Despite emergence of new systemic therapies, metastatic melanoma remains a challenging and often fatal form of skin cancer. The renin-angiotensin system (RAS) is a major physiological regulatory pathway controlling salt-water equilibrium, intravascular volume and blood pressure. Biological effects of the RAS are mediated by the vasoactive hormone angiotensin II (AngII) via two receptor subtypes, AT1R (encoded by AGTR1) and AT2R (encoded by AGTR2). We report decreasing expression and increasing CpG island methylation of AGTR1 in metastatic versus primary melanoma and detection in serum of methy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Recognizing cause-effect relationships is a fundamental inquiry in science. However, current causal inference methods often focus on directionality but not statistical significance. A ramification is chance patterns of uneven marginal distributions achieving a perfect directionality score.
RESULTS: To overcome such issues, we design the uniform exact function test with continuity correction (UEFTC) to detect functional dependency between two discrete random variables. The null hypothesis is two variables being statistically independent. Unique from related tests whose null populat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: The molecular basis of hepatocellular neoplasm, not otherwise specified (HCN-NOS) is unknown. We aimed to identify gene expression patterns, potential methylation-regulated genes and pathways that characterize the tumor, and its possible relationship to hepatoblastoma and hepatocellular carcinoma (HCC).
APPROACH & RESULTS: Parallel genome-wide profiling of gene expression (RNAseq) and DNA methylation (EPIC850) was performed on 4 pairs of pre-treatment HCN-NOS tumors and adjacent non-tumor controls. 2530 significantly differentially expressed genes (DEGs) were identified b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of aberrant methylation of CpG islands in the promoter regions of genes (P16/CDKN2A, P14/ARF, RASSF1A, GSTP1) in blood leukocytes of liquidators of the Chernobyl accident (n = 83, 38-76 years of age) and control subjects of two groups (n = 48, age ≤ 35 and n = 65, age > 35) was carried out using methylation-sensitive restriction endonuclease analysis followed by PCR. The total number of AciI sites in the analyzed fragments ranged from 2 to 7 for different genes. Only 1 subject (2.1%) from the control group (healthy young individuals, age ≤ 35) has methylation of the studied CpG--dinu
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is characterized by systemic microarchitecture impairment and bone loss, which ultimately lead to fragility fractures. This disease is most common in older people, especially in postmenopausal women. Cancellous bone is affected by osteoporosis earlier than cortical bone, and DNA methylation microarray analysis of the hip cancellous bone of patients with osteoarthritis revealed differential methylation. In view of the important role of cancellous bone in bone development, we examined genome-wide DNA methylation profiles in the cancellous bone from patients with postmenopausal osteo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mantle cell lymphoma (MCL) is a currently incurable B-cell malignancy. Lenalidomide (Len) has been demonstrated to be one of the most efficient new treatment options. Because Len and 1α,25-dihydroxyvitamin (VD3) synergize to kill breast cancer cells, we investigated whether VD3 could increase the ability of Len to induce MCL cell death. While MCL cells were weakly sensitive to Len (1 μM), the addition of VD3 at physiological dose (100 nM) strongly increased cell death, accompanied by slowdown in cell cycle progression in MCL cell lines (n=4 out of 6) and primary samples (n=5 out of 7). The Len
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The process of DNA CpG methylation has been extensively investigated for over 50 years and revealed associations between changing methylation status of CpG islands and gene expression. As a result, DNA CpG methylation is implicated in the control of gene expression in developmental and homeostasis processes, as well as being a cancer-driver mechanism. The development of genome-wide technologies and sophisticated statistical analytical approaches has ushered in an era of widespread analyses, for example in the cancer arena, of the relationships between altered DNA CpG methylation, gene expressi
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (ERAP1) is known to participate in the pathogenesis of ankylosing spondylitis (AS). This study aimed to evaluate the relationship between promoter methylation and mRNA levels of ERAP1 and AS susceptibility.
METHODS: DNA methylation levels of 100 AS patients and 100 healthy controls (HCs) were tested using a targeted bisulfite sequencing assay. To verify the results of DNA methylation, mRNA levels of ERAP1 were measured in 20 AS patients and HCs used quantitative real-time reverse transcription-polymerase chain reaction.
RESULTS: The DNA meth
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung carcinogenesis is causally linked to cigarette smoking, in part by epigenetic changes. We tested whether accumulated epigenetic change in smokers is apparent in bronchial basal cells as cells of origin of squamous cell carcinoma. Using an EM-seq platform covering 53.8 million CpGs (96% of the entire genome) at an average of 7.5 sequencing reads per CpG site at a single base resolution, we evaluated cytology-normal basal cells bronchoscopically brushed from the in situ tobacco smoke-exposed 'bronchial epithelial field' and isolated by short-term primary culture from 54 human subjects. We f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Familial hypercholesterolemia (FH) is characterized by high low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) levels and a high risk of early coronary heart disease. Structural alterations in the LDLR, APOB, and PCSK9 genes were not found in 20-40% of patients diagnosed using the Dutch Lipid Clinic Network (DCLN) criteria. We hypothesized that methylation in canonical genes could explain the origin of the phenotype in these patients. This study included 62 DNA samples from patients with a clinical diagnosis of FH according to the DCLN criteria, who previously tested negative for structural alteratio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation plays a major role in the epigenetic regulation of gene expression. Although a few DNA methylation profiling studies of porcine genome which is one of the important biomedical models for human diseases have been reported, the available data are still limited. We tried to study methylation patterns of diverse pig tissues as a study of the International Swine Methylome Consortium to generate the swine reference methylome map to extensively evaluate the methylation profile of the pig genome at a single base resolution. We generated and analysed the DNA methylome profiles of five d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia (SCZ) is a complex psychiatric disease with a lifetime morbidity rate of 0.5-1.0 %. To date, aberrant DNA methylation in SCZ has been reported in several studies. However, no comprehensive studies using medication-free subjects with SCZ have been conducted. In addition, most of these studies have been limited to the analysis of the CpG sites in CpG islands (CGIs) in the gene promoter regions, so little is known about the DNA methylation signatures across the whole genome in SCZ. Genome-wide DNA methylation profiling (485,764 CpG sites) of peripheral leukocytes was conducted in th
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cyclin-dependent kinase inhibitor p15INK4b has been shown to be involved in human and rodent tumors and seems to act as a tumor suppressor gene in hematological malignancies. Alterations of this gene in tumors include mainly homozygous deletions and hypermethylation of the CpG island in the promoter region. In this work, we describe a new area sensitive to methylation in the 3' untranslated region (UTR) of the murine p15INK4b gene. This region shows different levels of methylation depending on the tissues, being relatively highly methylated in brain and gut, and weakly methylated in liver,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The reverse transcriptase subunit of telomerase, TERT, is frequently activated in high-grade dysplasia and invasive cancers of the uterine cervix. Telomerase activation through hypomethylation of the TERT promoter holds promise as a biomarker for cervical cancer progression, however, specific CpG sites involved in cervical cancer risk remain to be fully defined. A recent genome-wide association study on cervical cancer identified genetic polymorphisms at 5p13.33 (close to TERT-CLPTM1L) but the underlying mechanisms are undetermined. We investigated 529 CpG sites within the TERT promoter region
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epithelial-mesenchymal (EMT) and mesenchymal-epithelial (MET) transitions occur in the development of human tumorigenesis and are part of the natural history of the process to adapt to the changing microenvironment. In this setting, the miR-200 family is recognized as a master regulator of the epithelial phenotype by targeting ZEB1 and ZEB2, two important transcriptional repressors of the cell adherence (E-cadherin) and polarity (CRB3 and LGL2) genes. Recently, the putative DNA methylation associated inactivation of various miR-200 members has been described in cancer. Herein, we show that the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CDKN2A gene located on chromosome region 9p21 encodes the cyclin-dependent kinase-4 inhibitor p16/INK4A, a negative cell cycle regulator. We analyzed p16/INK4A expression in different types of non-Hodgkin's lymphoma to determine whether the absence of this protein is involved in lymphomagenesis, while also trying to characterize the genetic events underlying this p16/INK4A loss. To this end, we investigated the levels of p16/INK4A protein using immunohistochemical techniques in 153 cases of non-Hodgkin's lymphoma, using as reference the levels found in reactive lymphoid tissue. The existen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome 12q24.1 is a recurrent breakpoint in high-grade B-cell non-Hodgkin lymphoma (B-NHL). To identify the genes involved at 12q24.1, molecular cloning of a three-way translocation t(8;14;12)(q24.1;q32.3;q24.1) in a Burkitt lymphoma cell line (Wien 133) was performed; all four translocation breakpoints were cloned and sequenced. Analysis of clones encompassing the der(12)(12;14)(q24.1;q32.3) breakpoint showed a CpG island from chromosome 12q24.1 juxtaposed in a tail-to-tail configuration with a productively rearranged Ig VH4-DH-JH5 gene. A total of 4.5 kb of genomic DNA including the CpG
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the relationship between TAP (transporter associated with antigen processing) gene promoter regional methylation level and cervical lesions with HPV infection in Uyghur women.
METHODS: A specialized software was used to design specific primers of CpG island fragments of TAP1 and TAP2 gene promoter for PCR amplification, bisulfitemodified SiHa cancer cell DNA for PCR amplification, cloning and sequencing analysis to obtain the relevant information on the gene base sequence methylation of CpG sites. Seventy-eight fresh cervical tissue samples from Uyghur women with cerviciti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Tobacco smoking induces persistent DNA methylation (DNAm) changes in blood that can serve as long-term biomarkers for smoking exposure. We aimed to develop and validate a DNAm classifier of smoking status using Illumina EPIC array data.
METHODS: We built Epigenetic Smoking status Estimator2 (EpiSmokEr2), a Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) regression-based DNAm classifier using 511 CpGs from Illumina Infinium MethylationEPIC array (EPIC) data. The model was trained on 1343 samples from the Young Finns Study cohort and validated across six independent datasets from f
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования