Hydrogen is dissociatively adsorbed on the gold particles in Au/Al(2)O(3) catalysts, as demonstrated by a combination of in-situ X-ray absorption spectroscopy, chemisorption, and H/D exchange experiments. This chemisorption of hydrogen induces changes in the Au L(3) and L(2) X-ray absorption near-edge structures. The gold atoms on corner and edge positions dissociate the hydrogen, which does not spill over to the face sites. Therefore, the average number of adsorbed hydrogen atoms per surface gold atom increases with decreasing particle size. With temperature, the hydrogen uptake by supported
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) is a powerful technique for analyzing the conformational dynamics of proteins. Using liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS), the method achieves high sensitivity and the option to measure the HDX either of the intact protein (global analysis) or of small peptide segments of the protein (local analysis) after online pepsin proteolysis. However, HDX-MS is currently limited by the significant cost of the specialized refrigerated UPLC-based chromatographic equipment needed and by the loss of deuterium label from the analyze
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glutathione S:-transferase (GST) from Schistosoma japonicum has been prepared in both normal protiated (pGST) and fully deuteriated (dGST) form by recombinant DNA technology. Electrospray mass spectrometry showed that the level of deuteriation in dGST was 96% and was homogeneous across the sample. This result is attributed to the use of a deuterium-tolerant host Escherichia coli strain in the preparation of the protein. 10 heteroatom-bound deuteriums (in addition to the carbon-bound deuteriums) were resistant to exchange when dGST was incubated in protiated buffer. The physicochemical and biol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A method is described for the determination of unconjugated terbutaline in plasma. The assay is based on gas chromatography chemical ionization mass spectrometry with ammonia as the reagent gas. Terbutaline and a deuterium labelled internal standard were isolated from plasma by ion exchange chromatography followed by extraction into t-butanol. Quantitation was performed by selected ion monitoring of the [MH]+ions m/z 442 and m/z 448 of the tri-O-TMS derivatives of terbutaline and the internal standard, respectively. Silylation was carried out in the presence of pyridine at room temperature and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria adhesin A (NadA) is one of the antigens of Bexsero, the recently licensed multicomponent vaccine against serogroup B Neisseria meningitidis (MenB). NadA belongs to the class of oligomeric coiled-coil adhesins and is able to mediate adhesion and invasion of human epithelial cells. As a vaccine antigen, NadA has been shown to induce high levels of bactericidal antibodies; however, the domains important for protective response are still unknown. In order to further investigate its immunogenic properties, we have characterized the murine IgG1 mAb (6E3) that was able to recognize the 2 ma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heme oxygenase (HO) catalyzes the O2 and NADPH/cytochrome P450 reductase-dependent conversion of heme to biliverdin, free iron ion, and CO through a process in which the heme participates as both dioxygen-activating prosthetic group and substrate. We earlier confirmed that the first step of HO catalysis is a monooxygenation in which the addition of one electron and two protons to the HO oxy-ferroheme produces ferric-alpha-meso-hydroxyheme (h). Cryoreduction/EPR and ENDOR measurements further showed that hydroperoxo-ferri-HO converts directly to h in a single kinetic step without formation of a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report documents the feasibility and advantages of integrating hydrogen/deuterium exchange (HDX) methodology with cyanylation (CN)-based methodology to determine the conformation of cystinyl proteins and intermediates during refolding. The CN-based methodology can be used to trap, identify, and preserve the disulfide structure of a given cystinyl protein folding intermediate, while the HDX methodology can be used to assess other conformational features of the intermediate. Specifically, in this study, CN-based methodology was used to trap a 1-disulfide bond and a 2-disulfide intermediate
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid : the international journal of experimental and clinical investigation : the official journal of the International Society of Amyloidosis2016eng
OBJECTIVES: The detailed structure of brain-derived Aβ amyloid fibrils is unknown. To approach this issue, we investigate the molecular architecture of Aβ(1-40) fibrils grown in either human cerebrospinal fluid solution, in chemically simple phosphate buffer in vitro or extracted from a cell culture model of Aβ amyloid plaque formation.
METHODS: We have used hydrogen-deuterium exchange (HX) combined with nuclear magnetic resonance, transmission electron microscopy, seeding experiments both in vitro and in cell culture as well as several other spectroscopic measurements to compare the morpholo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The methyltriphenylphosphonium methylcarbonate salt [Ph3 PCH3 ][CH3 OCO2 ], obtained directly by quaternarization of triphenylphosphine with dimethylcarbonate, is a latent ylide that promotes Wittig vinylation of aldehydes and ketones. Alkenes are obtained simply by mixing [Ph3 PCH3 ][CH3 OCO2 ] and the carbonyl and heating in a solvent (no base, no halides, and no inorganic byproducts). Deuterium exchange experiments and the particularly short anion-cation distance measured by XRD in [Ph3 PCH3 ][CH3 OCO2 ] allowed to explain the nature and reactivity of this species. Green chemistry metrics (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Buffers are commonly selected for their compatibility with biochemical measurements or their specific capabilities, yet buffer interactions with proteins and the surrounding water can actively reshape protein activity, structure, and dynamics. Here, we compare the influences of three widely used electrospray ionization (ESI) buffers on the dynamics and stability of wild-type transthyretin (wtTTR) and TTR mutants (V30M, L55P, T119M, V122I) using native mass spectrometry (nMS). Ammonium acetate (AmAc), ethylenediammonium diacetate (EDDA), and triethylammonium acetate (TEAA) are commonly employed
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of proteins into amyloid fibrils is associated with several neurodegenerative diseases. In Parkinson's disease it is believed that the aggregation of alpha-synuclein (alpha-syn) from monomers by intermediates into amyloid fibrils is the toxic disease-causative mechanism. Here, we studied the structure of alpha-syn in its amyloid state by using various biophysical approaches. Quenched hydrogen/deuterium exchange NMR spectroscopy identified five beta-strands within the fibril core comprising residues 35-96 and solid-state NMR data from amyloid fibrils comprising the fibril core r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The collision induced dissociation (CID) mass spectra were obtained for the X(+)-adducts (X=Na(+) or Li(+)) of five tetracyclines, four pyrimidine and three purine derivatives and their fully D-exchanged species in which the labile hydrogens were replaced by deuterium by either gas phase or liquid phase exchange. The CID spectra were obtained for [M + Na](+) and [M + Li](+) and the exchanged analogs, [M(D) + Na](+) and [M(D) + Li](+), and compositions of product ions and mechanisms of decomposition were determined by comparison of the MS(n) spectra of the undeuterated and deuterated species. M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proton nuclear magnetic resonance (1H NMR) assignments for the murine epidermal growth factor (mEGF) in aqueous solution were determined by using two-dimensional NMR at pH 3.1 and 28 degrees C. The assignments are complete for all backbone hydrogen atoms, with the exception of the N-terminal amino group, and for 46 of the 53 side chains. Among the additional seven amino acid residues, three have complete assignments for all but one side-chain proton, and between two and four protons are missing for the remaining four residues. The sequential assignments by nuclear Overhauser effect spectroscop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The higher atomic mass of deuterium basically affects hydrogen-bonding interactions and solvent association, raising critical alarms about the precision of biomolecular measurements executed in heavy water. Herein, we combine linear infrared (IR) spectroscopy, circular dichroism (CD) spectroscopy, molecular dynamics (MD) simulations, and density functional theory (DFT) calculations to explore how solvent isotopic exchange alters protein structure as well as dynamics. Comparative studies of different protonated (H2O, CH3OH) and deuterated (D2O, CD3OD) solvents expose noticeable differences in h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports methods for reductive microbial deuteration with a high degree of isotopic labelling, focusing on economical approaches using various yeast strains and inexpensive carbon sources. A strategy of α-hydrogen exchange followed by deuterative microbial reduction gave >95% backbone perdeuteration for crucial chiral building blocks for medicinal and analytical applications, without loss of the enantioselectivity demonstrated in the corresponding protiative processes. Under an air atmosphere, Saccharomyces cerevisiae strain MBG5177 outperformed baker's yeast in the synthesis of (2-2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apolipoproteins E3 and E4, proteins with a molecular mass of 34.15 kDa, differ by a single amino acid change. ApoE4 contains an arginine residue at position 112, whereas apoE3 has a cysteine at this position. ApoE4 is the major risk factor for late-onset Alzheimer's disease, whereas apoE3, the common isoform, is neutral with respect to this disease. Here, using literature data from both hydrogen-deuterium exchange and site-directed mutations, we suggest structural differences between these two isoforms that are distant from the site of the arginine-to-cysteine change. These structural differen
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Synuclein (aS) forms toxic intermediates ranging from small oligomers and protofibrils to large amyloid fibrils. Understanding the time course of aS fibril formation and the role played by its regions is critical for therapeutic intervention. Here, we used pulsed hydrogen-deuterium exchange and mass spectrometry (HDX-MS) for the first time to probe kinetic intermediates of the full aS aggregation in vitro, achieving kinetic snapshots containing spatially resolved protein information about critical stages. Monitoring the resultant mass shifts shows distinct binomial abundances for two main ex
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tripartite motif (TRIM) E3 ligases target specific substrates, including viral proteins, for proteasomal degradation, and are thus essential regulators of the innate antiviral response. TRIM69 ubiquitinates the non-structural NS3 protein of Dengue virus for its degradation by the host machinery. This antiviral strategy abrogates the immunosuppression mediated by the NS2B-NS3 protease complex. To understand how this host-driven antiviral response against Dengue virus, we sought to define the mode of interaction between human TRIM69 and Dengue NS2B-NS3 and the subsequent polyubiquitination of th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aminoglycosides are broad-spectrum antibiotics that bind to the 30S ribosomal subunit (30S) of bacteria and disrupt protein translation. NpmA, a structurally well-characterized methyltransferase identified in an E. coli clinical isolate, catalyzes methylation of 30S at A1408 of the 16S rRNA and confers aminoglycoside resistance. Using sucrose cushion centrifugation and isothermal titration calorimetry, we first confirmed the binding between NpmA and 30S. Next, we performed amide Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDXMS) of apo NpmA and in the presence and absence of SAM/SAH. We obs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hainantoxin-III (HNTX-III) purified from the venom of the spider Ornithoctonus hainana is a novel neurotoxin preferentially inhibiting tetrodotoxin-sensitive voltage-gated sodium channels in rat dorsal root ganglion cells. The structure of this toxin in aqueous solution was investigated using 2-D 1H-NMR techniques. The complete sequencespecific assignments of proton resonances in the 1H-NMR spectra were obtained by analyzing a series of 2-D spectra, including DQF-COSY, TOCSY and NOESY spectra, in H2O or D2O. All the backbone protons and more than 95% of the side-chain protons have been assigne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования