BACKGROUND: Although genome-wide association studies (GWAS) have identified numerous common genetic risk variants for Parkinson's disease (PD), the underlying biological mechanisms remain largely unresolved.
OBJECTIVES: We aimed to identify circulating proteins causally associated with PD risk in European and East Asian populations and determine whether these associations are shared or ancestry-specific.
METHODS: We employed a two-sample Mendelian randomization (MR) approach, integrating large-scale proteomic and genetic data, with validation using summary-data-based MR (SMR). European analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequential dengue virus (DENV) infection is thought to induce long-lived protection against dengue. However, little is known about the specificity, phenotype, and repertoire of the enduring B cell response due to limitations in high-throughput methods. We used stabilized DENV envelope (E) dimers as probes for in-depth memory B cell repertoire characterization using two complementary sequencing strategies. Using Rapid Assembly, Transfection, and Production of Immunoglobulins (RATP-Ig), we isolated 227 DENV2 E dimer-specific memory B cells from an immune donor, of which 87% bound at least two se
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeting cell cycle checkpoints has emerged as a promising strategy in cancer therapy, yet single-agent inhibitors often fail because of compensatory mechanisms. Here, we demonstrate that coinhibition of ATR (RP-3500) and PKMYT1 (RP-6306) induces synthetic lethality in Rb1-deficient breast cancers by disrupting both S-G2 and G2-M checkpoints. This leads to replication stress, premature mitotic entry, and accumulation of DNA damage. In vitro, Rb1-deficient breast cancer cells exhibited marked apoptosis and loss of clonogenic survival, whereas Rb1-proficient models remained resistant to combina
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Drug resistance is a major obstacle to the long-term effectiveness of cancer therapies. Approximately 70% of breast cancer patients relapse after 5 years of treatment, and the lack of biomarkers associated with drug resistance translates to poor prognosis in the clinic. Previous research has utilised omics approaches to uncover biomarkers driving drug resistance, with a strong emphasis on genetic mutations.
METHODS: Here, we identified a nine-marker signature associated with resistance to lapatinib in a HER2-positive breast cancer model using a target discovery approach by emplo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosome profiling has revealed thousands of noncanonical translation events across mammalian genomes, yet functional characterization has overwhelmingly focused on proliferative fitness in cancer cell lines. Here, we present a comprehensive survey of noncanonical translation in the mouse immune system and its functional consequences in macrophages. By performing a unified Ribo-seq meta-analysis across 20 public mouse leukocyte datasets - spanning macrophages, dendritic cells, neutrophils, B cells, and T cells - we define a compendium of 22,276 noncanonical coding sequences (CDSs), including u
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Multiple sclerosis (MS) develops after a prolonged preclinical phase. Identifying circulating biomarkers that capture this early biology can improve risk stratification and guide intervention. We aimed to identify plasma proteins driving MS susceptibility using large-scale proteogenomic integration and to evaluate their prediagnostic predictive value and effects on severity.
METHODS: We used cis-acting protein quantitative trait loci (pQTL) for 2,545 plasma proteins (n = 80,824). Predicted protein levels were tested for association with MS risk in 14,802 cases and 26,703 controls u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oesophageal adenocarcinoma (OAC) is a cancer of high unmet clinical need. Because of tumour heterogeneity, it is likely that OAC will be stratified into several subtypes. Claudin 18.2 antibodies form emerging novel therapeutics in patients with a subtype of OAC. A large-scale proteogenomics screen in OAC identified glycoprotein A33 (GPA33) protein as a dominating cancer-specific target. We set out to determine whether GPA33 is distinct from or overlaps with Claudin 18.2 as a theranostic target in OAC.
METHODS: A microarray from n = 106 patients, composed of cancer, normal squamous
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Prospective proteomic and proteogenomic studies may enhance the understanding of proteins associated with prostate cancer (PCa) development.
METHODS: In a case-cohort study within the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC), baseline plasma samples from 982 incident PCa cases and 1573 subcohort participants were profiled using the SomaScan 7k platform (over 6000 proteins). Associations were estimated using Prentice-weighted Cox models. The coprimary end points were incident overall PCa and aggressive PCa (n = 290). Findings were evaluated
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We aim to investigate whether the myelodysplastic syndrome stem cell (MDS-SC)-based assay could be used to predict relapse and survival after treatment in patients with MDS with excess blasts (MDS-EB).
METHODS: A total of 143 cases receiving allografting were prospectively enrolled. A single-cell proteogenomic technique was used to evaluate the characteristics of CD34+ MDS subsets. These cells were detected using multiparameter flow cytometry (MFC) at diagnosis and post-treatment.
RESULTS: The phenotypically defined (PD) CD34+CD38-cocktail+ (CD56/CD22/CD11b/CD7/Tim-3/CLL-1) MDS-S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Microproteins (miPs) translated from small open reading frames (smORFs) are crucial regulators of cell function. However, the expression and function of miPs in endothelial cells and alterations in miP expression linked with inflammation and cardiovascular disease, remain largely unexplored.
METHODS AND RESULTS: An optimized proteogenomic approach combining RiboTag RNA-sequencing and mass spectrometry of the small molecular mass proteome was utilized to identify endothelial cell-specific miPs. Heart, lung, and blood vessels from endothelial cell-specific RiboTag mice and human endotheli
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endogenous retroelements (EREs) constitute about 42% of the human genome and have been implicated in common human diseases such as autoimmunity and cancer. The dominant paradigm holds that EREs are expressed in embryonic stem cells (ESCs) and germline cells but are repressed in differentiated somatic cells. Despite evidence that some EREs can be expressed at the RNA and protein levels in specific contexts, a system-level evaluation of their expression in human tissues is lacking.
METHODS: Using RNA sequencing data, we analyzed ERE expression in 32 human tissues and cell types, inc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adult rattlesnakes within genus Crotalus express one of two distinct venom phenotypes, type I (hemorrhagic) and type II (neurotoxic). In Costa Rican Central American rattlesnake, ontogenetic changes in the concentration of miRNAs modulate venom type II to type I transition. Venomics and venom gland transcriptome analyses showed that adult C. simus and C. tzabcan expressed intermediate patterns between type II and type I venoms, whereas C. culminatus had a canonical type I venom. Neonate/juvenile and adult Mexican rattlesnakes showed notable inter- and intraspecific variability in the number, t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bone malignancies, particularly high-grade primary bone sarcomas, remain clinically challenging due to early dissemination, marked heterogeneity, and limited progress in systemic therapies for metastatic or relapsed disease. While genomics and transcriptomics have clarified structural complexity and transcriptional programs, they provide only an indirect view of the functional machinery that ultimately drives invasion, immune escape, and therapy resistance. Proteomics and phosphoproteomics offer a complementary and often non-redundant layer by reporting protein abundance, pathway a
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumors (MPNSTs) are aggressive sarcomas of peripheral nerve sheath that frequently arise in patients with neurofibromatosis type 1 (NF1) and currently have no approved targeted treatment. Loss of Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) activity, through inactivating mutations in SUZ12 or EED, occurs in 50 to 80% of NF1-associated MPNSTs, leads to depletion of H3K27me3 in cells, global epigenetic dysregulation, and serves as an indicator of poor clinical outcomes. SWI/SNF (BAF) complexes are ATPase-driven chromatin remodelers essential for orderly transcriptional
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate prediction of breast cancer biomarkers - including oestrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), human epidermal growth factor receptor 2 (HER2), molecular subtypes (PAM50), and the proliferation marker Ki-67 (MKI67) - is essential for treatment stratification and prognosis. Existing computational approaches predominantly rely on single-cohort data, limiting their clinical generalisability.
METHODS: We propose M3FusionNet (Multi-modal, Multi-scale, Multi-source Fusion Network), a comprehensive multimodal deep learning framework integrating haematoxylin-and-eosin (H
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Postmenopausal atrophic vaginitis (PAV) is a prevalent and undertreated condition driven primarily by estrogen deficiency. Whether circulating inflammatory proteins causally contribute to PAV pathogenesis remains unknown.
METHODS: Genetic instruments for 91 inflammatory proteins were derived from large-scale proteogenomic GWAS of European ancestry individuals. PAV outcome data were obtained from the FinnGen Consortium Release 12. Primary causal estimates were obtained using the inverse-variance weighted (IVW) method, complemented by MR-Egger, weighted median, and weighted mode ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrocephalus, the leading indication for childhood neurosurgery worldwide, is particularly prevalent in low- and middle-income countries. Hydrocephalus preceded by an infection, or postinfectious hydrocephalus, accounts for up to 60% of hydrocephalus in these areas. Since many children with hydrocephalus suffer poor long-term outcomes despite surgical intervention, prevention of hydrocephalus remains paramount. Our previous studies implicated a novel bacterial pathogen, Paenibacillus thiaminolyticus, as a causal agent of neonatal sepsis and postinfectious hydrocephalus in Uganda. Here, we rep
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endocrine disruptors (EDs) are chemicals that contribute to health problems by interfering with the physiological production and target effects of hormones, with proven impacts on a number of endocrine systems including the thyroid gland. Exposure to EDs has also been associated with impairment of the reproductive system and incidence in occurrence of obesity, type 2 diabetes, and cardiovascular diseases during ageing. SCREENED aims at developing in vitro assays based on rodent and human thyroid cells organized in three different three-dimensional (3D) constructs. Due to different levels of an
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Stroke incidence is declining in older adults but rising in younger populations. Circulating plasma proteins are promising biomarkers of vascular disease, yet their causal role in early-onset stroke (EOS) remains unclear. We used proteome-wide Mendelian randomization (MR) to identify proteins causally associated with EOS and its subtypes.
METHODS: We conducted two-sample MR using protein quantitative trait loci from 54,219 UK Biobank participants and summary-level association results from up to 11,114 EOS cases (onset <60 years) and 435,540 controls in the Early-Onset Stroke Conso
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma of the skin is the sixth most common type of cancer in Europe and accounts for 3.4% of all diagnosed cancers. More alarming is the degree of recurrence that occurs with approximately 20% of patients lethally relapsing following treatment. Malignant melanoma is a highly aggressive skin cancer and metastases rapidly extend to the regional lymph nodes (stage 3) and to distal organs (stage 4). Targeted oncotherapy is one of the standard treatment for progressive stage 4 melanoma, and BRAF inhibitors (e.g. vemurafenib, dabrafenib) combined with MEK inhibitor (e.g. trametinib) can effective
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования