Ribosomal decoding is an essential process in every living cell. During protein synthesis the 30S ribosomal subunit needs to accomplish binding and accurate decoding of mRNAs. From mutational studies and high-resolution crystal structures nucleotides G530, A1492 and A1493 of the 16S rRNA came into focus as important elements for the decoding process. Recent crystallographic data challenged the so far accepted model for the decoding mechanism. To biochemically investigate decoding in greater detail we applied an in vitro reconstitution approach to modulate single chemical groups at A1492 and A1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The translation initiation factor eif6 has been implicated as a regulator of ribosome assembly, selective mRNA translation and apoptosis. Many of these activities depend upon the phosphorylation of eif6 serine 235 by PKC. Previous data showed that eif6 binds to the 60S ribosomal subunit when unphosphorylated, inhibiting assembly with the 40S subunit. Phosphorylation of Ser235 releases eif6 from the 60S subunit and allows assembly. eif6 acts as an anti-apoptotic factor via regulation of the bcl2/bax balance and acts selectively upstream of bcl2. This activity also depends upon phosphorylation o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tetracycline class of antibiotics is widely used for treating bacterial diseases including Lyme disease, anthrax, acne vulgaris, and pneumonia. Using a series of high-resolution cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures, we show that tetracyclines can simultaneously target the mRNA decoding center in the 30S subunit and the nascent peptide exit tunnel (NPET) in the 50S subunit of the bacterial ribosome. Among the tested tetracyclines, Doxycycline was distinct in its ability to dimerize and bind the NPET at multiple locations. Structural comparison of Doxycycline, Minocycline, and Sarec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma cells exhibit elevated translation activity and rely on intact ribosomes to sustain their high protein synthesis demand. To support this process, efficient ribosome biogenesis is essential. RSL24D1 is a ribosome biogenesis factor required for late-stage maturation of the 60S ribosomal subunit. By ensuring correct ribosomal assembly, RSL24D1 supports global protein translation and maintains cellular homeostasis. Transcript and protein analyses revealed that RSL24D1 is upregulated in melanoma cells compared to normal human epidermal melanocytes. This overexpression correlates with reduc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomes, discovered in 1955 by George Palade, were initially described as small cytoplasmic particles preferentially associated with the endoplasmic reticulum (ER). Over the years, extensive research has focused on both the structure and function of ribosomes. However, a fundamental question - how many ribosomes are present within whole cells - has remained largely unaddressed. In this study, we developed a microscopic method to quantify the total number of ribosomes in hTERT-RPE-1 cells and in nematode cells from various tissues of Caenorhabditis elegans hermaphrodites. Using electron tomog
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apicomplexan parasites, including Toxoplasma gondii and Plasmodium falciparum, are major human pathogens that cause toxoplasmosis and malaria, respectively. The existing structures of T. gondii translational machinery are from empty ribosomes that lack several key components, including ribosomal protein RACK1 (Receptor for Activated C Kinase 1). Here, we used cryo-electron microscopy (cryoEM) to determine high-resolution structures of T. gondii ribosomal complexes, including a translating 80S ribosome bound to mRNA and tRNA. These structures reveal that RACK1 occupies the conserved binding sit
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have used the membrane-impermeable, thiol-cleavable, crosslinker 3,3'-dithio bis (sulfosuccinimidylpropionate) to identify proteins that are in the vicinity of membrane-bound ribosomes of the RER. A specific subset of RER proteins was reproducibly crosslinked to the ribosome. Immunoblot analysis of the crosslinked products with antibodies raised against signal recognition particle receptor, ribophorin I, and the 35-kD subunit of the signal sequence receptor demonstrated that these translocation components had been crosslinked to the ribosome, but each to a different extent. The most promine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Local translation in growth cones plays a critical role in responses to extracellular stimuli, such as axon guidance cues. We previously showed that brain-derived neurotrophic factor activates translation and enhances novel protein synthesis through the activation of mammalian target of rapamycin complex 1 signaling in growth cones of dorsal root ganglion neurons. In this study, we focused on 40S ribosomal protein S6 (RPS6), 60S ribosomal protein P0/1/2 (RPP0/1/2), and actin filaments to determine how localization of ribosomal proteins changes with overall protein synthesis induced by neurotro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis remains a threat to global health, and a more efficacious vaccine is needed to prevent disease caused by M. tuberculosis We previously reported that the mycobacterial ribosome is a major target of CD4+ T cells in mice immunized with a genetically modified Mycobacterium smegmatis strain (IKEPLUS) but not in mice immunized with Mycobacterium bovis BCG. Two specific ribosomal proteins, RplJ and RpsA, were identified as cross-reactive targets of M. tuberculosis, but the breadth of the CD4+ T cell response to M. tuberculosis ribosomes was not determined. In the present st
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kasugamycin (KSG) is an aminoglycoside antibiotic widely used in agriculture and exhibits considerable medical potential. Previous studies suggested that KSG interferes with translation by blocking binding of canonical messenger RNA (mRNA) and initiator transfer tRNA (tRNA) to the small ribosomal subunit, thereby preventing initiation of protein synthesis. Here, by using genome-wide approaches, we show that KSG can interfere with translation even after the formation of the 70S initiation complex on mRNA, as the extent of KSG-mediated translation inhibition correlates with increased occupancy o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aborted translation produces large ribosomal subunits obstructed with tRNA-linked nascent chains, which are substrates of ribosome-associated quality control (RQC). Bacterial RqcH, a widely conserved RQC factor, senses the obstruction and recruits tRNAAla(UGC) to modify nascent-chain C termini with a polyalanine degron. However, how RqcH and its eukaryotic homologs (Rqc2 and NEMF), despite their relatively simple architecture, synthesize such C-terminal tails in the absence of a small ribosomal subunit and mRNA has remained unknown. Here, we present cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two species of hookworms from genus Uncinaria have been found so far in Poland. Uncinaria stenocephala infects mainly dog, wolf and red fox, whereas Uncinaria criniformis is a parasite of mustelids (but it was also reported from red fox). 19 male and 29 female hookworms from red foxes have been compared with 10 male and 12 female worms from dogs. Hookworms from dogs were generally smaller than these from foxes, but no other morphological differences could be found. These hookworms were qualified to species Uncinaria stenocephala on the ground of morphology of male. Genomic DNA samples have bee
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in a broad variety of genes can provoke the severe childhood disorder trichothiodystrophy (TTD) that is classified as a DNA repair disease or a transcription syndrome of RNA polymerase II. In an attempt to identify the common underlying pathomechanism of TTD we performed a knockout/knockdown of the two unrelated TTD factors TTDN1 and RNF113A and investigated the consequences on ribosomal biogenesis and performance. Interestingly, interference with these TTD factors created a nearly uniform impact on RNA polymerase I transcription with downregulation of UBF, disturbed rRNA processing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eudistomin C (EudiC), a natural product, shows potent antitumor and antiviral activities, but the target molecule and the mechanism of action remain to be revealed. Here, we show that the 40S ribosome is the target in EudiC cytotoxicity. We isolated EudiC-resistant mutants from a multidrug-sensitive yeast strain, and a genetic analysis classified these YER (yeast EudiC resistance) mutants into three complementation groups. A genome-wide study revealed that the YER1-6 mutation is in the uS11 gene (RPS14A). Biotinylated EudiC pulled down Rps14p-containing complexes from 40S and 80S ribosomes, bu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Propiconazole is a widely used triazole fungicide and a pervasive contaminant in aquatic systems. However, its neurotoxic potential and underlying mechanisms remain poorly understood. This study investigated the neurobehavioral effects of propiconazole on adult zebrafish (Danio rerio) at two environmentally realistic concentrations (20 and 180 μg/L) selected to bracket realistic environmental exposure scenarios. A comprehensive analysis combining behavioral tests, transcriptomics, metabolomics, qRT-PCR and Western blotting validation was conducted. Our results demonstrated that propiconazole e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a fatal cancer with poor prognosis. COP9 signalosome subunit 6 (CSN6), a key regulator of different E3 ubiquitin ligases, plays oncogenic roles in various cancers. However, its function in PDAC remains elusive. Here, this demonstrates that human PDAC tumors expressing high levels of CSN6 present with poor prognosis and gemcitabine resistance. Conditional knockout (KO) of CSN6 hinders tumor formation in a KPP spontaneous PDAC mouse model. Proteomic analysis indicates that CSN6 promotes ribosome biogenesis by activating rDNA transcription and protein sy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lasso peptides are ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) with mechanically constrained structures that provide high stability and target selectivity. Among them, lariocidin (LAR), produced by Paenibacillus sp. M2, represents a recently discovered peptide antibiotic with a ribosome-targeting mechanism distinct from classical antibacterial agents. lariocidin binds a distinct site within the bacterial 30S ribosomal subunit, involving interactions with 16S rRNA and aminoacyl-tRNA, thereby disrupting protein synthesis through translocation inhibition and miscodi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies in eukaryotic ribosome biogenesis have largely been performed in yeast, where they have described a highly complex process involving numerous protein and RNA components. Due to the complexity and crucial nature of this process, a number of checkpoints are necessary to ensure that only properly assembled ribosomes are released into the cytoplasm. Assembly of the 5S ribonucleoprotein (RNP) complex is one of these checkpoints for late-stage 60S subunit maturation. Studies in Saccharomyces cerevisiae have identified the 5S rRNA and four proteins, L5, L11, Rpf2, and Rrs1, as comprising the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella species (Brucella spp.) are facultative intracellular zoonotic pathogens responsible for brucellosis, a disease causing substantial global public health and economic burdens. Rifampicin remains a first-line therapeutic agent, but the molecular mechanisms underlying rifampicin resistance in Brucella remain poorly defined, especially the contribution of ribosome-associated regulatory proteins. HflX is a conserved ribosome-binding GTPase involved in ribosomal quality control and antibiotic resistance, yet its role in rifampicin resistance has not been reported. Here, we constructed hflX
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) is a complex human retrovirus that causes adult T cell leukemia and of HTLV-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis. The mRNA of some complex retroviruses, including the human and simian immunodeficiency viruses (HIV and SIV), can initiate translation using a canonical cap-dependent mechanism or through an internal ribosome entry site (IRES). In this study, we present strong evidence showing that like HIV-1 and SIV, the 5'-untranslated region (5'UTR) of the HTLV-1 full-length mRNA harbors an IRES. Cap-independent translatio
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования