The misfolding and un-natural fibrillation of proteins/peptides are associated with many conformation diseases, such as human islet amyloid polypeptide (hIAPP) in type 2 diabetes (T2D). Inspired by molecular chaperones maintaining protein homeostasis in vivo, many polymer-based artificial chaperones were introduced to regulate protein/peptide folding and fibrillation. However, the pure polymer chaperones prefer to agglomerate into large-size micelles in the physiological environment and thus lose their chaperone functions, which greatly restricts the application of polymer-based chaperones. He
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteric bacterial pathogens employ various strategies to colonize the intestine and cause diseases ranging from gastroenteritis to systemic infections. For example, Salmonella enterica utilizes a nanomachine known as the type VI secretion system (T6SS) to facilitate colonization of the host gut. However, the varied mechanistic details of how the T6SS is loaded with effector proteins remains to be elucidated. Here, we present an X-ray crystal structure of the Salmonella Typhimurium VgrG (VgrS) that serves as platform for T6SS effector loading. Compared to other known structures of VgrG proteins
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conformational state of distinct prolines can determine the folding of a protein but equally other biological processes when coupled to a conformation-sensitive secondary reaction. For the neuronal tau protein, the importance of proline conformation is underscored by its interaction with different prolyl cis/trans isomerases. The proline conformation would gain even further importance after phosphorylation of the preceding residue by various proline-directed kinases. A number of molecular diseases including Alzheimer's disease and traumatic brain injury were thereby recently qualified as "
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular dynamics (MD) simulations are invaluable tools for studying molecular behavior, offering insights into the time-dependent evolution of molecular systems. However, these simulations often face significant limitations in exploring the full conformational space of the complex systems. The high dimensionality and the presence of energy barriers in the conformational landscape hinder the effective exploration of rare states, leaving large portions of the conformational space unexplored. To overcome these limitations and enhance the exploration of the conformational landscape, in this stud
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chameleonic behavior of cyclosporin A (CsA) was investigated through conformational ensembles employing multicanonical molecular dynamics simulations that could sample the cis and trans isomers of N-methylated amino acids; these assessments were conducted in explicit water, dimethyl sulfoxide, acetonitrile, methanol, chloroform, cyclohexane (CHX), and n-hexane (HEX) using AMBER ff03, AMBER10:EHT, AMBER12:EHT, and AMBER14:EHT force fields. The conformational details were discussed employing the free-energy landscapes (FELs) at T = 300 K; it was observed that the experimentally determined st
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcription factor estrogen receptor α is the primary driver of ER+ breast cancer progression and a target of multiple FDA-approved anticancer drugs. Ligand-dependent activity of ERα is determined by helix-12 conformation within the ligand binding domain. However, how helix-12 transitions from an unliganded (apo) state to active (estrogen-bound) or inactive (SERM/SERD-bound) states remains unresolved. Here, we present the crystal structure of an apo estrogen receptor α ligand binding domain from the teleost Melanotaenia fluviatilis, revealing a third distinct helix-12 conformation. Struc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper investigates the effect of solvent-induced conformational changes of poly(3,6-phenanthrene) on their two-photon absorption (2PA). Such effect was studied employing the wavelength-tunable femtosecond Z-scan technique and modeled using the sum-over-essential states approach. We observed a strong reduction of the 2PA cross-section when the sample was prepared in hexane (poor solvent) in comparison to chloroform (good solvent), which is related to the conformation adopted by the polymer in each case. In chloroform it adopts a random coil conformation, as opposed to the one-handed helix
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Symmetry is a fundamental principle permeating molecular and crystalline systems, and symmetry breaking remains a core scientific issue for understanding structural evolution, property origins, and functional performance across these two scales. Here, we demonstrate that energy-degenerate mirror-symmetric conformational pairs could provide a molecular-level basis for the observed paired conformations in solid-state flexible achiral molecules, a feature not explicitly considered in conventional structural analysis. Combining density functional theory (DFT) and Cambridge Structural Database (CSD
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular conformational diversity plays a crucial role in both polymorphic nucleation and cocrystal formation during the cocrystallization process. However, the relationship between molecular conformation and cocrystallization polymorphism is not well-explored. Herein, the impact of molecular conformational landscapes on cocrystallization outcomes was investigated using tizanidine (TZND) as model compound. Four coformers, namely maleic acid (MA), salicylic acid (SA), p-hydroxybenzoic acid (pHBA), and heptanedioic acid (HDA), were employed and five salt forms were developed for the first time.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor hypoxia, limited solid-tumor imaging, and insufficient systemic antitumor immunity remain major challenges to effective cancer phototheranostics. Here, a molecular conformation engineering strategy is developed to construct TBBP, which features a strengthened electron donor, a moderately twisted conformation, extended π-conjugation, and a robust molecular skeleton free of labile olefinic π-bridges. TBBP exhibits excellent photostability, broadband second near-infrared (1000-1600 nm) emission, and efficient photothermal conversion (42.17%). Supramolecular assembly with DSPE-PEG2000 afford
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Giant dimeric donors possess definite chemical structures and regulatable molecular skeletons and are expected to become alternative photovoltaic materials for polymer donors with batch differences. However, the design of giant dimeric donors is still at an early stage and needs to be further explored. Here, through creative semi-flexible and flexible linker design, we synthesized three interesting giant dimeric donors with relative monomer positions ranging from parallel to staircase to perpendicular in their optimized conformation. Unusually, the hyperconjugation effect in the semi-flexible
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of the tin(III) complex [Sn(2)(CH(2)CH(2)CN)(6)] has been determined. There are two independent molecules in the crystal, both adopt distorted eclipsed conformation. The molecular and electronic structures of this compound have been studied both at the semiempirical level and with the use of non-empirical ab initio methods. The calculated Sn-Sn distances agree well with those found crystallographically. The results of calculations showed that the eclipsed conformation of complex is more stable as compared with staggered conformation. The compound show modest cytotoxic activity ag
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholesterol is a key regulator of lipid nanocarrier for membrane stability and surface functionalization efficiency. Given widely application of liposomes in delivering peptide/antibody and demand of liposome upgrading, this study elucidates mechanism of cholesterol concentration on the anchoring and conformation of an LPP-scFv system on PEGylated liposome surfaces, relying on the coarse-grained molecular dynamics simulations and experiment assays. Our results demonstrate that cholesterol modulates the insertion depth and stability of the LPP anchor by altering membrane rigidity and the confor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanism of action of rifamycins against bacterial DNA-dependent RNA polymerase has been explained on the basis of the spatial arrangement of four oxygens which can form hydrogen bonds with the enzyme. Structural descriptors are derived from X-ray diffraction crystal structures of 25 active and nonactive rifamycins. Principal component analysis is used to find the combination of structural parameters which better discriminate between active and nonactive rifamycins. Two possible mechanisms of molecular rearrangement are described which can convert nonactive into active conformations. The
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we introduce two thiophene-phenylene-thiophene (TPT) polymers designed to leverage noncovalent intramolecular interactions to regulate main-chain conformation and enhance solid-state ordering. By incorporating unsubstituted thiophene (T) or bithiophene (2T) units, we reveal striking divergence in the thermal, morphological, and optoelectronic properties of the resulting films, facilitated by these noncovalent interactions. Using a combination of computational and experimental approaches, we show that annealing yields remarkably different polymer conformations and, consequently,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the title compound, C27H36O5, the dihedral angles between the planes of the benzene ring and the cyclo-hexenone rings are 60.87 (10) and 65.04 (10)°, while the dihedral angle between the mean planes of the two cyclo-hexenone rings is 39.33 (10)°. Each cyclo-hexenone ring has a carbon atom bonded to two methyl groups, which acts as the flap atom, resulting in an envelope conformation. The opposite orientation of the hy-droxy and carbonyl oxygen atoms allows for the formation of two intra-molecular O-H⋯O hydrogen bonds and C-H⋯π (ring) inter-actions also help to establish the molecular confor
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purely organic luminescent materials are pivotal for optoelectronics, with chalcogen-fused phenazines serving as basic building blocks owing to their strong electron donating ability and enhanced spin-orbit coupling effect. However, a systematic understanding of how the chalcogen identity governs intrinsic conformational preference between quasi-axial (QA) and quasi-equatorial (QE) forms remains elusive. To address this, we designed a series of derivatives featuring phenoxazine, phenothiazine, and phenoselenazine donors coupled with a terpyridine acceptor. We demonstrate that the chalcogen ato
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three-dimensional (3D) genome conformation is central to gene expression regulation, yet our understanding of its contribution to rapid transcriptional responses, signal integration, and memory in immune cells is limited. Here, we study the molecular regulation of the inflammatory response in primary macrophages using integrated transcriptomic, epigenomic, and chromosome conformation data, including base pair-resolution Micro Capture-C. We demonstrate that interleukin-4 (IL-4) primes the inflammatory response in macrophages by stably rewiring 3D genome conformation, juxtaposing endotoxin-, int
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we devised a new method to predict facial selectivity by quantifying steric and orbital factors for the nucleophile approaching both π-plane faces. Using this method, we quantified the total electron density and frontier orbital distributions of 163 cyclic ketones with various structures and quantitatively explained the surface selectivity of 323 reactions with eight nucleophiles (BH3, LiAlH4, NaBH4, LiAl(OMe)3H, MeLi, MeMgI, PhLi, and PnMgI). Importance analysis showed a large orbital effect for BH3, LiAlH4, and NaBH4 and the dominance of the steric effect for LiAl(OMe)3H, MeLi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rotaxanes can exhibit stimuli-responsive behavior by allowing positional fluctuations of their rota groups in response to physiochemical conditions such as the changes in solution pH. However, ionic strength of the solution also affects the molecular conformation by altering the charge state of the entire molecule, coupling the stimuli-responsiveness of rotaxanes with their conformation. A molecular-scale investigation on a model system can allow the decoupling and identification of various effects and can greatly benefit applications of such molecular switches. By using atomistic molecular dy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.