Ribosome biogenesis is a highly coordinated, multi-step process that assembles the ribosomal machinery responsible for translating mRNAs into proteins. It begins with the rate-limiting step of RNA polymerase I (Pol I) transcription of the 47S ribosomal RNA (rRNA) genes within a specialised nucleolar region in the nucleus, followed by rRNA processing, modification, and assembly with ribosomal proteins and the 5S rRNA produced by Pol III. The ribosomal subunits are then exported to the cytoplasm to form functional ribosomes. This process is tightly regulated by the PI3K/RAS/MYC oncogenic network
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant koala retrovirus (recKoRV) is a recently discovered variant of koala retrovirus (KoRV), which likely emerged due to recombination with another retrovirus (such as Phascolarctos endogenous retrovirus). KoRV spread and endogenization in Australia were thought to be ongoing in a north to south direction given the low prevalence of the virus in southern koala populations, based on molecular detection of the pol gene. However, recKoRV has highlighted that fragments of KoRV with the pol region missing are present within southern koalas. In this study, a new 5'-region-based KoRV PCR assay
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among the nearly 50 disease mutations in the gene for the catalytic subunit of human DNA polymerase gamma, POLG, the A467T substitution is the most common and has been found in 0.6% of the Belgian population. The A467T mutation is associated with a wide range of mitochondrial disorders, including Alpers syndrome, juvenile spinocerebellar ataxia-epilepsy syndrome, and progressive external ophthalmoplegia, each with vastly different clinical presentations, tissue specificities, and ages of onset. The A467T mutant enzyme possesses only 4% of wild-type DNA polymerase activity, and the catalytic de
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) uses a number of strategies to modulate viral and host gene expression during its life cycle. To characterize the transcriptional and translational landscape of HIV-1 infected cells, we used a combination of ribosome profiling, disome sequencing and RNA sequencing. We show that HIV-1 messenger RNAs are efficiently translated at all stages of infection, despite evidence for a substantial decrease in the translational efficiency of host genes that are implicated in host cell translation. Our data identify upstream open reading frames in the HIV-1 5'-untrans
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatitis B Virus (HBV) infection is one of the major causes of liver cirrhosis, hepatocellular carcinoma and deaths due to the acute or chronic consequences worldwide. HBV is distributed into various genotypes based on nucleic acid sequence variation.
OBJECTIVES: To develop a method of HBV genotyping and drug resistance interpretation using partial sequencing of polymerase gene.
METHODS: This study was performed on 98 HBV infected patients' serum samples from Western India. A nested PCR protocol was designed for amplification of pol gene from HBV genome and Sanger's sequencing o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The central nervous system (CNS) is of particular importance in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection. First, the CNS may be difficult to access for anti-retroviral treatment and may become a sanctuary for residual viruses. Second, HIV-1 infection may lead to AIDS dementia complex (ADC) culminating in HIV-1 encephalitis. In order to examine the pattern of drug resistance and the role of encephalitis in enhancing viral redistribution to the CNS, we compared pol gene quasispecies of the spleen and brain in two patients with and two patients without HIV-1 encephalitis, who had bee
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The HIV epidemic in Cameroon is characterized by a high degree of viral genetic diversity with circulating recombinant forms (CRFs) being predominant. The goal of our study was to determine recent trends in virus evolution and emergence of drug resistance in blood donors and HIV positive patients.
METHODOLOGY: Blood specimens of 73 individuals were collected from three cities and a few villages in Cameroon and viruses were isolated by co-cultivation with PBMCs. Nested PCR was performed for gag p17 (670 bp) pol (840 bp) and Env gp41 (461 bp) genes. Sequences were phylogenetically a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV transgenic mice often display lens cataracts as a consequence of viral-specific expression of HIV gene products in the developing lens. Cataractous mouse lines encoding either HIV-1 proviral DNA, HIV delta Gag/Pol] proviral DNA, or the HIV-1 nef gene alone were examined to ascertain the effect of Nef on murine lens development. Ocular disease was characterized by a progressive architectural disorganization within the lens fiber cell compartment developing in 100% of HIV-positive mice in five reported transgenic lines. Late embryonic stage transgenic lenses featured a mild microphthalmia, p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African-born Australians are a recognised "priority population" in Australia's Sixth National HIV/AIDS Strategy. We compared exposure location and route for African-born people living with HIV (PLHIV) in Victoria, Australia, with HIV-1 pol subtype from drug resistance assays and geographical origin suggested by phylogenetic analysis of env gene. Twenty adult HIV positive African-born Victorian residents were recruited via treating doctors. HIV exposure details were obtained from interviews and case notes. Viral RNA was extracted from participant stored plasma or whole blood. The env V3 region
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial DNA is replicated and repaired by DNA polymerase gamma (pol gamma), encoded by the POLG gene. The Y955C substitution in POLG leads to autosomal dominant progressive external ophthalmoplegia (PEO) with other severe phenotypes. PEO patients with this mutation can further develop parkinsonism or premature ovarian failure. Mouse and yeast models with this mutation show enhanced amounts of oxidative lesions and increased mtDNA damage. In DNA pol gamma, Tyr955 plays a critical role in catalysis and high fidelity DNA synthesis. 7,8-dihydro-8-oxo-2'-deoxyguanosine (8-oxo-dG) is one of th
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes simplex virus 1 (HSV-1) strain ANG and ANGpath were cloned as bacterial artificial chromosome (BAC). Two different types of BAC genomes were obtained. BAC genomes of type I contained the BAC replicon at the intended target region between the genes of UL48 and UL49. In BAC genomes of type II, the BAC sequences were found to be aberrantly fused between the termini of the HSV-1 genome. Both the BAC types were used to establish a conditional gene expression system for HSV-1 by Flp recombinase-mediated insertion of expression vectors that were modified to respond to the T-REx tetracycline (T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dried sample spots have molecular applications, but few data are available on conditions of HIV-1 RNA amplification.
OBJECTIVES: To determine the impact of (i) the sample type (plasma or serum), (ii) various storage periods, (iii) transfer at ambient temperature of the dried spots via postal mail, and (iv) two different methods of elution-extraction, to amplify partial pol and env genes with a view to both phylogenic and resistance analyses.
METHODS: Fourteen samples (dried plasma spot and dried serum spot) from seven patients were stored at 20-25 degrees C for 2, 5 and 7 days. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reduced sink demand, such as that caused by grain or ear removal, is known to accelerate senescence in maize; nonetheless, how diminished sink strength mechanistically triggers senescence and disrupts grain development remains poorly understood. In particular, the transcriptional and metabolic regulatory networks that link reduced sink demand to the onset of senescence have not been clearly defined.
RESULTS: We grew the maize inbred line 08LF, which exhibits early senescence in response to grain removal, under non-pollinated (NONPOL) and normally pollinated (POL) conditions. We th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Hspa1b (Hsp70.1) gene is one of the first genes expressed after fertilization, with expression occurring during the minor zygotic genome activation (ZGA) in the absence of stress. This expression can take place in the male pronucleus as early as the one-cell stage of embryogenesis. The importance of HSPA1B for embryonic viability during times of stress is supported by studies showing that depletion of this protein results in a significant reduction in embryos developing to the blastocyte stage. Recently, we have begun addressing the mechanism responsible for allowing expression of Hspa1b d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our laboratory has focused on defining, localizing, and understanding the mode of action of genes involved in fractionated x-irradiation (FXI) leukemia in susceptible and restraint mouse strains. We have described the genetic and molecular evidence suggesting the existence of multiple independent loci involved in FXI-induced leukemogenesis. These studies indicated that one of these, Ril-1, a locus on the distal portion of chromosome 15, is the major locus influencing susceptibility to the disease. Our data unequivocally place Ril-1 in the gene complex Ly-6--Ril-1--Sis--H-30--Pol-5. Ril-1 appea
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematological malignant tumors (HMTs) are serious diseases that threaten human health and life with high mortality. Therefore, it is necessary to develop novel strategies for diagnosis and treatment. Human endogenous retroviruses (HERVs) have recently attracted increasing attention as potential targets for cancer diagnosis and therapy. In this study, we explored the association between HERV-K expression levels and HMTs development. Clinical data and peripheral blood samples were collected from 236 leukemia, 384 lymphoma patients, and 69 healthy controls. Quantitative polymerase chain reaction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The temperature-sensitive and attenuated phenotypes of the Sabin type 1 vaccine strain of poliovirus result from numerous point mutations which occurred in the virulent Mahoney virus parent. One of these mutations is located in a 3D polymerase (3Dpol) codon (U-6203-->C, Tyr-73-->His) and is involved in attenuation in common mice (M. Tardy-Panit, B. Blondel, A. Martin, F. Tekaia, F. Horaud, and F. Delpeyroux, J. Virol. 67:4630-4638, 1993). This mutation also appears to contribute to temperature sensitivity, in association with at least 1 other of the 10 mutations of the 3'-terminal part of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A model system to study the pathogenesis of gammaherpesvirus infections is the infection of mice with murine gammaherpesvirus 68 (MHV-68). To define the kinetics of infection, we developed an RNase protection assay to quantitate gene expression from lytic (K3, Rta, M8, DNA polymerase [DNA pol], and gB) and candidate latency (M2, M3, M9, M11, ORF73, and ORF74) genes. All candidate latency genes were expressed during lytic infection of 3T3 cells. Four kinetic classes of transcripts were observed following infection of 3T3 cells: immediate-early (K3, Rta, M8, and ORF73), early (DNA pol), early-la
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the first application of ultra-deep sequencing (UDS) to varicella-zoster virus (VZV) genotypic antiviral testing in a case of acyclovir-resistant VZV infection initially detected by Sanger sequencing within a deeply immunocompromised heart transplant recipient. As added-value compared to Sanger analysis, UDS revealed complex dynamics of viral population under antiviral pressure. Varicella-zoster virus (VZV) is a ubiquitous human herpesvirus affecting populations worldwide. VZV is commonly acquired in youth whose primary infection usually manifests as benign varicella (chickenpox). Af
Клинический случайСравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of Trypanosoma brucei, the causative agent of African trypanosomiasis, was published five years ago, yet identification of all genes and their transcripts remains to be accomplished. Annotation is challenged by the organization of genes transcribed by RNA polymerase II (Pol II) into long unidirectional gene clusters with no knowledge of how transcription is initiated. Here we report a single-nucleotide resolution genomic map of the T. brucei transcriptome, adding 1,114 new transcripts, including 103 non-coding RNAs, confirming and correcting many of the annotated features and reveal
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования