Insoluble cytoplasmic aggregate formation of the RNA-binding protein TDP-43 is a major hallmark of neurodegenerative diseases including Amyotrophic Lateral Sclerosis. TDP-43 localizes predominantly in the nucleus, arranging itself into dynamic condensates through liquid-liquid phase separation (LLPS). Mutations and post-translational modifications can alter the condensation properties of TDP-43, contributing to the transition of liquid-like biomolecular condensates into solid-like aggregates. However, to date it has been a challenge to study the dynamics of this process in vivo. We demonstrate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
I am the Huntington Sheldon Professor of Medical Discovery in the Department of Molecular Biology and Genetics in the School of Medicine at the Johns Hopkins University, where I have been running a lab for 30 years. Our research focusses on the molecular control of embryonic polarity and germline development, with an emphasis on asymmetric cell division and biomolecular condensates. We have uncovered mechanisms that localize proteins and RNAs in the cytoplasm by controlling protein diffusion and RNA condensation. My lab has also characterized a repressive program that launches the germline by
Историческая статьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates, formed through phase separation of multivalent biomolecules, play essential roles in cellular processes such as stress response, RNA processing, transcriptional control, and genome organization. Nucleic acids are increasingly recognized as important drivers and regulators of condensate formation and dynamics. This review examines recent advances in coarse-grained molecular simulations of dynamic nucleic acids and their phase transitions. We survey established computational frameworks validated against experimental data and discuss emerging applications that address in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RIG-I-like receptors (RLRs) are essential for antiviral innate immunity through sensing viral RNA. Although liquid-liquid phase separation (LLPS) has emerged as a key mechanism in fine-tuning immune signaling, its role in the initial sensing of viral RNA remains poorly understood. Here, we identify the RNA-binding protein CSDE1 as a negative regulator of RLR signaling that facilitates viral immune evasion. Macrophages deficient in CSDE1 exhibit enhanced interferon production, and CSDE1-knockout mice show increased resistance to viral infection. Mechanistically, CSDE1 forms RNA-dependent biomol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Luminal breast cancer is characterized by a persistent risk of recurrence and dysregulated lipid metabolism. However, the role of phase separation, a novel mechanism for the spatial compartmentalization of proteins, in lipid remodeling within the context of breast cancer remains largely unexplored. Utilizing the multiomics data from our large breast cancer cohort (n = 773), we revealed that aberrant lipid metabolism negatively impacts the prognosis of patients with luminal breast cancer. Furthermore, we deciphered that the copy number alteration-driven cis-regulation of DDHD domain containing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates are key organizers of cellular biochemistry and are emerging as promising platforms for therapeutic delivery. However, how their molecular composition influences lipid organization and interfacial behavior remains poorly understood. Here, we report lipid-containing condensates ("LipCons") that form stable, micron-scale assemblies exhibiting distinctive lipid organization and excellent biocompatibility in circulation. LipCon structures reach cell-like dimensions (∼3 µm diameter), far bigger than conventional liposomes. Functionally, LipCons composed solely of natural li
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates formed by liquid-liquid phase separation (LLPS) have emerged as a major mode of intracellular organization, and their roles in craniofacial development are only beginning to be defined. In this review, we synthesize evidence that phase separation and condensate biology influences craniofacial morphogenesis at multiple levels, from transcriptional control in neural crest-derived lineages to signaling integration, mechanosensing, and the formation of mineralized tissues. Nuclear condensates formed by transcription factors and chromatin regulators are implicated in clefti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid-liquid phase separation (LLPS) underlies the formation of biomolecular condensates that organize processes, including endocytosis and membrane trafficking. Although LLPS has been implicated in clathrin-mediated pathways, the contribution of adaptor proteins to condensate formation and function remains unclear. Here we show that two yeast adaptors, Ent5 and Sla2, undergo LLPS in vitro and this property correlates with their roles in membrane trafficking and condensate recruitment in vivo. Ent5 condensation is driven by a dynamic helix within its disordered region that acts as a molecular
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cells are densely packed with macromolecules, creating a crowded environment that fundamentally alters water's hydrogen bond (H-bond) networks. H-bond networks, typically dynamic and tetrahedral in bulk water, are disrupted by macromolecular surfaces, confinement, and competitive solute interactions. Subtle shifts in H-bond lifetimes, connectivity, and reorientation dynamics cascade into large-scale biological consequences-modulating protein folding, enzymatic function, and liquid-liquid phase separation. This chapter highlights how recent advances in time-resolved vibrational spectroscopy (e.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solid-like protein deposits found in aged and diseased human brains have revealed a relationship between insoluble protein accumulations and the resulting deficits in neurologic function. Clinically diverse neurodegenerative diseases, including Alzheimer's disease, Parkinson's disease, frontotemporal lobar degeneration, and amyotrophic lateral sclerosis, exhibit unique and disease-specific biochemical protein signatures and abnormal protein depositions that often correlate with disease pathogenesis. Recent evidence indicates that many pathologic proteins assemble into liquid-like protein phase
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural biology is moving beyond the determination of static molecular structures toward quantitative descriptions of biomolecular mechanisms. Modern questions increasingly focus on conformational heterogeneity, exchange kinetics, weak and transient interactions, allostery, disorder, assembly, and phase behavior. These properties are often difficult to infer from crystallography, cryo-electron microscopy, scattering, imaging, mass spectrometry, molecular simulations, or structural prediction alone. Solution NMR spectroscopy occupies a distinctive position in this integrated landscape becaus
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid-liquid phase separation, a process facilitating biomolecular condensate formation, plays a critical role in various pathologies, including tumorigenesis, metabolic disorders, and neurodegenerative diseases. Dysregulated phase separation has been linked to tumor initiation and progression. However, the pathological significance of phase separation in primary tumors of mice remains largely unexplored. We constructed a series of primary liver cancer models via hydrodynamic tail vein injection and confirmed that endogenous Yes-associated protein (YAP) formed numerous condensates in primary
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tunable control over biomolecular phase transitions provides a powerful blueprint for engineering functional soft materials, yet generalizable protein scaffolds capable of rewiring pathological condensates remain largely unexplored. Here, we demonstrate that zinc finger (ZF) proteins function as programmable interaction units that modulate neurodegenerative amyloid liquid-liquid phase separation, redirect β-sheet-rich fibrillation toward nontoxic assemblies, and actively disassemble preformed fibrils. Multiscale investigations spanning molecular, cellular, and organismal levels reveal that tan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Signaling proteins often form biomolecular condensates through liquid-liquid phase separation (LLPS) during intracellular signal transduction. Modulating the LLPS property of intracellular protein condensates will redirect intracellular signals and provide a potential way to regulate cellular physiology. Phosphorylation of multiple tyrosine residues of the transmembrane receptor nephrin is known to drive the LLPS of the adaptor protein Nck and neuronal Wiskott-Aldrich Syndrome protein (N-WASP) and form the Nck signaling complex. Phosphorylation of the translocated intimin receptor (Tir) in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular stress induces profound changes in cytoskeletal organization and biomolecular condensate formation. Traditional approaches for monitoring cellular stress often require multi-component biosensors, endpoint staining procedures, or indirect biochemical measurements. Here, we describe a protocol for the use of OptoProfilin, a genetically encoded single-component optogenetic biosensor derived from Profilin-1 fused to Cryptochrome 2 (Cry2) and mCherry. Following transient expression in mammalian cells, OptoProfilin exhibits light-dependent localization to focal adhesions under non-stressed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative diseases involve toxic protein aggregation. Recent evidence suggests that biomolecular phase separation, a process in which proteins and nucleic acids form dynamic, liquid-like condensates, plays a key role in this aggregation. Optogenetics, originally developed to control neuronal activity with light, has emerged as a powerful tool to investigate phase separation in living systems. This is achieved by fusing disease-associated proteins to light-sensitive oligomerization domains, enabling researchers to induce or reverse condensate formation with precise spatial and temporal
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates formed via liquid-liquid phase separation (LLPS) are essential for cellular organization. α-Synuclein, an amyloidogenic protein linked to Parkinson's Disease (PD), undergoes phase separation at high concentrations, but the influence of lipid membranes on this process remains unclear. Here, combining in vitro reconstitution, cell biology, and simulations, we show that membranous interfaces promote α-Synuclein condensation at physiologically relevant sub-critical concentrations ( ~ 10 nM) without crowding agents. Notably, condensation occurs only on membranes with a spec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The blood-testis barrier is essential for sperm development but also blocks the delivery of non-hormonal male contraceptives and other germ-cell-targeting therapies. However, how this barrier opens and closes in a controlled manner remains poorly understood. Here we show that the barrier exhibits time-of-day-dependent changes in permeability, allowing drugs to enter selectively during the light phase while remaining sealed during the dark phase. This gating mechanism is driven by daily fluctuations in testosterone. When testosterone rises at night, it activates calcium channels in supporting c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid-liquid phase separation (LLPS) and biomolecular condensates formation in crowded bio-milieus are of paramount importance for cell compartmentalization. A topic of biophysics relevance is the responsiveness of the condensates to environmental stimuli. Here, we investigated solutions of bovine serum albumin (BSA) and polyethylene glycol of average molecular weight of 5000 Da (PEG5k) subject up to nc = 7 consecutive cooling cycles. The LLPS and condensate formation were assessed by temperature-dependent optical density measurements at 400 nm (OD400) and by microscopy observations, respecti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular amyloid-beta (Aβ) plaques and intracellular neurofibrillary tangles (NFTs) composed of hyperphosphorylated Tau are the two main pathological hallmarks of Alzheimer's disease (AD). Although the co-occurrence and synergistic effects of Aβ and Tau are well established, the mechanisms underlying their interplay in a biomolecular condensate environment remain unclear. Here we show that Aβ40 does not undergo liquid-liquid phase separation (LLPS) but significantly enhances Tau phase separation and is recruited into Tau condensates. This recruitment alters condensate physicochemical prop
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования