HYPOTHESIS: Surface-driven flow, associated with solute concentration gradient in the presence of an interface, is ubiquitous in nature and occurs in various natural systems, including the human body, as well as in novel micro/nanofluidic systems. Despite its importance, the microscopic mechanism underlying diffusio-osmotic flow is not completely understood.
SIMULATIONS: We perform direct nonequilibrium molecular dynamics simulations of a binary fluid mixture confined in a nanopore, connecting two bulk reservoirs with an imposed solute concentration gradient. Unlike previous simulation studie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
β-barrel nanopores are involved in crucial biological processes, from ATP export in mitochondria to antibiotic resistance in Gram-negative bacteria, and represent a promising platform for emerging sequencing technologies. However, in contrast to ion channels, the understanding of the fundamental principles governing ion transport through these nanopores remains in its early stages. In this chapter, we describe the production and mutation of three major biological nanopores-aerolysin, MspA, and α-HL-as well as experimental approaches to elucidate ion transport mechanisms in these biological nan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Helical nanopores are attractive molecular sensors, yet their rational design and assembly remain challenging. Here we show that the single peptide pPorA, derived from porin PorACj, self-assembles into flexible α-helical nanopores, inserts in lipid membranes and exists in distinct small- and large-conductance states. By strategically incorporating unnatural amino acids, we engineered small- and large-diameter pores exhibiting single-channel conductances of 2.4 nS and 3.5 nS in 1 M KCl, respectively, while retaining a common octameric architecture. These nanopores enabled the detection of sug
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biogas is one of the most common sources of biomass energy. Due to the associated environmental pollution and costs, desulfurization, and purification are the most important challenges of biogas power generation. Using all-atom molecular dynamics (MD), we systematically simulated the isothermal adsorption behavior of biogas (comprising CH4, CO2, H2O, H2S, and H2) in graphite (Gr) slit nanopores. The impact of slit width, system temperature, and moisture content on the adsorption energy, adsorption ratio, and diffusion coefficient of biogas molecules was investigated. Simulation results reveale
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Supercapacitors are electrochemical energy-storage devices distinguished by rapid charge-discharge and high power density. The observation of anomalously enhanced capacitance in nanoporous carbons challenged classical descriptions of double-layer charging and stimulated extensive in situ characterization and molecular modeling efforts. Yet the microscopic origin of this enhancement remains debated, with recent work questioning whether nanoscale confinement is the dominant factor and instead emphasizing the role of carbon disorder. Here we introduce a computational soft-templating protocol, pow
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transport properties of guest molecules within the nanoconfinement of the host are important for the tuning of nanoporous materials to various technological applications. In particular, the presence of water as an impurity can cause serious performance degradation of these materials. Hence, understanding water transport in nanoconfined space is important. Although it is well documented that water displays fast diffusion in pristine carbon pores, various trends in diffusivity as a function of loadings have been observed for different types of activated carbons, whose pore surfaces contain vario
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digital immunoassays enable highly sensitive detection of biomolecules, offering absolute quantification rather than relying on bulk signal intensity. We adapt a digital immunoassay scheme for a nanopore sensor, a versatile platform for single-molecule counting. Current nanopore sensors have demonstrated great progress when counting nucleic acids but struggle with proteins due to variability in translocation behavior and limited recognition strategies. While recent advancements have highlighted the promise of nanopore platforms for protein studies, precise quantification remains a challenge. H
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Achieving dynamic control of the size of solid-state nanopores remains a significant challenge in single-molecule sensing. In this work, a flexible PDMS (polydimethylsiloxane) nanopore (3.9 μm thick) was fabricated by focused ion beam (FIB) milling and subjected to an applied transmembrane hydrostatic pressure in a KCl electrolyte, enabling real-time modulation of its aperture. The flexible PDMS nanopore exhibits nonmonotonic deformation in response to external pressure: initial constriction at low pressure, followed by re-expansion at higher pressure, with the smallest pore diameter achieved
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological ion channels and pores frequently exhibit dynamic, concentration-dependent adaptive assembly, yet synthetic systems that faithfully replicate this intriguing behavior remain rare. In this study, we present a novel class of tripeptide-appended macrocyclic ion channels that undergo aromatic interaction-driven adaptive transformation from unimolecular chloride channels into higher-order nanopores. At low concentrations, analogues with aromatic tripeptide-functionalized macrocycles (MC-F and MC-W) function as discrete and efficient chloride channels. Upon increasing the concentration, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A crucial aspect of the label-free sequencing of peptides and single proteins in solid-state nanopores via optical methods is the ability to control the translocation dynamics of the biomolecule, especially its speed. Very often, this dynamics is studied in terms of its effect on ionic currents through the nanopore. Herein, with attention to label-free optical sequencing methods, we directly study the translocation motion of (poly)peptides by molecular dynamics. By analysis of a vast set of simulations of polyglutamic acids, we show that the peptide elongation is determined by the electrostati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study the translocation behavior of molecules through nanopores, the gold plasmonic nanopores (GPNs) structures with high Raman activity are fabricated. The process of molecule translocation (via potential, concentration and pH) is studied by Surface Enhanced Raman Scattering (SERS). The electrostatic effect is found critical for the translocation direction and speed of model molecule. What's more, the characteristic blinking signal of rhodamine 6G (R6G) molecules translocating through the nanopores is observed with millisecond temporal resolution.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, a novel chitosan nanopores membrane was developed by selective dissolution of its composition. Polyethylene glycol (PEG) as the porogen was selected to generate the nanopores structure of chitosan membrane. As the observation with scanning electron microscopy (SEM), we could find that the PEG content was greatly influenced on the structure of chitosan membrane. As the PEG content was larger than 50%, the chitosan nanopores membrane could successfully developed. Differential scanning calorimeter (DSC) measurement revealed that the PEG component could not be completely dissolved f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymers with distinct topologies-such as linear, star-shaped, ring, and bottlebrush architectures-exhibit diverse translocation behaviors when driven through solid-state nanopores due to differences in flexibility, hydrodynamic size, and steric interactions. These properties enable topology-sensitive single-molecule analysis. In this protocol, we describe detailed procedures for the electrophoretic translocation of PEG-based linear and star polymers through individual nanopores. This method enables precise characterization of polymer conformation and transport kinetics, with differences in dw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rational design of nanopore-forming proteins and peptides is a promising approach for single-molecule analysis by using custom-designed nanopores tailored to specific target molecules. One challenge in this approach is the expression or synthesis of the designed nanopores, due to their high hydrophobicity. We sought to streamline the synthesis of an artificial and highly aggregative nanopore-forming peptide using liposome-supplemented cell-free protein synthesis. By optimizing the liposomal lipid composition, we recovered yields of the expressed aggregative peptide that were suitable for funct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanoconfinement reduces the favorable hydration free energies of single ions, and is correlated with ion rejection and modified chemical reactivity in water-filled nanopores. Many factors contribute to the magnitude of the observed confinement effect. Here we use simple classical force fields and nonpolarizable carbon nanotubes filled with water as minimal, hydrogen-atom-like models to evaluate the single-ion intrinsic confinement hydration free energy penalty (ΔΔGhyd). In tubes of radius R = 7.5 Å, we predict ΔΔGhyd values that are up to 7.8 kcal/mol, are much larger for Cl- than the smaller
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrogen sulfide (H2S) is the third gasotransmitter after nitrogen oxide and carbon monoxide, playing vital roles in physiological controls, such as angiogenesis, vascular homeostasis, thrombosis, inflammation, and remodeling. Monitoring the content level and dynamic variations of H2S within cells will help understand its involvement and relationship in cancer proliferation and may also lead to new cancer therapy options. Herein, we developed a simple and effective approach for ionic rectification sensing detection of H2S in single living cells using p-azidobenzoic acid (PA)-functionalized gla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detection and characterization of protein-protein interactions are essential for many cellular processes, such as cell growth, tissue repair, drug delivery, and other physiological functions. In our research, we have utilized emerging solid-state nanopore sensing technology, which is highly sensitive to better understand heparin and fibroblast growth factor 1 (FGF-1) protein interactions at a single-molecule level without any modifications. Understanding the structure and behavior of heparin-FGF-1 complexes at the single-molecule level is very important. An abnormality in their formation can l
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, using a silicon nitride nanopore based device, we measure the binding locations of RNA Polymerase (RNAP) on 48.5 kbp (16.5 μm) long λ DNA. To prevent the separation of bound RNAPs from a λ DNA molecule in the high electric field inside a nanopore, we cross-linked RNAP proteins to λ DNA by formaldehyde. We compare the current blockage event data measured with a mixture of λ DNA and RNAP under cross-link conditions with our control samples: RNAP, λ DNA, RNAP, and λ DNA incubated in formaldehyde separately and in a mixture. By analyzing the time durations and amplitudes of current b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Silica nanopores have electron channels and ion channels interpenetrating each other, which prompt the use of this structure for creating efficient electronic devices. In this study, silica nanopores membrane modified screen printed electrodes were applied in a smartphone-based electrochemiluminescence system for nitroaromatic explosives detection. Universal serial bus-on the go (USB-OTG) and camera on smartphone were used as the electrical stimulation and luminescence capture, respectively. ⎕Multimode methods including (red-green-blue) RGB, (hue-saturation-brightness) HSB, and Gray were propo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ion transport across angstrom-scale graphene nanopores is governed by hydration-shell dynamics, yet the kinetic origin of the associated translocation energy barrier remains unresolved. Here, we bridge hydration-shell exchange kinetics and ion translocation energy barriers by resolving water residence events during pore crossing. Ionic conductance measurements establish the angstrom-scale confinement regime of graphene nanopores, within which molecular dynamics simulations are employed to analyze hydration-shell dynamics. We implement a residence-time analysis that decomposes hydration-shell w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.