Because of their ability to display yeast-like growth forms in various environmental conditions, dematiaceous (melanized) hyphomycetes of the form-genera Exophiala, Rhinocladiella, and Wangiella have been informally termed "black yeasts." Cladistic analysis of 1,050 bp of the genes coding for small-subunit rRNA (SSU rDNA) supported a close relationship among species of these black yeasts with other dematiaceous hyphomycetes in the form-genera Fonsecaea, Phialophora, and Ramichloridium. The conventional categories of these fungi based on asexual states are not supported by phylogenetic analysis
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The innate immune system provides defense against invading pathogens in insects and mammals.
METHODS: We conducted transcriptomic analyses of the locust Locusta migratoria under Aspergillus oryzae infection to clarify temporal variation in its molecular immune response.
RESULTS: We found that fat body cells and hemocytes play different roles in the immune response of locusts to Aspergillus infection at different time points after inoculation, and melanization was the main process underlying the immune response of female locusts. Most pattern recognition receptors (PRR) genes we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solanum tuberosum plants were transformed with three genetic constructions expressing the Nicotiana tabacum AP24 osmotine, Phyllomedusa sauvagii dermaseptin and Gallus gallus lysozyme, and with a double-transgene construction expressing the AP24 and lysozyme sequences. Re-transformation of dermaseptin-transformed plants with the AP24/lysozyme construction allowed selection of plants simultaneously expressing the three transgenes. Potato lines expressing individual transgenes or double- and triple-transgene combinations were assayed for resistance to Erwinia carotovora using whole-plant and tub
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungal spore killers are a class of selfish genetic elements that positively bias their own inheritance by killing non-inheriting gametes following meiosis. As killing takes place specifically within the developing fungal ascus, a tissue which is experimentally difficult to isolate, our understanding of the mechanisms underlying spore killers are limited. In particular, how these loci kill other spores within the fungal ascus is largely unknown. Here, we overcome these experimental barriers by developing model systems in 2 evolutionary distant organisms, Escherichia coli (bacterium) and Saccha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Predicting biological function from genomic sequence remains a major challenge in computational and systems biology. Here, we tested whether the genomic language model Evo2, which encodes context-dependent DNA sequence patterns into embeddings, enables prediction of essential genes in fungi, a phenotype central to fungal biology and antifungal target discovery. We found that model performance was constrained not by the type or complexity of the downstream classifier, but by the biological information contained in Evo2 DNA embeddings. Specifically, the information recoverable from t
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biosynthetic gene clusters (BGCs) of bioactive natural products occasionally encode resistant versions of the proteins they inhibit, offering opportunities for resistance gene-guided genome mining to uncover natural products with predictable modes of action. In this study, we developed a genome mining tool designed to identify fungal BGCs harboring putative resistance genes. Applying this tool to approximately 2500 fungal genomes, we identified a BGC designated as the pts cluster, which encodes an acetolactate synthase (ALS) homologue. Functional characterization of the pts cluster resulted in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Downy mildew, powdery mildew, and grey mold are some of the phytopathological diseases causing economic losses in agricultural crops, including grapevine, worldwide. In the current scenario of increasing global warming, in which the massive use of agrochemicals should be limited, the management of fungal disease has become a challenge. The knowledge acquired on candidate resistant (R) genes having an active role in plant defense mechanisms has allowed numerous breeding programs to integrate these traits into selected cultivars, even though with some limits in the conservation of the proper qua
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Allergic fungal rhinosinusitis (AFRS) is a severe phenotype of chronic rhinosinusitis with nasal polyposis (CRSwNP), characterised by localised and exaggerated type 2 inflammation. While fungal antigenic stimulation of unregulated Th2-mediated inflammation is the core pathophysiological mechanism, the direct and synergistic role of bacteria in disease modification is a pervasive hypothesis. We set out to define the microenvironment of AFRS to elucidate virulent organisms that may be implicated in the pathophysiology of AFRS.
METHODOLOGY: We undertook a cross-sectional study of A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene clusters for biosynthesis of the fungal polyketides hypothemycin and radicicol from Hypomyces subiculosus and Pochonia chlamydosporia, respectively, were sequenced. Both clusters encode a reducing polyketide synthase (PKS) and a nonreducing PKS like those in the zearalenone cluster of Gibberella zeae, plus enzymes with putative post-PKS functions. Introduction of an O-methyltransferase (OMT) knockout construct into H. subiculosus resulted in a strain with increased production of 4-O-desmethylhypothemycin, but because transformation of H. subiculosus was very difficult, we opted to charact
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fungal genus Coccidioides is composed of two species, Coccidioides immitis and Coccidioides posadasii. These two species are the causal agents of coccidioidomycosis, a pulmonary disease also known as valley fever. The two species are thought to have shared genetic material due to gene exchange in spite of their long divergence. To quantify the magnitude of shared ancestry between them, we analyzed the genomes of a population sample from each species. Next, we inferred what is the expected size of shared haplotypes that might be inherited from the last common ancestor of the two species and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The basidiomycete Cryptococcus neoformans, an invasive opportunistic pathogen of the central nervous system, is the most frequent cause of fungal meningitis worldwide resulting in more than 625,000 deaths per year worldwide. Although electroporation has been developed for the transformation of plasmids in Cryptococcus, only biolistic delivery provides an effective means to transform linear DNA that can be integrated into the genome by homologous recombination. Acetate has been shown to be a major fermentation product during cryptococcal infection, but the significance of this is not yet known
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcriptional regulation of cell fate plays a central role in eukaryotic cell differentiation. In the human fungal pathogen Candida albicans, the white-to-opaque cell fate switch is controlled by an interconnected network of eight transcription factors (TFs). These include Ssn6, a negative regulator of the opaque state that can function with its co-repressor Tup1; together, they form a global repressor complex that is conserved from yeast to mammals. Here, we evaluated the roles of four Ssn6 domains (N, TPR, M, and CTD) in white-opaque switching. Loss of the prion-like N or M domains had
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human fungal pathogen Candida glabrata is closely related to the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. The sexual cycle in S. cerevisiae has been extensively characterized. Haploid cells 'a' and alpha secrete pheromones involved in mating of the opposite cell type leading to the formation of a diploid cell. Under harsh conditions, diploid cells undergo meiosis for the formation of four haploid spores. In C. glabrata, cells are also found as 'a' and alpha and this organism possesses most S. cerevisiae homologous genes involved in meiosis and mating. However, mating has never been observed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell fate decisions in eukaryotes are regulated by interconnected networks of transcription factors (TFs) that drive heritable changes in identity. However, much is unknown about how TFs act together to control cell fate, despite links to cellular dysfunction and disease when TF function is aberrant. Here, we addressed the interplay between TFs that control heritable switching in the diploid fungal pathogen Candida albicans. This species can propagate in two distinct cell states, white and opaque, with epigenetic transitions between states regulated by a core network of eight TFs plus >100 aux
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis jirovecii is an unculturable fungus and the causative agent of Pneumocystis pneumonia, a life-threatening opportunistic infection. Although molecular diagnosis is often based on the detection of mtLSU rRNA mitochondrial gene, the number of copies of mitochondrial genes had not been investigated. We developed and optimized six real-time PCR assays in order to determine the copy number of four mitochondrial genes (mtSSU rRNA, mtLSU rRNA, NAD1, and CYTB) in comparison to nuclear genome (DHPS and HSP70) and tested 84 bronchoalveolar fluids of patients at different stages of the infect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The degradation of phenylacetate (PA) was investigated as a model to explore aromatic compound breakdown in the fungal system. Fungal strains capable of utilizing PA as their sole carbon source were isolated using a minimal solid medium supplemented with 0.5 % PA. Subsequent cultivation in minimum liquid medium revealed that selected fungal strains, including Trametes versicolor TV0876 and TV3295, Paecilomyces hepiali PH4477, and Akanthomyces muscarius AM1091, efficiently removed PA within 24 h. HPLC analysis of culture supernatants from various fungal strains revealed a time-dependent accumul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Receptor-like cytoplasmic kinases (RLCKs) represent a distinct class of receptor-like kinases crucial for various aspects of plant biology, including growth, development, and stress responses. This study delves into the characterization of RLCK VII-8 members within cucurbits, particularly in melon, examining both structural features and the phylogenetic relationships of these genes/proteins. The investigation extends to their potential involvement in disease resistance by employing ectopic overexpression in Arabidopsis. The promoters of CmRLCK VII-8 genes harbor multiple phytohormone- and stre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The main purpose of our study was to evaluate multiplex PCR assay targeting novel genes for detection of five fungal and bacterial agents in BAL samples; because many fungi and bacteria that cause respiratory infections have similar clinical symptoms, diagnosing and differentiating them are therefore essential to controlling and treating them. A total of 100 BAL specimens from a mycobacterium and mycology laboratory were collected from patients suspected of having TB or other respiratory diseases. Novel DNA targets for Aspergillus, Nocardia, Cryptococcus, and Streptomyces were found using modi
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonrecombining sex chromosomes are widely found to be more differentiated than autosomes among closely related species, due to smaller effective population size and/or to a disproportionally large-X effect in reproductive isolation. Although fungal mating-type chromosomes can also display large nonrecombining regions, their levels of differentiation compared with autosomes have been little studied. Anther-smut fungi from the Microbotryum genus are castrating pathogens of Caryophyllaceae plants with largely nonrecombining mating-type chromosomes. Using whole genome sequences of 40 fungal strain
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucormycosis is an emerging angio-invasive infection caused by Mucorales that presents unacceptable mortality rates. Iron uptake has been related to mucormycosis, since serum iron availability predisposes the host to suffer this infection. In addition, iron uptake has been described as a limiting factor that determines virulence in other fungal infections, becoming a promising field to study virulence in Mucorales. Here, we identified a gene family of three ferroxidases in Mucor circinelloides, fet3a, fet3b and fet3c, which are overexpressed during infection in a mouse model for mucormycosis,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования