Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
6346 публикаций
Поиск: 197 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 650 с найденным полным текстом
Glioblastoma, IDH-wildtype, is the most common and malignant adult-type diffuse glioma. It is characterized by extensive heterogeneity and poor prognosis. Recent single-cell RNA-sequencing studies have revealed distinct transcriptional programs that define cellular states such as astrocyte-like, mesenchymal-like, neural-progenitor-cell-like, and oligodendrocyte-progenitor-cell-like. However, their spatial context remains unclear because of the limitations of single-cell and spot-based spatial transcriptomics. In the present study, we applied a single-cell molecular classification of glioblasto
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spatial transcriptomics (ST) technologies have rapidly advanced the investigation of tumor microenvironment (TME) mechanisms by enabling high-resolution mapping of mRNA molecules within their native spatial context. However, existing methods often overlook phenotypic indices like malignancy status, limiting their interpretability within the tumor microenvironment.
METHODS: This work proposes SP-printer (Spatial-Phenotype printer), a flexible integrating approach that integrates phenotypic and spatial data to quantify stage-specific malignancy levels at each spot. SP-printer first
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the rise of spatially resolved transcriptomics biotechnologies, performing spatially-aware analysis of the resulting data is crucial to maximise advances in biological understanding. Dimensionality reduction is a first step in most analyses of spatial transcriptomics data, and common approaches that preserve total variation of gene expression features do not usually preserve biologically meaningful spatial variation. To this end, we develop weighted sliced inverse regression (wSIR), a sufficient dimension reduction technique that aims to retain the predictive power of the spatial coordina
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics extends traditional transcriptomic methods by quantifying gene expression within intact tissues while preserving each cell's precise spatial context. This technology also captures gene expression under physiological conditions, including interactions with the surrounding microenvironment, thereby enhancing our understanding of cellular states in both health and disease. Rapid recent advances have improved throughput, transcript capture, accuracy, and overall data quality. In this review, we summarize the major spatial transcriptomics platforms and outline their strength
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting spatial transcriptomics from histology images offers cost-effective insights but faces privacy barriers preventing cross-institutional data sharing. To address this, we present privateST, a homomorphic-encryption-optimized framework that substantiates the feasibility of secure spatial transcriptomics prediction. To accommodate the computational constraints of homomorphic encryption, we downsampled the input images using bilinear interpolation. To improve prediction accuracy for the 100 target genes, we incorporated predictions for an auxiliary set of 150 highly expressed genes. This
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ischemic stroke remains a leading contributor to cardiovascular disease, and unstable atherosclerotic plaques in the carotid arteries are an important contributor to its pathogenesis. Notably, sex differences exist in plaque composition and morphology; whereas males are more likely to develop unstable plaques, females present with worse outcomes poststroke. As such, this study aims to elucidate sex-specific cellular and molecular mechanisms driving carotid plaque instability.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing on carotid endarterectomy specimens from male and female
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver is composed of diverse cell populations that coordinate essential metabolic and immune functions. Single-cell transcriptomics has advanced characterization of liver cellular composition, but dissociation of tissue to single-cells can introduce biases through the enrichment or depletion of cell types. Spatial transcriptomics is a complementary approach to avoid inherent bias for cell populations and to add important spatial context. The Visium HD spatial transcriptomics technology from 10X Genomics enables high-resolution spatial mapping of gene expression in tissue samples with a bin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastatic solid tumors persist by evolving therapeutic resistance through complex, heterogeneous adaptive strategies that challenge standard precision medicine approaches. Current clinical decision making relies on bulk biomarkers, failing to resolve the spatial architecture and cellular contexts in which resistance mechanisms emerge. We present a patient-centric spatial framework, profiling 345,207 cells from four metastatic breast cancer patients across ten biopsies spanning personalized treatment courses of up to 3.5 years. By integrating probabilistic topic modeling with spatial deep lear
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ligand-receptor pair analysis, a key aspect of cell-to-cell interactions, is vital for understanding physiological and pathological processes in organisms. However, most analytical tools fail to incorporate spatial in situ information, resulting in false positive predictions. Spatial transcriptomics, which integrates gene expression data with cellular localization, has emerged as a powerful method for inferring cell-cell interactions. Co-localization analysis using spatial transcriptomic data enables the identification of cell candidates with potential interactions, significantly enhancing lig
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics (ST) of archival formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues is fundamentally limited by a trade-off between spatial resolution and transcriptomic sensitivity due to severe molecular crowding and RNA degradation. Here, we present Ex-spRandom, a highly sensitive platform that overcomes this limitation by directly converting diverse, fragmented RNA biotypes into stably anchored cDNA through the integration of random-primed in situ cDNA synthesis chemistry with interpenetrating polymer network (IPN)-based tissue expansion chemistry. This physicochemical synergy physica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tissue repair depends on how inflammatory cues drive regenerative cell-state transitions; a process poorly understood in human tissues. Human dental pulp provides an accessible, structurally well-defined injury model with robust clinical responses, facilitating in situ investigations of inflammatory signaling and endogenous regeneration. Here, we integrated high-resolution spatial transcriptomics with single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to chart its cellular ecosystem in health and caries. We resolved five major cell classes and four odontoblast progenitor subtypes, reconstructing their dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-stage mycosis fungoides (MF) manifests as patch or plaque lesions, and cancer-associated fibroblasts (CAFs) may promote tumorigenesis and Th2-skewed microenvironment. This study aimed to investigate genomic and transcriptomic changes from patch to plaque MF and assess their prognostic significance in early-stage disease. Whole-genome sequencing, CosMx Spatial Molecular Imaging, a single-cell-resolution spatial transcriptome, and immunohistochemical staining for CAF markers FAP, TIMP-1, and CXCL12 were conducted. Whole-genome sequencing showed similar single-nucleotide, copy-number, and s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hidradenitis suppurativa is a chronic, debilitating inflammatory skin disease that progresses from superficial nodules in early stages to dermal tunnels, tertiary lymphoid structures, and fibrosis in advanced lesions. Interplays between dermal tunnel keratinocytes, tertiary lymphoid structures, and fibroblasts promote pathogenic T-cell and B-cell inflammation in late-stage disease. However, whether these immune activations sequentially precede or follow late-stage structure formation is unclear. To delineate the temporal sequence of immune activation, we integrated spatial and single-cell tran
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnostic protocols in endodontics rely heavily on subjective pain assessments and sensibility testing, which may not reflect the underlying histopathological and molecular state of the dental pulp. This limitation can contribute to discordance between clinical diagnosis (reversible (RP) vs. irreversible (IP) pulpitis) and tissue biology, potentially leading to overtreatment of teeth that might respond to conservative, pulp-preserving approaches. Spatial transcriptomics offers an opportunity to explore the cellular and molecular heterogeneity of inflamed pulp in a spatially resolv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the graft-versus-leukemia effect observed with allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in refractory or relapsed acute myeloid leukemia (AML), immunotherapies have been explored in nontransplant settings. We applied a multiomic approach to examine bone marrow interactions in patients with AML treated with pembrolizumab and decitabine. Using extensively trained nuclear and membrane segmentation models, we achieved precise transcript assignment and deep learning-based image analysis. To address read-depth limitations, we integrated single-cell RNA sequencing with single-cell spa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has a poor survival rate due to late detection. PDAC arises from precursor microscopic lesions, termed pancreatic intraepithelial neoplasia (PanIN), that develop at least a decade before overt disease; this provides an opportunity to intercept PanIN-to-PDAC progression. However, immune interception strategies require full understanding of PanIN and PDAC cellular architecture. Surgical specimens containing PanIN and PDAC lesions from a unique cohort of 5 treatment-naive patients with PDAC were surveyed using spatial omics (proteomic and transcriptomic). F
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM), which develops from myocardial inflammation, is frequently linked to a poor prognosis and fatal outcome. Experimental autoimmune myocarditis (EAM) serves as an animal model of CD4+ T cells-dependent acute myocarditis that is followed by the development of post-inflammatory DCM. The study's objective was to employ spatial transcriptomics to investigate how cardiac fibroblasts' transcriptional patterns changed during the acute inflammatory phase of EAM. Our spatial transcriptomic analysis on 1545 cardiac fibroblasts enriched spots, in 657 of which fibroblasts were d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine spinal neurodegenerative conditions are frequently encountered in sport and racing horses and may be career-ending diagnoses. To further define the spatial transcriptomic landscape of equine dorsal root ganglia (DRG) in healthy adult horses, we investigated gene expression differences in distinct DRG regions using the GeoMx Digital Spatial Profiling from NanoString. Four human cell markers demonstrated high fidelity for equine cells; microtubule-associated protein 2 (MAP2), myelin basic protein (MBP), allograft inflammatory 104 factor 1/ionized calcium-binding adaptor molecule 1 (IBA1/A
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: More than half of patients with ischemic stroke experience futile reperfusion, increasing the risk of death and disabilities despite a successful recanalization. The reason behind this is debated, and we aim to investigate cerebrovascular changes toward a broader understanding of these conditions. We hypothesize that ischemic stroke reperfusion modifies the expression profile in the microvasculature in a spatial manner toward peri-infarct brain edema and circulatory failure.
METHODS: We investigated the early (24-hour) changes in spatial gene expression in the brain parenchymal en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics (ST) technologies provide genome-wide mRNA profiles in tissue context but lack direct protein-level measurements, which are critical for interpreting cellular function and microenvironmental organization. We present DGAT (Dual-Graph Attention Network), a deep learning framework that imputes spatial protein expression from transcriptomics-only ST data by learning RNA-protein relationships from spatial CITE-seq datasets. DGAT constructs heterogeneous graphs integrating transcriptomic, proteomic, and spatial information, encoded using graph attention networks. Task-specifi
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.