PURPOSE: N6-methyladenosine (m6A) is the most prevalent base epigenetic modification within eukaryotic mRNAs. It participates in post-transcriptional regulation, including maternal RNA maintenance and decay in mouse oocytes and during maternal-to-zygotic transition. The landscape in other mammalian species remains largely unexplored. The present work analyzed m6A dynamics in sheep cumulus oocyte complexes (COCs), during in vitro maturation. To explore potential relationships with oocyte developmental competence, a previously established model consisting of oocytes derived from adult and prepub
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are three types of metastases in ovarian cancer: lymphogenous, hematogenous, and peritoneal. Dissemination of the tumor in the peritoneum is directly related with the development of ascites and a poor prognosis. The purpose of this study is to determine changes in the methylation level of a group of long non-coding RNA (lncRNA) genes at different stages of ovarian cancer progression. The methylation level of 7 lncRNA genes (LINC00472, LINC00886, MAFG-DT, SNHG1, SNHG6, TP53TG1, and TUG1) was studied by quantitative methyl-specific PCR in 93 samples of ovarian tumors and 75 paired samples
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Some children infected with hand, foot, and mouth disease (HFMD) caused by enterovirus 71 (EV71) progressed to severe disease with various neurological complications in the short term, with a poor prognosis and high mortality. Studies had revealed that RNA N6 -methyladenosine (m6 A) modification had a significant impact on EV71 replication, but it was unknown how m6 A modification regulated the host cell's innate immune response brought on by EV71 infection. We used MeRIP-seq (methylation RNA immunoprecipitation sequencing), RNA-seq (RNA sequencing), cell transfection, and other techniques. Me
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A), internal modification of mRNA, has recently been reported to be an important regulatory mechanism affecting tumor proliferation. However, its role in endocrine system tumors is poorly understood. We obtained datasets for four types tumors from the TCGA database, analyzed the GTEx database as a supplement to the control group, and used "Perl" and "R" software to analyze the datasets. Then we differentiated the expression level, used it to cluster consensus. Besides, we established lasso regression model to screen variables, used univariate and multivariate cox analyses
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Matrix metalloproteinases (MMPs) are the major class of enzymes responsible for degradation of extracellular matrix components and participate in the pathogenesis of periapical inflammatory lesions. MMP expression may be regulated by DNA methylation. The purpose of the present investigation was to analyze the expression of MMP2 and MMP9 in periapical granulomas and radicular cysts and to test the hypothesis that, in these lesions, their transcription may be modulated by DNA methylation.
METHODS: Methylation-specific polymerase chain reaction was used to evaluate the DNA methylat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired resistance to epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) severely limits clinical efficacy. Myeloid zinc finger 1 (MZF1) inhibited EGFR phosphorylation and internalization by maintaining zinc homeostasis, which suggested its potential as a therapeutic target for resensitization. The two MZF1 splice variants exhibited functional divergence. MZF1S demonstrated significantly reduced Zn2+-binding capacity compared with MZF1L owing to C2H2 domain deletion. Although MZF1S was specifically upregulated in resistant patients, MZF1L predominated in treatment-sensiti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sensitive and efficient detection of RNA methylation sites is considered an integral part of epigenetic assessment. Contrary to previous studies on the detection of RNA m5C or m6A methylation alone, this study innovatively designed a biosensor capable of detecting RNA m5C or m6A methylation at the same time. Substances with specific electrochemical reactions such as ferrocene (FC) or methylene blue (MB) were modified onto the hairpin probe. When the hairpin probe was activated under specific conditions, it triggered a dendritic nonlinear hybridization chain reaction (HCR), which resulted in si
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N 6-methyladenosine (m6A) is the most prevalent messenger RNA modification with diverse regulatory roles in mammalian cells. While its functions are well-documented in mouse embryonic stem cells (mESCs), its role in human pluripotent stem cells (hPSCs) remains to be fully explored. METTL3 is the main enzyme responsible for m6A deposition. Here, using a METTL3 inducible knockout (iKO) system, we uncovered that, unlike in mESCs, METTL3 was indispensable for hPSC maintenance. Importantly, loss of METTL3 caused significant upregulation of pluripotency factors including naïve pluripotency genes and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Crimean-Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) is a tick-borne disease caused by a virus belonging to the Orthonairovirus genus. Mononuclear phagocytic cells, hepatocytes and endothelial cells are known to be the primary targets of the CCHF virus during the infection. Epitranscriptomes refers to all chemical modifications of RNA within a cell. The most common among these-and the focus of this study- is N6-methyladenosine (m6A) methylation.
METHODS AND RESULTS: In this study, for the first time, we investigated the expression profiles of ALKBH5, FTO and YTHDF2 genes using quantitative real
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myelodysplastic syndromes (MDS) are myeloid malignancies with heterogeneous genotypes and phenotypes, characterized by ineffective haematopoiesis and a high risk of progression towards acute myeloid leukaemia (AML). Prognosis for patients treated with hypomethylating agents (HMAs), as is azacytidine, the main drug used as frontline therapy for MDS is mostly based on cytogenetics and next generation sequencing (NGS) of the initial myeloid clone. Although the critical influence of the epigenetic landscape upon cancer cells survival and development as well on tumour environment establishment is c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A growing number of studies have reported that sperm DNA fragmentation (SDF) is associated with male infertility. However, no studies have compared genome-wide DNA methylation profiles and sncRNA signatures between sperm with high and low sperm DNA fragmentation indices (DFIs).
METHODS: Whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) was performed on sperm samples from a weak group (DFI ≥ 30%, n = 6) and normal group (DFI ≤ 15%, n = 7). Small noncoding RNA (sncRNA) deep sequencing was conducted for sperm samples from the weak (DFI ≥ 30%, n = 13) and normal (DFI ≤ 15%, n = 17) groups.
RE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myocardial infarction (AMI) is still a huge danger to human health. Sensitive markers are necessary for the prediction of the risk of AMI and would be beneficial for managing the incidence rate. N6-methyladenosine (m6A) RNA methylation regulators have been confirmed to be involved in the development of various diseases. However, their function in AMI has not been fully elucidated. The purpose of this study was to determine the expression of m6A RNA methylation regulators in AMI as well as their possible functions and prognostic values. The GEO database was used to get the gene expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adrenocortical carcinoma (ACC) is an aggressive and rare neoplasm that originates from the cortex of the adrenal gland. N6-methyladenosine (m6A) RNA methylation, the most common form of mRNA modification, has been reported to be correlated with the occurrence and development of the malignant tumor. This study aims to identify the significance of m6A RNA methylation regulators in ACC and construct a m6A based signature to predict the prognosis of ACC patients.
MATERIALS AND METHODS: RNA-seq data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database was used to identify the expression level
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants respond to abiotic stress stimuli, such as water deprivation, through a hierarchical cascade that includes detection and signaling to mediate transcriptional and physiological changes. The phytohormone abscisic acid (ABA) is well-characterized for its regulatory role in these processes in response to specific environmental cues. ABA-mediated changes in gene expression have been demonstrated to be temporally-dependent, however, the genome-wide timing of these responses are not well-characterized in the agronomically important crop plant Zea mays (maize). ABA-mediated responses are synerg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA N6 -methyladenosine (m6A) modification occurs in approximately 25% of mRNAs at the transcriptome-wide level. RNA m6A is regulated by the RNA m6A methyltransferases methyltransferase-like 3 (METTL3), METTL14, and METTL16 (writers), demethylases FTO and ALKBH5 (erasers), and binding proteins YTHDC1-2, YTHDF1-3, IGF2BP1-3, and SND1 (readers). These RNA m6A modification proteins are frequently upregulated or downregulated in human cancer tissues and are often associated with poor patient prognosis. By modulating pre-mRNA splicing, mRNA nuclear export, decay, stability, and translation of oncog
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallid herpesvirus type 2 (GaHV-2) is an oncogenic alphaherpesvirus that induces malignant T-cell lymphoma in chicken. GaHV-2 encodes a viral telomerase RNA subunit (vTR) that plays a crucial role in virus-induced tumorigenesis, enhances telomerase activity, and possesses functions independent of the telomerase complex. vTR is driven by a robust viral promoter, highly expressed in virus-infected cells, and regulated by two c-Myc response elements (c-Myc REs). The regulatory mechanisms involved in controlling vTR and other genes during viral replication and latency remain poorly understood but
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viruses hijack the host translation machinery to facilitate their replication by disturbing the host translation. SARS-CoV-2 nsp14 is known to inhibit host translation, yet the mechanistic details are still obscure. In this study, we report that nsp14 can elevate stress granules (SG) formation in a N7-methyltransferase activity-dependent manner. ER/Golgi localized nsp14 promotes m7G methylation of host RNAs, which are delivered into stress granules (SG), leading to elevated SG formation. Except for a few methylation-associated proteins, most components of SGs induced by nsp14 can be identified
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The asparaginyl-tRNA synthetase-like SlgZ and methyltransferase SlgM enzymes are involved in the biosynthesis of the tetramic acid streptolydigin in Streptomyces lydicus. Inactivation of slgZ led to a novel streptolydigin derivative. Overexpression of slgZ, slgM, or both in S. lydicus led to a considerable increase in streptolydigin production.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A compound tentatively identified as O2-methyl-5-carboxymethyluridine (cm5Um) was recently isolated in this laboratory from bulk yeast transfer RNA (Gray, M. W. (1975), Can, J. Biochem. 53, 735-746). Alkaline hydrolysis of yeast tRNA releases this nucleoside as part of an alkali-stable dinucleotide, cm5Um-Ap, from which sufficient cm5Um was prepared in the present investigation for a detailed examination of its properties. The ultraviolet absorption spectra and chromatographic and electrophoretic properties of cm5Um were consistent with the proposed structure, which was confirmed by characteri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N 6-Methyladenosine (m6A) is a key base modification that regulates RNA stability and translation during viral infection. While m6A methylation of host mRNAs has been studied in SARS-CoV-2-infected cells, its role in long noncoding RNAs (lncRNAs) is unknown. Here, we analyzed direct RNA sequencing (dRNA-seq) data from infected human lung cells (Calu-3) using a machine learning m6A detection framework. We observed a global increase in m6A levels across 10 antiviral response-associated lncRNAs, with UCA1, GAS5, and NORAD-regulators of interferon (IFN) signaling-showing the most pronounced change
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования