RNA silencing is an ancient regulatory mechanism operating in all eukaryotic cells. In fungi, it was first discovered in Neurospora crassa, although its potential as a defence mechanism against mycoviruses was first reported in Cryphonectria parasitica and, later, in several fungal species. There is little evidence of the antiviral potential of RNA silencing in the phytopathogenic species of the fungal genus Botrytis. Moreover, little is known about the RNA silencing components in these fungi, although the analysis of public genome databases identified two Dicer-like genes in B. cinerea, as in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant viruses severely limit global crop productivity, yet no pesticide-like antiviral agents are currently available for effective control. Double-stranded RNA (dsRNA) technologies, acting through RNA interference, provide a sequence-specific and non-transgenic strategy to suppress viral replication and have emerged as promising non-transgenic solutions for crop protection. Spray-induced gene silencing (SIGS), which applies externally produced dsRNA through foliar sprays, seed treatments, or root uptake, provides practical advantages over genetic modification, including rapid deployment, envi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hybridization of plants that differ in number of chromosome sets (ploidy) frequently causes endosperm failure and seed arrest, a phenomenon referred to as triploid block. In Arabidopsis, loss of function of NRPD1, encoding the largest subunit of the plant-specific RNA polymerase IV (Pol IV), can suppress the triploid block. Pol IV generates short RNAs required to guide de novo methylation in the RNA-directed DNA methylation (RdDM) pathway. Recent work suggests that suppression of the triploid block by mutants in RdDM components differs, depending on whether the diploid pollen is de
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pentatricopeptide repeat (PPR) proteins are key regulators of organelle RNA metabolism in plants, yet their precise mechanisms in chloroplast RNA processing remain unclear. Here, we identify WPR, a unique P-type PPR protein in rice (Oryza sativa L.), as a critical factor in chloroplast RNA splicing and editing. A ~112-kb chromosomal inversion upstream of WPR causes an albino panicle rachis phenotype (wpr mutant), while complete loss of WPR function leads to seedling lethality. WPR deficiency disrupts the splicing of multiple group II introns (atpF, ndhA, ndhB, petB, rpl2, and rps12) and impair
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MYB and bHLH are the key transcription factors to coordinate the balance between antioxidant system and secondary metabolism under combined temperature-water stress. Low temperature and drought severely impede medicinal plant growth and secondary metabolite accumulation. Identifying key regulatory genes or modules and clarifying their molecular mechanisms is critical for advancing the ginseng industry. Using ginseng hairy roots, we established a composite stress system combining 5 °C with 10-30% polyethylene glycol. We assessed effects on ginseng hairy roots growth, ginsenoside content, and st
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNAs (lncRNAs), typically over 200 nucleotides in length, with low or no coding capacity, possess significant regulatory roles in plant growth, development, and stress responses by interacting with DNAs, proteins, and other RNAs. This chapter outlines a comprehensive protocol for identifying and functionally characterizing wheat lncRNAs under stem rust infection. The workflow includes plant growth, pathogen inoculation, RNA isolation, and whole-transcriptome sequencing of wheat. In-silico approaches for data preprocessing, transcriptome assembly and subsequent characterization,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide (NO) is a crucial signaling molecule that regulates a wide range of metabolic pathways in different strata of organisms. In plants, nitrate reductase (NR) is a key enzyme for NO biosynthesis. There are two NR-encoding genes in Arabidopsis genome, NIA1 and NIA2, which are precisely regulated and expressed in a tissue-specific manner. In this study, we found that the natural antisense transcript as-NIA1, transcribed from the 3' UTR of NIA1, stabilizes NIA1 mRNA to maintain its circadian oscillation in plants grown under the light/dark cycle. Importantly, as-NIA1-dependent NIA1 mRNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During virus infection, Argonaute (AGO) proteins bind to Dicer-produced virus small interfering RNAs and target viral RNA based on sequence complementarity, thereby limiting virus proliferation. The Arabidopsis AGO2 protein is important for resistance to multiple viruses, including potato virus X (PVX). In addition, AGO5 is important in systemic defense against PVX. Normally AGO5 is expressed only in reproductive tissues, and its induction by virus infection is thought to be important for its participation in antiviral defense. However, it is unclear what mechanisms induce AGO5 expression in r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last 15 years, RNA sequencing (RNA-seq) has emerged as a popular tool for studying gene expression changes in an organism. In fungal plant pathology, this is a comprehensive method for identifying transcriptome changes to both the fungal pathogen and its host. RNA-seq generates a vast amount of data that can increase our understanding of the interaction between the fungus and its host, or how the fungal species adapts to various environmental conditions. This chapter emphasizes the importance of sample preparation for RNA-seq. It also describes a protocol for isolating high quality RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shepherd's purse (Capsella bursa-pastoris) is a cosmopolitan annual weed and a promising model plant for studying allopolyploidization in the evolution of angiosperms. Though plant mitochondrial genomes are a valuable source of genetic information, they are hard to assemble. At present, only the complete mitogenome of C. rubella is available out of all species of the genus Capsella. In this work, we have assembled the complete mitogenome of C. bursa-pastoris using high-precision PacBio SMRT third-generation sequencing technology. It is 287,799 bp long and contains 32 protein-coding genes, 3 rR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Temperature-sensitive male sterility is one of the core components for hybrid rice (Oryza sativa) breeding based on the 2-line system. We previously found that knockout of ARGONAUTE 1d (AGO1d) causes temperature-sensitive male sterility in rice by influencing phased small interfering RNA (phasiRNA) biogenesis and function. However, the specific phasiRNAs and their targets underlying the temperature-sensitive male sterility in the ago1d mutant remain unknown. Here, we demonstrate that the ago1d mutant displays normal female fertility but complete male sterility at low temperature. Through a mul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cucumber mosaic virus (CMV) is one of the most widespread and economically important plant viruses, infecting over 1,300 species across diverse plant families. A distinctive feature of CMV biology is its association with satellite RNAs (satRNAs), small non-coding RNA molecules that rely entirely on the helper virus for replication, encapsidation, and transmission. Despite lacking coding potential, satRNAs profoundly modulate CMV pathogenicity by influencing viral accumulation, symptom expression, and host-virus interactions. Depending on their sequence and structure, satRNAs may intensify symp
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phytochemicals are various compounds produced by plants. There is growing evidence on their potential health effects. Some of these compounds are considered as traditional medicines and used as painkillers, anti-inflammatory agents, and for other applications. One of these phytochemicals is curumin, a natural polyphenol derived from the turmeric plant (Curcuma longa L.). Curcumin is widely used as a food coloring, preservative and condiment. It has also been shown to have antioxidative and anti-inflammatory effects. Moreover, there is growing evidence that curcumin alters long noncoding RNAs (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant viruses are recognized as rapid and effective vectors to deliver CRISPR-Cas reaction components into plants, a strategy termed virus-induced gene editing (VIGE). However, VIGE is limited by the host range of the viral vectors. Development of new viral vectors to target a broad range of plant species will potentially enable the delivery of the editing components to new cultivars. Potyviruses (genus Potyvirus) comprise the largest group of plant RNA viruses. The main limitation of potyviral vectors to express a non-coding RNA consists of potential insertion of stop codons that interrupt th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the dearth of effective antiviral drugs, the exogenous delivery of dsRNA for RNAi against plant viral diseases holds great promise. Here, we present an effective delivery approach of dsRNA utilizing graphene oxide nanosheets (GONs) on mature plant leaves via a spray. Our method achieves rapid and sustained gene knockdown, reducing the level of the target gene to 46% by day 2, and continuously releases dsRNA for at least 6 days. The coupling of GONs with specific fragments of coat protein and replicase gene dsRNA exhibited a superior antiviral effect compared to specific fragments of RNA-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene delivery to target cells is required for bioengineering or medical/agricultural applications. However, the hydrophobicity of the cell membrane always makes it resistant to polar nucleic acids. This physicochemical barrier is usually overcome by a nano-formulation to hide the polarity. This study evaluated a specific formulation called star polycation (SPc) regarding its efficacy in DNA/RNA delivery to insect cells. The delivery efficiency of the SPc formulation was assessed by transient expression of green fluorescence protein (GFP) in Sf9 cells, in which SPc formulation significantly enh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Certification and disease management practices are reliant on accurate pathogen detection assays. Effective nucleic acid extraction is the cornerstone of various molecular detection techniques, and many virus and viroid RNA extraction protocols have been developed, each with accompanying advantages and limitations. The extraction method influences the type, quantity and quality of RNA and, therefore, the overall sensitivity of the assay.
METHODS: Plants from two citrus types were infected with multiple viruses and viroids. Ten plants from each were selected. RNA was extracted from
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small regulatory RNAs (sRNAs), including small interfering (si) and micro (mi) RNAs, are components of the RNA interference (RNAi) pathways regulating vital processes. These various sRNAs act via specialized executor ARGONAUTE (AGO) proteins constituting RNA induced silencing complexes (RISCs). In Arabidopsis, miRNAs load mainly into AGO1, while 24-nucleotide (nt) long siRNAs load into AGO4, typically. However, a large subset of sRNAs is present in the cytoplasm in AGO-unbound form. To uncover the potential importance of tissue specific AGO-loading efficiency of sRNAs in an economically import
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise manipulation of large DNA fragments in eukaryotic genomes remains limited by the low efficiency and delivery constraints of current multicomponent editing systems. In this study, we engineered an RNA-guided bridge recombinase system through rational mutagenesis and AI-assisted directed evolution, enabling programmable chromosomal rearrangements in both plant and mammalian cells and achieving up to a 29.8-fold increase in activity. In plants, the optimized system mediated precise deletions, insertions, and inversions from 1.8- to 315-kb DNA fragments, with stable editing efficiencies of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tomato spotted wilt virus (TSWV) is an economically devastating pathogen that rapidly overcomes genetic resistance in major crops. Reverse genetic systems are crucial for investigating plant-virus interactions and resistance-breaking mechanisms, and developing these tools for segmented ambisense RNA viruses remains a crucial challenge. Current TSWV clones rely on extensively modified Asian isolates requiring co-delivery of multiple replication helpers and viral silencing suppressors. Streamlining these systems for regionally significant strains with minimal genetic alterations is essential. He
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.