Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite current advances, Japanese Encephalitis Virus (JEV) still poses a considerable risk because effective antiviral drugs are lacking. The RdRp protein is the main component of viral genome replication and therefore a primary target for antiviral drug development. In this study, we applied a drug discovery protocol with multiple parameters to identify RdRp inhibitors. Using a pharmacophore model, ligand-based screening of the ADMET-like Screening Compound Library, which had more than 448,000 molecules, was carried out, and 102,496 hits were generated. The three-level docking cascade, namel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviral infections, particularly Dengue and Zika, continue to rise at an alarming rate, with both viruses declared global health emergencies in 2024 and 2016, respectively. The NS5 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of dengue virus (DENV) and Zika virus (ZIKV) is highly conserved, making nucleoside-based RdRp inhibitors a promising strategy for antiviral development. While nucleoside analogs have shown strong clinical potential, challenges such as cell permeability, the efficiency of triphosphate conversion, degradation, and mitochondrial toxicity remain. Advances in sugar ring modification
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Since the outbreak of COVID-19 in December 2019, it developed into a pandemic affecting all the countries and millions of people around the globe. Until now, there is no medicine available to contain the spread of the virus. As an aid to drug discovery, the molecular docking and molecular dynamic tools were applied extensively. In silico studies made it possible for rapid screening of potential molecules as possible inhibitors/drugs against the targeted proteins. As a continuation of our drug discovery research, we have carried out molecular docking studies of our 12 reported unnatura
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) is one of the crucial enzymes in severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) catalysing the replication of RNA, therefore acts as a potential target for antiviral drug design. The fixation of a ligand in the active site of RdRp may alter the SARS-CoV-2 life cycle. Present work aimed at identifying novel inhibitors of the SARS-CoV-2 RdRp enzyme by performing pharmacophore-based virtual screening, molecular docking and molecular dynamics simulation (MDS). Initially, the pharmacophore model of SARS-CoV-2 RdRp was constructed and the resulti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rabies virus (RABV) is a non-segmented, negative single-stranded RNA virus which causes acute infection of the central nervous system in humans. Once symptoms appear, the result is nearly always death, and to date, post-exposure prophylaxis (PEP) is the only treatment applicable only immediately after an exposure. Previous studies have identified viral RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) as a potential drug target due to its significant role in viral replication and transcription. Herein we generated an energy-minimized homology model of RABIES-RdRp and used it for virtual screening agains
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SARS-cov-2 RNA dependent RNA polymerase (nsp12) is a crucial viral enzyme that catalyzes the replication of RNA from RNA templates. The fixation of some ligands in the active site may alter the viral life cycle. The aim of the present study is to identify the conservation level of nsp12 motifs (A-G), using consurf server, and discover their interactions with rifabutin, rifampicin, rifapentin, sorangicin A, streptolydigin, myxopyronin B, VXR and VRX using AutoDockTools-1.5.6, Gromacs 2018.2 and g-mmpbsa. Thus, the most of amino acids residues located in nsp12 protein Motifs (A-G) were predi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of bottlenecks in the transmission cycle of many RNA viruses leads to a severe reduction of number of virus particles and this occurs multiple times throughout the viral transmission cycle. Viral replication is then necessary for regeneration of a diverse mutant swarm. It is now understood that any perturbation of the mutation frequency either by increasing or decreasing the accumulation of mutations in an RNA virus results in attenuation of the virus. To determine if altering the rate at which a virus accumulates mutations decreases the probability of a successful virus infection
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication of the hepatitis C viral genome is catalyzed by the NS5B (nonstructural protein 5B) RNA-dependent RNA polymerase, which is a major target of antiviral drugs currently in the clinic. Prior studies established that initiation of RNA replication could be facilitated by starting with a dinucleotide (pGG). Here we establish conditions for efficient initiation from GTP to form the dinucleotide and subsequent intermediates leading to highly processive elongation, and we examined the effects of four classes of nonnucleoside inhibitors on each step of the reaction. We show that palm site in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BMS-986094, a 2'-C-methylguanosine prodrug that was in development for treatment of chronic hepatitis C infection was withdrawn from Phase 2 clinical trials because of unexpected cardiac and renal adverse events. Investigative nonclinical studies were conducted to extend the understanding of these findings using more comprehensive endpoints. BMS-986094 was given orally to female CD-1 mice (25 and 150 mg/kg/d) for 2 weeks (53/group) and to cynomolgus monkeys (15 and 30 mg/kg/d) for up to 6 weeks (2-3/sex/group for cardiovascular safety, and 5/sex/group for toxicology). Endpoints included toxico
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline infectious peritonitis virus (FIPV) causes a fatal disease in cats that remains challenging to treat due to the absence of effective vaccines and limited antiviral therapies. Given its central role in viral replication and transcription, RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) represents a highly promising and strategic target for antiviral drug development. To enable live-cell monitoring of RdRp activity without external substrates or cell disruption, we developed a biologically validated, cell-based dual-fluorescent reporter assay using green fluorescent protein and red fluorescent protei
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of highly contagious SARS-CoV-2 variants emphasizes the need for antiviral drugs that can adapt to evolving viral mutations. Despite widespread vaccination efforts, novel variants and recurrence cases raise concerns about COVID-19. Although repurposed drugs like Remdesivir, a nucleoside inhibitor, offer treatment, there is still a critical need for alternative drugs. Inhibiting viral RdRp function remains a key strategy. Structural analysis highlights the importance of pyrrolo-triazine and pyrimidine scaffolds in nucleoside inhibitors. Our study designed Peptide Nucleic Acid (PNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA dependent RNA polymerase (RdRp) in SARS-CoV-2 is a highly conserved enzyme responsible for viral genome replication/transcription. To understand how the viral RdRp achieves fidelity control during such processes, here we computationally investigate the natural non-cognate vs. cognate nucleotide addition and selectivity during viral RdRp elongation. We focus on the nucleotide substrate initial binding (RdRp active site open) to the prechemical insertion (active site closed) of the RdRp. The current studies were first carried out using microsecond ensemble equilibrium all-atom molecular
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: Mucormycosis has been associated with SARS-CoV-2 infections during the last year. The aim of this study was to triple-hit viral and fungal RNA-dependent RNA polymerases (RdRps) and human inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH). Materials & methods: Molecular docking and molecular dynamics simulation were used to test nucleotide inhibitors (NIs) against the RdRps of SARS-CoV-2 and Rhizopus oryzae RdRp. These same inhibitors targeted IMPDH. Results: Four NIs revealed a comparable binding affinity to the two drugs, remdesivir and sofosbuvir. Binding energies were calculated using the mos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the ongoing pandemic, providing treatment consisting of effective, low-cost oral antiviral drugs at an early stage of SARS-CoV-2 infection has been a priority for controlling COVID-19. Although Paxlovid and molnupiravir have received emergency approval from the FDA, some side effect concerns have emerged, and the possible oral agents are still limited, resulting in optimized drug development becoming an urgent requirement. An oral remdesivir derivative, VV116, has been reported to have promising antiviral effects against SARS-CoV-2 and positive therapeutic outcomes in clinical trials. H
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis (JE), a neurological infection of severe nature, is caused by the Japanese encephalitis virus (JEV) and is transmitted by the mosquito vector. The polymerase domain of Non-structural 5 (NS5), which is also referred to as RdRp (RNA-dependent RNA polymerase), is considered a potential therapeutic target for JEV. The present study employed molecular dynamics modelling and high-throughput virtual screening to evaluate the possible antiviral activity of anti-dengue drugs against JEV RdRp. Furthermore, a ranking was performed utilising the MM/GBSA analysis to identify the three
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue is an arboviral disease caused by the dengue flavivirus. The NS5 protein of flaviviruses is a potential therapeutic target, and comprises an RNA-dependent RNA polymerase (RDRP) domain that catalyses viral replication. The aim of this study was to repurpose FDA-approved drugs against the RDRP domain of dengue virus serotype 3 (DENV3) using structure-based virtual screening and molecular dynamics (MD) simulations. The FDA-approved drugs were screened against the RDRP domain of DENV3 using a two-step docking-based screening approach with Glide SP and Glide XP. For comparison, four reported
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA-dependent RNA polymerase was purified from Rickettsia prowazekii, an obligate intracellular bacterial parasite. Because of limitation of available rickettsiae, the classical methods for isolation of the enzyme from other procaryotes were modified to purify RNA polymerase from small quantities of cells (25 mg of protein). The subunit composition of the rickettsial RNA polymerase was typical of a eubacterial RNA polymerase. R. prowazekii had beta' (148,000 daltons), beta (142,000 daltons), sigma (85,000 daltons), and alpha (34,500 daltons) subunits as determined by sodium dodecyl sulfate
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphorylation of human holoenzyme of DNA dependent RNA polymerase III subunits in vivo has been investigated. RNA polymerase III from human placenta nuclei and epidermoid carcinoma cells A431 was isolated as two subfractions (IIIa and IIIb) distinguished in the order of elution from DEAE Sephadex A-25 column chromatography and buoyant density at glycerol gradient centrifugation. The subfractions of RNA polymerase III holoenzyme consists of four subunits with molecular masses 60, 52, 45 and 38 kDa, respectively, phosphorylated in vivo. The subunits with molecular masses 60 and 45 kDa are phos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The coronavirus disease of 2019 (COVID-19) pandemic speaks to the need for drugs that not only are effective but also remain effective given the mutation rate of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). To this end, we describe structural binding-site insights for facilitating COVID-19 drug design when targeting RNA-dependent RNA polymerase (RDRP), a common conserved component of RNA viruses. We combined an RDRP structure data set, including 384 RDRP PDB structures and all corresponding RDRP-ligand interaction fingerprints, thereby revealing the structural characteristics
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования