In the previous paper of this series [Ko, H.-Y. et al. J. Chem. Theory Comput. 2020, 16, 3757-3785], we presented a theoretical and algorithmic framework based on a localized representation of the occupied space that exploits the inherent sparsity in the real-space evaluation of the exact exchange (EXX) interaction in finite-gap systems. This was accompanied by a detailed description of exx, a massively parallel hybrid message-passing interface MPI/OpenMP implementation of this approach in Quantum ESPRESSO (QE) that enables linear scaling hybrid density functional theory (DFT)-based ab initio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ConspectusA comprehensive understanding of electron transfer (ET) mechanisms in metal nanoclusters (NCs) is pivotal for unlocking their full potential in diverse chemical, biological, and energy-related applications. Owing to their atomic-level structural precision, ET dynamics in metal NCs can be precisely controlled and fine-tuned at the single-molecule or even single-atom level, thereby facilitating the establishment of well-defined structure-ET-application relationships. Furthermore, metal NCs occupy a unique transitional domain between individual atoms and larger nanoparticles, exhibiting
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fezolinetant, the first-in-class hot flashes drug, was flagged in September 2024 by US-FDA for liver injury. It is alarming that an FDA-approved drug shows liver toxicity within a year. Fezolinetant's metabolic pathways and metabolites are not disclosed in the FDA label, clinical trial, or other literature reports. This creates a gap in understanding the mechanisms of metabolism and toxicity. In this manuscript, we have investigated novel metabolic pathways that generate reactive metabolites and rationalize hepatotoxicity. Quantum chemical calculations were performed to assess the reactivity o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum chemical calculations using density functional theory at the BP86/def2-TZVPP level are reported for the structures and aromaticities of the monocyclic molecules E6H6 and E4H4 (E = C, Si). The results reveal drastic differences between the carbon and silicon homologues. Benzene (1b) is the global energy minimum on the C6H6 PES whereas planar D6h Si6H6 (2d) is not an energy minimum and the D3d form 2c is higher in energy than the prismane isomer 2a. There is an ubiquitous number of stable phenyl compounds but the only experimentally known Si6R6 compound has the structure of the tricyclic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the nature of the interaction between mercury(II) ions, Hg2+, and water molecules is crucial to describe the stability and chemical behavior of structures formed during solvation, as well as the conditions that favor the Hg2+ coordination or inducing water hydrolysis. In our study, we explored exhaustively the potential energy surface of Hg2+ with up to six water molecules. We analyzed electronic and Gibbs free energies, binding, and nuclear magnetic resonance parameters. We used the zeroth-order regular approximation Hamiltonian, including scalar and spin-orbit relativistic corr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small-molecule binding in metal-organic frameworks (MOFs) can be accurately studied both experimentally and computationally, provided the proper tools are employed. Herein, we compare and contrast properties associated with guest binding by means of density functional theory (DFT) calculations using nine different functionals for the M2(dobdc) (dobdc4- = 2,5-dioxido,1,4-benzenedicarboxylate) series, where M = Mg, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, and Zn. Additionally, we perform Quantum Monte Carlo (QMC) calculations for one system to determine if this method can be used to assess the performance of DFT. We
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The steroid 17 alpha-ethynyl-19-nor-4-androsten-17 beta-ol, 3-one (Norethisterone; NET) and its 5 alpha-dihydro (5 alpha-NET), 3 alpha- and 3 beta-tetrahydro derivatives (3 alpha,5 alpha- and 3 beta,5 alpha-NET), were comparatively studied by the ab initio quantum mechanics theory. Additionally, 5 alpha-androstan-3 beta,17 beta-diol (ADIOL) was also studied. The Hartree-Fock method and the 6-31G(*) basis set were used to obtain the lowest energy conformation, geometries, electronic structure and physicochemical properties of the steroids. The results showed bond distances and valence angles si
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 encodes the Mac1 domain within the large nonstructural protein 3 (Nsp3), which has an ADP-ribosylhydrolase activity conserved in other coronaviruses. The enzymatic activity of Mac1 makes it an essential virulence factor for the pathogenicity of coronavirus (CoV). They have a regulatory role in counteracting host-mediated antiviral ADP-ribosylation, which is unique part of host response towards viral infections. Mac1 shows highly conserved residues in the binding pocket for the mono and poly ADP-ribose. Therefore, SARS-CoV-2 Mac1 enzyme is considered as an ideal drug target and inhib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Searching for single-molecule magnets (SMM) with large effective blocking barriers, long relaxation times, and high magnetic blocking temperatures is vitally important not only for the fundamental research of magnetism at the molecular level but also for the realization of new-generation magnetic memory unit. Actinides (An) atoms possess extremely strong spin-orbit coupling (SOC) due to their 5f orbitals, and their ground multiplets are largely split into several sublevels because of the strong interplay between the SOC of An atoms and the crystal field (CF) formed by ligand atoms. Compared to
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chemical bonding of actinide ions with arene and borohydride ligands is explored via quantum chemical methods to understand how the transuranium elements interact with soft-donor ligands. Specifically, the [An(C6Me6)(BH4)3] complexes (An = U, Np, and Pu) and their reduced congeners are studied. Density functional theory (DFT) shows that the metal-ligand interactions in the neutral complexes are governed by electrostatic interactions. Both DFT and complete active space (CASSCF) results show that as one moves from U to Pu, the 5f-orbitals are stabilized leading to a poorer energy match with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twelve kinds of 8-hydroxyquinoline derivatives were synthesized and characterized. The weight loss method was used to evaluate their inhibition efficiencies (IEs) in a 1.0 M HCl solution at 333 K. The results showed that the alkyl chain length, heteroatoms (S, N, and O), and number of benzene rings significantly affect the IE. Herein, the IE of 5-[(dodecylthio)methyl]-8-quinolinol reached 98.71%. Meanwhile, the potentiodynamic polarization results indicated that all 8-hydroxyquinoline derivatives were mixed-type inhibitors. Electrochemical impedance spectroscopy results revealed that 8-hydroxy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ligand-induced chirality in semiconducting nanocrystals has been the subject of extensive study in the past few years and shows potential applications in optics and biology. Yet, the origin of the chiroptical effect in semiconductor nanoparticles is still not fully understood. Here, we examine the effect of the interaction with amino acids on both the fluorescence and the optical activity of chiral semiconductor quantum dots (QDs). A significant fluorescence enhancement is observed for l/d-Cys-CdTe QDs upon interaction with all the tested amino acids, indicating suppression of nonradiative pat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endohedral clusters, formed by incorporating a single Mn atom into a cage of tin atoms, have been generated in the gas phase. Mass spectrometry reveals that a cage size of 10 tin atoms is necessary for the efficient incorporation of one Mn atom. Some of the cluster compounds with one Mn atom attached to the tin clusters display large intensities compared to the pure tin clusters, indicating that the compound clusters are particularly stable. The manganese-doped tin cluster assemblies Mn@Sn12, Mn@Sn13, and Mn@Sn15 have been further analyzed within a molecular beam magnetic deflection experiment
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of transition metal complexes have been synthesized from biologically active curcumin and isoniazid Schiff base. They are characterized by various spectral techniques like UV-Vis, Fourier transform infrared (FT-IR), nuclear magnetic resonance (NMR), electron paramagnetic resonance (EPR) and mass spectroscopies. Moreover, elemental analysis, magnetic susceptibility and molar conductivity measurements are also carried out. All these data evidence that the metal complexes acquire square planar except zinc(II) which adopts a tetrahedral geometry, and they are non-electrolytic in nature. G
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cr(III), Mn(II) and Fe(III) complexes derived from the quadruple potential dithione heterocyclic thiosemicarbazide ligand (H(2)PET) have been prepared and characterized by conventional techniques. The isolated complexes were assigned the formulae, [Cr(HPET)(H(2)O)(2)Cl(2)]·3H(2)O, [Mn(HPET)(H(2)O)Cl](2) and [Fe(HPET)(H(2)O)(2)Cl(2)]·H(2)O, respectively. IR data revealed that the ligand behaves as monobasic bidentate through (C=N)(py) and (C-S) groups in both Cr(III) and Fe(III) complexes. In the binuclear Mn(II) complex, H(2)PET acts as NSNS monobasic tetradente via (C=N)(py), (C-S), (C=S) and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Motivated by their potential use as a photosensitizer in photodynamic therapy, we report an electrostatic embedding quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) study of 6-selenoguanine and 6-thioguanine in water. We analyzed triplet-state nonradiative decay within quasi-Marcus theory and assessed the influence of solvation by comparing QM/MM with previous microsolvation and PCM models. Both molecules follow similar deactivation pathways, involving torsional distortion around the chalcogen center and decay through a T₁/S₀ crossing point. Experimental studies show that triplet decay o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding light-activated processes in molecular rotors is essential for applications ranging from energy storage to light-emitting materials. Rotation around single bonds provides an efficient nonradiative decay pathway, leading many molecular rotors to undergo quenching across environments. Nonadiabatic dynamics simulations offer a route to disentangling competing decay channels, but the predicted mechanisms depend sensitively on the level of theory. Here, we examine how different electronic-structure methods shape the topology of conical intersections and, in turn, the photochemical beh
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a powerful neurodegenerative disease characterized by cholinergic deficiency, where the inhibition of acetylcholinesterase (AChE) remains a clinically validated strategy. In our current work, a virtual screening platform supported by machine learning identified new inhibitors of AChE out of a structurally diverse collection of 2,895 marine bacterial natural products. Following a curation based on a structure-based strategy, a robust regression model was constructed from the physicochemical and structural characteristics of the reported inhibitors of AChE in an attem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hydrated electron, an excess electron in liquid water, plays a crucial role in a plethora of chemical processes, motivating extensive research efforts to characterize its structure, dynamics, and reactivity in solution. Recent theoretical approaches to understanding this intriguing object have involved ab initio simulations based on density functional theory (DFT). Although DFT allows for the study of hydrated electron reactivity and quantum mechanical behavior, it is well-known that anionic systems can suffer from significant density-driven errors (DDEs). Density-corrected DFT (DC-DFT) pr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sunscreens, a primary defense against ultraviolet (UV) radiation, use UV filters to mitigate the harmful effects of UVA and UVB radiation, including DNA damage, skin aging, and cancer. However, organic UV filters like benzophenones, oxybenzone, sulisobenzone, and PABA are persistent pollutants, posing environmental risks due to their incomplete removal by conventional wastewater treatment. This study investigates the encapsulation of hazardous UV filters inside a stable belt[14]pyridine nanobelt to facilitate their removal through host-guest interactions. The higher values of interaction energ
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования