This article describes a method for selecting single-stranded DNA (ssDNA) molecules that bind with high-affinity aptamers to specific target proteins. This SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) method is similar to other "primer-free" approaches where the random sequence ssDNA starting pool has no fixed sequences at the 5' and 3' termini. Therefore, there are no predetermined sequences that could bias selection. Like other SELEX methods, repeated cycles (typically 5-15) of selection and then amplification and reselection are used. The method differs from other prime
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human spermatogonial stem cells (SSCs) exhibit a remarkable capacity for proliferation, crucial for sustaining spermatogenesis throughout life. While the Cullin-RING E3 ubiquitin ligase 2 (CRL2) complex is known to regulate various cellular functions, its precise role in human SSCs has not been fully elucidated. This study aimed to investigate a novel variant of the CRL2 complex, termed CRL2LRRC41, and its role in SSC function.
METHODS: We utilized molecular biology techniques, including gene knockdown and functional assays, to assess the effects of CRL2LRRC41 on the proliferative
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have studied the regulation of DNA ligase I gene expression in UV-C irradiated human primary fibroblasts. An increase of approximately 6-fold both in DNA ligase I messenger and activity levels was observed 24 h after UV treatment, when nucleotide excision repair (NER) is no longer operating. DNA ligase I induction is serum-independent and is controlled mainly by the steady-state level of its mRNA. The activation is a function of the UV dose and occurs at lower doses in cells showing UV hypersensitivity. No increase in replicative DNA polymerase alpha activity was found, indicating that UV i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pannexins (PANXs) are channel-forming proteins implicated in cellular communication through the secretion of biomolecules, such as ATP and glutamate. PANX1 and PANX3 are expressed in the male rat reproductive tract and their levels are regulated by androgens in the epididymis. There is currently no information on the regulation of the Panx1 promoter. The objective of the present study was to characterize the Panx1 promoter in order to understand its regulation in the epididymis. RNA ligase-mediated rapid amplification of cDNA ends identified three transcriptional start sites, at positions -443
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Liver regeneration is a tightly regulated process requiring coordinated interactions between hepatocytes and non-parenchymal cells; however, its molecular mechanisms remain incompletely defined. Here, we aimed to investigate the role of interferon-related developmental regulator 1 (IFRD1) in regulating metabolic-immune crosstalk during liver regeneration.
METHODS: We integrated public transcriptomic datasets, human liver disease samples, and multiple in-house-generated experimental models to characterize the dynamic expression of IFRD1 during liver regeneration. Genetic los
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: About 15% of couples experience difficulty in conceiving a child, of which half of the cases are thought to be male-related. Asthenozoospermia, or low sperm motility, is one of the frequent types of male infertility. Although energy metabolism is suggested to be central to the etiology of asthenozoospermia, very few attempts have been made to identify its underlying metabolic pathways. Here, we reconstructed SpermNet, the first proteome-scale model of the sperm cell by using whole-proteome data and the mCADRE algorithm. The reconstructed model was then analyzed using the COBRA tool
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumour necrosis factor receptor-associated factor 7 (TRAF7), an E3 ubiquitin ligase, regulates multiple signalling pathways through posttranslational modifications. However, its role in acute myeloid leukaemia (AML) remains controversial and poorly understood. METHODS: Analysis of public AML datasets and validation using in-house samples were conducted to evaluate TRAF7 expression in bone marrow samples from AML patients and to assess its potential as a prognostic marker. Gain- and loss-of-function studies were performed in AML cell lines, primary CD34+ cells and a xenograft mouse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Skeletal muscle fat infiltration is a common feature during ageing, obesity and several myopathies associated with muscular dysfunction and sarcopenia. However, the regulatory mechanisms of intramuscular adipogenesis and strategies to reduce fat infiltration in muscle remain unclear. Here, we identified the growth arrest and DNA damage-inducible alpha (GADD45A), a stress-inducible histone folding protein, as a critical regulator of intramuscular fat (IMAT) infiltration.
METHODS: To explore the role of GADD45A on IMAT infiltration and muscle regeneration, the gain or loss function
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly lethal liver cancer with complex pathogenesis intertwined with metabolic and mitochondrial dysfunction. MEN1/menin is a protein with context-dependent functions in liver diseases. While MEN1 has been linked to HCC progression and mitochondrial homeostasis, its precise regulatory mechanism in these processes remains incompletely understood. Here, we report that MEN1 localizes to the outer mitochondrial membrane (OMM) in HCC cells, which is mediated by its N-terminal mitochondrial targeting sequence and the TOMM20 translocase complex. In a genetically e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is an incurable cancer of plasma cells with a 5-year survival rate of 59%. Dysregulation of fatty acid (FA) metabolism is associated with MM development and progression; however, the underlying mechanisms remain unclear. Herein, we explore the roles of long-chain fatty acid coenzyme A ligase (ACSL) family members in MM. ACSLs convert free long-chain fatty acids into fatty acyl-CoA esters and play key roles in catabolic and anabolic fatty acid metabolism. Analysis of the Multiple Myeloma Research Foundation (MMRF) CoMMpassSM study showed that high ACSL1 and ACSL4 expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic competition and nutrient restriction in the tumor microenvironment (TME) shape the immune infiltrate in tumors and subsequently tumor immunity. In this study we used the transgenic melanoma mouse model tg(Grm1)EPv, which spontaneously develops melanoma due to the ectopic expression of the metabotropic glutamate receptor 1 (Grm1) in melanocytes to investigate if aberrant glutamate metabolism drives tumor formation and affects immune cell function.
METHODS: We performed liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS)-based metabolomic analyses and RNA sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Concurrent activation of poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) and DNA ligase was observed in cultured human epidermal keratinocytes (HEK) exposed to the DNA alkylating compound sulfur mustard (SM), suggesting that DNA ligase activation could be due to its modification by PARP. Using HEK, intracellular 3H-labeled NAD+ (3H-adenine) was metabolically generated and then these cells were exposed to SM (1 mM). DNA ligase I isolated from these cells was not 3H-labeled, indicating that DNA ligase I is not a substrate for (ADP-ribosyl)ation by PARP. In HEK, when PARP was inhibited by 3-amino benzamide (
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moyamoya disease (MMD) is an occlusive, chronic cerebrovascular disease affected by genetic mutation and the immune response. Furthermore, vascular smooth muscle cells (VSMCs) and endothelial cells (ECs) participate in the neointima of MMD, but the etiology and pathophysiological changes in MMD vessels remain largely unknown. Therefore, we established the circZXDC (ZXD family zinc finger C)-miR-125a-3p-ABCC6 (ATP-binding cassette subfamily C member 6) axis from public datasets and online tools based on "sponge-like" interaction mechanisms to investigate its possible role in VSMCs. The results
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Philadelphia chromosome-positive (Ph+) leukemia is among the most aggressive forms of leukemia and arises from the Philadelphia chromosome (Bcr-Abl fusion gene) abnormality. This disease is associated with a poor prognosis in adults and resistance to traditional treatment. Thus, the identification of novel therapeutic targets and drugs for Ph+ leukemia remains crucial. S-phase kinase-associated protein 2 (Skp2), a key component of the SCF ubiquitin ligase complex, is aberrantly overexpressed in various malignancies and therefore represents a potential target for anticancer therapy. This study
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the activation of error-prone DNA repair pathway in response to Helicobacter pylori infection. Relative changes in the expression levels of genes involved in the non-homologous end-joining pathway (NHEJ) in H. pylori-infected (Cases) and non-infected patients (Controls) with chronic gastritis were measured. A significant increase in the relative expression level of TP53, and significant decrease in the relative transcription of lncRNA LINP1 and XRCC5 were detected in the case group. The transcription of Lig4 and XRCC6 was increased in the case group, which was n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) is a highly conserved long non-coding RNA (lncRNA). Overexpression of MALAT1 has been demonstrated to related to poor prognosis of multiple myeloma (MM) patients. Here, we demonstrated that MALAT1 plays important roles in MM DNA repair and cell death. We found bone marrow plasma cells from patients with monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) and MM express elevated MALAT1 and involve in alternative non-homozygous end joining (A-NHEJ) pathway by binding to PARP1 and LIG3, two key components of the A-NHEJ protein
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although cocaine exposure has been shown to potentiate neuroinflammation by upregulating glial activation in the brain, the role of mitophagy in this process remains an enigma. In the present study, we sought to examine the role of impaired mitophagy in cocaine-mediated activation of microglia and to determine the ameliorative potential of superoxide dismutase mimetics in this context. Our findings demonstrated that exposure of mouse primary microglial cells (mPMs) to cocaine resulted in decreased mitochondrial membrane potential, that was accompanied by increased expression of mitophagy marke
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired drug resistance eventually leads to treatment failure in T-cell acute lymphoblastic leukaemia (T-ALL). Immunophenotypic and cytogenetic heterogeneities within T-ALL influence susceptibility to cytotoxic therapy, and little is known about the mechanisms of drug resistance at specific stages of T-cell ontogeny. We developed tolerance to therapeutic concentrations of daunorubicin (DNR) and L-asparaginase (L-asp) in Jurkat (CD1a(-), sCD3(+)) and Sup T1 (CD1a(+), sCD3(-)) cell lines, having respective 'mature' and 'cortical' stages of developmental arrest. DNR resistant cells acquired mult
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Disruption of mitochondrial homeostasis drives cardiomyopathy and heart failure, yet upstream regulatory mechanisms remain poorly defined. Neddylation, a reversible post-translational conjugation of the ubiquitin-like protein NEDD8 by E1/E2/E3 enzymes, is essential for cardiac morphogenesis, but its role in the adult heart is unknown.
METHODS: We assessed the relevance of neddylation to human cardiac disease by gene set enrichment analysis of ischemic (ICM) and non-ischemic cardiomyopathy (NICM) datasets and by immunoblotting and qPCR of ventricular tissue from patients with ICM o
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to imatinib (IM) and other tyrosine kinase inhibitors (TKI)s is an increasing problem in leukemias caused by expression of BCR-ABL1. As chronic myeloid leukemia (CML) cell lines expressing BCR-ABL1 utilize an alternative non-homologous end-joining pathway (ALT NHEJ) to repair DNA double-strand breaks (DSB)s, we asked whether this repair pathway is a novel therapeutic target in TKI-resistant disease. Notably, the steady state levels of two ALT NHEJ proteins, poly-(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1) and DNA ligase IIIα, were increased in the BCR-ABL1-positive CML cell line K562 and, to
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.