Allosteric and cryptic binding pockets represent a vast underexploited frontier in drug discovery, offering routes to biological targets historically considered undruggable. The absence of apparent binding pockets in the global conformations of apo structures, together with limitations in availability of chemical probes and experimental structures for novel targets, makes the identification of allosteric and cryptic sites particularly challenging. Despite their ability to reveal transient and otherwise inaccessible pockets, computational methods remain underutilized for allosteric and cryptic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetes mellitus is a global chronic metabolic disorder characterized by elevated blood glucose levels, primarily due to impaired insulin activity or secretion. α-amylase, a key enzyme in carbohydrate digestion, is a validated molecular target for controlling postprandial hyperglycemia in type 2 diabetes.
OBJECTIVES: This study aimed to identify potential α-amylase inhibitors from phytochemicals derived from Bauhinia forficata, Citrus spp. and Echinops ritro using an in-silico approach.
METHODS: A total of 55 phytochemicals were virtually screened against human pancreatic α-amyl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Propranolol, a non-selective β-blocker, exerts anti-inflammatory and neuroprotective effects beyond cardiovascular use. However, its role in autophagy remains unclear, despite the relevance of autophagy to neuroinflammatory conditions such as Parkinson's disease. This study integrated in vitro and in silico approaches to explore propranolol's potential modulation of autophagy-related signaling in enteric glial cells (EGCs) under inflammatory stress. EGCs, the representatives of brain astrocytes, were treated with rotenone (10 μM) to induce inflammation, ±propranolol co-treatment (10 and 50 μM)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Globally, RSV is a major contributor to severe lower respiratory tract infections among children. Despite the significant medical concern posed by RSV, efforts to develop effective vaccines and antiviral drugs have largely fallen short, with the exception of immune prophylaxis available only for specific high-risk infants. We employed a suite of computational tools to investigate the role of microRNAs in the host's response to RSV infection. miRanda and RNAHybrid were instrumental in predicting microRNA-mRNA binding sites. For a deeper structural analysis, MC-Fold and MC-Sym were used to predi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Leptospirosis is a zoonotic disease caused by Leptospira interrogans and represents a major public health and veterinary concern. The persistence of the pathogen is closely associated with biofilm formation, yet targeted therapeutics are currently unavailable. The GroEL chaperonin, a conserved protein involved in biofilm formation and immunogenicity, was investigated as a potential therapeutic target.
METHODS: A structure-based virtual screening approach was performed using a library of 543,503 natural compounds from the Life Chemicals database. Top-ranked ligands were evaluated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work collects the spin-dependent leading-order relativistic and quantum-electrodynamical corrections for the electronic structure of atoms and molecules within the nonrelativistic quantum electrodynamics framework. We report the computation of perturbative corrections using an explicitly correlated Gaussian basis set, which allows high-precision computations for few-electron systems. In addition to numerical tests for triplet Be, triplet H2, and triplet H3 + states and comparison with no-pair Dirac-Coulomb-Breit Hamiltonian energies, numerical results are reported for electronically excit
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deucravacitinib (Sotyktu) stands out as a novel and highly specific oral inhibitor targeting tyrosine kinase 2 (TYK2). Its mechanism of action involves an allosteric binding, to catalytically inactive pseudokinase domain of TYK2, this stabilizes an inhibitory contact between the catalytic and regulatory domains. This inhibition of Janus kinase (JAK) is associated with suppression of cytokine signaling using diverse molecules defining wide importance in current research. In our recent investigation, we examined the selectivity of the TYK2JH2 inhibitor, deucravacitinib, against four JAK kinases
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sleep disorders, such as insomnia and narcolepsy, significantly impact quality of life. They are often associated with long-term health consequences, including cardiovascular disease, immune dysfunction, and cognitive impairment. While traditional treatments, such as sedatives and hypnotics, can be effective, they are limited by issues of tolerance and dependence. The orexinergic system, particularly the orexin 1 receptor (OXR1), has emerged as a promising therapeutic target due to its central role in regulating sleep-wake cycles. In this study, we investigate the molecular interactions of thr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diverse chemical components of traditional Chinese medicine (TCM) exhibit significant therapeutic potential; however, the action mechanisms of these compounds often remain unclear. The use of drug-target prediction can aid in identifying the specific targets of TCM, thereby revealing their bioactivity and mechanisms. The efficiency, cost-effectiveness, and powerful predictive capabilities of artificial intelligence algorithms have led to their emergence as effective tools for accelerating drug-target interaction analysis. To systematically investigate TCM interaction mechanisms, we integra
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel Schiff base namely, (Z)-4-((3-cyano-4,6-dimethylpyridin-2-yl)amino)-N'-(2-oxoindolin-3-ylidene)benzohydrazide (H2BISH) (C1) and its corresponding metal acetate chelates; [Co2(HBISH)(CH3COO)3(H2O)2]·H2O (C2), [Ni(HBISH)(CH3COO)]·2.5H2O (C3) and [Cu(HBISH)(CH3COO)(H2O)] (C4) were prepared and characterized using elemental and spectroscopic (IR, UV-vis., nuclear magnetic resonance (1H&13C), electron paramagnetic resonance (ESR), mass and XRD measurements. IR spectral data revealed that H2BISH acts as monobasic in all metal complexes. The 1HNMR chemical shifts of the ligand protons are rel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A computational study of the encapsulation of a gaseous mixture of CO2 and SO2 in a Type II porous liquid is performed under different conditions. The system is composed of cryptophane-111 molecules dispersed in dichloromethane, and it is described using classic molecular dynamics at atomistic resolution. Gaseous CO2 tends to almost fully occupy cryptophane-111's cavities during the first phases of simulation, and, afterwards, it is surpassed by SO2's tendency for occupation. Calculations are performed at five different temperatures in the range of 273 K-310 K, finding a positive correlation b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorinated polar solvents, such as hexafluoro-2-propanol (HFIP), are known to denature proteins into α-helix-rich structures, a phenomenon of interest in protein engineering and fiber science. Molecular dynamics (MD) simulations offer a valuable approach to explore protein folding mechanisms. In the present study, steered molecular dynamics (SMD) simulations were conducted to stretch the polypeptide models along the α-helix axis in different solvents. The potential of mean force (PMF) associated with nonequilibrium stretching of the polypeptide chain was higher in HFIP than in water and varie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytochrome P450 3A (CYP3A) enzymes catalyze the metabolism of a wide range of endogenous and exogenous compounds. Genetic variations in the 3 CYP3A isoforms (CYP3A28, CYP3A74, and CYP3A76) may influence their expression and activity, leading to inter-individual differences in xenobiotic metabolism. In domestic cattle, understanding how genetic variations modulate CYP3A activity is crucial for both its therapeutic implications (clinical efficacy and adverse drug effects) and food safety (residues in foodstuff). Here, we updated the variant calling of CYP3As in 300 previously sequenced Piedmonte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contamination in food and the environment with fluoroquinolones (FQs) has become a serious threat to the global ecological balance and public health safety. Ofloxacin (OFL) is one of the most widely utilized sterilization agents in FQs. In the process of monitoring OFL, broad-spectrum monoclonal antibodies (mAb) cannot meet the demand for monospecific detection. Here, a computational chemistry-assisted hapten screening strategy was proposed in this study. Differences in the properties of antigenic epitopes were precisely extracted through a comprehensive comparative study of 16 common FQs mole
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroinflammation plays a vital role in Alzheimer's disease (AD) pathogenesis and other neurodegenerative disorders (NDs). Presently, only symptomatic treatments are available and no disease-modifying drugs are available for AD and other NDs. Thus, targeting AD-associated neuroinflammation with anti-inflammatory compounds and antioxidants has recently been given much focus. Now, flavonoids are being increasingly investigated as therapeutic agents to treat inflammation; apigenin has a neuroprotective effect. Iron dyshomeostasis plays a key role in sustaining the neuroinflammatory phenotype, hig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) has made many concerns for healthcare services especially, in finding useful therapeutic(s). Despite the scientists' struggle to find and/or creating possible drugs, so far there is no treatment with high efficiency for the disease. During the pandemic, researchers have performed some molecular analyses to find potential therapeutics out of both the natural and synthetic available medicines. Computer simulations and related data have shown a significant role in drug discovery and development before. In this field, antiviral drugs, phytochemicals, anti-inflam
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic raised by SARS-CoV-2 is a public health emergency. However, lack of antiviral drugs and vaccine against human coronaviruses demands a concerted approach to challenge the SARS-CoV-2 infection. Under limited resource and urgency, combinatorial computational approaches to identify the potential inhibitor from known drugs could be applied against risen COVID-19 pandemic. Thereof, this study attempted to purpose the potent inhibitors from the approved drug pool against SARS-CoV-2 main protease (Mpro). To circumvent the issue of lead compound from available drugs as antivirals,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: This study demonstrated potent inhibitors against COVID-19 using the molecular docking approach of FDA approved viral antiprotease drugs.
BACKGROUND: COVID-19 has now spread throughout world. There is a serious need to find potential therapeutic agents. The 3C-like protease (Mpro/6LU7) is an attractive molecular target for rational anti-CoV drugs.
METHODS: The tertiary structure of COVID-19 Mpro was obtained from a protein data bank repository, and molecular docking screening was performed by Molegro Virtual Docker, ver. 6, with a grid resolution of 0.30 Å. Docking scores (DOS) are repr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The investigation of biological systems involving all organs of the body including the skin is in era of big data. This requires heavy-duty computational tools, and novel statistical methods. Microarrays have allowed the interrogation of thousands of common genetic markers in thousands of individuals from the same population (termed genome wide association studies or GWAS) to reveal common variation associated with disease or phenotype. These markers are usually single nucleotide polymorphisms (SNPs) that are relatively common in the population. In the case of dermatological diseases such as a
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: We aimed at evaluating the relation of 18F-sodium fluoride (18F-NaF) uptake on positron emission tomography (PET) to coronary atherosclerosis detected and assessed by computed tomography (CT).
METHODS: Thirty-two patients with one or more coronary atherosclerotic lesions detected on cardiac CT underwent 18F-NaF PET/CT. Each coronary atherosclerotic lesion was evaluated on CT angiography for plaque types (calcified plaque [CP], non-calcified plaque [NCP], partially calcified plaque [PCP]), and the presence of CT-based high-risk features (minimum CT density <30 Hounsfield u
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.