UNLABELLED: KRAS mutations, present in about 40% of colorectal cancers, are strongly associated with an immunosuppressive tumor microenvironment characterized by restricted immune infiltration and poor responses to immunotherapy. In this study, we found that KRAS mutations remodel the N6-methyladenosine (m6A) epitranscriptome to promote immune evasion. Methylated RNA immunoprecipitation sequencing revealed that KRAS-mutant cells exhibit increased m6A deposition on CD73 mRNA, enhancing its stability through IGF2BP3. TEAD4-dependent recruitment of the METTL3 methyltransferase complex induced the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin, the largest human organ, demonstrates remarkable regenerative capacity through spatiotemporally coordinated healing processes. Chronic wounds, including diabetic ulcers and burn injuries pose significant clinical challenges due to persistent inflammation, impaired angiogenesis, defective appendage regeneration, and pathological scarring. Emerging evidence reveals N6-methyladenosine (m6A) methylation - the most prevalent RNA modification - as a critical regulator of wound healing and tissue remodeling. The m6A machinery (writers, readers, erasers) dynamically controls RNA stability, trans
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA modification is an essential component of the epitranscriptome, regulating RNA metabolism and cellular functions. Several types of RNA modifications have been identified to date; they include N6-methyladenosine (m6A), N1-methyladenosine (m1A), 5-methylcytosine (m5C), N7-methylguanosine (m7G), N6,2'-O-dimethyladenosine (m6Am), N4-acetylcytidine (ac4C), etc. RNA modifications, mediated by regulators including writers, erasers, and readers, are associated with carcinogenesis, tumor microenvironment, metabolic reprogramming, immunosuppression, immunotherapy, chemotherapy, etc. A novel perspect
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanopore direct RNA sequencing holds promise for advancing our understanding of the epitranscriptome. Recently, Oxford Nanopore Technologies released basecalling models capable of detecting N6-methyladenosine (m6A), inosine (I), pseudouridine (Ψ), and 5-methylcytosine (m5C). However, their performance and cross-reactivity with other modifications remain largely unexplored. Here, we systematically benchmark four available modification-aware basecalling models by evaluating their per-read and per-site predictions across synthetic molecules and biological samples from diverse species. Models perf
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effective therapies for primary sclerosing cholangitis (PSC), a progressive cholestatic liver disease characterized by biliary inflammation and fibrotic damage, remain limited due to an incomplete elucidation of its underlying molecular mechanisms. Although N6-methyladenosine (m6A) RNA methylation has been implicated in hepatic pathophysiology, its role in PSC remains undefined. Here, we demonstrate that hepatocyte-specific deletion of Mettl3, a critical m6A methyltransferase, induces spontaneous PSC-like pathology characterized by ductular reaction and peribiliary fibrosis. Therapeutic restor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-Methylcytosine modification (m5C) is an important posttranscriptional regulatory mechanism of gene expression. Exhausted CD8+T cells contribute to the development of many major diseases; however, their exact role and relationship to m5C in systemic lupus erythematosus (SLE) remain unknown. In this study, we identified a CD7highCD74high CD8+T subgroup that were robustly expanded in SLE patients through single-cell transcriptome sequencing (scRNA-seq). CD7highCD74high CD8+T cells displayed exhausted features and exhibited a superior diagnostic value in SLE. Then, we explored the m5C landscape
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine leiomyosarcoma (uLMS) is the most common subtype of uterine sarcomas. They have a poor prognosis with high rates of recurrence and metastasis. The five-year survival for uLMS patients is between 25 and 76%, with survival rates approaching 10-15% for patients with metastatic disease at the initial diagnosis. Accumulating evidence suggests that several biological pathways are involved in uLMS pathogenesis. Notably, drugs that block abnormal functions of these pathways remarkably improve survival in uLMS patients. However, due to chemotherapy resistance, there remains a need for novel dru
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic reprogramming is a hallmark of cancer that facilitates changes in many adaptive biological processes. Mutations in the tricarboxylic acid cycle enzyme fumarate hydratase (FH) lead to fumarate accumulation and cause hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC). HLRCC is a rare, inherited disease characterized by the development of non-cancerous smooth muscle tumors of the uterus and skin, and an increased risk of an aggressive form of kidney cancer. Fumarate has been shown to inhibit 2-oxoglutarate-dependent dioxygenases (2OGDDs) involved in the hydroxylation of HIF1α, as w
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenine (m6A) is the most abundant RNA modification in mammalian messenger RNAs (mRNAs), which participates in and regulates many important biological activities, such as tissue development and stem cell differentiation. Due to an improved understanding of m6A, researchers have discovered that the biological function of m6A can be linked to many stages of mRNA metabolism and that m6A can regulate a variety of complex biological processes. In addition to its location on mammalian mRNAs, m6A has been identified on viral transcripts. m6A also plays important roles in the life cycle of ma
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: The implementation of targeted therapies for acute myeloid leukemia (AML) has been challenging. Fat mass and obesity associated protein (FTO), an mRNA N6-methyladenosine (m6A) demethylase, functions as an oncogene that promotes leukemic oncogene-mediated cell transformation and leukemogenesis. Here, we investigated the role of Saikosaponin-d (SsD) in broad anti-proliferation effects in AML and evaluated the m6A demethylation activity by targeting FTO of SsD. Methods: It was examined whether and how SsD regulates FTO/m6A signaling in AML. The pharmacologic activities and mechanisms of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A), a novel epitranscriptomic RNA modification, plays crucial roles in a variety of biological processes and diseases. Recently, there are growing evidence supporting that m6A methylation is essential for bone development and homeostasis through the regulation of key genes by regulating RNA stability, localization, turnover and translation efficiency. In this review, we summarized our current understanding of the functional roles of m6A methylation and its related regulators in bone development and bone remodeling. These findings will offer new directions and insights on
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epitranscriptomic systems enable post-transcriptional modifications of cellular RNA that are essential for regulating gene expression. Of the ~ 170 known RNA chemical modifications, methylation is among the most common. Loss of function mutations in NSUN3, encoding the 5-methylcytosine (m5C) methyltransferase NSun3, have been linked to multisystem mitochondrial disease associated with combined oxidative phosphorylation deficiency. Here, we report a patient with early-onset mitochondrial encephalomyopathy and seizures in whom the novel biallelic NSUN3 missense variants c.421G>C (p.A141P) and c.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N7-methylguanosine (m7G), a prevalent modification in transfer RNAs (tRNAs), is primarily catalyzed by the methyltransferase METTL1. Although growing evidence supports a role for METTL1 in various tumors, its therapeutic potential and precise function in leukemia stem cell (LSC) homeostasis remain largely unexplored. Here, we identify METTL1 as a key regulator of LSC self-renewal and homing within bone marrow (BM) microenvironment through catalyzing m7G formation on a specific tRNA, tRNAPheGAA, thereby promoting leukemogenesis. Mechanistically, METTL1 loss significantly reduces m7G abundance a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N 6-methyladenosine (m6A) is a prevalent internal modification of eukaryotic mRNA that influences transcript fate, including mRNA stability and cell-type-specific gene expression. However, the mechanisms underlying m6A-mediated regulation remain poorly understood in many systems, including the highly regenerative planarian Schmidtea mediterranea. To address this, we generated a high-confidence atlas of ∼72 200 m6A sites across the planarian transcriptome using multiplexed direct RNA sequencing. The m6A sites follow a DRAYW consensus motif and are highly enriched near stop codons while being la
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) is a critical epigenetic modification that regulates lipid metabolism; however, its role in adipogenesis in chickens remains unclear. Here, we demonstrated that the m6A methylase METTL3 shows significant differences at the key stage of chicken development, and its expression in the breast muscle is significantly higher than in other tissues. Furthermore, METTL3 expression gradually decreases during the differentiation of both intramuscular preadipocytes (IMPA) and abdominal preadipocytes (APA). Gain- and loss-of-function assays demonstrated that METTL3 overexpression s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-Methylcytosine (m5C) RNA modification contributes to tumor initiation and progression. However, its transcriptome-wide distribution patterns and biological implications in hepatitis B virus (HBV)-negative hepatocellular carcinoma (HCC) remain poorly understood. Therefore, this study employs long-read Nanopore direct RNA sequencing to systematically elucidate the mechanisms of m5C-mediated epigenetic reprogramming in HBV-negative HCC. Paired tumor and adjacent normal tissues from three HBV-negative HCC patients were collected for Nanopore sequencing. Transcriptome-wide m5C sites were profiled
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput sequencing with chemical labeling enables robust, transcriptome-wide detection of RNA modifications at single-nucleotide resolution. However, these methods typically require substantial RNA amounts due to harsh treatments. We introduce Uli-epic, an innovative library construction strategy that enables profiling epitranscriptomic modifications using 100 pg to 1 ng of RNA. Utilizing Uli-epic BID-seq, we investigate pseudouridine (Ψ) sites in neural stem cells and sperm RNA from wild-type and fetal growth restriction mice, using only 500 pg of rRNA-depleted RNA. Uli-epic GLORI qua
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 polymerase, commonly known as HIV reverse transcriptase (RT), catalyzes the critical reaction of reverse transcription by synthesizing a double-stranded DNA copy of the viral genomic RNA. During the replication cycle, this synthesized DNA is integrated into the host genome. This entire process is essential for viral replication and is targeted by several antiviral drugs. Numerous studies in biochemistry and structural biology have led to a good understanding of HIV-1 RT functions. However, the discovery of epitranscriptomic marks, such as 2'-O-methylations, on the HIV-1 RNA genome raise
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Hepatic fibrosis remains a major global health burden, often progressing to cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Despite extensive research, no effective antifibrotic drugs are clinically approved due to the complexity of hepatic stellate cells (HSCs) activation and metabolic remodeling. Enhanced glycolysis is increasingly recognized as a metabolic hallmark sustaining the profibrotic phenotype of HSCs, representing a key but underexplored therapeutic target. This study explored the antifibrotic effect of 6-gingerol, the principal bioactive compound of Zingiber officinale, and rev
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A), the dominant internal RNA modification in eukaryotic mRNA, plays an important regulatory role in female reproductive physiology and associated pathologies. This review systematically outlines the precise regulatory mechanisms exerted by m6A writers, erasers, and readers in core processes including germ cell development, early embryogenesis, and hormone signaling. We further elaborate on how aberrant m6A modifications contribute to the pathogenesis of various female reproductive disorders, such as gynecological cancer, polycystic ovary syndrome, and preeclampsia. In ad
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.