Histone deacetylase inhibitors (HDACi) are potential candidates for therapeutic approaches in cancer and neurodegenerative diseases such as spinal muscular atrophy (SMA)--a common autosomal recessive disorder and frequent cause of early childhood death. SMA is caused by homozygous absence of SMN1. Importantly, all SMA patients carry a nearly identical copy gene, SMN2, that produces only minor levels of correctly spliced full-length transcripts and SMN protein. Since an increased number of SMN2 copies strongly correlates with a milder SMA phenotype, activation or stabilization of SMN2 is consid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dermatopontin (DPT), a small extracellular matrix protein that stimulates collagen fibrillogenesis, contains sulfotyrosine residues but neither its level of sulfation nor its binding sites on fibrillar collagens are known. Here, we discovered that DPT is present in a relatively high mass concentration (~ 0.02%) in porcine corneal stroma, from which we purified five DPT charge variants (A-E) containing up to six sulfations. The major variant (C), containing four sulfotyrosine residues, was used to locate binding sites for DPT on triple-helical collagens II and III using the Collagen Toolkits. D
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacteriophage T4 gene 59 helicase assembly protein is required for recombination-dependent DNA replication, which is the predominant mode of DNA replication in the late stage of T4 infection. T4 gene 59 helicase assembly protein accelerates the loading of the T4 gene 41 helicase during DNA synthesis by the T4 replication system in vitro. T4 gene 59 helicase assembly protein binds to both T4 gene 41 helicase and T4 gene 32 single-stranded DNA binding protein, and to single and double-stranded DNA. We show here that T4 gene 59 helicase assembly protein binds most tightly to fork DNA substrat
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferritins play a key role in iron management in organisms from all kingdoms of life. Excess iron is sequestered in mineral form within the hollow protein shell and can be liberated when supply becomes restricted. The protein consists of 24 isostructural monomeric units that pack with 4-, 3-, and 2-fold symmetry. Channels through the protein coat at the 3-fold axes of ferritins localised in the cytosol of animal cells contain a strictly conserved LCDFXEX 'twin carboxylate' motif, and have been shown to be the major iron entry route to animal ferritins, facilitating access to the H-chain intra-s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone defects, commonly associated with osteoporosis, result in fragile bones prone to fractures in both men and women. Osteoporotic fractures often lead to prolonged healing due to impaired cell differentiation. Understanding cellular crosstalk during bone regeneration is crucial for developing effective treatments. Periosteum-derived progenitor cells (PDPCs) and adipose-derived stem cells (ADSCs) play essential roles in bone formation because ADSCs secret key growth factors, such as bone morphogenetic protein-2, Wnt family member 1, Periostin, and platelet-derived growth factor subunit A, tha
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
De novo protein folding into a native three-dimensional structure is indispensable for biological function, is instructed by its amino acid sequence, and occurs along a vectorial trajectory. The human proteome contains thousands of membrane-spanning proteins, whose biosynthesis begins on endoplasmic reticulum-associated ribosomes. Nearly half of all membrane proteins traverse the membrane more than once, including therapeutically important protein families such as solute carriers, G-protein-coupled receptors, and ABC transporters. These mediate a variety of functions like signal transduction a
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein folding is a complex process in which amino acid sequences encode the information required for a polypeptide chain to fold into its functional three-dimensional (3D) structure. Many proteins share common substructures and recurring secondary structure elements that contribute to similar 3D folding patterns, even across different protein families. This study examines two distinct groups of proteins, the RNase A-like fold and the trypsin-like serine protease fold, classified by SCOPe. These proteins share only some substructures that contribute to their folding cores. Despite
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis is a lethal genetic disorder caused by misfolding of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) protein, most commonly due to the ΔF508 mutation. Despite extensive study, CFTR's folding process has remained inaccessible to direct observation. Here, we apply single-molecule magnetic tweezers to resolve the complete folding trajectories of wild-type and ΔF508 CFTR with near-amino acid resolution. We find that CFTR follows a hierarchical, template-guided folding pathway in which N-terminal domains scaffold downstream folding. This mechanism tightly couples the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the relationships between protein topology, amino acid sequence and folding mechanisms, the folding transition state of the Sso7d protein has been characterised both experimentally and theoretically. Although Sso7d protein has a similar topology to that of the SH3 domains, the structure of its transition state is different from that of alpha-spectrin and src SH3 domains previously studied. The folding algorithm, Fold-X, including an energy function with specific sequence features, accounts for these differences and reproduces with a good agreement the set of experimental phi(dou
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The funneled energy landscape theory suggests that the folding pathway of homologous proteins should converge at the late stages of folding. In this respect, proteins displaying a broad energy landscape for folding are particularly instructive, allowing inferring both the early, intermediate and late stages of folding. In this paper we explore the folding mechanisms of human frataxin, an essential mitochondrial protein linked to the neurodegenerative disorder Friedreich's ataxia. Building upon previous studies on the yeast homologue, the folding pathway of human frataxin is thoroughly examined
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single molecule techniques are particularly well suited for investigating the processes of protein folding and chaperone assistance. However, current assays provide only a limited perspective on the various ways in which the cellular environment can influence the folding pathway of a protein. In this study, a single molecule mechanical interrogation assay is developed and used to monitor protein unfolding and refolding within a cytosolic solution. This allows to test the cumulative topological effect of the cytoplasmic interactome on the folding process. The results reveal a stabilization agai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the factors that shape viral evolution is critical for developing effective antiviral strategies, accurately predicting viral evolution, and preventing pandemics. One fundamental determinant of viral evolution is the interplay between viral protein biophysics and the host machineries that regulate protein folding and quality control. Most adaptive mutations in viruses are biophysically deleterious, resulting in a viral protein product with folding defects. In cells, protein folding is assisted by a dynamic system of chaperones and quality control processes known as the proteostas
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zinc finger proteins that bind Zn(II) using a Cys2His2 coordination motif within a ββα protein fold are the most abundant DNA binding transcription factor domains in eukaryotic systems. These classic zinc fingers are typically unfolded in the apo state and spontaneously fold into their functional ββα folds upon incorporation of Zn(II). These metal-induced protein folding events obscure the free energy cost of protein folding by coupling the protein folding and metal-ion binding thermodynamics. Herein, we determine the formation constant of a Cys2His2/ββα zinc finger domain, the C-terminal fing
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The correct folding of proteins is a prerequisite for their biological functions, but the secret of protein folding is still not fully understood. Recently, a new theory of protein folding was proposed: the Confined Lowest Energy Fragment (CLEF) hypothesis, which can explain protein folding experiments well. According to the CLEF hypothesis, all proteins can be divided into independent folding units (CLEF fragments), which can even refold into their native conformation via suitable nanoparticle (NP)-peptide interactions. This opens the door to creating artificial proteins by restoring the nati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein folding is a natural phenomenon through which a linear polypeptide possessing necessary information attains three-dimension functionally active conformation. This is a complex and multistep process and therefore, the presence of several intermediary structures could be speculated as a result of protein folding. In in vivo, this folding process is governed by the assistance of other proteins called molecular chaperones and heat shock proteins. Due to the mechanism of protein folding, these intermediary structures remain major challenge for modern biology. Mutation in gene encoding amino
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein folding is a complex, multisystem process characterized by heavy molecular and cellular footprints. Chaperone machinery enables proper protein folding and stable conformation. Other pathways concomitant with the protein folding process include transcription, translation, post-translational modifications, degradation through the ubiquitin-proteasome system, and autophagy. As such, the folding process can go awry in several different ways. The pathogenic basis behind most neurodegenerative diseases is that the disruption of protein homeostasis (i.e. proteostasis) at any level will eventu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
E. coli chaperonin GroEL forms nano-cages for protein folding. Although the chaperonin-mediated protein folding mechanism is well understood, the role of the conserved glycine and methionine-rich carboxy-terminal residues remains unclear. Bacteria with multiple chaperonins always retain at least one paralogue having the gly-met-rich C-terminus, indicating an essential conserved function. Here, we observed a stronger selection pressure on the paralogues with gly-met-rich C-termini, consistent with their ancestral functional importance. E. coli GroEL variants having mutations in their C-termini
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The correction of protein folding is fundamental for cellular functionality and its failure can lead to severe diseases. In this context, molecular chaperones are crucial players involved in the tricky process of assisting in protein folding, stabilization, and degradation. Chaperones, such as heat shock proteins (HSP) 90, 70, and 60, operate within complex systems, interacting with co-chaperones both to prevent protein misfolding and direct to the correct folding. Chaperone targeting drugs could represent a challenging approach for the treatment of cystic fibrosis (CF), an autosomal recessive
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral protein biogenesis underpins every viral life cycle stage, and elucidating these processes could reveal fundamental principles of virus-host interaction, and vulnerabilities amenable to therapeutic targeting. Here we apply biophysical, molecular, and cell biology techniques to investigate the insertion, folding, and oligomerization of the SARS-CoV-2 M protein. We describe the sequential co-translational insertion of the hydrophobic core, and demonstrate that the cytosolic C-terminal domain undergoes slower adoption of its tertiary structure. Additionally, we characterize how the transmem
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular chaperones play a critical role in proteostasis by aiding the folding of newly synthesized proteins and the refolding of misfolded proteins. Cells must match the protein synthesis rate to the protein folding capacity to avoid the accumulation of unfolded proteins that can form toxic aggregates. The Hsp70 chaperone DnaK binds to ribosomes and decreases protein synthesis in the bacterial pathogen Salmonella enterica serovar Typhimurium when facing cytoplasmic Mg2+ starvation, an infection-relevant stress that disrupts proteostasis. DnaK decreases protein synthesis independently of J-do
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования