The immune mapped protein 1 (IMP1) was first identified as a protective antigen in Eimeria maxima and described as vaccine candidate and invasion factor in Toxoplasma gondii. We show here that TgIMP1 localizes to the inner leaflet of plasma membrane (PM) via dual acylation. Mutations either in the N-terminal myristoylation or palmitoylation sites (G2 and C5) cause relocalization of TgIMP1 to the cytosol. The first 11 amino acids are sufficient for PM targeting and the presence of lysine (K7) is critical. Disruption of TgIMP1 gene by double homologous recombination revealed no invasion defect o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hookworms are human parasites that have devastating effects on global health, particularly in underdeveloped countries. Ancylostoma ceylanicum infects humans and animals, making it a useful model organism to study disease pathogenesis. A. ceylanicum excretory-secretory protein 2 (AceES-2), a highly immunoreactive molecule secreted by adult worms at the site of intestinal attachment, is partially protective when administered as a mucosal vaccine against hookworm anemia. The crystal structure of AceES-2 determined at 1.75 Å resolution shows that it adopts a netrin-like fold similar to that found
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acyl-homoserine lactone (AHL) quorum sensing enables many species of proteobacteria to coordinate collective behaviors. In such systems, a synthase produces an AHL signal, which is sensed by a LuxR-family receptor. Despite extensive genomic annotation of LuxR homologs, preferred AHLs for most receptors remain unknown, limiting functional understanding of quorum sensing across diverse bacteria. Here, we present the COPAL (combining ordered predictions of audited ligands) pipeline, which integrates multiple protein-ligand co-folding models to identify preferred AHLs for a specific LuxR. Benchmar
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alzheimer's disease (AD) is the most common cause of dementia and cognitive decline, while its pathological mechanism remains unclear. Tauopathies is one of the most widely accepted hypotheses. In this study, the molecular network was established and the expression pattern of the core gene was analyzed, confirming that the dysfunction of protein folding and degradation is one of the critical factors for AD.
METHODS: This study analyzed 9 normal people and 22 AD patients' microarray data obtained from GSE1297 in Gene Expression Omnibus (GEO) database. The matrix decomposition analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The misfolding and self-aggregation of human Islet Amyloid Polypeptide (hIAPP) are linked to the onset of type 2 diabetes (T2D). However, the mechanism of how the disordered hIAPP aggregates trigger membrane damage leading to the loss of Islet cells in T2D is unknown. Using coarse-grained (CG) and all-atom (AA) molecular dynamics simulations, we have investigated the membrane-disruption behaviors of hIAPP oligomers on the phase-separated lipid nanodomains that mimic the highly heterogeneous lipid raft structures of cell membranes. Our results revealed that hIAPP oligomers preferentially bind t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human fibrillin-1 is an extra-cellular matrix glycoprotein with a modular organisation that includes 43 calcium-binding epidermal growth factor-like (cbEGF) domains arranged as multiple tandem repeats interspersed with transforming growth factor beta binding protein-like (TB) domains. We have studied Marfan syndrome-causing mutations which affect calcium binding to cbEGF13, and demonstrate that in human fibroblast cells they cause unexpected endoplasmic reticulum retention, indicative of a folding defect. Biochemical and biophysical studies of in vitro refolded fragments from the TB3-cbEGF14 r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral capsid proteins are widely explored for subunit vaccine development but are often hampered by their complexity of production and low immunogenicity. Here, we report a simple approach to overcoming these challenges by combining mRNA vaccine technology with protein engineering. Using African swine fever virus (ASFV) capsid proteins P72 and penton as models, we engineered them into membrane-bound and secreted forms and compared their immunogenicity to that of the native intracellular form in mice and pigs through mRNA vaccination. The membrane-bound and secreted P72 and penton folded into t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) chronically infects >250 million people. It replicates by a unique protein-primed reverse transcription mechanism, and the primary anti-HBV drugs are nucleos(t)ide analogs targeting the viral polymerase (P). P has four domains compared to only two in most reverse transcriptases: the terminal protein (TP) that primes DNA synthesis, a spacer, the reverse transcriptase (RT), and the ribonuclease H (RNase H). Despite being a major drug target and catalyzing a reverse transcription pathway very different from the retroviruses, HBV P has resisted structural analysis for decad
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Early identification of vocal fold leukoplakia (VFL), which has a risk of progressing to malignant transformation, remains a controversial topic. The identification of biological markers for diagnosing these lesions would lead to a more effective treatment. We aimed to analyze the immunoexpression of cathepsin B and E-cadherin in VFL and correlate it with clinical and epidemiological data and disease prognosis.
METHODS: Thirty-two patients with VFL treated with microsurgery were retrospectively evaluated. The patients were distributed according to the histological results into Gro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ro52, one of the major autoantigens in the rheumatic disease Sjögren's syndrome (SS), belongs to the tripartite motif (TRIM) or RING-B-box-coiled-coil (RBCC) protein family, thus comprising an N-terminal RING, followed by a B-box and a coiled-coil region. Several different proteomic functions have been suggested for Ro52, including DNA binding, protein interactions and Zn(2+)-binding. To analyze the presence and/or absence of these functions and, in particular, map those to different subregions, the modular composition of the Ro52 protein was experimentally characterized. Two structured parts
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: zeta-crystallin is a quinone oxido-reductase, recruited in the eye lens of hystricomorphic rodents and camels. A deletion mutation constituting the NADPH-binding domain causes congenital cataract in a strain of guinea pigs. The presence of large quantities of a-crystallin, a molecular chaperone, does not provide any protection against this. In order to investigate whether the underlying reason for the lack of protection is the formation of a folding-incompetent protein, we have expressed the mutant protein in a heterologous system along with other known chaperones.
METHODS: We expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloids are insoluble protein aggregates that arise through protein misfolding and are associated with numerous neurodegenerative disorders, systemic amyloidosis, and other human diseases. Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, encompassing both solution-state and solid-state approaches, offers unique capabilities to investigate each stage of the complex amyloid formation pathway, from soluble monomeric precursors through transient intermediate states and oligomeric assemblies to highly ordered mature fibrils. This residue-specific and atomic-level characterization of the aggregation
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fold-switching metamorphic protein sequences defy the classical "one sequence - one fold" paradigm. The ability of metamorphic proteins to reversibly switch between distinct folds make them attractive de novo protein engineering candidates since they can function as environment-sensitive molecular switches. However, the underlying thermodynamic design principles that drive their fold-switching behavior is poorly understood. Gaining insights into the molecular driving forces leading to fold switching behavior is crucial for the rational design of new metamorphic proteins based molecular switche
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multidrug-resistant sepsis pathogen Acinetobacter baumannii has diverged from model γ-proteobacteria in fundamental ways, hindering efforts to develop new lines of attack against the microbe. A major area of divergence is cell division. The pathogen lacks several widely conserved division enzymes, such as FtsEX, and instead possesses a suite of atypical gene products showing no sequence similarity to any well-characterized proteins. Key among these unusual proteins is AdvA. In previous Tn-seq studies, we identified AdvA as essential for A. baumannii division and fluoroquinolone resistance.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus agalactiae, also known as group B Streptococcus (GBS), is the major cause of neonatal sepsis in humans. A critical step to infection is adhesion of bacteria to epithelial surfaces. GBS adhesins have been identified to bind extracellular matrix components and cellular receptors. However, several putative adhesins have no host binding partner characterised. We report here that surface-expressed β protein of GBS binds to human CEACAM1 and CEACAM5 receptors. A crystal structure of the complex showed that an IgSF domain in β represents a novel Ig-fold subtype called IgI3, in which uni
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many disease-causing point mutations do not seriously compromise synthesis of the affected polypeptide but rather exert their effects by impairing subsequent protein folding or stability of the folded protein. This often results in rapid degradation of the affected protein. The concepts of such 'conformational disease' are illustrated by reference to cystic fibrosis, phenylketonuria and short-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency. Other cellular components such as chaperones and proteases, as well as environmental factors, may combine to modulate the phenotype of such disorders and this may
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient production of properly folded, disulfide-rich proteins in the cytosol of Escherichia coli remains challenging because the cytosol is highly reducing. Here, we developed an expression system for recombinant human serum albumin (rHSA) by fusing the a domain of human protein disulfide isomerase (PDI) to the N-terminus of HSA. PDI(a)-mediated cis-fusion enabled high-level production of soluble rHSA in oxidizing E. coli strains under low-temperature conditions. Purified E. coli-rHSA was predominantly monomeric and had the molecular mass expected for HSA containing 17 intramolecular disulf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An R345W mutation in the N-glycoprotein, fibulin-3 (F3), results in inefficient F3 folding/secretion and higher intracellular F3 levels. Inheritance of this mutation causes the retinal dystrophy malattia leventinese. N-Linked glycosylation is a common cotranslational protein modification that can regulate protein folding efficiency and energetics. Therefore, we explored how N-glycosylation alters the protein homeostasis or proteostasis of wild-type (WT) and R345W F3 in ARPE-19 cells. Enzymatic and lectin binding assays confirmed that WT and R345W F3 are both primarily N-glycosylated at Asn249.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanism of protein folding has been the subject of extensive investigation during the last decade, both because of its academic challenge and because of its relation to many diseases which are known to occur due to misfolding of proteins. In this context, we report here a systematic investigation on the step-wise formation of a helical structure by the addition of hexafluoroacetone, in a 14-residue peptide derived from a part of the scorpion neurotoxin protein. The NMR and circular dichroism results indicate that the peptide has an inherent propensity for helix formation and this is limi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrinsically disordered, low-complexity regions frequently cooperate with folded domains to mediate protein-protein interactions, yet accurately describing these mixed folded-disordered systems remains challenging. To visualize these mixed folded proteins, experimentally guided coarse-grained (CG) molecular dynamics simulations are often employed to extend the timescales required to capture the complex dynamics in play. However, the minimalistic nature of these approaches often compromises structural accuracy and can lead to inaccurate inter-domain interactions. Here we introduce backbone dih
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.