Selenocysteine (Sec), the 21st amino acid, combines the structural compatibility of cysteine with the unique chemical properties of selenium, enabling exceptional redox and catalytic performance in both natural and engineered systems. Its low pKa, high nucleophilicity, and increased polarizability underpin the activity of selenoproteins involved in antioxidant defence, redox regulation, and metabolic processes. This work integrates biochemical, structural, and evolutionary perspectives on Sec with advances in protein engineering and synthetic biology, where strategic Sec incorporation in place
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Force fields (FFs) for molecular simulation have been under development for more than half a century. As with any predictive model, rigorous testing and comparisons of models critically depends on the availability of standardized data sets and benchmarks. While such benchmarks are rather common in the fields of quantum chemistry, this is not the case for empirical FFs. That is, few benchmarks are reused to evaluate FFs, and development teams rather use their own training and test sets. Here we present an overview of currently available tests and benchmarks for computational chemistry, focusing
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isoprene is a substantial contributor to the global secondary organic aerosol (SOA) burden, with implications for public health and the climate system. The mechanism by which isoprene-derived SOA is formed and the influence of environmental conditions, however, remain unclear. We present evidence from controlled smog chamber experiments and field measurements that in the presence of high levels of nitrogen oxides (NO(x) = NO + NO2) typical of urban atmospheres, 2-methyloxirane-2-carboxylic acid (methacrylic acid epoxide, MAE) is a precursor to known isoprene-derived SOA tracers, and ultimately
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human carbonic anhydrases (hCAs) are emerging as increasingly relevant therapeutic targets due to their involvement in a broad spectrum of pathological conditions, ranging from glaucoma and epilepsy to cancer, neuroinflammation, metabolic disorders, and obesity. The coexistence of 15 isoforms with distinct catalytic activities and tissue distributions makes selectivity a central challenge in the development of CA inhibitors (CAIs). Recent advances in computational chemistry, artificial intelligence (AI), machine learning (ML), and Structure-Based Drug Design (SBDD) have significantly accelerat
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite considerable advances in computational chemistry, bridging the gap between the accuracy of all-atom molecular dynamics (AA-MD) and the high-throughput capabilities of docking remains an unsolved problem in protein-ligand binding free energy predictions. In this work, we propose to address this challenge through coarse-grained funnel metadynamics (CG-FMD) with the Martini 3 force field. This approach combines the reduced computational cost of a CG representation with state-of-the-art enhanced sampling techniques and the interpretability of a physics-based force field. Specifically, the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review meticulously examines the development, design, and pharmacological assessment of both well known antiviral and antihypertensive medications all time employing new chemical techniques and structure-based drug design to design and synthesize vital therapeutic entities such as aliskiren (renin inhibitor), captopril (a2-ACE-Inhibitor), dorzolamide (inhibitor of carbonic anhydrase) the review demonstrates initial steps regarding the significance of stereoselective synthesis, metal chelating pharmacophores, and rational molecular properties. More importantly, protease inhibitors (i.e., s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffusivities of several explosive compounds, as well as other complex organic compounds were experimentally derived using a peak parking methodology. High performance liquid chromatography (HPLC) with stop flow 'parking' was used to experimentally determine diffusivity based on band broadening associated with chemical diffusion within the HPLC column. This research builds on prior methods by determining an obstruction factor through comparing benzene diffusion in methanol in a C18 column to the previously published capillary column. The method is useful for structures not easily described by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiogenesis is crucial for tissue repair and the treatment of ischemic diseases, yet effective small-molecule proangiogenic agents are lacking in clinical practice. Chalcone-based compounds are of interest due to their diverse biological activities. This study aimed to synthesize and evaluate the proangiogenic potential of a series of novel chalcone derivatives and to elucidate their structure-activity relationship (SAR) using computational chemistry. We synthesized and tested six chalcone derivatives (1a-1f), with compound (E)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-3-(3-hydroxy-4-methoxyphenyl)prop-2-en-1-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Substantial attention has been given to modern organocopper chemistry in recent years since copper salts are naturally abundant, cheap, and less toxic in comparison to precious metals. Copper salts also exhibit versatility in catalyzing and mediating carbon-carbon and carbon-heteroatom bond forming reactions. Despite the wide applications of copper salts in catalysis, reaction mechanisms have remained elusive. Using azacalix[1]arene[3]pyridine, an arene-embedded macrocycle, and its isolated and structurally well-defined ArCu(II) and ArCu(III) compounds as molecular tools, we now report an in-d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Lumican is a major extracellular matrix (ECM) component in the cornea that is upregulated after injury and promotes corneal wound healing. We have recently shown that peptides designed based on the 13 C-terminal amino acids of lumican (LumC13 and LumC13C-A) are able to recapitulate the effects of lumican on promoting corneal wound healing. Herein we used computational chemistry to develop peptide mimetics derived from LumC13C-A with increased stability and half-life that are biologically active and non-toxic, thereby promoting corneal wound healing with increased pharmacological poten
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep generative models have emerged as powerful computational engines for de novo molecular design, enabling efficient exploration of a vast chemical space that remains inaccessible to traditional experimental approaches. This review provides a comprehensive survey of machine learning-driven molecular generation, systematically organizing the field across three foundational pillars: molecular representations, model architectures, and evaluation frameworks. We present a detailed taxonomy of state-of-the-art generative models, including Variational Autoencoders (VAEs), Generative Adversarial Net
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aims to gain insight into the circularly polarised luminescence (CPL) of lanthanide complexes through the angle of one of their elements, namely Samarium. The simulation of luminescent properties of Samarium(III) complexes remains a challenge for computational chemistry, considering the multiconfigurational character of the electronic structure, the importance of the spin-orbit coupling and the fact that its emissive level is high in energy and preceded by numerous states of various multiplicity. Herein, a methodology based on CASSCF/RASSI-SO calculations is exposed and appli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dinitrogen coordination to iron centers underpins industrial and biological fixation in the Haber-Bosch process and by the FeM cofactors in the nitrogenase enzymes. The latter employ local high-spin metal centers; however, iron-dinitrogen coordination chemistry remains dominated by low-valent states, contrasting the enzyme systems. Here, we report a high-spin mixed-valent cis-(μ-1,2-dinitrogen)diiron(I/II) complex [(FeBr)2 (μ-N2 )Lbis ]- (2), where [Lbis ]- is a bis(β-diketiminate) cyclophane. Field-applied Mössbauer spectra, dc and ac magnetic susceptibility measurements, and computational me
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tonsil Actisil FF, which is a commercial bentonitic clay, promotes the formation of cycloveratrylene macrocycles and benzyl oligomers from the corresponding benzyl alcohols in good yields under microwave heating and infrared irradiation in the absence of solvent in both cases. The catalytic reaction is sensitive to the type of substituent on the aromatic ring. Thus, when benzyl alcohol was substituted with a methylenedioxy, two methoxy or three methoxy groups, a cyclooligomerisation process was induced. Unsubstituted, methyl and methoxy benzyl alcohols yielded linear oligomers. In addition, co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amphotericin B (AmB) is a well known polyene macrolide antibiotic used to treat systemic fungal infections. Despite its toxicity AmB is still regarded as a life-saving drug. The lack of adequate knowledge of the AmB mechanism of action is a serious obstacle to efficient development of new less toxic derivatives. Complementary to various experimental approaches, computational chemistry methods were used to study AmB mechanism of action. A programme lasting for a decade, that was run by our group covered studies of: i) molecular properties of AmB and its membrane targets, ii) structure and prope
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the synthesis of the monomeric phosphaborene Ar*P═B(TMP) (2) (Ar* = 2,6-bis(triisopropylphenyl)-3,5-diisopropylphenyl) containing 2-coordinate phosphorus and boron centers. Compound 2 has a PB bond length of 1.741(3) Å, the shortest reported to date. Computational examination of the bonding in 2 reveals, in addition to the σ bond, the presence of a single classical π bond and a large Wiberg bond index of 1.9707, consistent with double bond, and not triple bond, character. The chemistry of 2 is marked by its low reactivity, which is rationalized by examination of the frontier molecula
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The synthesis and preliminary coordination chemistry of two new redox-active bidentate ligands containing amido and phosphido donors are described. Treatment of the [(R)NP](2-) (R = Ph, 2,4,6-trimethylphenyl) ligands with CuCl2 and PMe3 results in a dimeric copper(I) P-P coupled product via ligand oxidation. The intermediate of this reaction is proposed to involve a ligand radical generated via oxidation of the [(R)NP](2-) ligand by copper(II), and the existence of such an intermediate is probed using computational methods. Significant radical character on the phosphorus atoms of the alleged [
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance continues to threaten the effectiveness of current antibacterial therapies, creating an urgent need for novel chemotypes that act through alternative mechanisms. Among these, coumarin derivatives have emerged as promising inhibitors of bacterial type II topoisomerases, particularly DNA gyrase and topoisomerase IV, owing to their structural versatility and ability to target the ATP-binding domain. This review critically summarizes advances reported in the past decade in the design and biological evaluation of coumarin-based antibacterial agents targeting these enzymes.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ring strain energy (RSE) is crucial for understanding molecular reactivity, with broad implications in polymerization, click chemistry, drug discovery and beyond. However, quantitatively determining RSE through experiments or quantum mechanics (QM) is resource-intensive, limiting its application on a large scale. We present a machine learning (ML)-based workflow that enables the reliable and efficient prediction of RSE, entirely bypassing traditional QM calculations. Our workflow employs AIMNet2 machine learning interatomic potentials and Auto3D for the identification of low-energy conformers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A computationally-assisted and green spectrophotometric method has been developed for the determination of fostemsavir, a recently FDA-approved drug used in combination with antiretroviral drugs to treat multidrug-resistant HIV-1 infection. The method was developed using computational studies and solvent selection based on green chemistry principles. The density functional theory method was employed to identify bromophenol blue as the preferred acid dye for efficient extraction of fostemsavir. The solvent selection process involved a careful evaluation of the green ranking of solvents, which l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.