Circulating tumor DNA (ctDNA) is a promising biomarker for cancer detection, treatment selection, and disease monitoring. As a result, an increasing number of diagnostic developers are pursuing liquid biopsy assays using next-generation sequencing (NGS) to detect ctDNA. To support clinical adoption, these assays must undergo rigorous analytical validation (AV) to facilitate regulatory approval, support market entry, and ultimately improve outcomes for patients with cancer. To this end, the BLOODPAC AV Working Group developed and published a set of generic AV protocols in September 2020. These
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating tumor DNA (ctDNA) serves as a promising next-generation biomarker for noninvasive cancer screening and monitoring. In this work, we report an electrochemical biosensor for ctDNA detection. The sensor is constructed based on the synergistic integration of CRISPR/Cas12a and PB-Au NPs. CRISPR/Cas12a provides precise target recognition and triggers trans-cleavage, while the nanozyme enables strong signal amplification through its catalytic activity. Using a disposable carbon-fiber paper as the biosensing interface, we developed this sensitive detection strategy. On this interface, a PB
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistent circulating tumor DNA (ctDNA) during neoadjuvant treatment (NAT) of early breast cancer (EBC) indicates high-risk disease. Similarly, detection of ctDNA post-resection indicates molecular residual disease (MRD) and impending relapse. For ctDNA to be integrated into EBC management, accessible and scalable diagnostics are required. Here we apply an ultrasensitive, personalized tumor-informed approach to ctDNA evaluation predicated on analyses of structural variants (SVs) using a novel digital PCR (dPCR) multiplex SV technology. 136 patients eligible for NAT (29.4% TNBC, 44.9% HR+ /HER
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary mediastinal large B-cell lymphoma (PMBL) achieves excellent outcomes with dose-dense immunochemotherapy, yet response assessment by positron emission tomography (PET) remains limited. In this prospective multicenter observational study, we evaluated the clinical relevance of circulating tumor DNA (ctDNA) minimal residual disease (MRD) in patients with newly diagnosed PMBL and assessed whether MRD enhances outcome discrimination beyond PET. Plasma and PET images were collected at baseline and after 2 and 4 cycles. ctDNA and tumor biopsy were analyzed by high-depth, error-corrected seque
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Urothelial bladder cancer (UBC) carries significant mortality and treatment morbidity. Conventional diagnostic and monitoring methods, including cystoscopy and biopsy, are invasive and limited in sensitivity. Circulating tumor DNA (ctDNA), a minimally-invasive "liquid biopsy," has emerged as a promising tool for real-time disease assessment. This study aimed to systematically evaluate the diagnostic, prognostic, and predictive value of plasma and urine ctDNA in localized, locally advanced, and metastatic UBC.
METHODS: A systematic review was conducted according to PR
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating tumor DNA (ctDNA) testing has emerged as a cancer precision medicine approach. We investigated the genomic landscape and clinical utility of ctDNA in patients receiving 223Ra dichloride for bone metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). Methods: This prospective, observational, multicenter study enrolled patients treated with 223Ra for bone mCRPC. Targeted sequencing of cell-free DNA from plasma at baseline and end of treatment (EOT), along with paired leukocyte DNA, was performed using an 88-gene panel. Associations between ctDNA profiles and clinical outcomes, incl
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While circulating tumor DNA (ctDNA) may guide adjuvant therapy in stage II-III colon cancer, detection largely hinges on systemic tumor shedding. In a secondary analysis of three prospective ctDNA studies, peritoneal metastases occurred in up to 9.4% of patients, were predominantly isolated, and were enriched among ctDNA-negative recurrences. Molecular and clinical data demonstrate reduced ctDNA levels in peritoneum-only disease, identifying a surveillance blind spot with direct implications for high-risk patients.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Despite gains in understanding head and neck cancer over the past several decades, the discovery of reliable biomarkers remains elusive. With the advent of human papillomavirus-associated oropharynx cancer and Epstein-Barr virus-associated nasopharynx cancer, circulating tumor DNA (ctDNA) and oncogenic viral DNA have emerged as potentially promising biomarkers.
OBSERVATIONS: A review was conducted by the American Head and Neck Society to address the current utility of ctDNA. Ongoing clinical trials were reviewed, with discussion of its utility in monitoring treatment response and
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To demonstrate the detection of circulating human papillomavirus (HPV) DNA fragments can serve as a biomarker for presence of tumor and provide a universal, non-invasive tool for monitoring treatment response in HPV-related cervical cancers (CC).
METHODS: A multi-site prospective study of HPV-positive high-grade cervical dysplasia (CIN2/3) and CC was conducted. Serum samples were collected pre-, during, and post-treatment. NavDx® (Naveris,Inc) digital droplet polymerase chain reaction testing was used to detect tumor tissue modified viral (TTMV)-HPV DNA. The expanded panel include
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to assess (1) the prognostic value of circulating tumor DNA (ctDNA) and (2) the ability of ctDNA to detect recurrence compared with standard surveillance in curatively resected early-stage biliary tract cancer (BTC).
METHODS: This retrospective, multicenter cohort study evaluated serial ctDNA testing for surveillance in patients with early-stage BTC after curative resection. We evaluated the relapse-free survival (RFS) by ctDNA positivity. The sensitivity of ctDNA in detecting a confirmed recurrence of BTC, defined as a biopsy-proven or true progression by radiograph
Оценочное исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: This study aimed to identify mutation profile similarities between tissue and circulating tumor DNA (ctDNA) and to explore driver mutations as potential prognostic or predictive biomarkers or druggable targets in patients with advanced biliary tract cancer (BTC).
PATIENTS AND METHODS: We prospectively enrolled 18 patients with advanced BTC and analyzed next-generation sequencing data from 60 ctDNA samples using AlphaLiquid® 100. This assay screens up to 118 genes for single-nucleotide variants (SNVs) and insertion or deletions (INDELs), 27 genes for copy number alterations (CN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid biopsy using bile offers a promising non-invasive approach for molecular analysis in cholangiocarcinoma (CCA). However, the stability of key biomarkers, such as proteins and circulating DNA (ctDNA), at room temperature has not been fully elucidated. This study investigates the temporal stability of proteins and ctDNA in bile samples under room temperature conditions to optimize pre-analytical handling for molecular diagnostics. Bile samples were collected from six patients diagnosed with CCA. Protein concentrations, enzyme activity (E-Cadherin and N-Cadherin), and mutant KRAS ctDNA leve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treatment decisions in metastatic castration-resistant prostate cancer are mostly guided by clinical variables, but efforts to molecularly monitor the disease remain hampered by challenges in acquiring tumor tissue repeatedly. In this study, we simultaneously profiled the genome copy number and exome in longitudinal plasma circulating tumor DNA (ctDNA) acquired before, during, and upon progression to serial treatments with androgen signaling inhibitors and taxane chemotherapy from 60 patients with metastatic castration-resistant prostate cancer (2-10 samples per patient). The genomic data were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Circulating tumor DNA (ctDNA) analysis is an alternative to tissue biopsy for genotyping in various cancers. We aimed to establish a plasma ctDNA sequencing assay, then evaluate its clinical utility in advanced urothelial cancer (UC).
MATERIALS AND METHODS: This study included 82 patients with muscle-invasive or metastatic UC. A total of 158 blood samples and 73 tumor tissue samples were sequenced using our designed panel covering 53 UC-relevant genes and TERT promoter. We investigated the association between the proportion of ctDNA in total cell-free DNA (ctDNA fraction) and respons
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mantle cell lymphoma (MCL) is an aggressive subtype of B-cell non-Hodgkin's lymphoma. The applicability of circulating tumor DNA (ctDNA) for predicting treatment response and prognosis in MCL remains underexplored.
METHODS: This study included 34 MCL patients receiving first-line chemoimmunotherapy. We assessed the ability of plasma ctDNA to detect tumor-specific genetic alterations and explored its potential as a noninvasive biomarker for treatment response and prognosis in MCL.
RESULTS: Commonly mutated genes in MCL included CCND1 (93.5%), ATM (48.4%), KMT2D (25.8%), and TP53 (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Determining the cost of diagnosis of Burkitt lymphoma by DNA sequencing from a blood sample, compared with current histopathology. Estimating future sequencing costs at increased scale and exploring the effect of positivity rate on per-case cost.
METHODS: We conducted a microcosting of both diagnostics. Resource use information was derived from standard operating procedures and interviews with staff. Unit cost data were from salary scales, purchase records, and publicly available prices. Costs were collected during 2021 and 2022, in the currency of purchase, and converted to commo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early detection is paramount when reducing incidence and mortality of colorectal cancer (CRC). Current population-based screening programs primarily use fecal immunochemical test (FIT) to allocate individuals for colonoscopy although low specificity challenges colonoscopy capacities. We aimed to assess the potential of circulating tumor (ct)DNA markers for early CRC detection in a dual-test CRC screening approach among FIT positive individuals.
METHODS: Plasma samples from 774 FIT positive (≥100 ng Hemoglobin/mL) individuals from the Danish CRC screening program were analyzed for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasma circulating tumor DNA (ctDNA) is a promising biomarker for metastatic colorectal cancer (mCRC); however, its role in characterizing recurrence sites after mCRC resection remains poorly understood. This single-institution study investigated the timing of ctDNA detection and its levels in the context of recurrence at different sites after mCRC resection.
STUDY DESIGN: Patients who underwent optimal resection of CRC metastases involving the peritoneum, distant lymph nodes, or liver, with serial postoperative tumor-informed ctDNA assessments (Signatera) were included. Recurrenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A self-signal electrochemical identification interface was prepared for the determination of circulating tumor DNA (ctDNA) in peripheral blood based on poly-xanthurenic acid (PXTA) assembled on black phosphorus nanosheets (BPNSs) acquired through simple ultrasonication method. The BPNSs with large surface area could be integrated with the xanthurenic acid (XTA) monomers by right of physisorption, and hence improved the electropolymerization efficiency and was beneficial to the enlargement of the signal response of PXTA. The assembled PXTA/BPNSs composite with attractive electrochemical activit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently, ctDNA has become the focus for scientists with respect to personalized treatment, early screening, precise diagnosis, and prognosis of BC. This paper aims to use bibliometric analysis to investigate the research status and future trends in this field.
METHODS: All the related literature in the field of ctDNA and breast cancer was gathered from the Web of Science Core Collection. Data analyses were performed with R package Bibliometrics, VOS viewer 1.6.18, and online analysis in WoS. IBM SPSS (version 26.0) was used for statistical analysis.
RESULTS: A total of 739 publi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования