Rett syndrome, an X-linked neurodevelopmental disorder, is a major cause of mental retardation in females. Recent genetic analyses have revealed that mutations in the methyl-CpG-binding protein gene encoding MeCP2 are associated with Rett syndrome. In this study, we used transient expression systems to investigate the functional significance of mutations seen in patients with Rett syndrome. Missense mutations in the methyl-CpG-binding domain were analyzed by the transfection in mouse L929 cells and Drosophila SL2 cells. The L929 cells were utilized to investigate the effects of mutations on th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydroxymethylated cytosine (5hmC) is a stable DNA epigenetic mark recognized by methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2), which acts as a transcriptional regulator and a global chromatin-remodeling element. Because 5hmC triggers a gene regulation response markedly different from that produced by methylated cytosine (5mC), both modifications must affect DNA structure and/or DNA interaction with MeCP2 differently. MeCP2 is a six-domain intrinsically disordered protein (IDP) with two domains responsible for dsDNA binding: methyl-CpG binding domain (MBD) and intervening domain (ID). Here we report the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the human methyl-CpG-binding protein gene MECP2 cause the neurological disorder Rett syndrome and some cases of X-linked mental retardation (XLMR). We report that MeCP2 interacts with ATRX, a SWI2/SNF2 DNA helicase/ATPase that is mutated in ATRX syndrome (alpha-thalassemia/mental retardation, X-linked). MeCP2 can recruit the helicase domain of ATRX to heterochromatic foci in living mouse cells in a DNA methylation-dependent manner. Also, ATRX localization is disrupted in neurons of Mecp2-null mice. Point mutations within the methylated DNA-binding domain of MeCP2 that cause Rett s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) is a transcriptional regulator and a chromatin-associated structural protein. MeCP2 deregulation results in two neurodevelopmental disorders: MeCP2 dysfunction is associated with Rett syndrome, while excess of activity is associated with MeCP2 duplication syndrome. MeCP2 is an intrinsically disordered protein (IDP) constituted by six structural domains with variable, small percentage of well-defined secondary structure. Two domains, methyl-CpG binding domain (MBD) and transcription repressor domain (TRD), are the elements responsible for dsDNA binding abili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The methyl-CpG-binding protein 2 (MECP2) serves both organizational and transcriptional functions in the nucleus, with two well-characterized domains integrally related to these functions. The recognition of methylated CpG dinucleotides is accomplished by the methyl-binding domain (MBD), and the transcriptional repression domain (TRD) facilitates protein-protein interactions with chromatin remodeling proteins. For each known function of MECP2, chromatin binding is a crucial activity. Here, we apply photobleaching strategies within the nucleus using domain-deleted MECP2 proteins as well as natu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a stable epigenetic mark in plant and vertebrate genomes; it is implicated in regulation of higher order chromatin structure, maintenance of genome integrity, and stable patterns of gene expression. Biological effects of DNA methylation are, at least in part, mediated by proteins that preferentially bind to methylated DNA. It is now recognized that several structurally unrelated protein folds have the ability to recognize methylated CpGs in vitro and in vivo. In this chapter, we focus on the three major families of methyl-CpG-binding proteins: the MBD protein family, Kaiso a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterozygous mutations in the X-linked MECP2 gene cause the neurological disorder Rett syndrome. The methyl-CpG-binding protein 2 (MeCP2) protein is an epigenetic reader whose binding to chromatin primarily depends on 5-methylcytosine. Functionally, MeCP2 has been implicated in several cellular processes on the basis of its reported interaction with more than 40 binding partners, including transcriptional co-repressors (for example, the NCoR/SMRT complex), transcriptional activators, RNA, chromatin remodellers, microRNA-processing proteins and splicing factors. Accordingly, MeCP2 has been cast
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is an epigenetic modification that is implicated in transcriptional silencing. Recently, it has become increasingly clear that both correct levels and proper interpretation of methylation are important factors for normal development and function of the human organism. One example is the neurological disorder Rett syndrome (RTT), which affects approximately one in 10,000 girls. RTT is caused by mutations in MeCP2, a protein that was identified by its ability to bind specifically to CpG-methylated DNA. Furthermore, MeCP2 represses transcription in a methylation-dependent manner,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylation of DNA is essential for development in the mouse and plays an important role in inactivation of the X-chromosome, genomic imprinting and gene silencing. The properties of the methyl-CpG binding proteins (MeCPs) are being proved to be the key to interpreting the connection between DNA methylation and transcriptional repression. The founder member of the family, MeCP2, consists of a single polypeptide that contains both a methyl-CpG binding domain (MBD) and transcriptional repression domain (TRD). MBD binds to a single symmetrically methylated CpG site and is responsible for chromati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein MeCP2 mediates epigenetic regulation by binding methyl-CpG (mCpG) sites on chromatin. MeCP2 consists of six domains of which one, the methyl binding domain (MBD), binds mCpG sites in duplex DNA. We show that solution conditions with physiological or greater salt concentrations or the presence of nonspecific competitor DNA is necessary for the MBD to discriminate mCpG from CpG with high specificity. The specificity for mCpG over CpG is >100-fold under these solution conditions. In contrast, the MBD does not discriminate hydroxymethyl-CpG from CpG. The MBD is unusual among site-speci
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CXXC domains have traditionally been considered as CpG specific DNA binding domains that are repelled by cytosine modifications. This view has recently been challenged by the demonstration that CXXC domain of TET3 has relaxed sequence specificity and binds with the highest affinity to symmetric DNA duplex containing 5caCpG. Here, we present a comparative analysis of the MLL1-CXXC and TET3-CXXC sequence specificity and tolerance to cytosine modifications (5-methyl, 5-hydroxymethyl, 5-formyl, 5-carboxyl) in CpG and non-CpG context. For the first time, we take into consideration possible interfer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome neurodevelopmental disorder is caused by mutations in the epigenetic regulator MeCP2. While the MeCP2 methyl-CpG binding domain (MBD) is well-characterized, the function of the adjacent intervening domain (ID) remains largely understudied. The ID has been described as a distinct RNA-binding region, yet evidence also suggests RNA competitively displaces MeCP2 from DNA. Here, we address these conflicting findings by demonstrating the MBD and ID do not function in isolation but as a synergistic functional unit. The ID significantly enhances affinity of the MBD for methylated DNA by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) is a transcriptional regulator and a chromatin-binding protein involved in neuronal development and maturation. Loss-of-function mutations in MeCP2 result in Rett syndrome (RTT), a neurodevelopmental disorder that is the main cause of mental retardation in females. MeCP2 is an intrinsically disordered protein (IDP) constituted by six domains. Two domains are the main responsible elements for DNA binding (methyl-CpG binding domain, MBD) and recruitment of gene transcription/silencing machinery (transcription repressor domain, TRD). These two domains concentr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is an epigenetic modification that is implicated in transcriptional silencing. It is becoming increasingly clear that both correct levels and proper interpretation of DNA methylation are important for normal development and function of many organisms, including humans. In this review we focus on recent advances in understanding how proteins that bind to methylated DNA recognize their binding sites and translate the DNA methylation signal into functional states of chromatin. Although the function of methyl-CpG binding proteins in transcriptional repression has been attributed to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytosine residues at CpG dinucleotides can be methylated by endogenous methyltransferases in mammalian cells. The resulting 5-methylcytosine base may undergo spontaneous deamination to form thymine causing G/C to A/T transition mutations. Methylated CpGs also can form preferential targets for environmental mutagens and carcinogens. The Big Blue(R) transgenic mouse has been used to investigate tissue and organ specificity of mutations and to deduce mutational mechanisms in a mammal in vivo. The transgenic mouse contains approximately 40 concatenated lambda-like shuttle vectors, each of which co
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a major epigenetic modification in the genomes of higher eukaryotes. In vertebrates, DNA methylation occurs predominantly on the CpG dinucleotide, and approximately 60% to 90% of these dinucleotides are modified. Distinct DNA methylation patterns, which can vary between different tissues and developmental stages, exist on specific loci. Sites of DNA methylation are occupied by various proteins, including methyl-CpG binding domain (MBD) proteins which recruit the enzymatic machinery to establish silent chromatin. Mutations in the MBD family member MeCP2 are the cause of Rett
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of function of the X-linked gene encoding methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) causes the progressive neurological disorder Rett syndrome (RTT). Conversely, duplication or triplication of Xq28 causes an equally wide-ranging progressive neurological disorder, MECP2 duplication syndrome, whose features overlap somewhat with RTT. To understand which MeCP2 functions cause toxicity in the duplication syndrome, we generated mouse models expressing endogenous Mecp2 along with a RTT-causing mutation in either the methyl-CpG binding domain (MBD) or the transcriptional repression domain (TRD). We d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) is a chromatin-associated regulator essential for neuronal gene regulation, and pathogenic mutations in MeCP2 cause Rett syndrome (RTT). However, the mechanisms governing MeCP2 engagement on chromatin and the effects of RTT mutations on nucleosome interactions remain poorly understood. We determined cryo-EM structures of MeCP2 bound to mono-nucleosomes with or without linker DNA methylation. In the absence of linker DNA methylation, the methyl-CpG binding domain (MBD) engages nucleosomal DNA near superhelical location ±7, whereas a methylated linker CpG red
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-CpG-binding protein 2 (MeCP2) is a chromatin-associated factor whose dysfunction causes Rett syndrome. Although MeCP2 preferentially binds methylated DNA, its affinity for methylated substrates is only ∼ threefold higher than for unmethylated DNA, raising the question of how MeCP2 selectively recognizes its targets. Here, we quantify binding of full-length WT MeCP2 and Rett-associated variants (R106W, T158M, R270X, and R306C) to nucleic acid substrates that vary in length, secondary structure, methylation pattern, CpG symmetry, and strand composition. WT and mutant MeCP2 preferentially
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MeCP2 is an essential transcriptional repressor that mediates gene silencing through binding to methylated DNA. Binding specificity has been thought to depend on hydrophobic interactions between cytosine methyl groups and a hydrophobic patch within the methyl-CpG-binding domain (MBD). X-ray analysis of a methylated DNA-MBD cocrystal reveals, however, that the methyl groups make contact with a predominantly hydrophilic surface that includes tightly bound water molecules. This suggests that MeCP2 recognizes hydration of the major groove of methylated DNA rather than cytosine methylation per se.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.