Autism spectrum disorders (ASDs) are a group of diseases exhibiting impairment in social drive, communication/language skills and stereotyped behaviors. Though an increased number of candidate genes and molecular interactions have been identified by various approaches, the pathogenesis remains elusive. Based on clinical observations, data from accessible GWAS and expression datasets we identified ASDs gene candidates. Integrative gene network and a novel CNV-centric Node Network (CNN) analysis method highlighted ASDs-associated key elements and biological processes. Functional analysis identif
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preeclampsia is a complex pregnancy disorder that poses significant health risks to both mother and fetus. Despite its clinical importance, the underlying molecular mechanisms remain poorly understood. In this study, we developed an integrative deep learning and bioinformatics approach to identify potential biomarkers for preeclampsia. Three microarray datasets related to preeclampsia were initially analyzed to select a preliminary gene subset based on $P$-values. Feature selection was then performed in two consecutive rounds: first, the Fisher score method was applied to extract significant g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic, immune-mediated intestinal disorder driven by dysregulated immune responses in genetically susceptible individuals. Despite recent advances in treatment, more than 30% of patients either fail to respond initially or lose response over time, underscoring the need for a deeper mechanistic understanding of immunogenetic pathways and the development of individualized therapeutic strategies. We first discuss how newly identified susceptibility genes (e.g., IL23R, NOD2, BDNF, SLC) and their polymorphisms influence immune cell function and epithelial bar
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is usually diagnosed when therapeutic options are limited, highlighting the need for novel molecular targeted therapies. MicroRNAs, as important regulators in cancer-related pathways, may provide therapeutic targets through their gene networks; however, the role of the miR-625-5p network in CRC remains unclear. Therefore, this study aimed to identify potential therapeutic targets in CRC through miR-625-5p-regulated network analysis.
METHODS: miR-625 expression in TCGA samples was analyzed to assess its potential role in CRC development/progression. miR-625-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flowering plants respond to multiple environmental and endogenous cues to determine the timing of their transition from the vegetative to floral state. Most of our knowledge of the gene regulatory network (GRN) controlling the floral transition has been derived from the model plant, Arabidopsis thaliana. This knowledge needs to be translated to crop plants to support the development of varieties that can be grown in different and rapidly changing climate conditions. However, due to increased genome complexity and limited prior knowledge, its translation into crops is not always straightforward
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isatis indigotica (Banlangen) is a classic Traditional Chinese Medicine herbal remedy with well-documented antiviral and anti-inflammatory properties. However, the molecular mechanisms underlying its therapeutic effects against hepatitis B virus (HBV)-associated hepatic inflammation remain incompletely understood. This study aimed to systematically elucidate the multi-target regulatory mechanisms of Isatis indigotica against HBV-associated hepatic inflammation using network pharmacology and molecular simulation approaches. Bioactive compounds were screened from the TCMSP database (OB ≥ 30%, or
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aplastic anemia (AA), myelodysplastic syndromes (MDS), and acute myeloid leukemia (AML) exhibit complex pathogenic mechanisms and interrelated characteristics. We aimed to identify the common hub genes, establishing a foundation for preventing disease progression.
METHODS: We selected relevant datasets from the Gene Expression Omnibus(GEO) database for differential gene expression, gene set enrichment, and weighted gene co-expression network analyses to identify hub genes, and then validated them. Subsequent analyses included immune infiltration analysis, single-cell sequencing, a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Doublecortin-like kinase 1 (Dclk1) expression identifies cells that are rare in normal pancreas but occur with an increased frequency in pancreatic neoplasia. The identity of these cells has been a matter of debate. We employed Dclk1 reporter mouse models and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to define Dclk1-expressing cells. In normal pancreas, Dclk1 identifies subsets of ductal, islet, and acinar cells. In pancreatic neoplasia, Dclk1 identifies several cell populations, among which acinar-to-ductal metaplasia (ADM)-like cells and tuft-like cells are predominant. These two populations pl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Alopecia areata (AA) is an autoimmune-related non-cicatricial alopecia, with complete alopecia (AT) or generalized alopecia (AU) as severe forms of AA. However, there are limitations in early identification of AA, and intervention of AA patients who may progress to severe AA will help to improve the incidence rate and prognosis of severe AA.
METHODS: We obtained two AA-related datasets from the gene expression omnibus database, identified the differentially expressed genes (DEGs), and identified the module genes most related to severe AA through weighted gene co-expression network
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tips of the developing respiratory buds are home to important progenitor cells marked by the expression of SOX9 and ID2. Early in embryonic development (prior to E13.5), SOX9+progenitors are multipotent, generating both airway and alveolar epithelium, but are selective progenitors of alveolar epithelial cells later in development. Transcription factors, including Sox9, Etv5, Irx, Mycn, and Foxp1/2 interact in complex gene regulatory networks to control proliferation and differentiation of SOX9+progenitors. Molecular mechanisms by which these transcription factors and other signaling pathwa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: This aim of this study was to better understand ulcerative interstitial cystitis/painful bladder syndrome (IC/PBS) at the molecular level and provide new clues related to diagnosis and treatment.
METHODS: The microarray data set GSE11783, including the mRNA and miRNA profiles of bladder tissue obtained at cystoscopic biopsy from patients with ulcerative IC/PBS (presence of at least one Hunner's ulcer) and normal controls, was downloaded from the GEO (Gene Expression Omnibus) database (National Center for Biotechnology Information). These were evaluated using Green
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrauterine growth restriction (IUGR), a serious complication of perinatal period, results in metabolic and brain disorders. However, the exact cause of IUGR remains unclear. Recently, some evidences indicated that epigenetic modification plays an important role in IUGR. Hence, in this study the methylation status and gene expression profiles of IUGR were compared to investigate the changes in epigenetic regulation and gene expression induced by IUGR. DNA samples extracted from blood samples of infants with IUGR and controls appropriate for gestational age (AGA) were analyzed with Illumina Hu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The pathogenesis of ankylosing spondylitis (AS) remains undetermined. Ferroptosis is a newly discovered form of regulated cell death involved in multiple autoimmune diseases. Currently, there are no reports on the connection between ferroptosis and AS. Methods: AS samples from the Gene Expression Omnibus were divided into two subgroups using consensus clustering of ferroptosis-related genes (FRGs). Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) of the intergroup differentially expressed genes (DEGs) and protein-protein interaction (PPI) analysis of the key module were used to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Опубликованное исправлениеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A dataset of gene expression from Spodoptera frugiperda, a highly generalist pest moth, was used to understand how gene regulation is related to larval host plant preference. Transcriptomic data of corn and rice strains of S. frugiperda larvae, reared on different diets, were analysed with three different approaches of gene network inference, namely co-expression, weighted co-expression and Bayesian networks, since each methodology provides a different visualization of the data. Using these approaches, it was possible to identify two loosely interconnected co-expression networks, one of them r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the involvement of the immune system in the genetic susceptibility of bipolar disorder (BD) is widely acknowledged, the causal relationship between gene expression in specific immune cell subtypes and BD requires systematic elucidation.
METHODS: We implemented an analytical framework integrating single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization (scTWMR) with colocalization analysis. This approach utilized cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTLs) derived from 14 distinct immune cell types as instrumental variables to interrogate BD genome-wide association st
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify the potential diagnostic biomarkers and therapeutic targets of atherosclerotic carotid artery stenosis (ACAS), a comprehensive bioinformatics analysis was conducted to identify its related key genes and regulatory networks.
METHODS: Four datasets, including GSE43292, GSE100927, GSE28829, and GSE198600, were integrated to form the training set, with the GSE163154 dataset serving as the validation set. Subsequently, differential expression and functional enrichment analysis were performed on the training set. In addition, key pathogenic genes were identified using the pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BLCA) is a prevalent malignancy with substantial consequences for patient health. This study aimed to elucidate the underlying mechanisms of BLCA through integrated multi-omics analysis.
METHODS: Tumor and adjacent tissues from BLCA patients underwent transcriptomic, whole-exome sequencing, metabolomic, and intratumoral microbiome analyses. These data were integrated with public datasets to identify key genes, metabolites, and microorganisms. Molecular subtypes were defined by key gene expression and compared for pathways, immune profiles, mutations, immunotherapy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoporosis (OP) is a common comorbidity in ulcerative colitis (UC) patients. However, the specific mechanism by which UC induces bone loss remains unclear.
METHODS: Transcriptome data from the GSE87466 and GSE35958 datasets were analyzed to identify common differentially expressed genes (co-DEGs), construct protein-protein interaction network, and perform functional enrichment analysis. The R packages PROGENy, NetAct, and sRACIPE were used to infer the activity of the signaling pathways, construct transcription factor regulatory networks, and identify disease-promoting genes. A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several preclinical models have been recently developed for metabolic associated fatty liver disease (MAFLD) and associated hepatocellular carcinoma (HCC) but comprehensive analysis of the regulatory and transcriptional landscapes underlying disease in these models are still missing. We investigated the regulatory and transcriptional landscape in fatty livers and liver tumours from DIAMOND mice that faithfully mimic human HCC development in the context of MAFLD. RNA-sequencing and ChIP-sequencing revealed rewiring of the Wnt/β-catenin regulatory network in DIAMOND tumours, as manifested by chr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования