Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) causes persistent infection and can lead to adult T-cell leukemia-lymphoma (ATL), a hematological malignancy with a poor prognosis. In ATL patients, monoclonal expansion of HTLV-1-infected cells is observed. Each HTLV-1-infected clone harbors a unique proviral integration site. Based on this feature, various methods have been developed to detect and characterize HTLV-1-infected clones. Traditional Southern blotting detects monoclonal proliferation; however, it lacks sensitivity for detecting minor clones. Polymerase chain reaction (PCR)-based approac
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study was undertaken to determine the presence of retina-derived fetuin (RDF) protein and its message in retinal tissues and retinal pigment epithelial (RPE) cells. The techniques utilized in this study included light micros-copy, immunochemistry, Western blot, reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) and Southern blot.
METHODS: Retinal tissues and sections from embryonic, early postnatal and adult normal rats and retinal pigment epithe-lial (RPE) cells from postnatal rats were immunostained for fetuin with a polyclonal fetuin antibody and a peroxidase conjugated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Клинический случайПисьмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell populations of 22 plaque lesions from seven mycosis fungoides patients were studied for clonal rearrangement of the beta chain of the T-cell receptor (T beta) gene. All plaque lesions employed in this study showed clinically similar appearance. Histologically, all the biopsy specimens showed epidermotropism and the dermal infiltration of mononuclear cells including atypical cells. Histochemically, the majority of the infiltrated cells had surface markers of helper T cells. DNA extracted from skin lesions, peripheral lymphocytes, and lymph nodes revealed that the monoclonal expansion of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HBV covalently closed circular DNA (cccDNA) plays an important role in the persistence of hepatitis B virus (HBV) infection by serving as the template for transcription of viral RNAs. To cure HBV infection, it is expected that cccDNA needs either to be eliminated or silenced. Hence, precise cccDNA quantification is essential. Sample preparation is crucial to specifically detect cccDNA. Southern blot is regarded as the "gold standard" for specific cccDNA detection but lacks sensitivity. Here, we describe a rapid and reliable modified kit-based, HBV protein-free DNA extraction method as well as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B-cell associated antigens are frequently expressed by the Reed-Sternberg (RS) cells of lymphocyte predominance (LP) Hodgkin's disease (HD) and are sometimes expressed by those of nodular sclerosis (NS) and mixed cellularity (MC) HD. Clonal immunoglobulin gene rearrangements have been detected in some HD cases as well. These findings suggest that at least some cases of HD may be of B-cell derivation. Rearrangements of the bcl-2 gene, associated with the t(14;18)(q32;q21) are present in more than 75% of follicular and 30% of diffuse lymphomas of B-cell origin, suggesting that this translocation
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied peripheral blood mononuclear cells, bone marrow cells and lymph node cells from 30 patients with non-Hodgkin's lymphoma by DNA hybridization. Clonal JH or TCR beta gene rearrangements were detected in peripheral blood or bone marrow mononuclear cells from 15 of 30 (50.0%) patients studied, including 31.8% of those without evidence of tumor cells by morphological method. Four of 9 cases demonstrated identical clonal gene rearrangements at diagnosis and in remission phase in peripheral blood mononuclear cells. The presence of clonal gene rearrangements roughly correlated with the clin
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repeat expansion diseases, including fragile X syndrome, Huntington's disease, and C9orf72-related motor neuron disease and frontotemporal dementia, are a group of disorders associated with polymorphic expansions of tandem repeat nucleotide sequences. These expansions are highly repetitive and often hundreds to thousands of repeats in length, making accurate identification and determination of repeat length via PCR or sequencing challenging. Here we describe a protocol for monitoring repeat length in Drosophila models carrying 1,000 repeat C9orf72-related dipeptide repeat transgenes using Sout
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The feasibility and accuracy of gene-specific molecular genetic diagnosis for congenital adrenal hyperplasia due to 21-hydroxylase deficiency was studied in a group of 24 pregnancies at 25% risk of carrying an affected fetus. Chorionic villus sampling was performed at 9-10 weeks' gestation. Southern analysis and polymerase chain reaction, followed by allele-specific hybridization for a panel of nine known mutations, were performed for each family. Mutations were identified in 95% of chromosomes examined; the molecular diagnosis was accurate in 96% of infants as confirmed by postnatal examinati
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The GGGGCC-hexanucleotide repeat expansion in C9orf72 is the most common genetic cause of familial amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia. This study determined the frequency of C9orf72 repeat expansions in different motor neuron diseases (amyotrophic lateral sclerosis (ALS), motor neuron diseases affecting primarily the first or the second motor neuron and hereditary spastic paraplegia). Whereas most studies on C9orf72 repeat expansions published so far rely on a polymerase chain reaction-based screening, we applied both polymerase chain reaction-based techniques and Southe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoglobulin heavy chain (IgH) gene rearrangement serves as a marker of clonality in B lymphoproliferative malignancies. In order to study the IgH rearranged gene in acute nonlymphoblastic leukemia (ANLL) patients we combine polymerase chain reaction (PCR) with Southern blot to detect 41 ANLL patients and 7 of them (17.1%) were found to have IgH rearrangement by PCR amplification. All these 7 positive cases were confirmed by Southern blot. The sensitivity of this method was 10(-4)-10(-5) level. In 12 patients with complete remission, 3 (25.0%) were found to have IgH rearranged gene. All thes
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The authors report two patients with large granular lymphocyte (LGL) expansion associated with rheumatoid arthritis corresponding to pseudo Felty's syndrome. These cells have natural killer and T cell surface antigen markers. LGL are a heterogeneous population and expansion of these cells is responsible for leukemia, which is generally a monoclonal proliferation. It has been suggested that Epstein-Barr virus (EBV) is a putative agent in this leukemia. No EBV DNA was found with a polymerase chain reaction analysis in the lymphocyte DNA of our two patients. Some cases of pseudo Felty's syndrome
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragile X syndrome and associated disorders are characterized by the number of CGG repeats and methylation status of the FMR1 gene for which Southern blot (SB) historically has been required for analysis. This study describes a simple PCR-only workflow (mPCR) to replace SB analysis, that incorporates novel procedural controls, treatment of the DNA in separate control and methylation-sensitive restriction endonuclease reactions, amplification with labeled primers, and two-color amplicon sizing by capillary electrophoresis. mPCR was evaluated in two independent laboratories with 76 residual clin
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) is a genetic disorder caused by contraction or hypomethylation of the D4Z4 repeat array located at chromosome 4q35. For the disease to manifest, a permissive haplotype is required, as it enables the pathogenic expression of the DUX4 gene. FSHD cases often involve complex rearrangements, such as intrachromosomal rearrangements and translocations, which complicate diagnosis using conventional methods. This study focuses on evaluating the diagnostic potential of single molecule optical mapping (SMOM) for FSHD with complex rearrangements, part
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single, large-scale deletions of mitochondrial DNA (mtDNA) are a common finding in the molecular investigation of patients with suspected mitochondrial disorders and are typically detected by Southern blot analysis of muscle DNA that has been linearized by a single cutter enzyme (BamHI or PvuII). We describe our investigations of a 47-year-old woman with exercise intolerance, myalgia, and ptosis who underwent a muscle biopsy for a suspected mitochondrial genetic abnormality. Southern blot analysis after digestion of muscle DNA with BamHI revealed the apparent presence of two mtDNA species, ind
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent discovery of human herpesvirus 8 (HHV-8) as the etiologic agent of Kaposi's sarcoma (KS) has led to the interest in the development of PCR for this virus that is accurate, rapid, and convenient. We developed a sensitive PCR assay for HHV-8 with microtiter plate detection of amplimers. DNA was purified from white blood cells and saliva from HIV-infected men with and without Kaposi's sarcoma and one-step PCR was undertaken with primer sets specific for the N-terminal region of the glycoprotein B gene and open reading frame (orf) 26 of HHV-8. PCR was performed on 40 clinical specimens,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reliable detection of clonal T cell receptor beta (TCRB) gene rearrangements is essential for clonality assessment of suspect T cell proliferations. Since no appropriate Southern blot probes were available, we developed a new set of optimized TCRB gene probes. The TCRBJ1 and TCRBJ2 probes are positioned just downstream of the Jbeta1 and Jbeta2 gene segments, respectively, and can be used for detection of both incomplete Dbeta-Jbeta and complete Vbeta-Jbeta rearrangements, whereas the TCRBD1U and TCRBD2U probes upstream of the Dbeta segments can be used to confirm incomplete Dbeta-Jbeta rearran
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cases found to be positive for human papilloma virus (HPV) infection in the cervix by Southern blot method were evaluated with a newly developed kit for in situ HPV tissue hybridization. By the in situ hybridization method, HPV-DNA was detected without damaging the tissue structure. It appeared as purple or black stains in the nucleus of the epithelial cells that were located at the level of one-third of the epithelial thickness from the surface. The cases that were negative with the Southern blot method were also negative with the in situ hybridization method, but only 55.8% of the cases posi
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, detection rates of Leishmania parasites from human skin were compared among three different types of specimens, formalin-fixed, ethanol-fixed, and frozen, by polymerase chain reaction (PCR) and Southern blotting. For this purpose, we used biopsy specimens collected from 19 leishmaniasis patients and performed PCR and Southern hybridization with the probe specific for Leishmania (Viannia) braziliensis complex. Among these 19, 16 specimens were from cutaneous leishmaniasis (CL), one, diffuse cutaneous leishmaniasis (DCL) and 2, mucocutaneous leishmaniasis (MCL) and were formalin-f
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.