The transcriptional regulator MucR from Brucella species controls the expression of many genes, including those involved in virulence, by binding AT-rich DNA regions. MucR and its homologs belong to the Ros/MucR family, whose members occur in α-proteobacteria. MucR is a recent addition to the family of histone-like nucleoid structuring (H-NS) proteins. Indeed, despite the lack of sequence homology, MucR bears many functional similarities with H-NS and H-NS-like proteins, structuring the bacterial genome and acting as global regulators of transcription. Here we present an integrated cryogenic e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid urea hydrolysis in soil triggers substantial ammonia volatilization; it severely limits nitrogen use efficiency and increases greenhouse gas emissions. In this work, we describe a series of surface-engineered organo-montmorillonites that could achieve >80% suppression of urease activity through the hydrophobic interaction with urease. Kinetic analysis revealed a trend indicative of a chain-length-dependent transition from competitive-like inhibition to non-competitive-like inhibition driven by entropy-favored hydrophobic anchoring. Multi-technique characterizations combined with molecula
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prospective use of sludge compost for restoring depleted soils requires balancing its agronomic benefits against potential ecological risks. This study employed an integrated metagenomic and metabolomic approach to evaluate the dose-dependent effects of sludge compost on soil properties, maize growth, and rhizosphere microbial communities. Results showed that moderate compost application (≤15% w/w) enhanced soil nutrient availability, promoted root development, and enriched beneficial microbial taxa (Streptomyces, Mesorhizobium, Flavisolibacter), while upregulating plant stress-response me
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 201 endophytic root nodule-associated bacteria collected from two legumes indigenous to different Qilian Mountain altitudes (Hexi Corridor) were characterized through 16S rDNA polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism, 16S rRNA gene sequence analysis, and enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR clustering. The isolates phylogenetically belonged to 35 species in the Phyllobacterium, Ensifer, Rhizobium, Microvirga, Sphingomonas, Paracoccus, Mycobacterium, Paenibacillus, Cohnella, Sporosarcina, Bacillus, Staphylococcus, Brevibacterium, Xenophi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicted highly expressed (PHX) genes in five currently available high G+C complete alpha-proteobacterial genomes are analyzed. These include: the nitrogen-fixing plant symbionts Sinorhizobium meliloti (SINME) and Mesorhizobium loti (MESLO), the nonpathogenic aquatic bacterium Caulobacter crescentus (CAUCR), the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens (AGRTU), and the mammalian pathogen Brucella melitensis (BRUME). Three of these genomes, SINME, AGRTU, and BRUME, contain multiple chromosomes or megaplasmids (>1 Mb length). PHX genes in these genomes are concentrated mainly in the major (larg
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The use of microorganisms in remediating environmental contaminants such as crude oil sludge has become a promising technique owing to its economy and the fact it is environmentally friendly. Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), as the major components of oil sludge, are hydrophobic and recalcitrant. An important way of enhancing the rate of PAH desorption is to compost crude oil sludge by incorporating commercial surfactants, thereby making them available for microbial degradation. In this study, crude oil sludge was composted for 16 weeks during which surfactants were added i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A symbiotic microalgal-bacterial system may be an optional technology for wastewater treatment. It was composed of microalgae and activated sludge and established in the SBR to explore the effect of different dosing ratios of algae and sludge on the removal of nitrogen and phosphorus from simulated wastewater containing ammonium. It can be seen from the result that varied algae-sludge dosing ratios had a higher removal effect on COD removal, but the difference was not significant. The algal-bacterial symbiosis system had a 100% removal rate for ammonium removal on the 8th day. Relatively speak
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhizobial infection of legume root hairs requires a rearrangement of the actin cytoskeleton to enable the establishment of plant-made infection structures called infection threads. In the SCAR/WAVE (Suppressor of cAMP receptor defect/WASP family verpolin homologous protein) actin regulatory complex, the conserved N-terminal domains of SCAR proteins interact with other components of the SCAR/WAVE complex. The conserved C-terminal domains of SCAR proteins bind to and activate the actin-related protein 2/3 (ARP2/3) complex, which can bind to actin filaments catalyzing new actin filament formation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microbial community in sand filters (SFs) of drinking water treatment plants (DWTPs) likely contributes to SF functionalities, such as organic carbon removal through heterotrophic metabolism. However, the dynamics and functionality of the SF microbiome and microbial communities in oligotrophic freshwater environments in general, are poorly understood. Therefore, the availability of bacterial strains from these oligotrophic environments is of great interest, but such organisms are currently underrepresented in culture collections. Focusing on heterotrophic carbon metabolism, bacteria were i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed-linkage β-glucans (MLGs) are emerging as promising biopolymers with significant biotechnological potential due to their unique structural and rheological properties. In rhizobia, MLG biosynthesis is controlled by the second messenger cyclic di-GMP (c-di-GMP) and mediated by the bicistronic operon bgsBA. However, the full composition of the biosynthetic machinery and strategies for enhanced production remain incompletely understood. In this study, we demonstrate that the outer membrane protein TolC is essential for MLG production in Sinorhizobium meliloti. Genetic disruption of tolC aboli
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Uranium (U) pollution harms soil and plants. It is still unclear how microbes help plants survive uranium stress in different root and leaf environments.
OBJECTIVES: In this study, We examined how soil microbial reassembly affects rapeseed growth and the microbes living in soil, roots, and leaves under uranium stress, and explored the functional compensation mechanisms involved.
METHODS: A pot experiment was conducted with rapeseed grown in three soil backgrounds (original, sterilized, sterilized-inoculated) under control and 150 mg⋅kg-1 uranium stress. Plant growth, uranium cont
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enoyl-CoA carboxylases/reductases (ECRs) are enzymes with the fastest carbon dioxide (CO2) fixation capabilities, yet the precise mechanisms behind their assembly and catalytic activity are structurally not yet fully understood. Here, we employed cryo X-ray crystallography to reveal the dimeric structural organization of a novel ECR, isolated from mesophilic Mesorhizobium metallidurans (M. metallidurans). We examined the interactions in silico and compared oligomerization of our dimeric ECR from M. metallidurans (ECRMm_Dim) with tetrameric ECR from Burkholderia ambifaria (ECRBa_Tet)by using si
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhizobia-soybean symbiosis is essential for agriculture and ecosystems, yet it is vulnerable to disruption by cadmium (Cd) pollution. Here, we investigated the protective role of non-nitrogen-fixing bacteria on soybean (Glycine max) under Cd-induced stress. Three Cd-immobilizing bacteria were identified: Arthrobacter sp. CC3, Pseudarthrobacter sp. CC12, and Mesorhizobium sp. CC13. These bacteria reduced the bioavailable Cd content in the soil, decreased Cd accumulation in soybeans, and increased nodule nitrogenase activity. However, no nitrogenase genes were identified in the genomes of the th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An aerobic bacterium, strain BN12T, which degrades substituted naphthalenesulfonates and substituted salicylates was isolated from a 6-aminonaphthalene-2-sulfonate-degrading microbial consortium originating from the River Elbe, Germany. Chemotaxonomic investigations of quinones, polyamines and polar lipids allowed allocation of this strain to the alpha-subclass of the Proteobacteria and revealed similarity to species of the genera Aminobacter, Chelatobacter and Mesorhizobium. This was confirmed by typing with 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes and 16S rDNA sequencing and phylogenetic ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Restructuring tilth layers (RTL) is an innovative tillage practice that involves the vertical exchange of topsoil and subsoil while the deeper layer is loosened, and this practice has been verified to significantly reduce the incidence of cotton Verticillium wilt. However, the ecological mechanisms underlying disease suppression remain unclear. In this study, we integrated field experiments, metagenomic sequencing, untargeted metabolomics, and functional validation to elucidate the effects of RTL on the rhizosphere ecosystem from the perspectives of microbe and metabolite interactions. RTL sig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, ferrous ion (Fe(II)) had the potential to promote ecological functions in constructed wetlands (CWs) under perfluorooctanoic acid (PFOA) stress. Concretely, Fe(II) at 30 mg/L and 20-30 mg/L even led to 11.37% increase of urease and 93.15-243.61% increase of nitrite oxidoreductase respectively compared to the control. Fe(II) promotion was also observed on Nitrosomonas, Nitrospira, Azospira, and Zoogloea by 1.00-6.50 folds, which might result from higher expression of nitrogen fixation and nitrite redox genes. These findings could be explanation for increase of ammonium removal by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
VjbR is a LuxR-type quorum-sensing (QS) regulator that plays an essential role in the virulence of the intracellular facultative pathogen Brucella, the causative agent of brucellosis. It was previously described that VjbR regulates a diverse group of genes, including the virB operon. The latter codes for a type IV secretion system (T4SS) that is central for the pathogenesis of Brucella. Although the regulatory role of VjbR on the virB promoter (P(virB)) was extensively studied by different groups, the VjbR-binding site had not been identified so far. Here, we identified the target DNA sequence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphatidylcholine (PC) is the major membrane-forming phospholipid in eukaryotes with important structural and signalling functions. Although many prokaryotes lack PC, it can be found in significant amounts in membranes of rather diverse bacteria. Two pathways for PC biosynthesis are known in bacteria, the methylation pathway and the phosphatidylcholine synthase (PCS) pathway. In the methylation pathway, phosphatidylethanolamine is methylated three times to yield PC, in reactions catalysed by one or several phospholipid N-methyltransferases (PMTs). In the PCS pathway, choline is condensed dir
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic diversity of 44 rhizobial isolates from Astragalus, Oxytropis, and Onobrychis spp. originating from different geographic locations was evaluated by mapped restriction site polymorphism (MRSP) analysis of 16S rRNA genes and by PCR DNA fingerprinting with repetitive sequences (REP-PCR). A comparison of tree topologies of reference strains constructed with data obtained by MRSP and by 16S rRNA gene sequence analyses showed that the topologies were in good agreement, indicating that the MSRP approach results in reasonable estimates of rhizobial phylogeny. The isolates were distributed
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The remediation of volatile chlorinated hydrocarbons in the quasi-vadose zone has become a significant challenge. We applied an integrated approach to assess the biodegradability of trichloroethylene to identify the biotransformation mechanism. The formation of the functional zone biochemical layer was assessed by analyzing the distribution of landfill gas, physical and chemical properties of cover soil, spatial-temporal variations of micro-ecology, biodegradability of landfill cover soil and distributional difference metabolic pathway. Real-time online monitoring showed that trichloroethylene
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования