethanol was used.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe an investigation using structural mass spectrometry (MS) of the impact of two antibodies, 15497 and 15498, binding the highly flexible SARS-CoV-2 Nsp1 protein. We determined the epitopes and paratopes involved in the antibody-protein interactions by using hydrogen-deuterium exchange MS (HDX-MS). Notably, the Fab (Fragment antigen binding) for antibody 15498 captured a high energy form of the antigen exhibiting significant conformational changes that added flexibility over most of the Nsp1 protein. The Fab for antibody 15497, however, showed usual antigen binding behavior, revealing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The equilibrium isotope effects (EIEs) in the capsule complex (12 + p-xylene + CCl4) were computed with two simple models that mimic two types of contacts, -CH3.Ar and -CH3.CCl4. By using the MP2/6-311++G(d,p) method, the calculated equilibrium constants are consistent with the reported experimental data. Harmonic frequency analyses indicate that vibrational frequency changes caused by nonbonding attractions lead to the observed EIE.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Chemical fixatives such as formalin form cross-links between proteins and affect the relaxation times and diffusion properties of tissue. These fixation-induced changes likely also affect myelin density measurements produced by quantitative magnetization transfer and myelin water imaging. In this work, we evaluate these myelin-sensitive MRI methods for fixation-induced biases.
METHODS: We perform quantitative magnetization transfer, myelin water imaging, and deuterium oxide-exchanged zero TE imaging on unfixed human spinal cord tissue at 9.4 Tesla and repeat these measurements after
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human neurodegenerative conditions such as Parkinson's and Alzheimer's disease are characterized by the formation and deposition of toxic protein species which exacerbate neuronal dysfunction, impacting the structure and function of the healthy brain. Deciphering the mechanisms underlying protein (mis)folding and aggregation is not only essential for a more coherent view of neurodegeneration, but also crucial for the development of novel therapeutics targeting this family of disorders. Key pathological drivers of neurodegeneration, such as alpha-synuclein and tau proteins, have traditionally p
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell receptor (TCR)-based therapeutics recognize specific peptides presented by human leukocyte antigens (HLAs) on antigen-presenting cells. The docking orientation of TCRs to peptide-HLA (pHLA) complexes is critical for T-cell activation as it underpins signaling and downstream immune responses. Traditionally, TCR binding geometries with pHLAs have been resolved through X-ray crystallography. Here, we demonstrate that conventional peptide-level hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) workflows can identify productive TCR engagement with their cognate pHLAs. By quantifying dif
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In-depth research into the precise evaluation of enzymatic digestion efficiency and the selection of a suitable deuterium-labelled internal standard remains a gap in the accurate determination of β2-agonists in animal-derived food by isotope dilution-liquid chromatography/tandem mass spectrometry (ID-LC-MS/MS). In this study, the enzymatic digestion conditions were optimized by monitoring the presence of β2-agonist conjugates in positive samples, which proved to be reliable for ensuring complete enzymatic digestion. Comparative analysis of deuterium-labelled internal standards for salbutamol (
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Stable isotope-labeled compounds are indispensable internal standards for reliable liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) analysis, but their preparation frequently requires multistep synthesis. Base-catalyzed hydrogen-deuterium exchange at carbon centers provides a simple alternative for generating stable isotopologues. Beyond quantitative applications, carbon-bound deuterium may serve as a mechanistic probe for investigating gas-phase fragmentation and chemically induced molecular transformations. In this work, tadalafil and omeprazole were selected as complementary model
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stable isotope-labeled internal standards (SIL-IS) are the gold standard for liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) quantification in complex biological matrices. Their application can be limited by synthetic complexity, high cost, and the lack of commercially available labeled standards for many bioactive analytes. Here, we establish and evaluate an internal-standard strategy based on hydrogen-deuterium exchange (HDX)-derived deuterated isotopologue mixtures. Using Pd/C, Pt/C, and AlCl₃ catalytic systems, deuterated isotopologue mixtures (d₁-dₙ) of eight structurally divers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) has emerged as the method of choice for characterizing increasingly complex protein assemblies. However, deuterium back-exchange remains a major limitation, as it requires rapid analysis to preserve deuterium labeling and ensure data accuracy. Reducing the temperature during the HDX-MS workflow has been recognized as an effective way to enhance deuterium retention. While sub-zero liquid chromatography (LC) has been successfully implemented, protein digestion at sub-zero temperatures has never been investigated. In this stu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix-assisted laser desorption/ionization-based hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (MALDI-HDX-MS) can provide peptide-level information on protein conformational dynamics without any specialized liquid chromatography (LC)-HDX instrumentation. Accurate interpretation of structure-dependent deuterium incorporation and reproducible MALDI-HDX measurements require minimization of unintended exchange and spectral variability during MALDI sample preparation and acquisition. Appropriate control of matrix crystallization, humidity, and spectral acquisition timing is therefore essential for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrogen-deuterium exchange coupled with mass spectrometry (HDX-MS) is widely used for monoclonal antibody (mAb) epitope mapping, which aids in the development of therapeutic mAbs and vaccines, as well as enables the understanding of viral immune evasion. Numerous mAbs are known to recognize N-glycosylated epitopes and to bind in close proximity to an N-glycan site; however, glycosylated protein sites are typically obscured from HDX detection as a result of the inherent heterogeneity of glycans. To overcome this limitation, we covalently immobilized the glycosidase PNGase Dj on a solid resin a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The processes of H(3)O(+) production from alcohols (ethanol, 2-propanol, 1-propanol, 2-butanol) and ethers (diethyl ether and ethyl methyl ether), and their deuterium-substituted species, by intense laser fields (800 nm, 100 fs, approximately 1 x 10(14) W/cm) were investigated through time-of-flight (TOF) mass spectrometry. H(3)O(+) formation was observed for all these compounds except for ethyl methyl ether. From the analysis of TOF signals of H((3-n))D(n)O(+) (n = 0, 1, 2, and 3) that have expanding tails with increasing flight time, it has been confirmed that the reaction proceeds through m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen-antibody interactions play a key role in the immune response post vaccination and the mechanism of action of antibody-based biopharmaceuticals. 4CMenB is a multicomponent vaccine against Neisseria meningitidis serogroup B in which factor H binding protein (fHbp) is one of the key antigens. In this study, we use hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) to identify epitopes in fHbp recognized by polyclonal antibodies (pAb) from two human donors (HDs) vaccinated with 4CMenB. Our HDX-MS data reveal several epitopes recognized by the complex mixture of human pAb. Furthermore,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deuterium-enriched amino acids occur in the Murchison carbonaceous chondrite. Synthesis from D-enriched interstellar precursors by Strecker reactions during aqueous alteration of the parent body has been proposed. To test this hypothesis, we have measured the retention of deuterium in amino acids produced from HCN, NH3, and formaldehyde-D2, acetaldehyde-D4, and acetone-D6 in H2O. The isotopic label is 50% to 98% retained, with variations in retentivity depending on the amino acid and the reaction conditions. If amino acids, once formed on the parent body by the Strecker synthesis, lose no deut
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования