The tuberous sclerosis complex (TSC) is a negative regulator of mTOR complex 1, a signaling node promoting cellular growth in response to various nutrients and growth factors. However, several regulators in TSC signaling still await discovery and characterization. Using pulldown and MS approaches, here we identified the TSC complex member, TBC1 domain family member 7 (TBC1D7), as a binding partner for PH domain and leucine-rich repeat protein phosphatase 1 (PHLPP1), a negative regulator of Akt kinase signaling. Most TBC domain-containing proteins function as Rab GTPase-activating proteins (Rab
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In plants, the regulation of transgene transcription is typically achieved using chemical agents. A safe alternative to chemically induced systems may be optogenetic systems. The BphP1-QPAS1 system has distinct advantages over other optogenetic systems, as it is activated by near-infrared (NIR, 780 nm) light, which is beyond the spectrum of plant photoreceptors. This system is based on the use of a split transcription factor (TF), consisting of the DNA-binding and dimerization domains of the yeast TF Gal4, fused to the QPAS1 component, along with the transactivation domain VP16 fused to BphP1.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ERF-VII gene family, a critical branch of the AP2/ERF superfamily, is central to plant stress adaptation. However, its evolutionary history and function in tea plant (Camellia sinensis) remain unclear. Here, we performed integrated evolutionary, genomic, and functional analyses of ERF-VII genes across 14 plant lineages and 20 tea plant cultivars. The phylogenetic analysis revealed that ERF-VII proteins originated after vascular plant divergence, coinciding with the emergence of the N-terminal MCGGA/I motif linked to the oxygen-dependent N-degron pathway. Gymnosperms retained few conserved
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukemia (AML) remains a therapeutic challenge due to complex oncogenic networks, including the often-undruggable MYC pathway. Here, we present an integrated in silico framework combining transcriptomic analysis, machine learning, and molecular dynamics (MD) simulations to explore potential therapeutic approaches targeting vault RNA1-1 (VTRNA1-1) in AML. RNA-seq profiling revealed that VTRNA1-1 depletion is associated with a profound disruption of the MYC and FOXM1 regulatory axes. To highlight compounds capable of recapitulating this transcriptomic signature, we developed a mach
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic modulators of the histone deacetylase (HDAC) family control key biological processes and are frequently dysregulated in cancer. There is superior activity of HDAC inhibitors (HDACi) in patients with myeloproliferative neoplasms (MPNs) that carry the Janus kinase-2 point mutant JAK2V617F. This constitutively active tyrosine kinase activates signal-transducer-and-activator-of-transcription (STAT) transcription factors to promote cell proliferation and inflammatory processes. We reveal that the inhibition of HDAC1/HDAC2 with the clinically advanced HDACi romidepsin, the experimental HD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Azole resistance in the pathogenic yeast Candida glabrata is a serious clinical complication and increasing in frequency. The majority of resistant organisms have been found to contain a substitution mutation in the Zn2Cys6 zinc cluster-containing transcription factor Pdr1. These mutations typically lead to this factor driving high, constitutive expression of target genes like the ATP-binding cassette transporter-encoding gene CDR1. Overexpression of Cdr1 is required for the observed elevated fluconazole resistance exhibited by strains containing one of these hyperactive PDR1 alleles. While th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability to remotely control the activity of chimeric antigen receptors (CARs) with small molecules can improve the safety and efficacy of gene-modified T cells. Split ON- or OFF-switch CARs involve the dissociation of tumor-antigen binding from T cell activation (i.e., CD3ζ) on the receptor (R-) and signaling (S-) chains, respectively, that either associate or are disrupted in the presence of a small molecule. Here, we have developed an inducible (i)ON-CAR comprising the anti-apoptotic B cell lymphoma protein 2 protein in the ectodomain of both chains which associate in the presence of ven
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii resides in its intracellular niche by employing a series of specialized secretory organelles that play roles in invasion, host-cell manipulation and parasite replication. Rab GTPases are major regulators of the parasite's secretory traffic that function as nucleotide dependent molecular switches to control vesicle trafficking. While many of the Rab proteins have been characterized in T. gondii , precisely how these Rabs are regulated remains poorly understood. To better understand the parasite's secretory traffic, we investigated the entire family of Tre2-Bub2-Cdc16 (TBC)-dom
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Notch receptors participate in a signaling pathway in which ligand-induced proteolysis frees the Notch intracellular domain (NICD), allowing it to translocate to the nucleus, form a transcription complex, and induce target gene expression. Chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma (CLL/SLL), splenic marginal zone B-cell lymphoma (SMZL), and distinct subsets of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) are strongly associated with mutations in the 3' end of NOTCH1 or NOTCH2 that disrupt a proline, glutamic acid, serine, and threonine (PEST) degron domain and stabilize NICD1 and NICD2.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gluconeogenesis, the reverse process of glycolysis, is a favorable mechanism at conditions of glucose deprivation. Pck1 is a rate-limiting gluconeogenic enzyme, where its deficiency or mutation contributes to serious clinical situations as neonatal hypoglycemia and liver failure. A recent report confirms that Pck1 is a target for proteasomal degradation through its proline residue at the penultimate position, recognized by Gid4 E3 ligase, but with a lack of informative structural details. In this study, we delineate the localized sequence motif, degron, that specifically interact with Gid4 lig
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Glioblastoma (GBM) is the most aggressive and lethal primary brain tumor, and elucidating the molecular determinants of its malignant progression is essential for improving patient outcomes. NTAN1 encodes N-terminal asparagine amidase 1, a component of the N-degron pathway involved in selective protein turnover; however, its role in GBM remains unclear. This study aimed to investigate the clinical significance and biological function of NTAN1 in GBM. Methods: Integrated analyses of The Cancer Genome Atlas (TCGA) transcriptomic and clinical data were performed, together w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an Apicomplexan parasite that possesses a well-developed system of scavengers of reactive oxygen species (ROS). Among its components, T. gondii mitochondrial superoxide dismutase (TgSOD2) is essential, as predicted by the CRISPR phenotype index and evidenced by the non-viability of its constitutive knockouts. As an obligate intracellular parasite, TgSOD2 is upregulated during extracellular stages. Herein, we generated a viable TgSOD2 knockdown mutant using an inducible auxin-degron system to explore the biological role of TgSOD2 in T. gondii. Depletion of TgSOD2 led to imp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Toxoplasma gondii cannot synthesize purines de novo and must import them; however, the functional interplay among its four equilibrative nucleoside transporters (ENTs) homologs remains unclear. We systematically deconstructed this network by combining CRISPR-Cas9 knockouts with an auxin-inducible degron. Across all phenotypic assays, tachyzoite replication, nucleoside-analog sensitivity, alkaline-stress-induced differentiation, and murine cyst formation, the ΔTgENT2 strain was indistinguishable from the parental line, indicating that TgENT2 is dispensable under the conditions teste
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In humans, two ubiquitously expressed N-myristoyltransferases, NMT1 and NMT2, catalyze myristate transfer to proteins to facilitate membrane targeting and signaling. We investigated the expression of NMTs in numerous cancers and found that NMT2 levels are dysregulated by epigenetic suppression, particularly so in hematologic malignancies. This suggests that pharmacological inhibition of the remaining NMT1 could allow for the selective killing of these cells, sparing normal cells with both NMTs.
METHODS AND RESULTS: Transcriptomic analysis of 1200 NMT inhibitor (NMTI)-treated cance
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii resides in its intracellular niche by employing a series of specialized secretory organelles that play roles in invasion, host cell manipulation, and parasite replication. Rab GTPases are major regulators of the parasite's secretory traffic that function as nucleotide-dependent molecular switches to control vesicle trafficking. While many of the Rab proteins have been characterized in T. gondii, precisely how these Rabs are regulated remains poorly understood. To better understand the parasite's secretory traffic, we investigated the entire family of Tre2-Bub2-Cdc16 (TBC) dom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In apicomplexan parasites, the macroautophagy/autophagy machinery is repurposed to maintain the plastid-like organelle apicoplast. Previously, we showed that in Toxoplasma and Plasmodium, ATG12 interacts with ATG5 in a non-covalent manner, in contrast to the covalent interaction in most organisms. However, it remained unknown whether apicomplexan parasites have functional orthologs of ATG16L1, a protein that is essential for the function of the covalent ATG12-ATG5 complex in vivo in other organisms. Furthermore, the mechanism used by the autophagy machinery to maintain the apicoplast is unclea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soil salinization/alkalization represents a universal challenge that severely constrains crop productivity. Elucidating the molecular mechanisms underpinning saline/alkaline tolerance of wheat (Triticum aestivum) holds profound significance for global food security and sustainable agriculture. In this study, we functionally characterized a wheat alkaline sensitive locus designated Wheat Alkaline Sensitive 1 (WAS1), through whole exome-capture sequencing-based bulked segregant analysis and fine mapping of was1 mutant populations. This locus encodes TaIAA25, a canonical member of the Auxin/Indol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-structural protein 3 (nsp3), the largest multifunctional membrane-associated protein encoded by coronaviruses, contains a papain-like protease (PLpro) domain that cleaves viral polypeptides at the nsp1/nsp2, nsp2/nsp3 and nsp3/nsp4 junctions, as well as host substrates such as polyubiquitin chains and ISG15. While host substrate recognition by PLpro is well characterized, the processes by which PLpro identifies and interacts with membrane-associated viral substrates remains poorly defined. In this study, we developed full-length nsp3-containg reporter constructs to investigate PLpro-mediat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite that relies on a complex network of protein kinases to regulate essential processes such as invasion, replication, and egress. The Toxoplasma genome encodes approximately 159 kinases, yet only a small subset has been characterized. Our group is interested in defining the role of cell cycle-regulated kinases important for Toxoplasma fitness. In this study, we investigated the role of an uncharacterized, cell cycle-regulated cytoplasmic kinase, which we named TgCRCK1, in parasite biology and pathogenesis. Using endogenous tagging and immuno
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Epigenetic alterations at cis-regulatory elements (CRE) fine-tune transcriptional output. Epigenetic readers interact with CREs and can cooperate with other chromatin regulators to drive oncogene transcription. Here, we found that the YEATS domain-containing histone acetylation reader ENL (eleven-nineteen leukemia) acts as a key regulator of super-enhancers (SE), which are highly active distal CREs, across cancer types. ENL occupied the majority of SEs with substantially higher preference over typical enhancers, and the enrichment of ENL at SEs depended on its ability to bind acety
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования