N 6-methyladenosine (m6A), a critical epitranscriptomic modification, regulates RNA metabolism and antiviral defenses. However, how pathogens evade m6A-mediated RNA decay in plants remains poorly understood. Here, we uncover a dynamic m6A modification arms race during infection of sugarcane mosaic virus (SCMV), a prevalent potyvirus that infects maize and causes 20%-80% yield loss. We demonstrate that maize m6A methyltransferase (ZmMTA) specifically deposits m6A at A6556 of the SCMV genomic RNA, enabling recognition by the m6A reader EVOLUTIONARILY CONSERVED C-TERMINAL REGION 23 (ZmECT23). ZmE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever is a flavivirus having plus-sensed RNA which encodes a single polyprotein. Host proteases cut this polyprotein into seven nonstructural proteins including a vital NS3 protein. The present study aims to identify the most effective inhibitor against the helicase (NS3) using different advanced ligand and structure-based computational studies. A set of 300 ligands was selected against helicase by chemical structural similarity model, which are similar to S-adenosyl-l-cysteine using infiniSee. This tool screens billions of compounds through a similarity search from in-built chemical sp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The NS3 protein of Japanese encephalitis virus (JEV) is a large multifunctional protein possessing protease, helicase, and nucleoside 5'-triphosphatase (NTPase) activities, and plays important roles in the processing of a viral polyprotein and replication. To clarify the enzymatic properties of NS3 protein from a structural point of view, an enzymatically active fragment of the JEV NTPase/helicase catalytic domain was expressed in bacteria and the crystal structure was determined at 1.8 A resolution. JEV helicase is composed of three domains, displays an asymmetric distribution of charges on i
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G-quadruplexes (G4s) are four-stranded alternative secondary structures formed by guanine-rich nucleic acids and are prevalent across the human genome. G4s are enzymatically resolved by specialized helicases. Previous in vitro studies showed that DEAH-box helicase 36 (DHX36/G4R1/RHAU) has the highest specificity and affinity for G4 structures. Here, by mapping genome-wide DNA double-strand breaks (DSBs), we demonstrate that knockout of DHX36 helicase increases DSB enrichment at G4 sites and that the presence of the G4 motif is a significant mediator of genome instability at regulatory regions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious diseases caused by flaviviruses are important emerging public health concerns and new vaccines and therapeutics are urgently needed. The NS3 protein from flavivirus is a multifunctional protein with protease, helicase and nucleoside 5' triphosphatase activities (NTPase). Thus, NS3 plays a crucial role in viral replication and represents an interesting target for the development of specific antiviral inhibitors. We have solved the structure of an enzymatically active fragment of the dengue virus NTPase/ helicase C-terminal catalytic domain in several related crystal forms. The struct
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flavivirus NS3 protein plays an important role in the cleavage and processing of the viral polyprotein and in the synthesis of the viral RNA. NS3 recruits NS2B and NS5 proteins to form complexes possessing protease and replicase activities through protease and nucleoside triphosphatase/helicase domains. We have found that NS3 also induces apoptosis. Expression of the Langat (LGT) virus NS3 protein resulted in a cleavage of cellular DNA and reduced the viability of cells. Coexpression of NS3 with apoptotic inhibitors (CrmA and P35) and addition of caspase peptide substrates (Z-VAD-FMK and Z
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DHX37 is an autosomal gene responsible for encoding a helicase from the DExD/H-box family that plays an essential role in ribosome biogenesis. Variants in this gene were previously reported in two different phenotypes: neurodevelopmental disorders and disorders/differences of sex development (DSD). Particularly for the DSD group, variants were mainly reported associated with gonadal dysgenesis and testicular regression syndrome.
SUMMARY: Focusing specifically in the DSD group, we revised the 21 DHX37 variants described across a total of 55 cases published in the literature so far.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the human XPD gene result in a defect in nucleotide excision repair of ultraviolet damaged DNA and cause the cancer-prone syndrome xeroderma pigmentosum (XP). Besides XP, mutations in XPD can cause another seemingly unrelated syndrome, trichothiodystrophy (TTD), characterized by sulfur-deficient brittle hair, ichthyosis, and physical and mental retardation. To ascertain the underlying defect responsible for TTD, we have expressed the TTD mutant proteins in the yeast Saccharomyces cerevisiae and determined if these mutations can rescue the inviability of a rad3 null mutation. RAD3,
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of protein arginine methylation in regulating transcription and RNA processing is well established, but its function in DNA replication remains poorly understood. In this study, we identify asymmetric dimethylarginine (aDMA) modification of the RECQ4 helicase as a key mechanism linking arginine methylation to replication control. Five arginine residues located within a glycine/arginine-rich region adjacent to the helicase domain of RECQ4 are targeted by type I PRMTs. This modification is enriched during S phase and promotes nuclear localization of RECQ4. On chromatin, aDMA modificatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Schlafen (SLFN) family of proteins are a group of DNA/RNA processing enzymes with emerging importance in human health and disease, where their functions are implicated in a variety of immunological and anti-tumor processes. Here, we present the cryo-electron microscopy structure of full-length human SLFN14, a member with antiviral activity and linked to an inherited bleeding disorder. SLFN14 is composed of an RNase domain, a SWADL domain, and a two-lobe helicase domain. SLFN14 exhibited strong RNase activity over different substrates, and the positively charged patches at the valley of the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While astrocytes produce key inflammatory mediators following exposure to neurotropic nonsegmented negative-sense RNA viruses such as rabies virus and measles virus, the mechanisms by which resident central nervous system (CNS) cells perceive such viral challenges have not been defined. Recently, several cytosolic DExD/H box RNA helicases including retinoic acid-inducible gene I (RIG-I) have been described that function as intracellular sensors of replicative RNA viruses. Here, we demonstrate that primary human astrocytes constitutively express RIG-I and show that such expression is elevated f
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia with oculomotor apraxia type 2 (AOA2) is caused by a diversity of mutations within the coding region of the senataxin gene. Recently, rare noncoding senataxin mutations affecting RNA processing have been identified in AOA2. Here, we report the case of an 18-year-old woman, with classic clinical features of AOA2, who was found to harbor a mutation within senataxin intron 16. This mutation disrupts the local 5' splice site architecture via a novel intronic frameshift mechanism, causing skipping of exon 16 with predicted disruption of the conserved DNA/RNA helicase domain. RNA processing m
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Double-stranded RNA (dsRNA) is synthesized during the course of infection by RNA viruses as a byproduct of replication and transcription and acts as a potent trigger of the host innate antiviral response. In the cytoplasm of the infected cell, recognition of the presence of viral dsRNA as a signature of "non-self" nucleic acid is carried out by RIG-I-like receptors (RLRs), a set of dedicated helicases whose activation leads to the production of type I interferon α/β (IFN-α/β). To overcome the innate antiviral response, RNA viruses encode suppressors of IFN-α/β induction, which block RLRs recog
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several arenaviruses cause hemorrhagic fever (HF) diseases that are associated with high morbidity and mortality in humans. Accordingly, HF arenaviruses have been listed as top-priority emerging diseases for which countermeasures are urgently needed. Because arenavirus nucleoprotein (NP) plays critical roles in both virus multiplication and immune-evasion, we used an unbiased proteomic approach to identify NP-interacting proteins in human cells. DDX3, a DEAD-box ATP-dependent-RNA-helicase, interacted with NP in both NP-transfected and virus-infected cells. Importantly, DDX3 deficiency compromi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type I interferons (IFNs) play a critical role in the host defense against viruses. Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) infection induces robust type I IFN production in its natural host, the mouse. However, the mechanisms underlying the induction of type I IFNs in response to LCMV infection have not yet been clearly defined. In the present study, we demonstrate that IRF7 is required for both the early phase (day 1 postinfection) and the late phase (day 2 postinfection) of the type I IFN response to LCMV, and melanoma differentiation-associated gene 5 (MDA5)/mitochondrial antiviral signa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNAs (lncRNAs) have increasingly been recognized as being integral to cellular processes, including the antiviral immune response. Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is costly to the global swine industry. To identify PRRSV-related lncRNAs, we performed RNA deep sequencing and compared the profiles of lncRNAs in PRRSV-infected and uninfected Marc-145 cells. We identified a novel lncRNA called MAHAT (maintaining cell morphology-associated and highly conserved antiviral transcript; LTCON_00080558) that inhibits PRRSV replication. MAHAT binds and negatively
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series N,N'-bis[4-(1H(2H)-benzotriazol-1(2)-yl)phenyl]alkyldicarboxamides (3a-f and 5a-j) were prepared starting from their already known (1a-d) and (4a-c) or new (4d) amine parents. Because of the antiviral activity of several N-[4-(1H(2H)-benzotriazol-1(2)-yl)phenyl]alkylcarboxamides previously reported, title compounds were evaluated in vitro for cytotoxicity and antiviral activity against viruses representative of Picornaviridae, [i.e. Enterovirus Coxsackie B2 (CVB-2) and Polio (Sb-1)] and of two of the three genera of the Flaviviridae [Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV) and Yellow Fever
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 nonstructural protein 13 (nsp13) is a highly conserved helicase that couples ATP hydrolysis to RNA translocation through long-range allosteric communication between its ATPase and RNA-binding domains. In prior work, we identified L405 as a key regulator of interdomain motions and proposed that the L405D mutation would disrupt this coupling by perturbing conformational transitions required for translocation [J. Phys. Chem. B2024, v128, 492-503. ]. Subsequent experiments confirmed that L405D attenuates helicase activity and ATPase activity, implicating the potential formation of a new
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gonadotropin-regulated testicular RNA helicase (GRTH)/DDX25 is a member of DEAD-box family of RNA helicase essential for the completion of spermatogenesis and male fertility, as evident from GRTH-knockout (KO) mice. In germ cells of male mice, there are two species of GRTH, a 56 kDa non-phosphorylated form and 61 kDa phosphorylated form (pGRTH). GRTH Knock-In (KI) mice with R242H mutation abolished pGRTH and its absence leads to infertility. To understand the role of the GRTH in germ cell development at different stages during spermatogenesis, we performed single-cell RNA-seq analysis of testi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A virus with a large genome was identified in the transcriptome of the potato aphid (Macrosiphum euphorbiae) and was named Macrosiphum euphorbiae virus 1 (MeV-1). The MeV-1 genome is 22 780 nt in size, including 3' and 5' non-coding regions, with a single large ORF encoding a putative polyprotein of 7333 aa. The C-terminal region of the predicted MeV-1 polyprotein contained sequences with similarities to helicase, methyltransferase and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) motifs, while the N-terminal region lacked any motifs including structural proteins. Phylogenetic analysis of the helicase p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования