The Ku antigen consists of 70 and 80 kDa protein subunits (p70 and p80, respectively) that form the DNA binding component of a DNA-dependent protein kinase (DNA-PK). It is controversial whether the interaction of Ku with DNA is mediated by p70 alone or requires formation of p70/p80 dimers. In the present studies, the DNA binding properties of p70/p80 heterodimers and full-length human p70 expressed in the absence of p80 were investigated. The binding of free p70 and p70/p80 heterodimers to DNA showed similar sensitivity to high ionic strength buffers. Competitive DNA binding studies revealed t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus spp. include human pathogens such as Bacillus anthracis, the causative agent of anthrax and a biothreat agent. Bacillus spp. form spores that are physically highly resistant and may remain active over sample handling. We tested four commercial DNA extraction kits (QIAamp DNA Mini Kit, RTP Pathogen Kit, ZR Fungal/Bacterial DNA MiniPrep, and genesig Easy DNA/RNA Extraction kit) for sample inactivation and DNA recovery from two powders (icing sugar and potato flour) spiked with Bacillus thuringiensis spores. The DNA was analysed using a B. thuringiensis-specific real-time PCR assay. The
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pyrrolobenzodiazepines (PBDs) represent a major class of sequence-selective DNA-alkylating molecules, one example of which, in its dimeric DNA-cross-linking form, is employed as the payload in the anticancer Antibody Drug Conjugate (ADC) loncastuximab tesirine-lpyl. To date, PBD analogues have been produced with substituents at every position of the tricyclic skeleton except the C1-position. We report here the first synthesis of a C1-subsitituted PBD monomer and dimer, both of which possess DNA-binding activity and cytotoxicity in a cancer cell line.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transformation of normal cells by DNA reactive, genotoxic carcinogens and the growth promotion and development of mutated cells by enhancing factors is involved in the overall basic mechanism of cancer induction. Thus, discrimination between genotoxic carcinogens and nongenotoxic chemicals is essential. The dose-response curves, reversibility, and organ-and species specificity are distinct. Genotoxic carcinogens are mutagenic, form DNA adducts, induce DNA repair, and form hydroxy radicals and inappropriate peroxidation reactions that antioxidants such as those in vegetables, fruits, and te
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endocrine disruptors (EDs) represent a major toxicological and public health issue, and the xenoestrogen bisphenol A (BPA) has received much attention due to its high production volume and widespread human exposure. Also, due to its similarity to diethylstilbestrol, a known human carcinogen, BPA has been investigated for its genotoxic and carcinogenic properties, but the results have been either inconclusive or controversial. Metabolically activated BPA has previously been shown to form DNA adducts both in vitro and in rat liver. The present study was designed (a) to assess the sensitivity thr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: AbstractObjective: To analyze the DNA methylation gene mutations of myeloproliferative neoplasm (MPN), and preliminarily explore its clinical features.
METHODS: Next-generation sequencing technology was used to detect 31 MPN-related genes in 105 cases of MPN patients [40 cases of polycythaemia vera (PV), 65 cases of essential thrombocythemia (ET)], and to analyze the relationship between DNA methylation gene mutations and clinical features.
RESULTS: 15 mutation types were detected in 105 patients (88 mutations in total), and the total mutation detection rate was 87.6% (92/105). A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenotypic plasticity in amphibious plants was considered a key evolutionary strategy for survival in fluctuating environments; however, the epigenetic mechanisms and post-transcriptional regulations governing the transition between aquatic and terrestrial life forms were previously poorly understood. In the present study, the interplay between 5mC DNA methylation and alternative splicing (AS) was investigated in Riccia fluitans, a species exhibiting distinct morphological and transcriptomic adaptations to different habitats. To achieve this, Illumina short-read sequencing was integrated with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thymine analogs with saturated 5-6 bonds are important types of DNA damage that are recognized by the DNA N-glycosylase activity of E. coli endonuclease III. Seeking agents which could preferentially form 5,6-hydrated thymine residues in duplex DNA both in vivo and in vitro, we exposed purified duplex DNA to 325- or 313-nm light; however, after such exposure pyrimidine dimers greatly predominated over 5,6-hydrated thymine. Hydrogen peroxide, on the other hand, formed significant numbers of endonuclease III-sensitive sites in vitro which were not apurinic/apyrimidinic lesions and thus were like
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
mRNA-DNA hybrid origami enables integration of the RNA functionality into programmable DNA nanostructures, yet robust design and assembly rules remain lacking. Here, we systematically define parameters governing the high-yield formation of compact mRNA-DNA hybrid origami. Using mature mRNAs encoding firefly luciferase, enhanced green fluorescent protein (EGFP), and mCherry as scaffolds, we designed five architectures spanning varied sizes, shapes, crossover geometries, and packing densities. We identify asymmetric A-form crossovers, monovalent-cation-rich buffers, and moderate-temperature anne
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we have developed a sensitive cancer cell amplified detection method which combined Au NPs enhanced electrochemiluminescence (ECL) of CdS nanocrystals (NCs) film, with isothermal circular amplification reaction of polymerase. In DNA circular amplification detection system, hairpin DNA beacon/Au NPs composite modified CdS NCs film was used as an ECL emitter. Messenger DNA is hybridized with the aptamer modified on magnetic beads (MBs) to form MB-Au bioconjugates. In the presence of HL-60 cell, the aptamer would conjugate with the glycoprotein at cell surface and messenger DNA sequence woul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The repair of DNA damage by ultraviolet light is defective in the hereditary disease xeroderma pigmentosum. A deoxyribonucleotide excision-proficient form and several excision-deficient forms of xeroderma pigmentosum have been identified. Premature solar skin damage develops in all xeroderma pigmentosum patients. Some patients also have neurological abnormalities caused by premature death of nerve cells. This abnormal aging of the central nervous system and of sun-exposed skin appears to be the result of the abnormal DNA repair processes. Clinical, biological, and physicochemical studies on DN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) genome is greatly dependent on the viral trans-activator protein Tat. Tat functions through the TAR element, which is represented in both viral DNA and RNA. At present, there is no definitive evidence that determines whether Tat acts through a DNA or RNA form of TAR. We have used an intramolecular mutagenesis approach to change selectively the RNA secondary structure of TAR without affecting its primary sequence. We show that a specific RNA secondary structure for TAR is needed for biological activity. Furthermore, transcripts that
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In eukaryotes, mismatch repair begins with MutS homolog (MSH) complexes, which scan newly replicated DNA for mismatches. Upon mismatch detection, MSH complexes recruit the PCNA-stimulated endonuclease Mlh1-Pms1/PMS2 (yeast/human), which nicks the DNA to allow downstream proteins to remove the mismatch. Past work has shown that although Mlh1-Pms1 is an ATPase and this activity is important in vivo, ATP is not required to nick DNA. Our data, using yeast as a model, suggests that Mlh1-Pms1 forms oligomeric complexes that drive DNA conformational rearrangements using the protein's ATPase activity.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) is a type of DNA damage that occurs when adjacent pyrimidine bases in DNA, typically thymine or cytosine, form covalent bonds with each other due to exposure to ultraviolet (UV) radiation. When UV light hits DNA, it can induce the formation of covalent bonds between the C=C double bonds of adjacent pyrimidine bases. In the case of CPD, the most common dimers formed are between two adjacent thymine or cytosine bases. Pyrimidine-Pyrimidone (6-4) photoproducts (64-PPs), and Dewar valence photoisomers are also produced by UV exposure. The formation of these UV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ligands, mostly binding to proteins to form complexes and catalyze chemical reactions, can serve as drug and probe molecules, as well as sensing elements. DNA nanotechnology can integrate the high editability of DNA nanostructures and the biological activity of ligands into functionalized DNA nanostructures in a manner of controlled ligand stoichiometry, type, and arrangement, which provides significant advantages for targeted therapeutics and diagnostics. As therapeutic agents, multiple- and multivalent-ligands functionalized DNA nanostructures increase ligand-receptor affinity and activate m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is a critical risk factor for cancer development with genetic instability presenting as a common hallmark. Alternative DNA-forming sequences are endogenous sources of genetic instability that are enriched at mutation hotspots in cancer genomes. Using a transgenic mutation-reporter mouse model containing an H-DNA-forming sequence from a mutation hotspot in Burkitt lymphoma, we demonstrate tissue-specific effects of aging on DNA structure-induced mutagenesis, with H-DNA mutation frequencies increasing in spleen and liver and decreasing in brain tissues. DNA sequencing revealed a correlatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) induces reproductive disorders in sows and respiratory illnesses in growing pigs and is considered as one of the main pathogenic agents responsible for economic losses in the porcine industry worldwide. Modified live PRRSV vaccines (MLVs) are very effective vaccine types against homologous strains but they present only partial protection against heterologous viral variants. With the goal to induce broad and cross-protective immunity, we generated DNA vaccines encoding B and T antigens derived from a European subtype 1 strain that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular DNA (eDNA) has become a focus in public health, with soil recognized as a key reservoir where eDNA's mobility and stability are primarily controlled by clay minerals and organic matter. Montmorillonite (MMT) often interacts with humic acids (HA), forming MMT-HA complexes, although the molecular mechanisms behind DNA adsorption in these complexes remain unclear. Here, molecular dynamics simulations were used to examine the adsorption, diffusion, interfacial structure, and dynamics of DNA on MMT and MMT-HA complexes, revealing critical molecular interactions. Interaction energy ana
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA alkylating drugs have been used as cancer chemotherapy with variable outcomes. The establishment of predictive biomarkers to identify patients who will effectively respond to treatment would allow for the development of personalized therapies. As the degree of interaction of alkylating drug with DNA plays a key role in their mechanism of action, our hypothesis is that the measurement of the DNA adducts formed by alkylating drugs could be used to inform patient stratification. Beginning with busulfan, we took advantage of our DNA adductomic approach to characterize DNA adducts formed by rea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electron paramagnetic resonance spectroscopy was employed to monitor the dynamics associated with a B-Z transition in both a linear (dG-dC)n and a modified pUC8 plasmid. A spin label consisting of cytidine substituted in position C5 with an 11-atom-tethered 5-membered ring nitroxide (DCAVAP) was incorporated into linear (dG-dC)n with Micrococcus luteus DNA polymerase or into a specific 34-bp Z-DNA-forming region of the 2.7-kb plasmid pRDZ8 with Thermus aquaticus DNA polymerase (Stoffel fragment). Although DCA-VAP is a modified nucleotide, it was an excellent substrate for both enzymes. The Z c
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.