We report a case of endocarditis in a human infected with Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii, which causes bacteremia and endocarditis in dogs. Bacterial identification was established by PCR amplification and sequencing of an intergenic spacer region (ITS1), 16S ribosomal DNA, and a gene encoding citrate synthase (gltA). Bartonella antibodies were detected by immunofluorescence.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence structure of complete internal transcribed spacer 1 and 2 (ITS1 and ITS2) of the ribosomal DNA region and partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (cox1) gene sequences were studied in the monozoic tapeworm Atractolytocestus sagittatus (Kulakovskaya et Akhmerov, 1965) (Cestoda: Caryophyllidea), a parasite of common carp (Cyprinus carpio carpio L.). Intraindividual sequence diversity was observed in both ribosomal spacers. In ITS1, a total number of 19 recombinant clones yielded eight different sequence types (pairwise sequence identity, 99.7-100%) which, however, did not r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A sensitive rolling-circle amplification (RCA)-based method utilizing species-specific padlock probes targeted to the internal transcribed spacer 2 region of the fungal ribosomal DNA gene complex was developed. The assay was rapid (2 hours) and specific. Of 28 fungal isolates (16 of Candida, six of Aspergillus, and six of Scedosporium spp.), all were all identified correctly.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ribosomal RNA (rRNA) gene units of Schistosoma mansoni (lateral spined eggs) and six species of schistosomes with terminal spined eggs (S. haematobium, S. curassoni, S. bovis, S. intercalatum, S. margrebowiei and S. mattheei) have been studied. The schistosome rRNA gene unit consists of a regular interspersion of the two genes encoding the large and small rRNA units with two spacers. The large spacer is not transcribed while the small spacer is part of the transcription unit. Variation in the rRNA gene unit of the species studied is demonstrated and takes three forms: First, variation in D
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pattern of sequence variation in the mitochondrial DNA cytochrome b gene (cyt-b) and ribosomal DNA internal transcribed spacer 2 (ITS2) was examined in Anopheles funestus from Senegal and Burkina Faso in West Africa and Kenya in East Africa. From both West African countries, samples included individuals hypothesized to represent reproductively isolated taxa based upon different karyotypes and behaviours. Analysis of the cyt-b data revealed high haplotypic diversity (86%) and an average pairwise difference per site of 0.42%. Sequence variation was not partitioned by geographical origin or k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomal RNAs (rRNAs), essential components of ribosomes involved in protein synthesis, are encoded by ribosomal DNAs (rDNAs), which are typically organized as tandem repeats within rDNA clusters. The internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA, characterized by low intraspecific but high interspecific divergence, has been a focus of phylogenetic and diagnostic studies. However, comprehensive analysis of rDNA clusters remains challenging due to their repetitive nature and polymorphisms. In apicomplexan genomes, rDNA structure and function remain poorly explored. Here, we developed a pipe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have developed a single PCR test for the simple and unequivocal differentiation of all currently recognised genotypes of Trichilnella. Partial DNA sequence data were generated from internal transcribed spacers ITS1 and ITS2, and from the expansion segment V region of the ribosomal DNA repeat from five species of Trichinella and two additional genotypes, designated T5 and T6. Five different PCR primer sets were identified which, when used simultaneously in a multiplex PCR, produce a unique electrophoretic DNA banding pattern for each species and genotype including three distinct genotypes of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic manipulation in African trypanosomes typically relies upon electroporation with chromosomal integration of DNA constructs by homologous recombination. Relatively little is known about chromosomal recombination and repair in these organisms however and low transformation efficiency and position effects can limit forward genetic approaches. In yeast and mammalian cells, site-specific DNA double-strand breaks (DSBs) stimulate targeted integration through homologous recombination-based repair where the exogenous DNA serves as the template. We have explored the effect of DSBs on targeted in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a case of scleral keratitis caused by Phomopsis phoenicicola. Pterygium surgery was a predisposing factor, and the patient was treated with natamycin and fluconazole eye drops and oral fluconazole. The fungus was identified by sequencing of the internal transcribed spacer (ITS) region of the fungal ribosomal DNA (rDNA) locus and confirmed on the basis of its typical pycnidia and conidia.
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a case of eumycetoma due to Cladophialophora bantiana in a 3-year-old male Siberian Husky living in France. The dog presented a tumefaction on the thorax and deformity of the second and third subjacent ribs, which were surgically removed. Macroscopic black granules were visible on the ribs, and direct microscopic examination revealed their fungal origin. Cultures yielded pure colonies of C. bantiana. The identification of the causative agent was confirmed after amplification and sequence analysis of fungal internal transcribed spacers 1 and 2 and 5.8S ribosomal DNA regions. Surgery a
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sequences of the nuclear ribosomal DNA region spanning the first internal transcribed spacer, the 5.8S rRNA gene and the second internal transcribed spacer were determined for Ascaris samples from pigs and humans from different geographical regions. The sequences of the 5.8S gene and the second internal transcribed spacer were the same for all samples examined, whereas all Ascaris samples from humans had six (1.3%) nucleotide differences in the first internal transcribed spacer compared with those from pigs. These differences provided some support for the existence of separate species of A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel xerophilic fungus, Wallemia orionensis sp. nov., was isolated from air samples collected in a cake production environment and is described here based on a polyphasic approach, including molecular phylogenetics, morphology, and physiological traits. Phylogenetic analyses using concatenated ITS and SSU rDNA sequences revealed that the three strains form a distinct and well-supported clade within the genus Wallemia, clearly separated from all currently recognized species. Colonies of W. orionensis exhibit slow to moderate growth on media supplemented with high concentrations of glucose or
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nuclear ITS1-5.8S rDNA-ITS2 region is among the most widely used markers for phylogenetic studies in plants. We sequenced the ITS1-5.8S rDNA-ITS2 region in several species of Selenicereus, two species of Deamia and Epiphyllum chrysocardium. The newly generated sequences were found to be more closely related to ITS and 5.8S rDNA sequences from representatives of other cactus tribes than to the Selenicereus ITS sequences previously deposited in GenBank by research group O. Plume. Importantly, all these sequences retained three conserved motifs of the 5.8S rRNA gene that are commonly used to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Locus-specific Illumina NGS was used to analyze the polymorphism of the partial 18S rDNA, spacer ITS1, and partial 5.8S rDNA sequences across 25 cactus species (53 accessions) of the subtribes Hylocereinae and Echinocereinae. To ensure data reliability, only ribotypes (zero-radius operational taxonomic units, ZOTUs) with a minimum read depth of 10 reads within each genome-read pool were retained. A single ribotype was identified in 18 analyzed genomes. In 23 accessions, two or three ribotypes were detected, typically consisting of a major ribotype (98-99%) and one or two minor ribotypes. In th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic heterogeneity has been observed among isolates of human-derived Pneumocystis carinii (P. carinii sp. f. hominis). DNA sequence analysis has been shown to be informative in distinguishing between isolates of P. carinii sp. f. hominis. Single base polymorphisms have been observed in the genes encoding the mitochondrial large subunit ribosomal RNA, the mitochondrial small subunit ribosomal RNA and the AROM protein. The highest level of genetic variation has been found at the internal transcribed spacer (ITS) regions of the nuclear ribosomal RNA operon. Typing of isolates of P. carinii sp.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The first human case with trichinellosis was reported in 1964 in Tibet, China. However, up to the present, the etiological agent of trichinellosis has been unclear. The aim of this study was to identify a Tibet Trichinella isolate at a species level by PCR-based methods. Multiplex PCR revealed amplicon of the expected size (173 bp) for Trichinella spiralis in assays containing larval DNA from Tibet Trichinella isolate from a naturally infected pig. The Tibet Trichinella isolate was also identified by PCR amplification of the 5S ribosomal DNA intergenic spacer region (5S ISR) and mitochondrial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flukes were found in the bile ducts of domestic ducks (Anas platyrhynchos), necropsied in the Binh Dinh province of Central Vietnam. Following staining, morphological characteristics of the bird flukes were compatible with Opisthorchis viverrini, although some characteristics differed from those described in specimens collected from mammal hosts. Computation of the phylogenetic trees on the partial sequences of the second internal ribosomal spacer (ITS2) of the ribosomal DNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) markers of the mitochondrial DNA showed close similarity of the 'bird' Opisthor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study was performed on a male European bison (Bison bonasus bonasus L.) foetus spontaneously aborted at the fourth or fifth month of pregnancy in the Białowieża Forest. Serum samples from the foetus and mother revealed the presence of antibodies against T. gondii (S/P% = 88% and 75%, respectively). Mobile extracellular tachyzoites were first observed in a Vero cell culture, 110 days following inoculation of brain homogenate. PCR amplification with TGR1E1 and TGR1E2 primers confirmed the presence of T. gondii DNA, which was classified as Type I by PCR-RFLP genotyping. The sequences of 18S r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soil samples were collected in 2006 from Dinosaur National Monument (DNM), Utah, the site of an outbreak of coccidioidomycosis in 2001. DNA was isolated from two soil samples, and polymerase chain reaction (PCR) amplified Coccidioides DNA present in both samples. Ribosomal RNA genes and internal transcribed spacer (ITS) region PCR products were sequenced. Single-nucleotide polymorphisms indicated that the DNA from sample SS06RH was that of Coccidioides immitis, while the DNA from sample SS06UM was C. posadasii. This is the first report to directly demonstrate Coccidioides in soils from DNM and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Six cases of tinea of the scrotum with atypical clinical features were observed in the dermatology department of our hospital between 2001 and 2007. The age of onset ranged from 14 to 26 years. Unusual clinical presentations of pseudomembranous-like disease were observed in every patient. Causative agents were Microsporum gypseum in five patients and Trichophyton rubrum in one patient. Three of the M. gypseum isolates had atypical morphologies. All six isolates were identified by cultural morphologies and DNA sequence analysis of the internal transcribed spacer region of the ribosomal DNA.
Клинический случайПисьмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.