OBJECTIVE The pathogenesis of cerebral aneurysms (CAs) remains largely unknown. Long noncoding RNAs (lncRNAs) were reported recently to play crucial roles in many physiological and biological processes. Here, the authors compared the gene-expression profiles of CAs and their control arteries to investigate the potential functions of lncRNAs in the formation of CAs. METHODS A prospective case-control study was designed to identify the changes in expression of lncRNAs and mRNAs between 12 saccular CA samples (case group) and 12 paired superficial temporal artery samples (control group). Microarr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary aldosteronism is present in ≈10% of hypertensives. We previously performed a microarray assay on aldosterone-producing adenomas and their paired zona glomerulosa and fasciculata. Confirmation of top genes validated the study design and functional experiments of zona glomerulosa selective genes established the role of the encoded proteins in aldosterone regulation. In this study, we further analyzed our microarray data using AmiGO 2 for gene ontology enrichment and Ingenuity Pathway Analysis to identify potential biological processes and canonical pathways involved in pathological and p
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The cortex mori comes from the white endothelium of the young root of Morus alba L., and its medical value was first described in Shen Nong Ben Cao Jing (Classic on Materia Medical of Shennong). It was originally intended to purge lung, relieve asthma and reduce swelling. More and more studies reported that its pharmacological effects include analgesic, anti-inflammatory, antitussive, antiasthmatic, hypoglycemic, hypolipidemic and anti-diabetic peripheral neuropathy. Accumulating clinical evidences exhibited that it can treat asthma, pneumonia and lung cancer. However, a comprehe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer disease (AD) and Postoperative delirium (POD) may share a common mechanism, but their shared genes and potential novel therapeutic targets remains unknown. We selected datasets GSE48350, GSE4226, and GSE16759 containing AD and control samples from the GEO database for AD model development, and use the GSE63061 dataset for AD model validation. The GSE163943 dataset containing PODs and controls was used to identify common genes. Differentially expressed genes (DEGs) associated with POD and AD respectively, as well as common DEGs between 2 diseases were analyzed. Shared DEGs were assess
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder intracavitary hyperthermic perfusion chemotherapy (HIPEC) is a promising treatment for non-muscular invasive bladder cancer (NMIBC). However, the molecular mechanisms underlying the response to HIPEC remain poorly understood. This study aimed to elucidate the transcriptomic profiles associated with the response to HIPEC in NMIBC patients.
METHODS: RNA sequencing was performed on bladder tumor samples from NMIBC patients who underwent HIPEC treatment. Differentially expressed genes (DEGs) between responders and non-responders to HIPEC were identified. Gene ontology and path
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc (IVD) degeneration contributes to disabling back pain. Degeneration can be initiated by injury and progressively leads to an irreversible loss of cells and function. IVD function restoration through cell replacement therapies have had limited success due to knowledge gaps in the critical cell populations important for repair. Here, we used single cell RNA sequencing to identify the transcriptional changes of IVD resident and infiltrating cell populations from Control and Injured coccygeal IVDs extracted from 12-week-old female C57BL/6J mice 7 days post injury. Clustering, g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postmenopausal osteoporosis (PMOP) has become one of most frequent bone diseases worldwide with aging population. Lycii Fructus, a common plant fruit with the property of drug homologous food, has long since been used to treat PMOP. The aim of this study is to explore pharmacological mechanisms of Lycii Fructus against PMOP through using network pharmacology approach. The active ingredients of Lycii Fructus were obtained from Traditional Chinese Medicine System Pharmacology database. Target fishing was performed on these ingredients in UniProt database for identification of the relative target
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study concerns the analysis of the modulation of Chronic Myeloid Leukemia (CML) cell model K562 transcriptome following transfection with the tumor suppressor gene encoding for Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type G (PTPRG) and treatment with the tyrosine kinase inhibitor (TKI) Imatinib. Specifically, we aimed at identifying genes whose level of expression is altered by PTPRG modulation and Imatinib concentration. Statistical tests as differential expression analysis (DEA) supported by gene set enrichment analysis (GSEA) and modern methods of ontological term analysis are presented
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) still tends to propagate and increase the occurrence of COVID-19 across the globe. The clinical and epidemiological analyses indicate the link between COVID-19 and Neurological Diseases (NDs) that drive the progression and severity of NDs. Elucidating why some patients with COVID-19 influence the progression of NDs and patients with NDs who are diagnosed with COVID-19 are becoming increasingly sick, although others are not is unclear. In this research, we investigated how COVID-19 and ND interact and the impact of COVID-19 on the severity of NDs by perfo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In this theoretical study, a text mining search and clustering analysis of data related to genes potentially involved in human pemphigoid autoimmune blistering diseases (PAIBD) was performed using web tools to create a gene/protein interaction network.
METHODS: The Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins (STRING) database was employed to identify a final set of PAIBD-involved genes and to calculate the overall significant interactions among genes: for each gene, the weighted number of links, or WNL, was registered and a clustering procedure was performed using t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Rituximab displays therapeutic benefits in the treatment of patients with rheumatoid arthritis (RA) resistant to tumor necrosis factor (TNF) blockade. However, the precise role of B cells in the pathogenesis of RA is still unknown. We undertook this study to investigate the global molecular effects of rituximab in synovial biopsy samples obtained from anti-TNF-resistant RA patients before and after administration of the drug.
METHODS: Paired synovial biopsy samples were obtained from the affected knee of anti-TNF-resistant RA patients before (time 0) and 12 weeks after (time 12) in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neospora caninum is a coccidian cyst-forming parasite found in a wide range of host species such as mice, dogs and cattle. The development of methods such as vaccines to prevent abortion and fetal loss due to neosporosis would be greatly assisted by further knowledge on immunity and host responses to infection. In this study we used microarray technology to investigate the protective host responses occurring at 6h post infection in the spleen of mice infected with a prototype live N. caninum vaccine. Naive non-pregnant mice were infected with the NC-Nowra isolate as such infections are known t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinical and radiographic measures are gold standards for diagnosing periodontitis but offer little information regarding the pathogenesis of the disease. We hypothesized that a comparison of gene expression signatures between healthy and diseased gingival tissues would provide novel insights in the pathobiology of periodontitis and would inform the design of future studies.
METHODS: Ninety systemically healthy non-smokers with moderate to advanced periodontitis (63 with chronic periodontitis and 27 with aggressive periodontitis) each contributed at least two diseased interproxima
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bipolar disorder (BPD) is a complex psychiatric trait with high heritability. Despite efforts through conducting genome-wide association (GWA) studies, the success of identifying susceptibility loci for BPD has been limited, which is partially attributed to the complex nature of its pathogenesis. Pathway-based analytic strategy is a powerful tool to explore joint effects of gene sets within specific biological pathways. Additionally, to incorporate other aspects of genomic data into pathway analysis may further enhance our understanding for the underlying mechanisms for BPD. Patterns of DNA me
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH QUESTION: What is the effect on mouse fetal gene expression of combined antioxidants (acetyl-L-carnitine, N-acetyl-L-cysteine and alpha-lipoic acid; A3) when used in culture media and vitrification/warming solutions?
DESIGN: A laboratory-based analysis of an animal model. Embryo transfers were conducted on in-vivo-flushed blastocysts, or blastocysts cultured or vitrified with and without A3. Transcriptional profiles of E14.5 fetal liver and placental tissue in all groups were quantified using RNA-Seq and functional analyses (gene ontology [GO] biological processes and Kyoto Encyclope
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although it has been well documented that pre-eclampsia is caused by a combination of maternal and fetal susceptibility genes, little is known about the precise etiology of this complicated disorder. To investigate how the expression of fetal genes contributes to the mechanisms underlying the progression of this disease, we have analyzed differentially expressed genes using placentas from 13 normal pregnancies and 14 pregnancies with severe pre-eclampsia. We performed genome-wide expression profiling using high-density oligonucleotide microarrays, followed by validation using real-time PCR. Am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emodin is the main component of traditional Chinese medicines including rhubarb, Polygonum multiflorum, and Polygonum cuspidatum. It has confirmed hepatotoxicity and may be the main causative agent of liver damage associated with the above-mentioned traditional Chinese medicines. However, current research does not explain the mechanism of emodin in hepatotoxicity. In this study, L02 cells were used as a model to study the mechanism of emodin-induced hepatocyte apoptosis using quantitative proteomics, and the results were verified by Western blot. A total of 662 differentially expressed protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism Spectrum Disorder (ASD) is a biologically heterogeneous neurodevelopmental condition, presenting a major barrier to the identification of robust and translatable molecular biomarkers. Here, we employ a cross-species proteomic framework to identify conserved protein signatures associated with ASD. Quantitative proteomic profiling of brain and serum from CNTNAP2 knockout mice, integrated with serum proteomes from individuals with ASD, revealed 132 proteins consistently dysregulated across species. Functional pathway analyses implicated coordinated alterations in lipid metabolism, synaptic
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ovary is the primary reproductive organ in goats, and its development significantly influences the sexual maturity and reproductive capacity of individuals. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are integral to a wide array of biological processes. However, the regulatory function of lncRNAs in the development of ovarian tissue during sexual maturity in goats remains largely unexplored. In this study, we conducted RNA sequencing on ovarian tissue samples from Meigu goats at sexually immature (3 months, n = 3) and sexually mature periods (6 months, n = 3). We identified a total of 966 lncRNAs acro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple objectives have emerged in tuning protein-protein interaction (PPI) networks, such as identifying cross-species network similarities and predicting protein complexes and functions. Despite the proliferation of tuning methodologies, challenges remain in balancing accuracy and efficiency. In this paper, we introduce GA2Vec, a novel approach for globally aligning multiple PPI networks using genetic algorithms in a many-to-many fashion. GA2Vec leverages vector embeddings of protein sequences from ProtBERT, ESM-2, and ProtT5-XL-UniRef50 to reconstruct weighted PPI networks, incorporating f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования