Voltage-gated sodium channel NaV1.7 is a key mediator of electrical excitability and signal transmission in peripheral nociceptors and has emerged as a highly attractive therapeutic target for the development of novel analgesic agents. However, the development of selective NaV1.7 inhibitors has been characterized by significant challenges, with repeated failures in clinical trials despite encouraging preclinical data. In this study, we developed and validated a series of ligand-based pharmacophore models (LBPMs) that can be useful for the discovery of novel NaV1.7 inhibitors with improved sele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Barriers to the ready adoption of biocatalysis into asymmetric synthesis for early stage medicinal chemistry are addressed, using ketone reduction by alcohol dehydrogenase as a model reaction. An efficient substrate screening approach is used to show the wide substrate scope of commercial alcohol dehydrogenase enzymes, with a high tolerance to chemical groups employed in drug discovery (heterocycle, trifluoromethyl and nitrile/nitro groups) observed. We use our screening data to build a preliminary predictive pharmacophore-based screening tool using Forge software, with a precision of 0.67/1,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The management of neurological disorders such as dementia associated with Alzheimer's or Parkinson's disease includes the use of cholinesterase inhibitors. These compounds can slow down the progression of these diseases and can also be used in the treatment of glaucoma and myasthenia gravis. The majority of the cholinesterase inhibitors used in the clinic are derived from natural products and our current paper describes the use of a small marine pharmacophore to develop potent and selective cholinesterase inhibitors. Fourteen small inhibitors were designed based on recent discoveries about the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among the various heterocyclic molecules employed for drug design and discovery, pyrazolopyridine is one of the promising pharmacophores. Pyrazolopyridine is a result of fusion of pyrazole and pyridine rings. The potent pharmacology of pyrazolopyridine may be the synergistic effect of pyrazole and pyridine moieties in a single framework. It has been used in drug design of a wide range of diseases such as anticancer, antimicrobial, anti-inflammatory, and neuroprotection. Cancer has become a common disease among elderly people now a days that might be because of genetic inheritance to some exten
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prodiginines are a family of linear and cyclic oligopyrrole red-pigmented compounds possessing antibacterial, anticancer and immunosuppressive activities and are produced by actinomycetes and other eubacteria. Recently, prodiginines have been reported to possess potent in vitro as well as in vivo antimalarial activity against chloroquine sensitive D6 and multi-drug resistant Dd2 strains of Plasmodium falciparum. In the present paper, a QSAR and pharmacophore modeling for a series of natural and synthetic prodiginines was performed to find out structural features which are crucial for antimalar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several secondary amines exhibit promising macrofilaricidal response in vivo through oral route of administration against Acanthocheilonema viteae in which N-hexylcyclohexylamine (1) shows 100% macrofilaricidal activity while a tertiary amine such as 9 elicits predominantly microfilaricidal (93%) response.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We develop an extension of conventional distance geometry techniques that treats two or more molecules as a single "ensemble". This extension can be used to find a common pharmacophore, i.e., the spatial arrangement of essential groups, from a small set of biologically active molecules. The approach can generate, in one step, coordinates for the set of molecules in their "active" conformations such that their essential groups are superimposed. As an example, we show how the nicotinic pharmacophore can be deduced from a set of four nicotinic agonists: nicotine, cytisine, ferruginine methiodide,
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benzimidazole (BI) and its derivatives are interesting molecules in medicinal chemistry because several of these compounds have a diversity of biological activities and some of them are even used in clinical applications. In view of the importance of these compounds, synthetic chemists are still interested in finding new procedures for the synthesis of these classes of compounds. Astemizole (antihistaminic), Omeprazole (antiulcerative), and Rabendazole (fungicide) are important examples of compounds used in medicinal chemistry containing BI nuclei. It is interesting to observe that several of
ОбзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of novel chalcone and thiol-Michael addition analogues was synthesized and tested against Mycobacterium tuberculosis and other clinically significant bacterial pathogens. Previously reported chalcone-like antibacterials (1a-c and 2) were used as a training set to generate a pharmacophore model. The chalcone derivative hit compound 3 was subsequently identified through a pharmacophore-based virtual screen of the Specs library of >200 000 compounds. Among the newly synthesized chalcones and thiol-Michael addition analogues, chalcones 6r and 6s were active (minimum inhibitory concentrati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sirtuins are involved in epigenetic regulation, the pathogenesis of cancer, and several metabolic and neurodegenerative diseases. Despite being a promising drug target, only one small molecule passed class II clinical trials to date. Deriving a better mechanistic understanding is hence crucial to find new modulators. We previously reported on a series of dithienyl maleimides as photochromic tool compounds. However, their photochromic behavior was limited. To improve the interconversion and stability of both photoisomers, we replaced the dithienyl maleimide with a fulgimide as a photochromic co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The design and the preparation of a small library of 1,4-diphenyl-1,2,3-triazole derivatives is reported, with the aim to obtain a new class of Hedgehog pathway inhibitors. The smoothened protein is part of the hedgehog signaling pathway that is inhibited by the lead compound Vismodegib. Based on molecular modeling simulations, seven triazole derivatives of Vismodegib are synthesized and their biological effect on different endothelial, cancer, and cancer stem cell lines is reported.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The binding of a series of metal-binding pharmacophores (MBPs) related to the ligand 1-hydroxypyridine-2-(1H)-thione (1,2-HOPTO) in the active site of human carbonic anhydrase II (hCAII) has been investigated. The presence and/or position of a single methyl substituent drastically alters inhibitor potency and can result in coordination modes not observed in small-molecule model complexes. It is shown that this unexpected binding mode is the result of a steric clash between the methyl group and a highly ordered water network in the active site that is further stabilized by the formation of a hy
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cannabinoid CB(1) and CB(2) receptors belong to the Class A, rhodopsin-like family of G protein-coupled receptors. Antagonists for each receptor sub-type, as well as four structural classes of agonists that bind to both receptors, have been identified. An extensive amount of SAR has been developed for agonists and antagonists that bind at CB1, while the SAR of CB2 ligands is only now emerging in the literature. Cannabinoid agonists have been suggested to have potential therapeutic uses as appetite stimulants, analgesics, anti-emetics, anti-diarrheals, anti-spasmodics, tumor anti-proliferat
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a data-driven and unsupervised approach for extracting 3D pharmacophore hypotheses, without prior ligand selection, from a chemogenomic kinase dataset (406 kinases and 645 compounds, PKIS2). A metric called NEM for Normalized Enrichment Measure is introduced for each pharmacophore, which quantifies change in the proportion of active compounds consistent with the pharmacophore compared to the original dataset. Based on this metric, we can identify pharmacophores associated with specific kinases and, conversely, determine all kinases that share similar metric values. This approach ena
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adenosine deaminase (ADA) is a key enzyme in purine metabolism, and abnormal ADA activity has been associated with various diseases, including severe combined immunodeficiency, cancer, neurodegenerative disorders, and liver diseases.
OBJECTIVES: This study employed a pharmacophore-based virtual screening strategy to identify novel ADA inhibitors from an in-house library.
METHODS: Two crystal structures of ADA co-crystallized with erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl) adenine (EHNA) and pentostatin were used to develop a pharmacophore model. The validated model was used to screen an in-ho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nowadays, an efficient and robust virtual screening procedure is crucial in the drug discovery process, especially when performed on large and chemically diverse databases. Virtual screening methods, like molecular docking and classic QSAR models, are limited in their ability to handle vast numbers of compounds and to learn from scarce data, respectively. In this study, we introduce a universal methodology that uses a machine learning-based approach to predict docking scores without the need for time-consuming molecular docking procedures. The developed protocol yielded 1000 times faster bindi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thevinols and their 3-O-demethylated relatives, orvinols, are derivatives of the Diels-Alder adduct of natural alkaloid thebaine with methyl vinyl ketone. Taken together, thevinols and orvinols constitute an important family of opioid receptor (OR) ligands playing an important role in both the OR mediated antinociception and OR antagonism. Herein, we disclose for the first time the antagonist activity of the N-allyl substituted orvinol derivative fluorinated within the pharmacophore associated with C(20) and its surrounding. This compound was prepared via a novel synthetic sequence from 18,19-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Search for new pharmacological alternatives for obesity is based on the design and development of compounds that can aid in weight loss so that they can be used safely and effectively over a long period while maintaining their function. The endocannabinoid system is related to obesity by increasing orexigenic signals and reducing satiety signals. Cannabis sativa is a medicinal plant of polypharmaceutical potential that has been widely studied for various medicinal purposes. The in silico evaluation of their natural cannabinoids (also called phytocannabinoids) for anti-obesity purpose stems fro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antipyrine (1,2-dihydro-1,5-dimethyl-2-phenylpyrazole-3-one) in a structural frame consists of a five membered lactam pyrazolone heterocyclic ring as a pharmacophore moiety. It is evident from literature that the molecules having nitrogen bearing heterocyclic nuclei clearly exhibit several biological actions. Commercially available pyrazolone derivatives as drugs, analgin and metamizol are an established chemical class of analgesics. Recent trends of synthetic routes and several biological actions of antipyrine analogues are considered in this review. Indeed, the synthesized derivatives posses
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flupyradifurone (4-[(2,2-difluoroethyl)amino]-2(5H)-furanone), a member of the new class of butenolide insecticides, contains a novel bioactive scaffold as pharmacophore. It is very versatile in terms of application methods to a variety of crops, exhibits excellent and fast action against a broad spectrum of sucking pest insects including selected neonicotinoid resistant pest populations such as whiteflies and aphids expressing metabolic resistance mechanisms. As a partial agonist flupyradifurone reversibly binds to insect nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs) and lacks metabolization by
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.