Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
6346 публикаций
Поиск: 77 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 650 с найденным полным текстом
BACKGROUND: Sjögren's Disease (SjD) is a systemic autoimmune disorder characterised by exocrine gland dysfunction and immune infiltration. However, the spatial cellular architecture and metabolic-immune crosstalk underlying glandular pathology in SjD remain unclear.
METHODS: We performed spatial transcriptomics on SjD salivary glands (SGs) and conducted integrative analyses with single-cell RNA sequencing to delineate disease-specific transcriptomic alterations, followed by validation in an independent cohort. Key findings were verified via immunofluorescence, immunohistochemistry, and functi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In severe Placenta Accreta Spectrum (PAS), trophoblasts gain deep access in the myometrium (placenta increta). This study investigated alterations at the fetal-maternal interface in PAS cases using a systems biology approach consisting of immunohistochemistry, spatial transcriptomics and proteomics. We identified spatial variation in the distribution of CD4+, CD3+ and CD8+ T-cells at the maternal-interface in placenta increta cases. Spatial transcriptomics identified transcription factors involved in promotion of trophoblast invasion such as AP-1 subunits ATF-3 and JUN, and NFKB were upregulat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extramedullary disease (EMD) is a high-risk feature of multiple myeloma (MM) and remains a poor prognostic factor, even in the era of novel immunotherapies. Here, we applied spatial transcriptomics (RNA tomography for spatially resolved transcriptomics [tomo-seq] [n = 2] and 10x Visium [n = 12]) and single-cell RNA sequencing (n = 3) to a set of 14 EMD biopsies to dissect the 3-dimensional architecture of tumor cells and their microenvironment. Overall, infiltrating immune and stromal cells showed both intrapatient and interpatient variations, with no uniform distribution over the lesion. We o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in spatial transcriptomics (ST) techniques provide valuable insights into cellular interactions within the tumor microenvironment (TME). However, most analytical tools lack consideration of histological features and rely on matched single-cell RNA sequencing data, limiting their effectiveness in TME studies. To address this, we introduce the Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI), an end-to-end framework that maps cancer cells and TME components, stratifies cell types and states, and analyzes cell co-localization. By integrating spatial transcripto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: The intrahepatic processes associated with chronic hepatitis B (CHB), especially in the context of hepatitis delta virus (HDV) and HIV co-infection, require a better understanding. Spatial transcriptomics can provide new insights into the complex intrahepatic biological processes, guiding new personalised treatments. Our aim is to evaluate this method characterising the intrahepatic transcriptional landscape, cellular composition and biological pathways in liver biopsy samples from patients with hepatitis B virus (HBV) and HDV or HIV co-infection.
METHOD: The NanoString G
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aquaporin-4 (AQP4) is highly polarized to perivascular astrocytic endfeet. Loss of AQP4 polarization is associated with many diseases. In Alzheimer's disease (AD), AQP4 loses its normal location and thus reduces the clearance of amyloid-β plaques and tau protein. Clinical and experimental studies showed that moxibustion can improve the learning and memory abilities of AD. To explore whether moxibustion can affect the polarization of AQP4 around the blood-brain barrier (BBB), we used spatial transcriptomics (ST) to analyze the expression and polarization of Aqp4 in wild-type mice, APP/PS1 mice,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne muscular dystrophy is caused by mutations in the DMD gene, leading to lack of dystrophin. Chronic muscle damage eventually leads to histological alterations in skeletal muscles. The identification of genes and cell types driving tissue remodeling is a key step to developing effective therapies. Here we use spatial transcriptomics in two Duchenne muscular dystrophy mouse models differing in disease severity to identify gene expression signatures underlying skeletal muscle pathology and to directly link gene expression to muscle histology. We perform deconvolution analysis to identify c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomic technologies, such as the Visium platform, measure gene expression in different regions of tissues. Here, we describe new software, STmut, to visualize somatic point mutations, allelic imbalance, and copy number alterations in Visium data. STmut is tested on fresh-frozen Visium data, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) Visium data, and tumors with and without matching DNA sequencing data. Copy number is inferred on all conditions, but the chemistry of the FFPE platform does not permit analyses of single nucleotide variants. Taken together, we propose solutions to add
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis and cirrhosis have limited therapeutic options and represent a serious unmet patient need. Recent use of single-cell RNA sequencing (scRNAseq) has identified enriched cell types infiltrating cirrhotic livers but without defining the microanatomical location of these lineages thoroughly. To assess whether fibrotic liver regions specifically harbor enriched cell types, we explored whether whole-tissue spatial transcriptomics combined with scRNAseq and gene deconvolution analysis could be used to localize cell types in cirrhotic explants of patients with end-stage liver disease (to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To understand the cellular and spatial composition of conventional ameloblastoma and its alteration after marsupialization treatment.
MATERIALS AND METHODS: We applied single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics on pre- and post-marsupialization conventional ameloblastoma slices, followed by cluster, trajectory, network analysis, and immunofluorescence validation.
RESULTS: We found a continuous cell trajectory from pre-marsupialization epithelium-like cell types to post-marsupialization mesenchyme-like cell types. Comparison with our recently established human embryonic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serial spatial omics technologies capture genome-wide gene expression patterns in thin tissue sections but lose spatial continuity along the third dimension. Reconstructing these two-dimensional measurements into coherent three-dimensional volumes is necessary to relate molecular domains, gradients, and tissue architecture within whole organs or embryos. sc3D is an open-source Python framework that registers consecutive spatial transcriptomic sections, interpolates bead coordinates in three dimensions, and stores the result in an AnnData object compatible with Scanpy. The workflow performs sli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postnatal uterine development requires precise coordination of epithelial differentiation, gland formation, and stromal organization, yet how transcriptional programs are spatially integrated during this process remains poorly understood. Here, we generated a spatially resolved transcriptomic map of the mouse uterus across key postnatal stages from day 3 to day 21 by combining high resolution in situ transcriptomics with histology, proteomics, genetic models, and functional assays. This approach defines the temporal emergence and spatial arrangement of all major uterine cell types and demonstr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics has enabled numerous deep learning models in this area, and training them requires large amounts of high-quality data, especially expression matrices paired with histological images. Here, we present a unified spatial transcriptomic dataset generated using the Stereo-seq platform, covering 10 mouse organs-including brain, kidney, lung, thymus, large intestine, skin, spleen, ovary, testis, and uterus-encompassing 23 tissue sections generated from 21 chips, each with matched ssDNA or H&E staining images. The dataset comprises single-cell-resolution (cell-bin) or square bi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, the rapid advancement of spatial transcriptomics technologies has led to the public availability of a large and diverse collection of datasets spanning multiple species, organs, and tissue types. These datasets exhibit substantial biological and technical heterogeneity, highlighting the urgent need for a generalizable clustering algorithm capable of adapting to such diversity. To address this challenge, we propose DiffuScope, a clustering framework based on Graph Convolutional Variational Autoencoders (GC-VAE). DiffuScope leverages self-supervised learning to extract informati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spatial resolution of omics analyses is fundamental to understanding tissue biology1-3. The capacity to spatially profile DNA methylation, which is a canonical epigenetic mark extensively implicated in transcriptional regulation4,5, is lacking. Here we introduce a method for whole-genome spatial co-profiling of DNA methylation and the transcriptome of the same tissue section at near single-cell resolution. Applying this technology to mouse embryogenesis and the postnatal mouse brain resulted in rich DNA-RNA bimodal tissue maps. These maps revealed the spatial context of known methylation b
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Perineural invasion (PNI), a common occurrence in oral squamous cell carcinomas, is associated with poor survival. Consequently, these tumors are treated aggressively. However, diagnostic criteria of PNI vary and its role as an independent predictor of prognosis has not been established. To address these knowledge gaps, we investigated spatial and transcriptomic profiles of PNI-positive and PNI-negative nerves.
EXPERIMENTAL DESIGN: Tissue sections from 142 patients were stained with S100 and cytokeratin antibodies. Nerves were identified in two distinct areas: tumor bulk and margin.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oropharyngeal candidiasis (OPC) caused by the fungus Candida albicans triggers a robust inflammatory response that rapidly eliminates the bulk of the fungal load in the oral mucosa. While pro-inflammatory responses to OPC have been extensively studied, little is known about the counterbalance of immunity in the infection milieu that mitigates inflammatory damage. We employed 10× Visium Spatial Transcriptomics, a next-generation technology that preserves the spatial integrity of infected tongue tissues, enabling high-resolution mapping of the host microenvironment during Candida infection in a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prostate is an organ characterized by significant spatial heterogeneity. To better understand its intricate structure and cellular composition, we constructed a comprehensive single-cell atlas of the adult human prostate. Our high-resolution mapping effort identified 253,381 single cells and 34,876 nuclei sampled from 11 patients who underwent radical resection of bladder cancer, which were categorized into 126 unique subpopulations. This work revealed various new cell types in the human prostate and their specific spatial localization. Notably, we discovered four distinct acini, two of wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with treatment-refractory pancreatic cancer often succumb to systemic metastases1-3; however, the transcriptomic heterogeneity that underlies therapeutic recalcitrance remains understudied, particularly in a spatial context. Here we construct high-resolution maps of lineage states, clonal architecture and the tumour microenvironment (TME) using spatially resolved transcriptomics from 55 samples of primary tumour and metastases (liver, lung and peritoneum) collected from rapid autopsies of 13 people. We observe discernible transcriptomic shifts in cancer-cell lineage states as tumours
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural components of the thymus are essential for guiding T cell development, but a thorough spatial view is still absent. Here we develop the TSO-his tool, designed to integrate multimodal data from single-cell and spatial transcriptomics to decipher the intricate structure of human thymus. Specifically, we characterize dynamic changes in cell types and critical markers, identifying ELOVL4 as a mediator of CD4+ T cell positive selection in the cortex. Utilizing the mapping function of TSO-his, we reconstruct thymic spatial architecture at single-cell resolution and recapitulates class
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.