Diverse viral suppressors of RNA interference (RNAi) and RNA silencing (VSRs) interact directly with core protein and/or RNA components of the host RNAi pathway. However, the specific counter-defense function of any VSR biochemical activity is fully validated only when it is shown as essential for viral infection in the wild-type but not mutant hosts defective in antiviral RNAi. Here, we investigated the role of VSR activities for direct binding to small-interfering RNA duplexes (siRNA), long double-stranded RNA (dsRNA), or RNA-dependent RNA polymerase 1 (RDR1) during plant infection by wild-t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A virus with a large genome was identified in the transcriptome of the potato aphid (Macrosiphum euphorbiae) and was named Macrosiphum euphorbiae virus 1 (MeV-1). The MeV-1 genome is 22 780 nt in size, including 3' and 5' non-coding regions, with a single large ORF encoding a putative polyprotein of 7333 aa. The C-terminal region of the predicted MeV-1 polyprotein contained sequences with similarities to helicase, methyltransferase and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) motifs, while the N-terminal region lacked any motifs including structural proteins. Phylogenetic analysis of the helicase p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All eukaryotes possess three DNA-dependent RNA polymerases, Pols I-III, while land plants possess two additional polymerases, Pol IV and Pol V. Derived through duplication of Pol II subunits, Pol IV produces 24-nt short interfering RNAs that interact with Pol V transcripts to target de novo DNA methylation and silence transcription of transposons. Members of the grass family encode additional duplicated subunits of Pol IV and V, raising questions regarding the function of each paralog. In this study, we identify a null allele of the putative Pol IV second subunit, NRPD2, and demonstrate that N
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant-parasitic cyst nematodes, such as Heterodera schachtii, cause substantial crop losses world-wide and induce specialized feeding structures in host roots, yet the molecular mechanisms underlying feeding structure initiation and development remain poorly understood. We introduce RNA tomography for plants, a powerful untargeted spatial transcriptomics technology that allows studying gene expression at high spatial resolution. We applied RNA tomography to Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) roots infected with H. schachtii, capturing 96 consecutive cross sections of 20 micrometers at 1- and 2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aphids (order Hemiptera) are important insect pests of crops and are also vectors of many plant viruses. However, little is known about aphid-infecting viruses, particularly their diversity and relationship to plant viruses. To investigate the aphid viromes, we performed deep sequencing analyses of the aphid transcriptomes from infested barley plants in a field in Japan. We discovered virus-like sequences related to nege/kita-, flavi-, tombus-, phenui-, mononega-, narna-, chryso-, partiti-, and luteoviruses. Using RT-PCR and sequence analyses, we determined almost complete sequences of seven n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant disease resistance is a complex process that is maintained in an intricate balance with development. Increasing evidence indicates the importance of posttranscriptional regulation of plant defense by RNA binding proteins. In a genetic screen for suppressors of Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) accelerated cell death 6-1 (acd6-1), a small constitutive defense mutant whose defense level is grossly in a reverse proportion to plant size, we identified an allele of the canonical flowering regulatory gene FLOWERING LOCUS K HOMOLOGY DOMAIN (FLK) encoding a putative protein with triple K homolo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants respond to herbivore or pathogen attacks by activating specific defense programs that include the production of bioactive specialized metabolites to eliminate or deter the attackers. Volatiles play an important role in the interaction of a plant with its environment. Through transcript profiling of jasmonate-elicited Medicago truncatula cells, we identified Emission of Methyl Anthranilate (EMA) 1, a MYB transcription factor that is involved in the emission of the volatile compound methyl anthranilate when expressed in M. truncatula hairy roots, giving them a fruity scent. RNA sequencing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advance of metatranscriptomic sequencing, an increasing number of symbiotic viruses have been recognized in insects. These insect symbiotic viruses not only modulate key aspects of insect biology, including physiology, fecundity, development, and behavior, but also influence the vector competence of arthropods for transmitting arboviruses. The majority of such vectors belong to the orders Hemiptera and Diptera, which transmit a wide spectrum of plant and animal arboviruses. Although insect symbiotic viruses usually replicate exclusively within insect cells, several symbiotic viruses h
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nearly 10,000 plant species are represented by RNA-seq datasets in the NCBI sequence read archive, which are difficult to search in unassembled format due to database size. Here, we optimize RNA-seq assembly to transform most of this public RNA-seq data to a searchable database for biosynthetic gene discovery. We test our transcriptome mining pipeline towards the diversification of moroidins, which are plant ribosomally-synthesized and posttranslationally-modified peptides (RiPPs) biosynthesized from copper-dependent peptide cyclases. Moroidins are bicyclic compounds with a conserved stephanot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Plant-derived virus-like particles (VLPs) are emerging nanoplatforms for local cancer immunotherapy, yet their relative performance across structurally distinct particles remains insufficiently defined. Methods: We performed a comparative benchmarking study of eleven plant-derived VLPs spanning diverse architectures and functional properties using an integrated workflow of physicochemical characterization, immune-functional profiling, and in vivo evaluation. All VLPs were produced in endotoxin-minimized ClearColi BL21 (DE3), enabling assessment of intrinsic particle-associated immu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants face the challenge of balancing dynamic environmental stresses with internal developmental demands during growth, necessitating the precise regulation of gene expression networks to optimize resource allocation. Recent studies have shown that epigenetic regulatory systems, which serve as bridges between genotype and phenotype, enable plants to respond rapidly to environmental changes and facilitate adaptive evolution by establishing heritable epigenetic memory. This article systematically elucidates the molecular mechanisms by which core epigenetic processes coordinate plant growth and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhizobacteria are known to induce defense responses in plants without causing disease symptoms, resulting in increased resistance to plant pathogens. This study investigated how Streptomyces sp. strain AcH 505 suppressed oak powdery mildew infection in pedunculate oak, by analyzing RNA-Seq data from singly- and co-inoculated oaks. We found that this Streptomyces strain elicited a systemic defense response in oak that was, in part, enhanced upon pathogen challenge. In addition to induction of the jasmonic acid/ethylene-dependent pathway, the RNA-Seq data suggests the participation of the salicy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The convergence of nanotechnology and genome editing in plant sciences is redefining modern precision breeding through efficient, transgene free, tissue culture independent pathways for genetic improvement in crops. Conventional breeding and transgenic tools are limited to genotype dependency, inefficient gene delivery, unpredictable transgene insertions, thereby restricting their application in elite germplasm. Nanoparticles-mediated gene delivery systems have revolutionized the genetic transformation in plants through targeted and transgene free delivery of CRISPR/Cas ribonucleoproteins (RNP
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Geminiviruses employ multifunctional protein ammunition to evade robust plant defense pathways. Key viral proteins effectively manipulate host signaling mechanisms to create a permissive environment for viral replication. Rapid evolutionary adaptation of geminiviruses, synergized by the proliferation of insect vectors, creates a challenge for effective disease control. Current plant resistance against geminiviruses primarily relies on antiviral RNA silencing and the localized cell death mechanism as an outcome of the hypersensitive response. To win the escalating arms race between geminivirus
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Livestock manure is widely treated by anaerobic digestion (AD) followed by composting or conventional thermal treatment (70 °C, 30 min) prior to land application, yet the community‑level fate of RNA viruses across treatment chains remains undefined considering their potential ecological and public health risks. Here, we systematically characterized RNA viromes in raw manure, AD digestate, compost, and thermally treated digestate (70-90 °C, 30 min) using metatranscriptomics and RT-qPCR. A total of 7472 viral operational taxonomic units (vOTUs) were identified, with hosts spanning plants, verteb
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In plants, long-distance transport and phloem-mediated signal distribution play crucial roles in regulating stress adaptation and development. Phloem sap contains various types of RNAs, including small RNAs (sRNAs), messenger RNAs (mRNAs), and long noncoding RNAs (lncRNAs). Recently, endogenous circular RNAs have been identified in phloem sap of apple trees. Some phloem RNAs have been shown to have long-distance signaling functions, but for most, no functions have yet been determined. Due to their stability, circRNAs are interesting candidates with potential functions in long-distance signalin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Induction of plant resistance, either achieved by chemicals (systemic acquired resistance, SAR) or by rhizobacteria (induced systemic resistance, ISR) is a possible and/or complementary alternative to manage virus infections in crops. SAR mechanisms operating against viruses are diverse, depending on the pathosystem, and may inhibit virus replication as well as cell-to-cell and long-distance movement. Inhibition is often mediated by salicylic acid with the involvement of alternative oxidase and reactive oxygen species. However, salicylate may also stimulate a separate downstream pathway, leadi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phosphoinositide-3-OH-kinase-related kinases (PIKKs) are atypical protein kinases exclusive to eukaryotes. They mediate the cellular response to a range of stresses, including genome and RNA surveillance and availability of nutrients for growth. Orthologues of five out of the six PIKK family members are present in plant genomes. Recent studies in plant PIKKs have revealed features unique to, and in common with, other PIKKs. This review summarizes the basic knowledge of these proteins in mammals and yeast in comparison with what is known for Arabidopsis and other plants.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Most arthropod-borne viruses produce intermittent epidemics in infected plants. However, the underlying mechanisms of these epidemics are unclear. Here, we demonstrated that rice stripe mosaic virus (RSMV), a viral pathogen, significantly increases the mortality of its overwintering vector, the leafhopper species Recilia dorsalis. Cold-stress assays indicated that RSMV reduces the cold tolerance of leafhoppers, a process associated with the downregulation of leafhopper cuticular protein genes. An RSMV-derived small RNA (vsiR-t00355379) was found to facilitate the downregulation of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In plant–pathogen interactions, infection typically leads to growth inhibition or even host mortality. However, under certain environmental conditions, some pathogens can paradoxically enhance host fitness in response to stress. Viroids, such as potato spindle tuber viroid (PSTVd), are circular single-stranded RNAs that cause plant diseases. In this study, PSTVd was used as a model to investigate adaptive host–pathogen interactions under polyethylene glycol (PEG)-simulated drought stress. Tomato (Solanum lycopersicum) plants were infected with PSTVd and then subjected to drought treatment usin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования