OBJECTIVE: To establish a rapid detection method for identifying rpoB mutations associated with rifampin (RIF) resistance in sputum specimens.
METHODS: We detected rpoB mutations directly in 90 sputum specimens collected from suspected tuberculosis patients using PCR-based denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and compared these results with those obtained by rpoB sequencing and conventional drug susceptibility testing.
RESULTS: The positive detection rate of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) was 52.2% by Acid-Fast Bacilli staining and 72.2% by conventional mycobacterial
Оценочное исследованиеСтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline mutations in the presenilin 1 (PS1) gene apparently account for the majority of early-onset, familial Alzheimer's disease (AD). Using a mutation-screening strategy (denaturing gradient gel electrophoresis; DGGE), we analyzed a large family with early onset AD and seizures. The patients in this family showed a novel missense mutation in exon 5 of the PS1 gene (A to T change in codon 120, altering glutamine to aspartic acid). This novel mutation is located within the second hydrophilic domain of the molecule, a region not particularly involved in previously described germline mutations,
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study characterizes the colonization and composition of bacterial flora in dwarf Asian honeybee (Apis florea) larvae and compares bacterial diversity and distribution among different sampling locations. A. florea larvae were collected from 3 locations in Chiang Mai province, Thailand. Bacterial DNA was extracted from each larva using the phenol-chloroform method. Denaturing gradient gel electrophoresis was performed, and the dominant bands were excised from the gels, cloned, and sequenced for bacterial species identification. The result revealed similarities of bacterial community profile
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the prevalence of K-ras codon 12 mutations in biliary tract (BT) tumors has been addressed in previous studies, the results have shown large discrepancies in mutation frequency.
METHODS: K-ras codon 12 mutations were investigated by polymerase chain reaction (PCR)-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), a sensitive method for detecting DNA base changes, in a large series of BT tumors.
RESULTS: In A-549 cells, which are known to contain a G to A change at the first base of K-ras codon 12, the mutation could be detected by DGGE even after 1:16 dilution with normal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic diversity of Desulfovibrio species in environmental samples was determined by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of PCR-amplified [NiFe] hydrogenase gene fragments. Five different PCR primers were designed after comparative analysis of [NiFe] hydrogenase gene sequences from three Desulfovibrio species. These primers were tested in different combinations on the genomic DNAs of a variety of hydrogenase-containing and hydrogenase-lacking bacteria. One primer pair was found to be specific for Desulfovibrio species only, while the others gave positive results with other bact
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Most nosocomial urinary tract infections are related to urinary catheters and their biofilm. For the research in this province, animal models are needed to explain the host-pathogen interactions and have an advantage in controlling external interference. This study investigated the validity of the denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) technique for identification of bacteria in a rat model of urinary catheter biofilm.
METHODS: After cutting with aseptic technique, the 24-gauge polyurethane IV catheter was placed in the female rat bladder through the urethra. The catheters we
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coeliac disease (CD) is a chronic inflammatory disorder of the small intestinal mucosa. Scientific evidence supports a role of the gut microbiota in chronic inflammatory disorders; yet information is not specifically available for CD. In this study, a comparative denaturing gradient gel electrophoresis analysis of faecal samples from coeliac children and age-matched controls was carried out. The diversity of the faecal microbiota was significantly higher in coeliac children than in healthy controls. The presence of the species Lactobacillus curvatus, Leuconostoc mesenteroides and Leuconostoc c
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous T-cell lymphomas represent a group of malignant lymphoproliferative disorders characterised by the occurrence of a monoclonal population of T-lymphocytes. Diagnosis of early stages of this disease is a difficult challenge for both the dermatologist and the dermatopathologist. With the aid of the polymerase chain reaction it is possible to amplify specific regions of the T-cell receptor gamma gene. The amplification products can then be separated by denaturing gradient gel electrophoresis in order to detect a monoclonal population of T-lymphocytes in the infiltrate. We studied 4 patie
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous T-cell lymphomas represent a group of malignant lymphoproliferative disorders characterised by the occurrence of a monoclonal population of T-lymphocytes. Diagnosis of early stages of this disease is a difficult challenge for both the dermatologist and the dermatopathologist. With the aid of the polymerase chain reaction it is possible to amplify specific regions of the T-cell receptor gamma gene. The amplification products can then be separated by denaturing gradient gel electrophoresis in order to detect a monoclonal population of T-lymphocytes in the infiltrate. We studied 4 patie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ornithine transcarbamylase (ornithine carbamoyltransferase, EC 2.1.3.3) deficiency is an X-linked inborn error of metabolism with considerable phenotypic variability in affected males. Using a combination of the polymerase chain reaction and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), we defined a mutation in a family in whom affected males have significant residual enzyme activity. A C----T change in the first nucleotide of codon 277 resulted in the substitution of a tryptophan for an arginine at amino acid 245 of the mature protein. This change appears to represent a deleterious mutation
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gilbert's syndrome, due to reduced hepatic bilirubin glucuronidation is associated with the presence of two extra nucleotides (TA) in the promoter region of the UDP-glucuronosyltransferase 1 (UGT1A1) gene. A rapid method was developed to detect this genetic polymorphism, using double gradient denaturing gradient gel electrophoresis (DG-DGGE). The promoter region of the UGT1A1 gene was amplified with a 40-mer GC-clamp attached to the 5'-end of the reverse primer. The polymerase chain reaction (PCR) product was then separated by DG-DGGE using denaturant concentrations of 15-25% and polyacrylamid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have outlined a fast, non-radioactive strategy to identify point mutations in the 5' flanking region of the gamma-globin genes using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of amplified DNA. In a sample of previously characterized carriers of non deletion-type hereditary persistence of fetal haemoglobin (HPFH) the different point mutations in both gamma gene promoters could be easily identified by DGGE of a 327 bp fragment. A 4 bp deletion at position -225 to -222 of the A gamma globin gene was unexpectedly found in several samples and shown to represent a frequent polymorphism. Anal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of this study was to analyze the differences in the intestinal composition between normal individuals and colon cancer patients.
METHODS: To establish the criteria for screening a normal individual for colon cancer, human colonic biopsies were obtained at routine colonoscopy. For patients with colon cancer, samples were obtained from cancerous regions. For normal individuals, colonic biopsies were taken from 3 sites of large intestine (descending, transverse, and ascending colon). Thereafter, a comparison of the microbiota structure by polymerase chain reaction-denaturing g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterial community manifested in a corneal ulcer was investigated with culture-independent techniques. DNA was extracted from the eye swab, 200-bp fragments spanning the hypervariable V3 region of the 16S rRNA gene (16S rDNA) were amplified by broad-range PCR and genetic fingerprinting of the total bacterial community was performed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Additionally, 16S rDNA clone libraries containing 1500-bp fragments were constructed, clones were screened by DGGE and sequenced. Microorganisms were phylogenetically most closely related to the Cytophaga/Flavo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gap junction channels formed by the connexin43 protein are considered to play crucial roles in development and function because they allow the direct cell-to-cell exchange of molecules that mediate multiple signaling events. Previous results have shown that connexin43 channels are intricately gated by phosphorylation and that disruption of this regulation gives rise to severe heart malformations and defects of laterality in human, chick and frog. Here we report the identification of connexin43 gene mutations that represent a minor population of connexin43 alleles, which could be reliably detec
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In cutaneous T-cell infiltrates, the demonstration of a clonal T-cell receptor (TCR) gene rearrangement has been considered helpful to distinguish Cutaneous T-cell lymphomas from reactive lymphoproliferation. Hence, a polymerase chain reaction (PCR) method using GC-clamp primers and denaturing gradient gel electrophoresis has been developed in our laboratory to analyze the TCR gamma locus configuration. Two hundred eleven cutaneous samples from 155 patients were analyzed. A detectable clonal TCR gamma rearrangement was significantly associated with cutaneous T-cell lymphomas as defined by morp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The analysis of polymerase chain reaction (PCR)-amplified beta-globin DNA with allele-specific oligonucleotide (ASO) probes reveals a very heterogeneous spectrum of beta-thalassaemia in the Netherlands. However about 20% of the beta-thalassemia mutations cannot be identified with this approach. The combination of specific amplification of certain regions of the beta-globin gene with denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) allowed us to rapidly localize several of these mutations to specific regions of the gene, which were again amplified and directly sequenced. We believe that the combi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MERRF (Myoclonic Epilepsy and Ragged-Red Fibres) syndrome is one of the maternally inherited diseases for which a mitochondrial DNA (mtDNA) point mutation has recently been identified. The mutation is always heteroplasmic, that is normal and mutant mtDNA coexist within the same individual. We studied mtDNA heteroplasmy in two families with MERRF syndrome, using a denaturing gradient gel electrophoresis technique that avoids the errors in the evaluation of wild/mutant mtDNA ratios caused by restriction enzyme cutting in the situation of amplification of a heteroplasmic DNA. In two patients, the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using Southern blotting for the diagnosis of clonality in peripheral T-cell lymphomas (PTCLs), analysis of the T-cell receptor (TCR) gamma gene rearrangement was shown to be more informative than that of the TCR beta gene rearrangement. In order to amplify every VJ gamma rearrangement, a polymerase chain reaction (PCR) procedure using newly designed GC-clamp primers has been developed. All primers can be mixed in a single multiplex PCR. PCR products are analysed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), providing tumour-specific imprints inasmuch as the procedure characterizes N seque
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.