INTRODUCTION: This study aimed to investigate the oral cecal transit time (OCTT) and its correlation with small intestinal dysbiosis in cirrhotic patients with minimal hepatic encephalopathy (MHE) and coexisting small intestinal bacterial overgrowth (SIBO).
METHODS: We enrolled 110 patients with a confirmed diagnosis of cirrhosis admitted to the Department of Gastroenterology at The Affiliated Hospital of Qingdao University between December 2021 and December 2023. The lactulose hydrogen breath test was used to diagnose SIBO and to measure OCTT. Patients were stratified into 3 cohorts: a SIBO(
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prior to soil formation, phosphate liberated by rock weathering is often sequestered into highly insoluble lanthanide phosphate minerals. Dissolution of these minerals releases phosphate and lanthanides to the biosphere. Currently, the microorganisms involved in phosphate mineral dissolution and the role of lanthanides in microbial metabolism are poorly understood.
RESULTS: Although there have been many studies of soil microbiology, very little research has investigated microbiomes of weathered rock. Here, we sampled weathered granite and associated soil to identify the zones of l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The application of rifaximin, a non-absorbable antibiotic, in hepatic encephalopathy (HE) has been well established; however, its effect on other complications in cirrhotic patients with previous gastroesophageal variceal bleeding (GEVB) remains unclear. Therefore, we performed a pilot randomized controlled trial aiming to evaluate the impact of rifaximin on cirrhosis-related complications and changes in gastric microbiota.
METHODS: Eighty cirrhotic patients who received prophylactic endoscopic treatment for variceal rebleeding were randomly assigned to the control or rifaximin tr
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although considerable attention has been paid to the effects of eutrophication on aquatic methane (CH4) emissions to the atmosphere, the ecosystem-level effects of oligotrophication/re-oligotrophication on aquatic CH4 production and subsequent ecological responses remain to be elucidated. It has been hypothesized that dissolved inorganic phosphorus (DIP)-deficient conditions drive the ecosystem to utilize poorly bioavailable organic phosphorus for biomass formation, thereby generating CH4 as a by-product. To test this hypothesis, a mass balance approach was used to estimate in situ oxic methan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: With the advent of more sensitive culture and molecular diagnostic testing modalities, Bartonella spp. infections have been documented in blood and/or cerebrospinal fluid specimens from patients with diverse neurological symptoms. Pediatric acute-onset neuropsychiatric syndrome (PANS) is characterized by an unusually abrupt onset of cognitive, behavioral, or neurological symptoms. Between October 2015 and January 2017, a 14-year-old boy underwent evaluation by multiple specialists for sudden-onset psychotic behavior (hallucinations, delusions, suicidal and homicidal ideation).
MET
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial signals have been linked to autoantibody induction. Recently, we found that purified anti-CD4 autoantibodies from the plasma of chronic HIV-1-infected patients under viral-suppressed antiretroviral therapy (ART) play a pathologic role in poor CD4+ T cell recovery. The purpose of the study was to investigate the association of systemic microbiome and anti-CD4 autoantibody production in HIV. Plasma microbiome from 12 healthy controls and 22 HIV-infected subjects under viral-suppressed ART were analyzed by MiSeq sequencing. Plasma level of autoantibodies and microbial translocation (LPS
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Potential synergetic interaction between chemicals, climate change and the emergence of opportunistic diseases is of utmost concern within the amphibian decline scenario. Understand the structure and dynamic of this microbiome and how environmental stressors act on this community is a priority. The present study aimed to: i) characterize the skin microbiome of Pelophylax perezi frog by looking for variations between populations in reference and under stress conditions (one metal contaminated and another with salinity fluctuations) and ii) evaluate the tolerance of skin-isolated bacteria to che
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present the draft genome for the Rickettsia endosymbiont of Ixodes scapularis (REIS), a symbiont of the deer tick vector of Lyme disease in North America. Among Rickettsia species (Alphaproteobacteria: Rickettsiales), REIS has the largest genome sequenced to date (>2 Mb) and contains 2,309 genes across the chromosome and four plasmids (pREIS1 to pREIS4). The most remarkable finding within the REIS genome is the extraordinary proliferation of mobile genetic elements (MGEs), which contributes to a limited synteny with other Rickettsia genomes. In particular, an integrative conjugative element
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A Gram-negative, non-spore-forming, rod-shaped bacterial strain, K107(T), was isolated from sludge collected from a textile dye works in Korea and its taxonomic position was investigated by means of a polyphasic analysis. Strain K107(T) contained Q-10 as the predominant ubiquinone. The major fatty acids (>10% of total fatty acids) were C(18:1)omega7c and C(18:1) 2-OH. The DNA G+C content was 57.0 mol%. A phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain K107(T) was closely related to the genera Mycoplana, Brucella and Ochrobactrum. Strain K107(T) exhibited 16S rRNA gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Like many eukaryotes, bacteria make widespread use of postreplicative DNA methylation for the epigenetic control of DNA-protein interactions. Unlike eukaryotes, however, bacteria use DNA adenine methylation (rather than DNA cytosine methylation) as an epigenetic signal. DNA adenine methylation plays roles in the virulence of diverse pathogens of humans and livestock animals, including pathogenic Escherichia coli, Salmonella, Vibrio, Yersinia, Haemophilus, and Brucella. In Alphaproteobacteria, methylation of adenine at GANTC sites by the CcrM methylase regulates the cell cycle and couples gene
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A Gram-negative, aerobic, non-motile, ovoid bacterium, designated strain MF3-039T, was isolated from tidal mudflat sediment sampled in Gunsan, Republic of Korea. The strain formed yellow-pigmented colonies on marine agar and was positive for catalase and oxidase. It grew at temperatures ranging from 10 to 37 °C (optimum, 25 °C), pH levels from 6.0 to 9.0 (optimum, 7.0), and 0 to 7.0% (w/v) NaCl (optimum, 2.0%). Phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences revealed that strain MF3-039T clustered within the genus Altererythrobacter (family Erythrobacteraceae), with closest sequence similarit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During 2004-2011, we collected green lizards and Ixodes ricinus ticks in Slovak Karst National Park in Slovakia; 90% (36/40) of lizards and 37% of ticks removed from lizards were infected with family Anaplasmataceae bacteria. Only Candidatus Cryptoplasma sp. REP (reptile) was identified in these samples. Green lizards transmit this bacterium.
Историческая статьяСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The outer membrane (OM) of the intracellular parasite Brucella abortus is permeable to hydrophobic probes and resistant to destabilization by polycationic peptides and EDTA. The significance of these unusual properties was investigated in a comparative study with the opportunistic pathogens of the genus Ochrobactrum, the closest known Brucella relative. Ochrobactrum spp. OMs were impermeable to hydrophobic probes and sensitive to polymyxin B but resistant to EDTA. These properties were traced to lipopolysaccharide (LPS) because (i) insertion of B. abortus LPS, but not of Escherichia coli LPS,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explores the evolutionary origins of class I and II fumarases across the tree of life, focusing on the prevalence and phylogenetic patterns of their enzymes. Using a dataset of ∼21,000 complete proteomes and MMseqs2 easy-search against known fumarase sequences, we identified representative sequences for each class and constructed phylogenetic trees. Class I fumarases are found primarily in bacteria and in several eukaryotic groups, including Protozoa, SAR, and algae, with absence in fungi and archaea and low presence in plants and animals. Their patchy distribution and absence in ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Anaplasma (family Anaplasmataceae, order Rickettsiales) includes obligate intracellular alphaproteobacteria that multiply within membrane-bound vacuoles and are transmitted by Ixodidae ticks to vertebrate hosts. Since the last reclassification of Anaplasmataceae twenty years ago, two new Anaplasma species have been identified. To date, the genus includes eight Anaplasma species (A. phagocytophilum, A. marginale, A. centrale, A. ovis, A. bovis, A. platys, A. odocoilei, and A. capra) and a large number of unclassified genovariants that cannot be assigned to known species. Members of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have reported on the relationship between gut microbiota and major depressive disorder (MDD). However, there remain gaps in literature concerning the role of the intestinal barrier and microflora in the pathogenesis of depression. This study analyzes the potential causative relationship between gut microbiota and inflammatory and gut integrity markers and clinical symptoms in inpatients with depressive episodes. Sixteen inpatients (50% females) being treated with escitalopram (5-20 mg daily) in standardized conditions were included in the study. The composition of fecal microb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious complications are a common cause of morbidity and mortality in cancer patients undergoing chemotherapy due to increased risk of oral and gastrointestinal candidiasis, candidemia and septicemia. Interactions between C. albicans and endogenous mucosal bacteria are important in understanding the mechanisms of invasive infection. We published a mouse intravenous chemotherapy model that recapitulates oral and intestinal mucositis, and myelosuppression in patients receiving 5-fluorouracil. We used this model to study the influence of C. albicans on the mucosal bacterial microbiome and com
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inherent resistance of low-density polyethylene (LDPE) to degradation leads to its continued accumulation in the natural environment. The present study evaluates an integrated approach coupling cold atmospheric plasma (CAP) pretreatment with hydrocarbon-driven biostimulation to accelerate microbial degradation of LDPE. The degradation of untreated and pretreated LDPE was analyzed in Winogradsky columns with diesel as a co-substrate. After 45 days, the system containing both pretreated LDPE and diesel (W4) showed the highest LDPE weight loss (4.22 ± 0.73%), outperforming systems with only C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plants release a wealth of metabolites into the rhizosphere that can shape the composition and activity of microbial communities in response to environmental stress. The connection between rhizodeposition and rhizosphere microbiome succession has been suggested, particularly under environmental stress conditions, yet definitive evidence is scarce. In this study, we investigated the relationship between rhizosphere chemistry, microbiome dynamics, and abiotic stress in the bioenergy crop switchgrass grown in a marginal soil under nutrient-limited, moisture-limited, and nitrogen (N)-replete, phos
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The causal relationships between the gut microbiota and prostate cancer, prostatitis, and benign prostatic hyperplasia remain uncertain. We intend to identify the causal connections between the gut microbiota and prostatic diseases and investigate the potential mechanisms involved.
METHODS: A two-sample Mendelian randomization (MR) analysis was conducted to elucidate the impact of 196 gut microbiota on prostatic diseases risk. Reverse MR, linkage disequilibrium regression score (LDSC), and colocalization analyses were performed to strengthen causal evidence. Phenome-wide MR (Phe-M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.