Atypical porcine pestivirus (APPV) can cause congenital tremor type A-II in neonatal piglets, posing a significant threat to swine herd health globally. Our previous study demonstrated that the Mut domains, comprising 112 amino acids at the N-terminus, are the primary functional regions of the E2 protein of APPV. This study identified 14 host cellular proteins that exhibit potential interactions with the Mut domains of the E2 protein using yeast two-hybrid screening. Using bioinformatics analysis, we discovered that the Mut domains of the E2 protein might exert regulatory effects on apoptosis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent research has highlighted the presence of Toll/Interleukin 1 receptor (TIR)-domain proteins (Tdps) in a range of bacteria, suggested to form interactions with the human adaptor protein MyD88 and inhibit intracellular signaling from Toll-like receptors (TLRs). A Tdp has been identified in Yersinia pestis (YpTdp), a highly pathogenic bacterium responsible for plague. Expression of a number of YpTIR constructs of differing lengths (YpTIR1, S130-A285; YpTIR2, I137-I273; YpTIR3, I137-246; YpTIR4, D107-S281) as fusions with an N-terminal GB1 tag (the B1 immunoglobulin domain of Streptococcal p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep neural networks have improved many difficult prediction tasks in biology, but it remains challenging to interpret these networks and learn the molecular mechanisms. Here, we address interpretation challenges by building biophysical neural networks for predicting activation domains, the regions within transcription factors (TFs) that recruit coactivators to drive gene expression. Deep neural networks can now accurately predict acidic activation domains from protein sequences, but these predictors are difficult to interpret. We designed shallow neural networks that incorporated biophysical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline Coronaviruses (FCoVs) commonly cause mild enteric infections in felines worldwide (termed Feline Enteric Coronavirus [FECV]), with around 12% developing into deadly Feline Infectious Peritonitis (FIP; Feline Infectious Peritonitis Virus [FIPV]). Genomic differences between FECV and FIPV have been reported, yet the putative genotypic basis of the highly pathogenic phenotype remains unclear. Here, we used state-of-the-art molecular evolutionary genetic statistical techniques to identify and compare differences in natural selection pressure between FECV and FIPV sequences, as well as to id
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline coronaviruses (FCoVs) commonly cause mild enteric infections in felines worldwide (termed feline enteric coronavirus [FECV]), with around 12 per cent developing into deadly feline infectious peritonitis (FIP; feline infectious peritonitis virus [FIPV]). Genomic differences between FECV and FIPV have been reported, yet the putative genotypic basis of the highly pathogenic phenotype remains unclear. Here, we used state-of-the-art molecular evolutionary genetic statistical techniques to identify and compare differences in natural selection pressure between FECV and FIPV sequences, as well
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The metalloprotease ADAM17 (a disintegrin and metalloprotease 17) regulates EGF-receptor and TNFα signaling, thereby not only protecting the skin and intestinal barrier, but also contributing to autoimmunity. ADAM17 can be rapidly activated by many stimuli through its transmembrane domain (TMD), with the seven membrane-spanning inactive Rhomboids (iRhom) 1 and 2 implicated as candidate regulatory partners. However, several alternative models of ADAM17 regulation exist that do not involve the iRhoms, such as regulation through disulfide bond exchange or through interaction with charged phosphol
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FH22 has been previously identified as a calcium-binding protein from the common liver fluke, Fasciola hepatica. It is part of a family of at least four proteins in this organism which combine an EF-hand containing N-terminal domain with a C-terminal dynein light chain-like domain. Here we report further biochemical properties of FH22, which we propose should be renamed FhCaBP1 for consistency with other family members. Molecular modelling predicted that the two domains are linked by a flexible region and that the second EF-hand in the N-terminal domain is most likely the calcium ion binding s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TBX5 is the gene mutated in Holt-Oram syndrome, an autosomal dominant disorder with complex heart and limb deformities. Its protein product is a member of the T-box family of transcription factors and an evolutionarily conserved dosage-sensitive regulator of heart and limb development. Understanding TBX5 regulation is therefore of paramount importance. Here we uncover the existence of novel exons and provide evidence that TBX5 activity may be extensively regulated through alternative splicing to produce protein isoforms with differing N- and C-terminal domains. These isoforms are also present
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ERCC1-XPF is a heterodimeric, structure-specific endonuclease that cleaves single-stranded/double-stranded DNA junctions and has roles in nucleotide excision repair (NER), interstrand crosslink (ICL) repair, homologous recombination, and possibly other pathways. In NER, ERCC1-XPF is recruited to DNA lesions by interaction with XPA and incises the DNA 5' to the lesion. We studied the role of the four C-terminal DNA binding domains in mediating NER activity and cleavage of model substrates. We found that mutations in the helix-hairpin-helix domain of ERCC1 and the nuclease domain of XPF abolishe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nesprins [also known as SYNEs (synaptic nuclear envelope proteins)] are a family of type II transmembrane proteins implicated in the tethering of membrane-bound organelles and in the genetic aetiology of cerebellar ataxia and Emery-Dreifuss muscular dystrophy. They are characterized by a common structure of an SR (spectrin repeat) rod domain and a C-terminal transmembrane KLS (klarsicht)/KASH [klarsicht/ANC-1 (anchorage 1)/SYNE homology] domain which interacts with SUN [Sad1p/UNC (uncoordinated)-84] proteins in the nuclear envelope; most nesprins also have N-terminal actin-binding CH (calp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusion of members of the Paramyxoviridae family involves two glycoproteins: the attachment protein and the fusion protein. Changes in the fusion-protein conformation were caused by binding of the attachment protein to the cellular receptor. In the membrane-fusion process, two highly conserved heptad-repeat (HR) regions, HR1 and HR2, are believed to form a stable six-helix coiled-coil bundle. However, no crystal structure has yet been determined for this state in the mumps virus (MuV, a member of the Paramyxoviridae family). In this study, a single-chain protein consisting of two HR regions con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural studies of the calmodulin-dependent protein kinase I have shown how the calmodulin-binding domain and autoinhibitory domain interact with the active sites of the enzyme. In this work, we have studied the interaction in solution of two synthetic short and long (22- and 37-residue) peptides representing the binding and autoinhibitory domains of CaMKI with Ca2+-CaM using CD, NMR, and EPR spectroscopy. Both peptides adopt alpha-helical structure when bound to Ca2+-CaM, as detected by CD spectroscopy. Cadmium-113 NMR showed that both peptides induced cooperativity in metal ion binding be
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuronal Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) and the actin-related protein 2/3 (Arp2/3) complex have emerged as critical host proteins that regulate pathogen actin-based motility. Actin tail formation and motility in Listeria monocytogenes require the Arp2/3 complex but bypasses N-WASP signaling. Motility of Shigella flexneri and vaccinia virus requires both N-WASP and the Arp2/3 complex. Functional roles for these cytoskeletal regulatory proteins in actin-based motility of Rickettsia rickettsii have not been established. In this study, functional domains of N-WASP tagged with green fluo
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type VII collagen is the major component of anchoring fibrils, attachment structures necessary for stable association of the dermal-epidermal basement membrane to the underlying dermis. The critical role of the anchoring fibrils in providing integrity to the cutaneous basement membrane zone is attested to by demonstration of mutations in the type VII collagen gene (COL7A1) in patients with dystrophic epidermolysis bullosa. To gain insight into the evolutionary conservation of the type VII collagen gene, in this study we have cloned the entire mouse type VII collagen cDNA and elucidated the int
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The activated c-myc allele in Burkitt's lymphoma tumor cells is associated with a clustering of somatic mutations within intron I near the exon I boundary. We have identified several discrete protein binding sites within this region of c-myc intron I designated as myc intron factor-1 (MIF-1), MIF-2, and MIF-3. In addition to our previous characterization of a 20-nucleotide binding site for MIF-1, we now have identified adjacent 20-nucleotide and 34-nucleotide binding sites for MIF-2 and MIF-3, respectively. All three elements are protected from exonuclease digestion by nuclear protein extracts
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we show that E1, an ankyrin-related, potentially protective, neuronal protein of the human filarial nematode Onchocerca volvulus contains a death domain (DD), most similar to that of human Mort1/FADD (39% identity). In addition, sequence comparison of E1 to its homologue from Litomosoides sigmodontis and to Caenorhabditis elegans ankyrin defines two further putative functional domains. One represents the end of the spectrin-binding domain of ankyrins, the other an unique domain, most highly conserved between these nematodes, containing a calpain sequence motif. Thus, E1 may be involved in
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periplakin was first identified as a precursor of the cornified cell envelope, residing in desmosomes and in interdesmosomal plasma membrane of differentiated keratinocytes in epidermis. However, most antibodies used so far have been raised against the C-terminal peptide of periplakin, the region which is heavily involved in protein-protein interactions. In order to avoid the lack of signal due to the epitope masking, other regions of periplakin were selected as antigens. Indeed, periplakin is present throughout the epidermis, but while the head domain is accessible for the antibody recognitio
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reversible tyrosine phosphorylation of proteins is one of the major regulatory physiological events in response to cell-cell- and cell-matrix contact in Metazoa. Previously it was documented that the tyrosine phosphorylating enzymes, the tyrosine kinases (TKs), are autapomorphic characters of Metazoa, including sponges. In this paper the tyrosine dephosphorylating enzymes, the protein-tyrosine phosphatases (PTPs), are studied which can be grouped into two subfamilies, the soluble PTPs and the receptor PTPs (RPTPs). PTPs are characterized by one PTPase domain which interestingly comprises seque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptospirosis is a neglected zoonosis of ubiquitous distribution. Symptoms are often non-specific and may range from flu-like symptoms to multi-organ failure. Diagnosis can only be made by specific diagnostic tests like serology and PCR. In non-endemic countries, leptospirosis is often not suspected before antibiotic treatment has been initiated and consequently, relevant samples for diagnostic PCR are difficult to obtain. Blood cultures are obtained from most hospitalized patients before antibiotic therapy and incubated for at least five days, thus providing an important source of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The two cytoskeletal proteins VASP and WASP and the protein Homer share a conserved domain, currently designated the WHI domain (WASP homology domain 1) or EVH1 domain (ENA/VASP homology domain 1), which could play an important role in various cellular events such as transport, folding of proteins, and signal transduction. We report here additional occurrences of this domain in Ran-binding proteins of the RanBP1 family and various others proteins, or putative proteins of eukaryotic organisms, suggesting that the EVH1/WH1 domain may be more widely used than originally thought.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.