The physicochemical properties of a drug molecule determine the therapeutic effectiveness of the drug. Thus, the development of fast and accurate theoretical approaches for the prediction of such properties is inevitable. The participation to the SAMPL7 challenge is based on the estimation of logP coefficients and pKa values of small drug-like sulfonamide derivatives. Thereby, quantum mechanical calculations were carried out in order to calculate the free energy of solvation and the transfer energy of 22 drug-like compounds in different environments (water and n-octanol) by employing the SMD s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A commercial fast pyrolysis probe coupled with a high-resolution tandem mass spectrometer was employed to identify the initial reactions and products of fast pyrolysis of xylobiose and xylotriose, model compounds of xylans. Fragmentation of the reducing end by loss of an ethenediol molecule via ring-opening and retro-aldol condensation was found to be the dominant pyrolysis pathway for xylobiose, and the structure of the product-β-d-xylopyranosylglyceraldehyde-was identified by comparing collision-activated dissociation of the ionized product and an ionized authentic compound. This intermediat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular dynamic simulations were performed to investigate the stability of heterocyclic peptide nanotubes composed of 1,4-disubstituted-1,2,3-triazol ε-amino acid. 45 ns MD simulations were conducted on the cyclic peptide nanotube (CPNT) and cyclic peptide dimer in methanol, chloroform, and water and revealed that these structures are more stable in nonpolar solvents. MM-PBSA and MM-GBSA calculations were employed to analyze the solvent effect on the stability and length of the CPNT. These calculations showed that CPNT in chloroform was more stable and longer as compared to other solvents. I
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, we showed that peroxynitrite (ONOO(-)) reacts directly and rapidly with aromatic and aliphatic boronic acids (k ≈ 10(6) M(-1)s(-1)). Product analyses and substrate consumption data indicated that ONOO(-) reacts stoichiometrically with boronates, yielding the corresponding phenols as the major product (∼85-90%), and the remaining products (10-15%) were proposed to originate from free radical intermediates (phenyl and phenoxyl radicals). Here, we investigated in detail the minor, free radical pathway of boronate reaction with ONOO(-). The electron paramagnetic resonance (EPR) spin-trap
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Force fields and vibrational wavenumbers were calculated for the molecules SO(2)XF (X=Cl, Br) using DFT techniques. The previously available experimental data and assignments for SO(2)ClF and SO(2)BrF were partially confirmed by the theoretical results. These data were subsequently used in the definition of scaled quantum mechanics force fields for such molecules. A comparison of the obtained force constants is made with results previously published for the SO(2)X(2) molecules.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study describes an enhancement of the photoluminescence of CdSe quantum dots under long-term ultraviolet irradiation in organic solvents. The photoenhancement effect followed multiexponential kinetics and was found to depend on several factors: intensity of ultraviolet light, polarity of the solvent, presence of capping agents on the nanocrystal surface, and presence of free Cd and Se ions in the solution. High intensity ultraviolet irradiation provoked a rapid enhancement of the photoluminescence of CdSe nanocrystals, reaching the maximum with subsequent photoluminescence decay. L
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioinformatics has revolutionized biology and medicine by using computational methods to analyze and interpret biological data. Quantum mechanics has recently emerged as a promising tool for the analysis of biological systems, leading to the development of quantum bioinformatics. This new field employs the principles of quantum mechanics, quantum algorithms, and quantum computing to solve complex problems in molecular biology, drug design, and protein folding. However, the intersection of bioinformatics, biology, and quantum mechanics presents unique challenges. One significant challenge is th
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting how protein mutations affect drug binding remains a major challenge, particularly when the mutations are distal from the binding site. In this study, we introduce a coupled simulation workflow that combines classical molecular dynamics (MD) with high-throughput quantum mechanical (QM) analysis to reveal the electronic structure signatures of mutation-induced drug resistance in the HIV-1 protease. Our workflow leverages GPU-accelerated MD to generate conformational ensembles, and performs in operando linear-scaling density functional theory (DFT) calculations on selected frames paral
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum-dot (QD)-engineered heterointerfaces offer a versatile route to low-temperature chemiresistive gas sensing through tunable electronic structure, large surface-to-volume ratio, short charge-transfer distances, and interface-sensitive transport. Yet QD incorporation simultaneously changes particle size, accessible area, defect and ligand chemistry, porosity, carrier transport, and network connectivity. Enhanced response therefore does not, by itself, demonstrate quantum confinement or heterojunction-controlled transduction. This critical review evaluates metal-oxide, chalcogenide, carbon
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel, sustainable spectrofluorimetric method was developed for memantine determination using erythrosin B as a fluorescent probe, addressing critical analytical gaps in pharmaceutical quality control and environmental monitoring. The method exploits static fluorescence quenching through ground-state complex formation between protonated memantine and anionic erythrosin B. Initially, UV-Vis absorption spectroscopy revealed a significant hypochromic effect accompanied by a hypsochromic shift of 5 nm, with the absorption maximum shifting from 527 to 522 nm upon complex formation, while fluoresc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The concept of chemical bonds and the detailed knowledge of how and where the breaking/formation processes occur are perhaps the central research fields in chemical sciences. However, the exact mechanisms underlying these processes still deserve an in-depth explanation. This perspective article systematically describes how the electronic distribution changes along the reaction pathway using Bonding Evolution Theory (BET) and Non-Covalent Interaction (NCI) analysis, highlighting their crucial role in the study of reaction mechanisms. Both methods enable on-the-fly topological classification for
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Starch is a biomass polymer material with a high yield and comprehensive source. It is used as a raw material for preparing adhesives because of its highly active hydroxyl group. However, poor adhesion and water resistance hinder the application of starch-based adhesives (SBAs). Based on this, the starch was modified through graft copolymerization with itaconic acid as a cross-linking agent, methyl methacrylate and methyl acrylate as copolymers. Additionally, reed fibers were synergistically modified with polydopamine deposition to prepare an environmentally friendly SBA used in plywood produc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The alkylation of beta-dicarbonyl compounds in a K2CO3/DMSO system was found to afford O- and C-alkylated derivatives, depending on the type of the beta-dicarbonyl compound involved. The alkyl derivatives obtained were used in the synthesis of some new spiro barbituric acid derivatives. Quantum chemical calculations were carried out to elucidate the reaction mechanisms for some typical synthesis.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing burden of schistosomiasis, compounded by the restriction imposed by monotherapeutic regimens, highlights the pressing need for new molecules that target specific molecular pathways. Schistosoma mansoni histone deacetylase 8 (SmHDAC8), a zinc-dependent epigenetic regulator, has emerged as a nonredundant and druggable enzyme, critical for parasite survival, fertility, and chromatin homeostasis. In this study, we outline multiple-mode computational analysis involving structure-based virtual screening against a chemically diverse ligand library, frontier molecular orbital analysis t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sphalerite flotation is generally achieved by copper activation followed by xanthate collection. This study aims to propose a design idea to find novel collectors from the perspective of molecular design and prove the theoretical feasibility that the collector can effectively recover sphalerite without copper activation. To address this, 30 compounds containing different structures of sulfur atoms and different neighboring atoms were designed based on coordination chemistry. Twelve potential collectors were screened, and their properties and interactions with a hydrated sphalerite (110) surfac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the spirit of the mounting interest in noncovalent interactions, the present study was conducted to scrutinize a special type that simultaneously involved both σ-hole and lone pair (lp) interactions with aromatic π-systems. Square-pyramidal pentavalent halogen-containing molecules, including X-Cl-F4, F-Y-F4, and F-I-X4 compounds (where X = F, Cl, Br, and I and Y = Cl, Br, and I) were employed as σ-hole/lp donors. On the other hand, benzene (BZN) and hexafluorobenzene (HFB) were chosen as electron-rich and electron-deficient aromatic π-systems, respectively. The investigation relied upon a v
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The occurrence of carbamazepine (CBZ) in environments poses a potential risk to aquatic life and exhibits growth inhibition of human embryonic cells. In this work, for the first time a series of Ag-SnO2 quantum dots (QDs)/silver phosphate (AgSn/AgP) composites were synthesized and used as photocatalysts for CBZ degradation. The obtained AgSn/AgP composites showed superior photodegradation efficiency for CBZ removal. The degradation rate constant of 10AgSn/AgP (with 10 wt% of Ag-SnO2 QDs) was almost 8.5, 5.7, 5.7, and 1.9 times as that of Ag-SnO2 QDs, Ag3PO4, Ag/Ag3PO4, and SnO2 QDs/Ag3PO4, res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The isomerization of o-quinolyl ↔ o-isoquinolyl radicals and their thermal decomposition were studied by quantum chemical methods, where potential energy surfaces of the reaction channels and their kinetics rate parameters were determined. A detailed kinetics scheme containing 40 elementary steps was constructed. Computer simulations were carried out to determine the isomerization mechanism and the distribution of reaction products in the decomposition. The calculated mole percent of the stable products was compared to the experimental values that were obtained in this laboratory in the past,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A sensitive fluorescence biosensor for determining sparfloxacin (SPF) based on the electron transfer mechanism and the fluorescence quenching effect of SPF to cadmium telluride quantum dots (CdTe QDs) was developed. The mechanism of the interaction between SPF and CdTe QDs was investigated by UV/Vis absorption and fluorescence spectroscopy. The biosensor could be used for the determination of SPF with a high sensitivity. Under optimum conditions, the linear range was from 0.28 to 40 μg SPF ml(-1) with a correlation coefficient of 0.9983, and the detection limit (3δ/k) was 83.7 ng SPF ml(-1). F
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TNF-α is an inflammatory cytokine that plays an important role in insulin resistance observed in obesity and chronic inflammation. Many cellular components involved in insulin signaling cascade are known to be inhibited by TNF-α. Insulin receptor substrate (IRS)-1 is one of the major targets in TNF-α-induced insulin resistance. The serine phosphorylation of IRS-1 enables the inhibition of insulin signaling. Until now, many studies have been conducted to investigate the mechanism of TNF-α-induced insulin resistance based on Western blot. Intracellular protein kinase crosstalk is com
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования