INTRODUCTION: Respiratory infection outbreaks pose a threat to the readiness of the United States and allied armed forces. Predicting and preventing such outbreaks requires understanding of the epidemiology of potential respiratory pathogens in communities where service members live and work. We conducted pan-viral surveillance of respiratory specimens from people living with HIV or without HIV but under the risk enrolled in the U.S. Military HIV Research Program's African Cohort Study to determine the prevalence and possible clinical presentation of viruses in this population.
METHODS: The A
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The early warning and tracking of COVID-19 prevalence in the community provided by wastewater surveillance has highlighted its potential for much broader viral disease surveillance. In this proof-of-concept study, 46 wastewater samples from four wastewater treatment plants (WWTPs) in Queensland, Australia, were analyzed for the presence and abundance of 13 respiratory viruses, and the results were compared with reported clinical cases. The viruses were concentrated using the adsorption-extraction (AE) method, and extracted nucleic acids were analyzed using qPCR and RT-qPCR. Among the viruses t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Little is known about the etiology of meningitis in the MENA region, including Qatar. Viral agents are considered the major cause for meningitis worldwide. Here, we present primary data about the etiology and clinical and demographic characteristics of viral meningitis (VM) in Qatar between 2015 and 2018. Methods: We retrospectively collected data from Hamad Medical Corporation (HMC), which provides about 80% of healthcare services in Qatar. Data were collected for the period between 2015 and 2018. During this time period, 6,705 specimens were collected from patients with suspected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The Paediatric Active Enhanced Disease Surveillance (PAEDS) network is a hospital-based active surveillance system employing prospective case ascertainment for selected serious childhood conditions, particularly vaccine preventable diseases and potential adverse events following immunisation (AEFI). PAEDS data is used to better understand these conditions, inform policy and practice under the National Immunisation Program, and enable rapid public health responses for certain conditions of public health importance. PAEDS enhances data available from other Australian surveillance s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Despite wide sequence divergence, multiple picornaviruses use the Golgi adaptor acyl coenzyme A (acyl-CoA) binding domain protein 3 (ACBD3/GCP60) to recruit phosphatidylinositol 4-kinase class III beta (PI4KIIIβ/PI4KB), a factor required for viral replication. The molecular basis of this convergent interaction and the cellular function of ACBD3 are not fully understood. Using affinity purification-mass spectrometry, we identified the putative Rab33 GTPase-activating proteins TBC1D22A and TBC1D22B as ACBD3-interacting factors. Fine-scale mapping of binding determinants within ACBD3
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction The application of polymerase chain reaction (PCR) to cerebrospinal fluid (CSF) analysis has enabled the direct detection of neuropathogenic viruses in patients with meningitis or encephalitis. However, the presence of a virus in the CSF does not necessarily confirm a diagnosis of encephalitis. Clinical judgment is required to determine whether neurological follow-up is warranted. This study aimed to investigate the incidence of encephalitis among patients with viral detection in CSF and to evaluate the relationship between viral load and disease occurrence. Methods Patients under
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of our study was to define the spectrum of viral infections in pilgrims with acute respiratory tract illnesses presenting to healthcare facilities around the holy places in Makkah, Saudi Arabia during the 2019 Hajj pilgrimage. During the five days of Hajj, a total of 185 pilgrims were enrolled in the study. Nasopharyngeal swabs (NPSs) of 126/185 patients (68.11%) tested positive for one or more respiratory viruses by PCR. Among the 126 pilgrims whose NPS were PCR positive: (a) there were 93/126 (74%) with a single virus infection, (b) 33/126 (26%) with coinfection with more than one vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: High rates of potentially pathogenic bacteria and respiratory viruses can be detected in the upper respiratory tract of healthy children. Investigating presence of and associations between these pathogens in healthy individuals is still a rather unexplored field of research, but may have implications for interpreting findings during disease.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We selected 986 nasopharyngeal samples from 433 6- to 24-month-old healthy children that had participated in a randomized controlled trial. We determined the presence of 20 common respiratory viruses using real-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Few comprehensive data exist on disease incidence for specific etiologies of acute respiratory illness (ARI) in older children and adults in Africa.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: From March 1, 2007, to February 28, 2010, among a surveillance population of 21,420 persons >5 years old in rural western Kenya, we collected blood for culture and malaria smears, nasopharyngeal and oropharyngeal swabs for quantitative real-time PCR for ten viruses and three atypical bacteria, and urine for pneumococcal antigen testing on outpatients and inpatients meeting a ARI case definition (cough o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The incidence of viral infections in patients treated in the neonatal intensive care unit (NICU) is not well-known. We summarized the data of all patients with laboratory-confirmed viral infections admitted at the NICU of our hospital during the period of 1992-2003.
OBJECTIVES: To determine the incidence of viral infections among infants hospitalized in a NICU, the associated clinical manifestations and their outcome.
METHODS: Retrospective analysis of epidemiologic, virologic and clinical data from infants with proven viral infection. The diagnosis viral infection was confirmed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It has recently been shown that Ljungan virus (LV) is associated with disease in its wild rodent reservoir. In addition, it has been demonstrated that LV causes malformations and perinatal death in a mouse model. The question was therefore raised whether LV is a zoonotic agent in humans.
METHODS: Population fluctuations of native rodents in Sweden were compared to the incidence of intrauterine fetal deaths (IUFDs) using the Swedish national hospitalization database. Formalin-fixed tissues from cases of IUFD were investigated using LV-specific immunohistochemistry.
RESULTS: Variat
Сравнительное исследованиеСтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human parechoviruses (HPeV) are classified into 14 genotypes. HPeV1 and HPeV2 are the most prevalent genotypes in young children, which have been associated with mild to severe diseases. This study was conducted to investigate the involvement of HPeVs in aseptic meningitis and sepsis-like illness in Iran. Viral RNA was extracted from 148 cerebrospinal fluid samples from children <8 years old with primary diagnosis of aseptic meningitis and/or sepsis-like illness. Specific HPeV, HEV real-time PCR and HPeV typing were done to identify the infection rate of these viruses. HPeV and HEV were detect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence and re-emergence of zoonotic and vector-borne diseases are increasing in Europe. Prominent rodent-borne zoonotic viruses include Puumala hantavirus (PUUV; the causative agent of nephropathia epidemica, NE), lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV), and orthopoxviruses (OPV). In addition, Ljungan virus (LV) is considered a potentially zoonotic virus.
OBJECTIVE: The aim of this study was to compare clinical picture between acute PUUV patients with and without additional rodent-borne viral infections, to investigate if concurrent infections influence disease severity.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peru was one of the most affected countries during the COVID-19 pandemic. Moreover, multiple other viral diseases (enteric, respiratory, bloodborne, and vector-borne) are endemic and rising. According to Peru's Ministry of Health, various health facilities in the country were reallocated for the COVID-19 pandemic, thereby leading to reduced action to curb other diseases. Many viral diseases in the area are under-reported and not recognized. The One Health approach, in addition to clinical testing, incorporates environmental surveillance for detection of infectious disease outbreaks. The purpos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogens involved in central nervous system (CNS) infections are various, such as viruses, bacteria, and fungi, so a syndromic approach can be required. In addition, since their rapid and accurate detection is very crucial, molecular diagnostics using cerebrospinal fluid is becoming the emerging standard method.
METHODS: The study was conducted retrospectively to identify the incidence and distribution patterns of the pathogens according to gender, age, season, and month and to analyze their codetection from August 2017 to July 2020. It was also conducted to investigate turn-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Syndromic molecular testing for the diagnosis of infections has been advantageous given high sensitivity and rapid diagnostics; however, challenges remain with appropriate interpretation. A post-implementation evaluation of the cerebrospinal fluid (CSF) BioMerieux BioFire FilmArray Meningitis/Encephalitis panel in an adult and pediatric population was performed. The aims were to assess the prevalence and epidemiology of all targets and to correlate laboratory parameters with results from human herpesvirus 6 (HHV-6) detection in CSF to identify opportunities to apply diagnostic stew
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effective detection of viruses in aircraft wastewater is crucial to establish surveillance programs for monitoring virus spread via aircraft passengers. This study aimed to compare the performance of two virus concentration workflows, adsorption-extraction (AE) and Nanotrap® Microbiome A Particles (NMAP), in detecting the prevalence and concentrations of 15 endogenous viruses including ssDNA, dsDNA, ssRNA in 24 aircraft lavatory wastewater samples. The viruses tested included two indicator viruses, four enteric viruses, and nine respiratory viruses. The results showed that cross-assembly p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Kenya introduced Rotarix® (GlaxoSmithKline Biologicals, Rixensart, Belgium) vaccination into its national immunization programme beginning July 2014. The impact of this vaccination program on the local epidemiology of various known enteropathogens is not fully understood.
METHODS: We used a custom TaqMan Array Card (TAC) to screen for 28 different enteropathogens in 718 stools from children aged less than 13 years admitted to Kilifi County Hospital, coastal Kenya, following presentation with diarrhea in 2013 (before vaccine introduction) and in 2016-2018 (after vaccine introductio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Meningoencephalitis in children poses a diagnostic challenge, as etiology remains unknown for most of patients. Viral metagenomics by shotgun sequencing represents a powerful tool for investigating unknown viral infections related to these cases.
PATIENTS AND METHODS: In a two-year, reference-centre, retrospective study, we investigated the usefulness of viral metagenomics of cerebrospinal fluid (CSF) for the diagnosis of viral infectious meningoencephalitis in forty seven pediatric patients, forty of them previously tested negative with a routine neurologic panel of viral targe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reducing acute respiratory infection burden in children in Africa remains a major priority and challenge. We analyzed data from population-based infectious disease surveillance for severe acute respiratory illness (SARI) among children <5 years of age in Kibera, a densely populated urban slum in Nairobi, Kenya.
METHODS: Surveillance was conducted among a monthly mean of 5,874 (range = 5,778-6,411) children <5 years old in two contiguous villages in Kibera. Participants had free access to the study clinic and their health events and utilization were noted during biweekly home visit
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования