Brucella melitensis is a pathogenic bacterium responsible for brucellosis in mammals and humans. Its outer membrane proteins (Omp) control the diffusion of solutes through the membrane, and they consequently have a crucial role in the design of diagnostics and vaccines. Moreover, such proteins have recently revealed their potential for protein-based biomaterials. In the present contribution, the structure of the B. melitensis porin Omp2a is built using the RaptorX threading method. This is a 16-stranded β-barrel with an α-helix on the third loop folding inside the barrel and forming the constr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the common use of thrombolytic drugs, especially in stroke treatment, there are many conflicting studies on factors affecting fibrinolysis. Because of the complexity of the fibrinolytic system, mathematical models closely tied with experiments can be used to understand relationships within the system. When tPA is introduced at the clot or thrombus edge, lysis proceeds as a front. We developed a multiscale model of fibrinolysis that includes the main chemical reactions: the microscale model represents a single fiber cross-section; the macroscale model represents a three-dimensional fibr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among the different aquaporins (AQPs), human aquaporin-4 (hAQP4) has attracted the greatest interest in recent years as a new promising therapeutic target. Such a membrane protein is, in fact, involved in a multiple sclerosis-like immunopathology called Neuromyelitis Optica (NMO) and in several disorders resulting from imbalanced water homeostasis such as deafness and cerebral edema. The gap of knowledge in its functioning and dynamics at the atomistic level of detail has hindered the development of rational strategies for designing hAQP4 modulators. The application, lately, of molecular model
Историческая статьяСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) was first described in 1947, and became a health emergency problem in 2016 when its association with fetal microcephaly cases was confirmed by Centers for Disease Control and Prevention (CDC) in the United States. To date, ZIKV infection has been documented in 66 countries. ZIKV is recognized as a neurotropic virus and numerous diseases manifested in multiple neurological disorders have been described, mainly in countries that have been exposed to ZIKV after the 2007 outbreak in the Federated States of Micronesia. The most dramatic consequence of ZIKV infection documented is
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac myosin binding protein-C (cMyBP-C) is a multi-domain (C0-C10) protein that regulates heart muscle contraction through interaction with myosin, actin and other sarcomeric proteins. Several mutations of this protein cause familial hypertrophic cardiomyopathy (HCM). Domain C1 of cMyBP-C plays a central role in protein interactions with actin and myosin. Here, we studied structure-function relationship of three disease causing mutations, Arg177His, Ala216Thr and Glu258Lys of the domain C1 using computational biology techniques with its available X-ray crystal structure. The results suggest
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a common neurodegenerative disorder that is characterized by the degeneration of dopaminergic neurons in the substantia nigra and dopamine depletion in the striatum. Although the motor symptoms are still regarded as the main problem, non-motor symptoms in PD also markedly impair the quality of life. Several non-motor symptoms, such as sleep disturbances and depression, are suggested to be implicated in the alteration in circadian clock function. In this study, we investigated circadian disruption and the mechanism in a 1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (M
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is a serious public health problem in Brazil and worldwide. Although the drugs used to treatment schistosomiasis are effective, the disease continues to expand in all endemic countries due to constant reinfection, poor sanitation, and the lack of effective programs for disease control. However, advances generated through genome projects have provided important information that has improved the understanding of the biology of this parasite. These advances, associated with the advent of bioinformatic analysis, are becoming an important tool in reverse vaccinology. Through databas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is necessary to eliminate linoleic acid and allergenic arachins from peanuts for good health reasons. Virginia-type peanuts, harvested from plots treated with mineral salts combinations that mimic the subunit compositions of glutamate dehydrogenase (GDH) were analyzed for fatty acid and arachin compositions by HPLC and polyacrylamide gel electrophoresis, respectively. Fatty acid desaturase and arachin encoding mRNAs were analyzed by Northern hybridization using the homologous RNAs synthesized by peanut GDH as probes. There were 70-80 % sequence similarities between the GDH-synthesized RNAs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constitutive STAT signaling provides growth promoting signals in many forms of malignancy. We performed molecular modeling and molecular dynamics studies of the interaction between the regulatory Src homology 2 (SH2) domains of STAT3 and 6 with phosphorylated peptides of the herpesviral oncoprotein Tip, which facilitates Src kinase mediated STAT-activation and T cell proliferation. The studies give insight into the ligand binding specificity of the STAT SH2 domains and provide the first model for the differential activation of STAT3 or STAT6 by two distinct regions of the viral Tip protein. Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virstatin is a small molecule that inhibits Vibrio cholerae virulence regulation, the causative agent for cholera. Here we report the interaction of virstatin with human serum albumin (HSA) using various biophysical methods. The drug binding was monitored using different isomeric forms of HSA (N form ∼pH 7.2, B form ∼pH 9.0 and F form ∼pH 3.5) by absorption and fluorescence spectroscopy. There is a considerable quenching of the intrinsic fluorescence of HSA on binding the drug. The distance (r) between donor (Trp214 in HSA) and acceptor (virstatin), obtained from Forster-type fluorescence reso
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tetracycline (TC) and chlortetracycline (CTC) are common members of the widely used veterinary drug tetracyclines, the residue of which in the environment can enter human body, being potentially harmful. In this study, we establish a new strategy to probe the binding modes of TC and CTC with trypsin based on spectroscopic and computational modeling methods. Both TC and CTC can interact with trypsin with one binding site to form trypsin-TC (CTC) complex, mainly through van der Waals' interactions and hydrogen bonds with the affinity order: TC>CTC. The bound TC (CTC) can result in inhibition of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oryzias melastigma, also called O. dancena, is becoming a very useful model for estuarine and marine ecotoxicity studies. With O. melastigma being adopted by ILSI Health and Environmental Science Institute (HESI) for embryo toxicity testing, improved knowledge of biomarker based embryonic development becomes especially important for mechanism-based toxicity evaluations. Using whole mount in situ hybridization and immunostaining techniques together with widely used molecular markers, this study describes the molecular development of marine medaka embryos, focusing on the brain, eye, heart, pect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cell lines are invaluable model systems for the investigation of cancer. Knowledge of the molecular alterations that exist within cell models is required to define the mechanisms governing cellular phenotypes.
METHODS: Five tongue squamous cell carcinomas cell lines and 1 submaxillary salivary gland epidermoid carcinoma cell line were analyzed for copy number and mRNA expression by tiling-path DNA microarrays and Agilent Whole Human Genome Oligoarrays, respectively.
RESULTS: Integrative analysis of genetic and expression alterations revealed the molecular landscape of each cell l
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A chelator is a molecule which binds a metal or metalloid ion by two or more functional groups to form a stable ring complex known as a chelate. Despite the widespread clinical use of so-called chelation therapy to remove mercury, none of the drugs currently in use have been shown to chelate mercury. Mercury can adopt three common coordination environments: linear diagonal, trigonal planar, and tetrahedral. We have previously discussed some of the structural criteria for optimal binding of mercury in linear-diagonal coordination with thiolate donors (George et al. in Chem. Res. Toxicol. 17:999
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The in-vitro contracture test is the standard test to diagnose malignant hyperthermia (MH) susceptibility. Maximum sensitivity is important for patient safety. For scientific purposes, the reduced specificity of contracture testing is a major drawback, and precise phenotyping is of utmost importance. Our study aimed to improve phenotyping for MH susceptibility to more accurately select patients for molecular genetic research in MH, thus, improving the probability to detect novel MH associated variants.
METHODS: Patients who underwent contracture and molecular genetic testing were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Right ventricular (RV) dysfunction is a common long-term complication in patients after the repair of congenital heart disease. Previous investigators have examined the cellular and molecular mechanisms of left ventricular (LV) remodeling, but little is known about the stressed RV. Our purpose was to provide a detailed physiological characterization of a model of RV hypertrophy and failure, including RV-LV interaction, and to compare gene alterations between afterloaded RV versus LV. Pulmonary artery constriction was performed in 86 mice. Mice with mild and moderate pulmonary stenosis (PS) dev
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The electrostatic continuum solvent model developed by [Fattebert and Gygi J. Comput. Chem. 23, 662 (2002); Int. J. Quantum Chem. 93, 139 (2003)] is combined with a first-principles formulation of the cavitation energy based on a natural quantum-mechanical definition for the surface of a solute. Despite its simplicity, the cavitation contribution calculated by this approach is found to be in remarkable agreement with that obtained by more complex algorithms relying on a large set of parameters. Our model allows for very efficient Car-Parrinello simulations of finite or extended systems in solu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic diseases, caused by protozoa, helminths and arthropods, rank among the most important problems in human and veterinary medicine, and in agriculture, leading to debilitating sicknesses and loss of life. In the absence of vaccines and with the general failure of vector eradication programs, drugs are the main line of defence, but the newest drugs are being tracked by the emergence of resistance in parasites, sharing ominous parallels with multidrug resistance in bacterial pathogens. Any of a number of mechanisms will elicit a drug resistance phenotype in parasites, including: active ef
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report Monte Carlo simulation results for freezing of Lennard-Jones carbon tetrachloride confined within model multiwalled carbon nanotubes of different diameters. The structure and thermodynamic stability of the confined phases, as well as the transition temperatures, were determined from parallel tempering grand canonical Monte Carlo simulations and free-energy calculations. The simulations show that the adsorbate forms concentric molecular layers that solidify into defective quasi-two-dimensional hexagonal crystals. Freezing in such concentric layers occurs via intermediate phases that s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.