Background and Objectives: The ubiquitin proteosome system (UPS) is a non-lysosomal pathway that functions in all eukaryotes. The transport of polyubiquitinated proteins to proteosomes takes place via the p97/Valosin-containing protein (VCP) chaperone protein. The p97/VCP binds to polyubiquitinated proteins, allowing these proteins to reach the proteasome and, thus, their destruction. In the case of p97/VCP deficiency, ubiquitinated proteins accumulate in the cell cytoplasm, and their subsequent failure to break down produces various pathological conditions. Small VCP interacting protein (SVIP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubc13 is required for Lys63-linked polyubiquitination and innate immune responses in mammals, but its functions in plant immunity still remain largely unknown. Here, we used molecular biological, pathological, biochemical, and genetic approaches to evaluate the roles of rice OsUbc13 in response to pathogens. The OsUbc13-RNA interference (RNAi) lines with lesion mimic phenotypes displayed a significant increase in the accumulation of flg22- and chitin-induced reactive oxygen species, and in defence-related genes expression or hormones as well as resistance to Magnaporthe oryzae and Xanthomonas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cytokines such as tumor necrosis factor-α (TNFα) have been implicated in cardiac dysfunction and toxicity associated with doxorubicin (DOX). Although TNFα can elicit different cellular responses, including survival or death, the mechanisms underlying these divergent outcomes in the heart remain cryptic. The E3 ubiquitin ligase TRAF2 (TNF receptor associated factor 2) provides a critical signaling platform for K63-linked polyubiquitination of RIPK1 (receptor interacting protein 1), crucial for nuclear factor-κB (NF-κB) activation by TNFα and survival. Here, we investigate alteration
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ebola virus (EBOV), a member of the Filoviridae family, is a highly pathogenic virus that causes severe hemorrhagic fever in humans and is responsible for epidemics throughout sub-Saharan, central, and West Africa. The EBOV genome encodes VP35, an important viral protein involved in virus replication by acting as an essential cofactor of the viral polymerase as well as a potent antagonist of the host antiviral type I interferon (IFN-I) system. By using mass spectrometry analysis and coimmunoprecipitation assays, we show here that VP35 is ubiquitinated on lysine 309 (K309), a residue located on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Legionella pneumophila Sde family of translocated proteins promotes host tubular endoplasmic reticulum (ER) rearrangements that are tightly linked to phosphoribosyl-ubiquitin (pR-Ub) modification of Reticulon 4 (Rtn4). Sde proteins have two additional activities of unclear relevance to the infection process: K63 linkage-specific deubiquitination and phosphoribosyl modification of polyubiquitin (pR-Ub). We show here that the deubiquitination activity (DUB) stimulates ER rearrangements while pR-Ub protects the replication vacuole from cytosolic surveillance by autophagy. Loss of DUB activity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of chromosome 16q is a recurrent genomic alteration in bladder and prostate cancers and is associated with poor clinical outcomes. However, the mechanisms by which 16q loss contributes to tumor progression remain poorly understood. Here, we identify the deubiquitinase CYLD as a major contributor to genomic instability associated with chromosome 16q deletion. Mechanistically, CYLD stabilizes the 53BP1 regulator TIRR by removing K48-linked polyubiquitin chains, thereby preventing excessive accumulation of 53BP1 at sites of DNA damage and maintaining efficient homologous recombination repair
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein homeostasis is crucial for maintaining cardiomyocyte (CM) function. Disruption of proteostasis results in accumulation of protein aggregates causing cardiac pathologies such as hypertrophy, dilated cardiomyopathy (DCM), and heart failure. Here, we identify ubiquitin-specific peptidase 5 (USP5) as a critical determinant of protein quality control (PQC) in CM. CM-specific loss of mUsp5 leads to the accumulation of polyubiquitin chains and protein aggregates, cardiac remodeling, and eventually DCM. USP5 interacts with key components of the proteostasis machinery, including PSMD14, and the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
E3 ligases and RNA-binding protein-mediated dysregulation of proinflammatory cytokines leads to autoimmune and inflammatory diseases. However, whether RNA-binding E3 ligases can regulate specific proinflammatory cytokine expression remains unclear. Here we found that the RNA-binding E3 ligase MKRN2 selectively inhibits the expression of interleukin-6 (IL-6) in lipopolysaccharide-activated macrophages. LysM-Cre+Mkrn2fl/fl mice showed increased amounts of IL-6 in the serum after lipopolysaccharide treatment and exhibited increased severity of experimental colitis, which was associated with incre
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deubiquitinating enzymes play crucial roles in various cellular activities, yet their involvement in central nervous system (CNS) vascularization and barrier function remains elusive. Canonical Wnt signaling is essential for proper CNS vascularization and barrier maintenance. Using a loss-of-function screening for Wnt-signaling activity, we identified ubiquitin-specific peptidase 9 X-linked (USP9X) as a key regulator in brain endothelial cells (BECs). Endothelium-specific Usp9x knockout mice exhibit reduced Wnt-signaling activity, compromising CNS vascularization and barrier function during de
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic effectively treats acute promyelocytic leukemia by inducing SUMO and ubiquitin-dependent degradation of the promyelocytic leukemia (PML)-retinoic acid receptor alpha oncogenic fusion protein. However, some patients relapse with arsenic-resistant disease because of missense mutations in PML. To determine the mechanistic basis for arsenic resistance, PML-/- cells were reconstituted with YFP fusions of wild-type PML-V and two common patient mutants: A216T and L217F. Both mutants were resistant to degradation by arsenic but for different biochemical reasons. Arsenic did not trigger SUMOyla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubiquitin mediated signaling contributes critically to host cell defenses during pathogen infection. Many pathogens manipulate the ubiquitin system to evade these defenses. Here we characterize a likely effector protein bearing a deubiquitylase (DUB) domain from the obligate intracellular bacterium Orientia tsutsugamushi, the causative agent of scrub typhus. The Ulp1-like DUB prefers ubiquitin substrates over ubiquitin-like proteins and efficiently cleaves polyubiquitin chains of three or more ubiquitins. The co-crystal structure of the DUB (OtDUB) domain with ubiquitin revealed three bound ub
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
P62 is capable of binding the polyubiquitin chain that targets proteins for degradation by the proteasome through its ubiquitin associated domain (UBA). Immunostaining of hepatocytes from human liver with alcoholic hepatitis showed colocalization of ubiquitin and P62 in Mallory bodies. Rats fed ethanol chronically and their controls showed that P62 is colocalized with the proteasome in hepatocytes as shown by confocal microscopy. P62 cosedimented with 26S proteasomes isolated from livers of control and alcohol fed rats. P62 was increased in the 26S proteasome fraction when the proteasome chymo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disease that casts a significant shadow over global health and the identification of therapeutic targets for PD will empower more effective clinical treatment. The gene encoding the deubiquitinating enzyme USP25 has been identified as a susceptible locus for PD, but the role of USP25 in PD remains unknown. In this study, we found that USP25 exacerbated dopaminergic neuronal loss and motor deficits in murine models of PD by sabotaging the mitophagy machinery. USP25 physically interacted with the autophagy receptor optineurin and disrup
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The posttranslational modifier ubiquitin regulates most cellular processes. Its ability to form polymeric chains of distinct linkages is key to its diverse functionality. Yet, we still lack the experimental tools to induce linkage-specific polyubiquitylation of a protein of interest in cells. Here, we introduce a set of engineered ubiquitin protein ligases and matching ubiquitin acceptor tags for the rapid, inducible linear (M1-), K48-, or K63-linked polyubiquitylation of proteins in yeast and mammalian cells. By applying the so-called "Ubiquiton" system to proteasomal targeting and the endocy
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammasome activation is essential for host defence against invading pathogens, but is also involved in various forms of inflammatory diseases. The processes that control inflammasome activity are thus important for averting excessive immune responses and tissue damage. Here we show that the deubiquitinase POH1 negatively regulates the immune response triggered by inflammasome activation. POH1 deficiency in macrophages enhances mature IL-1β production without significant alterations in inflammasome priming and ASC-caspase-1 activation. In WT macrophages, POH1 interacts with and deubiquitinat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During antibacterial autophagy, ubiquitination of intracellular bacteria recruits proteins that mediate bacterial delivery to the lysosome for degradation. Smurf1 is an E3 ubiquitin ligase whose role in selective bacterial autophagy is unknown. We show that Smurf1 facilitates selective autophagy of the human pathogen Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Smurf1-/- macrophages are defective in recruiting polyubiquitin, the proteasome, the ubiquitin-binding autophagy adaptor NBR1, the autophagy protein LC3, and the lysosomal marker LAMP1 to Mtb-associated structures and are more permissive for Mtb g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The availability of new and fast tools in structure determination has led to a more than exponential growth of the number of structures solved per year. It is therefore increasingly essential to assess the accuracy of the new structures by reliable approaches able to assist validation. Here, we discuss a specific example in which the use of different complementary techniques, which include Bayesian methods and small angle scattering, resulted essential for validating the two currently available structures of the Josephin domain of ataxin-3, a protein involved in the ubiquitin/proteasome pathwa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to paclitaxel-based chemotherapy represents a major clinic challenge in triple-negative breast cancer (TNBC). Insights on the regulation genes of chemoresistance and underlying mechanisms in TNBC are waiting for in-depth investigation to address the current treatment bottlenecks. In this study, we identified that ubiquitin carboxyl terminal hydrolase-L1 (UCH-L1) was preferentially overexpressed in TNBC and correlated with worse prognosis as well as poor response to chemotherapy. Upregulation of UCH-L1 attenuated the inhibitory effect of paclitaxel on tumor cells through modulating t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Particulate matter ≤2.5 µm (PM2.5) elevates risks of neurological and chronic metabolic diseases, but the underlying mechanisms linking PM2.5-induced central nervous system (CNS) injury to metabolic dysfunction remain unclear. Hypothalamic pro-opiomelanocortin-expressing (POMC+) neurons regulate systemic metabolic homeostasis, and tripartite motif-containing protein 31 (TRIM31) modulates inflammation and metabolism. Here, we investigated whether TRIM31 in POMC+ neurons mediates PM2.5-induced hypothalamic injury and peripheral metabolic disorders in mice subjected to 24-week PM2.5 exposure. TRI
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
СПРАВОЧНАЯ ИНФОРМАЦИЯ: Было продемонстрировано, что THCT E3 Ubriquitin ligase Nedd4 позитивно регулирует реакцию клеток Т, однако его роль в дифференциации клеток и автономном иммунитете Т неизвестна. Считается, что 17 клеток играют ключевую роль в развитии и патогенезе аутоиммунных заболеваний. Тем не менее, правила, регулирующие активацию РОРТ в ходе дифференциации клеток TH17 с помощью сигнала TCR, пока еще не уточнены. Эти неизведанные аспекты вдохновляют нас на изучение потенциальной роли Nedd4 в автоматическом иммунитете Th17.МЕТОДЫ: Мы провели оценку воздействия дефицита Nedd4 на развит
СтатьяПолный текст найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования