Osteoarthritis (OA) is a heterogeneous joint disease in which patients differ widely in onset, progression, pain burden, and inflammatory activity, yet clinical tools for early risk stratification and mechanism-informed subtyping remain limited. Human genetic studies have identified many OA-associated loci, but translation into deployable biomarkers has been slow because most signals are polygenic, largely noncoding, and dependent on tissue and cell state. Despite rapid progress in OA genomics, a major remaining challenge is how to systematically convert genetic discoveries into clinically act
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial intelligence (AI) is increasingly being explored as a bridge between high-dimensional cardiovascular phenotyping and genomic interpretation in children with inherited and congenital heart disease. This review focuses specifically on where AI-assisted approaches in pediatric cardiovascular genetics have progressed beyond proof-of-concept, how the maturity of evidence differs between general genomic tools and pediatric cardiovascular applications, and what is required for responsible clinical translation. Inherited and rare cardiovascular disorders are characterized by genetic heterog
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell Painting is a high-content imaging approach that enables systematic characterization of cellular responses to chemical perturbations through quantitative morphological profiling. Although this methodology has been widely applied in drug discovery and functional genomics, ovarian cancer models remain comparatively underrepresented in Cell Painting studies. In the present work, we established a Cell Painting workflow for OVCAR-3 ovarian cancer cells and applied it to the phenotypic profiling of 54 anticancer compounds representing diverse mechanisms of action. Cells were exposed to compound
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lipids play key roles in numerous biological processes, including energy storage, cell membrane structure, signaling, immune responses, and homeostasis, making lipidomics a vital branch of metabolomics that analyzes and characterizes a wide range of lipid classes. Addressing the complex etiology, age-related risk, progression, inflammation, and research overlap in conditions like Alzheimer's Disease, Parkinson's Disease, Cardiovascular Diseases, and Cancer poses significant challenges in the quest for effective therapeutic targets, improved diagnostic markers, and advanced treatmen
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent revolution in imaging techniques and results from RNA footprinting in situ reveal how the bacteriophage MS2 genome regulates both particle assembly and genome release. We have proposed a model in which multiple packaging signal (PS) RNA-coat protein (CP) contacts orchestrate different stages of a viral life cycle. Programmed formation and release of specific PS contacts with CP regulates viral particle assembly and genome uncoating during cell entry. We hypothesize that molecular frustration, a concept introduced to understand protein folding, can be used to better rationalize how P
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMMARY: Viral genome sequencing and analysis are crucial for understanding the diversity and evolution of viruses. Traditional Sanger sequencing is limited by low sequence depth and is labor intensive. Next-Generation Sequencing (NGS) methods, such as Illumina, offer improved sequencing depth and throughput but face challenges with accurate reconstruction of viral genomes due to genome fragmentation. Third-generation sequencing platforms, such as PacBio and Oxford Nanopore Technologies (ONT), generate long reads with high throughput. However, PacBio is constrained by substantial resource requ
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic DNA encodes regulatory information that determines where, when, and to what extent genes are expressed. Theoretically, we should be able to identify these transcriptional "instructions" by examining genomic DNA sequence alone, yet this has remained challenging. Here we present the Vertebrate Regulatory MOdule Detector (VRMOD), a method that accurately predicts gene regulatory sequences using only the query genomic sequences. We applied VRMOD to 309 Ensembl genomes, generating a compendium of high-resolution, genome-position-fixed cis-regulatory modules without parameter tuning. We perf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The abundance of immune and stromal cells in the tumor microenvironment (TME) is informative of levels of inflammation, angiogenesis, and desmoplasia. Radiomics, an approach of extracting quantitative features from radiological imaging to characterize diseases, have been shown to predict molecular classification, cancer recurrence risk, and many other disease outcomes. However, the ability of radiomics methods to predict the abundance of various cell types in the TME remains unclear. In this study, we employed a radio-genomics approach and machine learning models to predict the inf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of African swine fever virus (ASFV) is characterized by a single linear double-stranded DNA molecule. However, the question of whether ASFV genomic DNA enters the nucleus has been a subject of debate. In this study, DNAscope in situ hybridization (ISH) technology was employed to trace the genomic DNA of ASFV. Specific probes targeting the DNA of the ASFV HLJ/18 strain were designed and synthesized, facilitating the successful detection of ASFV DNA in ASFV-infected porcine alveolar macrophages (PAMs). Detection of ASFV genomic DNA commenced as early as 2 h post-infection (hpi), with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Synchronous occurrence of choroidal melanoma and clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is exceptionally rare and traditionally suspicious for BAP1 tumor predisposition syndrome. Distinguishing synchronous primaries from metastasis poses diagnostic challenges.
CASE PRESENTATION: A 64-year-old Chinese male with a 2-year history of progressive vision loss in his right eye was found to have an intraocular melanocytic tumor by multimodal imaging. Staging PET/CT incidentally detected a hypermetabolic mass in the right kidney. Guided by imaging and multidisciplinary team (MDT) discussi
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular function depends on the spatial organization of cells and biomolecules within the tissue microenvironment. Advances in spatial omics have enabled profiling of molecular features such as transcriptome, proteome and epigenome, and there has been rapid progress of imaging-based approaches to study spatial three-dimensional (3D) genome organization. Here we present Spatial-ATAC-Hi-C, a microfluidic‑based platform for genome-wide, spatially resolved joint-profiling of 3D genome organization and chromatin accessibility on tissue slides. Applied to mouse and human brains, Spatial-ATAC-Hi-C r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease (ADPKD) is the most prevalent hereditary kidney disorder. While the disease is well-defined, its clinical course is highly variable, making the prediction of individual patient outcomes a significant challenge for clinicians and a source of psychological distress for those affected. Current prognostic tools fall into two primary categories: imaging-based models and genetic scoring systems. However, these unimodal approaches have inherent limitations. Imaging-based metrics often lose prognostic resolution in advanced disease stages as fibrosis begins
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial genomes are continuously being rearranged by mobile genetic elements (MGEs), leading to configurations that may confer novel phenotypic traits such as antibiotic resistance, degradation of compounds, or metabolic features. Standard genomic sequencing provides a snapshot of a genome in one configuration, but this static image does not give insight into the dynamics of genomic evolution and whether MGEs are actively changing a genome. We applied single-strain mobilome sequencing to Escherichia coli K-12 MG1655 under various stress conditions: UV, SDS, nalidixic acid, tetracycline, cetr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The nectin cell adhesion molecule 4 (NECTIN4) has been implicated in tumor progression and immune evasion, yet its role and translational targeted imaging potential in lung cancer remain unclear. Therefore, this study aims to elucidate the significance of NECTIN4 by integrating multi-omics analyses, and to evaluate the diagnostic efficacy of the NECTIN4-targeted PET/CT imaging in lung cancer. METHODS: Transcriptomic and proteomic datasets from The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), Gene Expression Omnibus (GEO) and other bioinformatic tools were used to
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Though representing a major component of eukaryotic biodiversity, many microbial eukaryotes remain poorly studied, including the focus of the present work, testate amoebae of the order Arcellinida (Amoebozoa) and non-model lineages of ciliates (Alveolata). In particular, knowledge of genome structures and changes in genome content over the often-complex life cycles of these lineages remains enigmatic. However, the limited available knowledge suggests that microbial eukaryotes have the potential to challenge our textbook views on eukaryotic genomes and genome evolution. In this study, we develo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Growth performance and carcass traits are economically vital in poultry breeding. In Wenchang chickens, reducing excessive abdominal fat represents a critical breeding objective. However, as a typical carcass trait, abdominal fat thickness has traditionally been measurable only post-slaughter, resulting in inefficient and costly selection processes that hinder genetic progress for these traits. To overcome this limitation, we developed an integrated approach combining non-invasive ultrasound phenotyping and multi-model genomic selection to evaluate growth and fat-related traits in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: We present Pancreas Genome Phenome Atlas (PGPA) as a resource for the mining and analysis of pancreatic -omics datasets, and demonstrate the biological interpretations possible due to this dynamic analytics hub accommodating an extensive range of publicly available datasets.
METHODS: Clinical and molecular datasets from four primary sources are included (The Cancer Genome Atlas, International Cancer Genome Consortium, Cancer Cell Line Encyclopaedia, Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange), which form the foundation of -omics profiling of pancreatic malignancies and relat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioluminescent images of viral replication in live animals (in vivo) reveal disease dynamics and effects of medical countermeasures over time. After selecting an appropriate orthopoxvirus animal model for the study, a recombinant virus with the firefly luciferase gene inserted in the genome is used to infect the animals. On the day of bioluminescent imaging, the substrate, D-luciferin, is prepared; animals are sedated and injected with the substrate and IVIS imager is utilized; various bioluminescent images are acquired; then animals recover and are able to continue in the study. Ex vivo imagi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Frontotemporal dementia (FTD) is a neurodegenerative disorder characterized by focal neuronal loss in the frontal and temporal cortices. Although microtubule-associated protein tau, granulin, and C9orf72 mutations are common in behavioral variant FTD (bvFTD), there are also less common variants. This case highlights a 48-year-old man with a diagnosis of bvFTD with valosin-containing protein (VCP) mutation based on comprehensive clinical, genetic, and neuroimaging findings.
METHODS: The patient underwent neurological, psychiatric, and neuropsychological assessments, along with magn
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scoliosis is the most common developmental spinal deformity, but its genetic underpinnings remain only partially understood. To identify scoliosis-related loci, we utilized dual energy X-ray absorptiometry (DXA) scans from 57,588 individuals in the UK Biobank (UKB), and quantified spinal curvature using deep learning-based vertebral segmentation and landmarking to measure cumulative horizontal displacement. On a subset of 150 individuals, our automated image-derived curvature measurements showed a correlation of 0.83 with clinical Cobb angle assessments, supporting their validity as a proxy fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.