Metagenomic approaches to detect viral genomes and variants in clinical samples have various challenges, including low viral titers and bacterial and human genome contamination. To address these limitations, we examined a next-generation sequencing (NGS) and iterative mapping approach for virus detection in clinical samples. We analyzed 40 clinical specimens from hospitalized children diagnosed with acute bronchiolitis, croup, or respiratory tract infections in which virus identification by viral culture or polymerase chain reaction (PCR) was unsuccessful. For our NGS data analysis pipeline, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute gastroenteritis (AGE) represents a world public health relevant problem especially in children. Enteric viruses are the pathogens mainly involved in the episodes of AGE, causing about 70.00% of the cases. Apart from well-known rotavirus (RVA), adenovirus (AdV) and norovirus (NoV), there are various emerging viral pathogens potentially associated with AGE episodes. In this study, the presence of ten different enteric viruses was investigated in 152 fecal samples collected from children hospitalized for gastroenteritis. Real time PCR results showed that 49.3% of them were positive for vira
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed viral nucleic acids in stool samples collected from 35 South Asian children with nonpolio acute flaccid paralysis (AFP). Sequence-independent reverse transcription and PCR amplification of capsid-protected, nuclease-resistant viral nucleic acids were followed by DNA sequencing and sequence similarity searches. Limited Sanger sequencing (35 to 240 subclones per sample) identified an average of 1.4 distinct eukaryotic viruses per sample, while pyrosequencing yielded 2.6 viruses per sample. In addition to bacteriophage and plant viruses, we detected known enteric viruses, including ro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Most childhood meningitis is viral in countries with widespread conjugate vaccine use. This study assessed clinical features and neurodevelopmental outcomes in preschool children following enteroviral and parechoviral meningitis.
METHODS: Children 18-42 months of age in Canterbury, New Zealand were included, who had enterovirus (EV) or parechovirus (HPEV) meningitis from 2015 to 2021. Comprehensive neurodevelopmental assessments were completed by a psychologist using the Bayley Scale for Infant Development-3 (BSID-3). Mean composite and scaled scores and proportion below the cutof
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human parvovirus 4 (PARV4) is a newly discovered parvovirus prevalent in injecting drug users and other groups with histories of parenteral exposure including persons with hemophilia exposed to non-virally inactivated clotting factor concentrates. To investigate its potential ongoing transmission to persons with hemophilia treated with plasma-derived, virally inactivated clotting factors, we screened a large cohort of persons with hemophilia for antibody seroconversion to PARV4 over a 5-year observation period.
STUDY DESIGN AND METHODS: Samples from 195 persons with hemophilia enr
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To describe actigraphically detected and parent-reported sleep problems in nonmedicated children with attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD); to clarify whether or not comorbid oppositional defiant disorder contributes to sleep difficulties; and to compare objectively measured sleep with the parents' observations of sleep.
DESIGN: Case-control study.
SETTING: A child and adolescent psychiatric department of a teaching hospital.
PARTICIPANTS: Two hundred six children aged 5 to 11 years, including 45 with a diagnosis of ADHD, 64 with a diagnosis of other psychiatric diagn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningitis and encephalitis can lead to severe morbidity and result in permanent neurologic deficits in children, but outcomes differ depending on the causative pathogen. Early diagnosis of viral meningitis may allow for appropriate management, including avoidance of antimicrobial treatment and hospital admission. We sought to determine the clinical utility of a multiplexed meningitis-encephalitis (ME) panel at a quaternary care pediatric institution in patients diagnosed with human enterovirus (HEV) and human parechovirus (HPeV) meningitis. Retrospective analysis of patients between June 2016
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurotropic viral infections continue to pose significant global health challenges, with pathogens such as herpes simplex virus (HSV), varicella-zoster virus, human immunodeficiency virus, poliovirus, enteroviruses, parechovirus, West Nile virus and Japanese encephalitis virus driving the search for more effective therapeutic interventions. Current antiviral strategies, including small molecules and monoclonal antibodies, often face limitations such as drug resistance, narrow spectrum activity and adverse side effects, underscoring the need for alternative approaches. Antiviral peptides are em
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Meningococcal meningitis is rare in Japan; however, when outbreaks do occur, they predominantly involve domestically infected cases rather than those contracted overseas. CASE REPORT A Japanese man with diabetes in his 50s experienced fever and loss of consciousness, with no history of international travel. In our hospital, gram-negative diplococci were detected in the cerebrospinal fluid (CSF) of the patient by Gram staining, although the rapid agglutination test and cultures of blood and CSF were negative. Multiplex polymerase-chain reaction (PCR) testing returned positive results
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis-like illness with suspected meningitis or encephalitis is a common reason for using empiric antimicrobial therapy in infants and children. However, in cases of viral meningitis not covered by these antimicrobials, this management is ineffective and due to side effects potentially harmful.
METHODS: A retrospective analysis of cerebrospinal fluid (CSF) multiplex PCRs (Biofire FilmArray®) in children with clinical suspicion of meningitis, encephalitis or sepsis-like illness was performed over the period of 1 year. Subsequently, a subgroup of children (age of 8-84 days of life)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The study aimed to describe the prevalence of HSV DNA, VZV DNA, Enterovirus RNA, Parechovirus RNA, CMV DNA, EBV DNA, adenovirus DNA, HHV-6 DNA, HHV-7 DNA, HHV-8 DNA and Parvovirus B19DNA in children aged less 14 years with a suspected viral infection of the central nervous system in a clinical practice setting.
METHODS: Between January 2012 and May 2015, cerebrospinal fluids from 304 children were tested with an in-house real-time PCR method.
RESULTS: A positive PCR was detected in 64 subjects (21%): the mean number of tests performed in patients who showed a viral infection was 7
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory tract viral infection is one of the most common and important diseases in children. Polymerase chain reaction (PCR) tests are often used to detect viruses in samples, it is difficult to interpret the clinical significance of PCR positivity, which may reflect a past, imminent or active asymptomatic infection due to their high sensitivity. Although single respiratory viruses have been detected in samples from children with symptoms, other respiratory viruses can also be detected simultaneously. However, the clinical importance of these findings for the symptoms is not kno
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute gastroenteritis continues to be a major public health problem worldwide. A wide variety of viruses associated with diarrhea disease is being reported continually. This study investigated the epidemiological situation of viruses that cause diarrhea in Japanese pediatric patients. This study enrolled a total of 2,381 fecal specimens collected between 2009 and 2013 from Japanese children with acute gastroenteritis. There is currently a 70.4% prevalence of viruses causing diarrhea among these Japanese pediatric outpatients. Norovirus was detected in 39.3% of the patients, whereas the prevale
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human parechoviruses (HPeVs) are known to cause meningo-encephalitis among neonates and infants. We aimed to describe the epidemiology of HPeVs causing central nervous system infections in Alberta from 2014 to 2019 with comparison of known HPeV-3 and emerging HPeV-5. Genomic analysis was completed on a subset of HPeV-5 strains to understand genetic relatedness to other known strains. All cerebrospinal fluid (CSF) samples in Alberta with detection of HPeVs were identified and a case review of medical records was conducted, retrospectively, to gather demographic and clinical details. Descriptive
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enteroviruses (EV) and parechoviruses (PeV) are ubiquitous viruses that cause a range of illness, including acute illness in children aged <1 year.
OBJECTIVES: We describe EV and PeV infections among children from 2 US study sites aged <1 year and hospitalized with acute infections. For EV- and PeV-negative case-patients, we explored other viral etiologies.
METHODS: Participants were aged <1 year, hospitalized during 2016, and had cerebrospinal fluid (CSF) collected for routine diagnostic testing. Demographic and clinical data were abstracted from medical charts, and residual spe
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: We present a two-week old girl who was diagnosed with cerebrotendinous xanthomatosis (CTX), an inborn error of bile acid synthesis, after a diagnostic workup for convulsions which were shown to be caused by a parechovirus encephalitis. The diagnosis of CTX was confirmed with CYP27A1 mutation analysis. She was started on chenodeoxycholic acid (CDCA) supplementation, which inhibits cholestanol production through a feedback mechanism, at the advised dosage of 15 mg/kg/day. Within 6 weeks, she developed jaundice with hepatomegaly. CDCA supplementation was stopped after which liver size
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human parechoviruses (HPeVs) and enteroviruses (EVs) belong to the family Picornaviridae. EVs are known to cause a wide range of disease such as meningitis, encephalitis, and sepsis. HPeV1 and 2 have been associated with mild gastrointestinal or respiratory symptoms in young children. HPeV3 is associated with more severe neonatal infection. Little is known about the epidemiology and pathology of HPeV4-6 in children.
METHODS: We evaluated the clinical symptoms of the children with an HPeV 4, 5, or 6 infection. The patients with positive HPeV4-6 in stool samples were selected and av
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inadequate diet and frequent symptomatic infections are considered major causes of growth stunting in low-income countries, but interventions targeting these risk factors have achieved limited success. Asymptomatic infections can restrict growth, but little is known about their role in global stunting prevalence. We investigated factors related to length-for-age Z-score (LAZ) at 24 months by constructing an interconnected network of various infections, biomarkers of inflammation (as assessed by alpha-1-acid glycoprotein [AGP]), and growth (insulin-like growth factor 1 [IGF-1] and collagen X bi
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute viral hepatitis is a disease of great clinical importance. This study proposes actions to better characterise cases of acute hepatitis in Brazil and to provide relevant information to institutionalised health policies within the Unified Health System. Available data on acute hepatitis in Brazil need to be re-evaluated regarding the different hepatotropic agent (hepatitis A to E virus) frequencies, as well as other agents that can cause similar clinical conditions, such as Herpes Simplex Virus 1 and 2(HSV1, HSV2), Varicella Zoster Virus (VZV), Cytomegalovirus (CMV), Epstein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sewage contains a mixed ecosystem of diverse sets of microorganisms, including human pathogenic viruses. Little is known about how conventional as well as advanced treatments of sewage, such as ozonation, reduce the environmental spread of viruses. Analyses for viruses were therefore conducted for three weeks in influent, after conventional treatment, after additional ozonation, and after passing an open dam system at a full-scale treatment plant in Knivsta, Sweden. Viruses were concentrated by adsorption to a positively charged filter, from which they were eluted and pelleted by ultracentrifu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования