Childhood malnutrition is linked to gut microbiome changes; however, most studies focus on faecal samples, while less is known about the small intestinal microbiome. Here, we characterized the duodenal microbiota of children in Zambia with severe acute malnutrition (SAM) and stunting and compared the microbiomes of stunted children living across the globe. To do this, duodenal aspirates from only stunted (i.e. not concurrently wasted) (n = 53) and SAM (n = 24) Zambian children were analysed by 16S rRNA gene amplicon sequencing. Associations between bacterial composition, clinical features and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mucosal adaptive immune response is dependent on the production of IgA antibodies and particularly IgA1, yet opportunistic bacteria have evolved mechanisms to specifically block this response by producing IgA1 proteases (IgA1Ps). Our lab was the first to describe the structures of a metal-dependent IgA1P (metallo-IgA1P) produced from Gram-positive Streptococcus pneumoniae both in the absence and presence of its IgA1 substrate through cryo-EM single particle reconstructions. This prior study revealed an active-site gating mechanism reliant on substrate-induced conformational changes to the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To investigate the difference in the structural composition of salivary flora between chronic periodontitis patients with and without diabetic nephropathy (DN).
METHODS: Thirty salivary samples of 15 chronic periodontitis patients with DN (DN group) and 15 chronic periodontitis patients with diabetes but without DN (DM group) were subjected to pyrosequencing of polymerase chain reaction-amplified 16 s ribosomal RNA genes. After diversity testing, the differential flora were analyzed. The sequencing results were compared with GenBank database to determine the type of differential f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dysbiosis in lung cancer has been underexplored. The aim of this study was to define the bacterial and fungal microbiota of the bronchi in central lung cancer and to compare it with that of the oral and intestinal compartments.
METHODS: Twenty-five patients with central lung cancer and sixteen controls without antimicrobial intake during the previous month were recruited. Bacterial and fungal distribution was determined by massive sequencing of bronchial biopsies and saliva and faecal samples. Complex computational analysis was performed to define the core lung microbiota.
RESULT
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of orthodontics and dentofacial orthopedics : official publication of the American Association of Orthodontists, its constituent societies, and the American Board of Orthodontics2014eng
INTRODUCTION: The aim of this study was to investigate the presence of transient bacteremia after a piezocision procedure.
METHODS: The sample consisted of 30 subjects (24 women, 6 men; mean age, 19.6 ± 0.7 years; range, 18.1-22.4 years) with the American Society of Anesthesiologists' physical status I. All patients had Class I skeletal and dental relationships and had fixed orthodontic treatment with the Damon system. The piezocision surgery was performed 1 week after the placement of the orthodontic appliances in all patients. Two 20-mL venous blood samples were collected before and 30 to 6
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The objective of this research was to investigate the presence of viable bacteria in tissue samples from persistent apical lesions and to correlate the microbiological findings with the histopathological diagnosis of the lesion.
METHODS: Twenty persistent apical lesions associated with well-performed endodontic retreatment were collected. Tissue samples were processed through culture techniques including serial dilution, plating, aerobic and anaerobic incubation, and biochemical tests for microbial identification followed by histopathological diagnosis.
RESULTS: Cysts were more
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In this study the potential presence of bacteria in radicular cyst (RC) and keratocystic odontogenic tumour(KCOT) fluids from clinically asymptomatic patients was investigated.
MATERIALS AND METHODS: Cyst fluids were collected by needle aspiration from 16 patients with asymptomatic osteolytic lesions (10 RCs and 6 KCOTs) undergoing surgery. All samples were transferred into tubes containing pre-reduced transport medium, delivered to the microbiology laboratory and processed within 1h. The cysts, surgically enucleated, were sent for standard histopathological examination. Cyst fluid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The real-world risk profiles of newly defined steatotic liver disease (SLD) subtypes-MASLD, MetALD, and ALD-remain incompletely described in community settings. Methods: A cross-sectional analysis of 950 health-checkup participants was conducted. SLD (CAP ≥ 248 dB/m) and significant fibrosis (LSM ≥ 7.0 kPa) were evaluated by transient elastography. Associations between alcohol intake, cardiometabolic factors, fibrosis, and gut microbiota (16S rRNA sequencing) were assessed. Results: Among 950 participants, 310 (33%) had SLD (MASLD, n = 222; MetALD, n = 41; ALD, n = 23). Treated as
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although Helicobacter pylori plays a central role in gastric cancer (GC), other microorganisms involved in gastric dysbiosis may also impact carcinogenesis. We aimed to characterize gastric dysbiosis and its role in the transition from non-atrophic gastritis (NAG) to gastric premalignant lesions (GPLs) in two populations from Nariño, Colombia, with distinct GC risks: low-risk Afro-Colombians from Barbacoas and high-risk Amerindian-Mestizos from Cumbal.
METHODS: Gastric biopsies from 200 individuals were analyzed using 16S rRNA gene sequencing. Microbial diversity and composition w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma accounts for over 90% of oral neoplasms. Despite therapeutic advances, the lack of reliable, non-invasive biomarkers and delayed diagnosis continues to impede effective clinical management. By combining paired lesion and non-lesion sampling with predictive metagenomics analysis, our study addresses this gap and advances the current understanding of microbiome‒tumor interactions.
METHODS: We analyzed 92 buccal swab samples from 39 OSCC patients and 14 healthy controls using 16S rRNA gene (V3-V4) sequencing. Taxonomic profiling was conducted using QIIME2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This systematic review summarized current evidence regarding the role of upper aerodigestive tract microbiomes (UAM) in laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) development, progression, clinical, and oncological outcomes.
METHODS: Two investigators systematically search PubMed, Scopus, and Cochrane Library databases for studies investigating microbiome characteristics, mechanistic roles, and associations with clinical and oncological outcomes in LSCC according to the Preferred Reporting Items For A Systematic Review And Meta-analysis statements. The bias analysis was conducted wi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disruptions in vaginal microbiota and metabolites during pregnancy may be the most important risk factor for preterm delivery, thus the difference in vaginal microbiota and metabolites between women who subsequently delivered at term and who eventually experienced preterm birth. In this study, 63 participants were enrolled before the cervical cerclage surgery (namely pre-cerclage), comprising women who subsequently delivered at term and who eventually experienced preterm birth. The cervical-vaginal fluid (CVF) was collected two days prior to the cervical cerclage surgery. Compared with the ter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neonatal jaundice is a common disease that affects up to 60% of newborns. Herein, we performed a comparative analysis of the gut microbiome in neonatal jaundice and non-neonatal jaundice infants (NJIs) and identified gut microbial alterations in neonatal jaundice pre- and post-treatment. We prospectively collected 232 fecal samples from 51 infants at five time points (0, 1, 3, 6, and 12 months). Finally, 114 samples from 6 NJIs and 19 non-NJI completed MiSeq sequencing and analysis. We characterized the gut microbiome and identified microbial differences and gene functions. Meconium microbial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The incidence of oral squamous cell carcinoma (OSCC) is rising in patients under the age of 50, without smoking or alcohol abuse. Viruses are not a causative factor of OSCC in younger patients. The oral microbiome has not been evaluated in this unique patient cohort for a potential bacterial etiology.
METHODS: We report the bacterial diversity and composition of the largest cohort of OSCC patients with whole genome sequencing (n = 72) and compare it with oral mucosa from healthy controls (n = 10) using the Strengthening the Organization and Reporting of Microbiome Studies guidelin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The analysis of sputum is the principal basis for characterising lower airway microbiology in those with chronic respiratory conditions. For such analysis to be informative, samples that poorly reflect the lower airways must be identified and removed. Our cross-sectional study explored the relationship between the quality of sputum samples and their microbiological content. We further investigated the impact of excluding low quality samples on observed microbiota-disease relationships in childhood asthma.
METHODS: Induced sputum was collected from children with or without asthma.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acquisition and development of the oral microbiome are dynamic processes that occur over early life. This study aimed to characterize the temporal development of the oral microbiome of predominantly breastfed infants during the first two years of life.
METHODS: Infant oral samples (n=667) were collected at ten time points from the first week to year two of life from 84 infants. Bacterial DNA profiles were analyzed using full-length 16S rRNA gene sequencing.
RESULTS: The oral microbiome was dominated by Streptococcus mitis, Gemella haemolysans, and Rothia mucilaginosa. Bacterial r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: We compared the oral bacteriome and mycobiome of patients with oral submucosal fibrosis (OSMF) and oral squamous cell carcinoma (OSCC) who consumed tobacco/betel quid with those of healthy individuals.
METHODS: Targeted amplicon sequencing coupled with bioinformatics analysis was performed to assess the bacterial and fungal communities in the oral cavity.
RESULTS: Distinct variations in the microbial communities were observed among the healthy, OSMF, and OSCC samples. Firmicutes was dominant at the phylum level: 21.71 %, 21.73 %, and 24.56 % in the healthy control, OSMF, and OSCC
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Crohn's disease (CD)-associated periodontitis is common. However, the role of periodontal pathogens in the Coexistence of CD and periodontal disease remains unclear.
METHODS: To investigate the potential relationship mediated by periodontal pathogens between periodontitis and CD, we collected salivary samples from healthy participants (H group, n = 12), patients with CD (Ch group, n = 10), patients with periodontitis (Ps group, n = 12), and patients with Coexistence of CD and periodontal disease (Cp group, n = 12) and analyzed them by 16 S rRNA sequencing.
RESULTS: Patients with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A complex microbiota in the gastric mucosa (GM) has been unveiled recently and its dysbiosis is identified to be associated with gastric cancer (GC). However, the microbial composition in gastric fluid (GF) and its correlation with GM during gastric carcinogenesis are unclear.
METHODS: We obtained GM and GF samples from 180 patients, including 61 superficial gastritis (SG), 55 intestinal metaplasia (IM) and 64 GC and performed 16S rRNA gene sequencing analysis. The concentration of gastric acid and metabolite nitrite has been measured.
RESULTS: Overall, the composition of microbi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To compare the use of the Halimeter and the Oral Chroma™ to assess the ability of common oral anaerobic bacteria isolated from the Kuwaiti population to produce volatile sulfur compounds (VSCs).
MATERIALS AND METHODS: Broth cultures of common anaerobes isolated from supragingival plaque were centrifuged and pellets resuspended in phosphate buffer (pH 7.7) with an optical density OD(550) of 0.3. 100 μl of this suspension and 870 μl of buffer were added in 2 sterile 15-ml head space vials. Reaction was initiated by addition of 30 μl of 33 mML-methionine and L-cysteine, respectively,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.