Phytochromes are dimeric photoreceptors found in bacteria, fungi, and plants that reversibly interconvert between a red-absorbing Pr state and a far-red-absorbing Pfr state. In bacteria, phytochromes (BphPs) regulate diverse responses through a two-component signaling pathway comprising a C-terminal histidine kinase (HK) and a response regulator. A previous cryo-EM study of the wild-type BphP from Stigmatella aurantiaca (SaBphP2) revealed a stable Pr/Pfr heterodimer in which the two protomers adopt distinct Pr and Pfr conformations. Here, using the Spotiton technique, we captured the same hete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After the perception of vegetation proximity by phytochrome photoreceptors, shade-avoider plants initiate a set of responses known as the shade avoidance syndrome (SAS). Shade perception by the phytochrome B (phyB) photoreceptor unleashes the PHYTOCHROME INTERACTING FACTORs and initiates SAS responses. In Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) seedlings, shade perception involves rapid and massive changes in gene expression, increases auxin production, and promotes hypocotyl elongation. Other components, such as phyA and ELONGATED HYPOCOTYL 5, also participate in the shade regulation of the hypoco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Etiolated seedlings initiate grana stacking and chlorophyll biosynthesis in parallel with the first exposure to light, during which phytochromes play an important role. Functional phytochromes are biosynthesized separately for two components. One phytochrome is biosynthesized for apoprotein and the other is biosynthesized for the chromophore that includes heme oxygenase (HO).
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDING: We isolated a ho1 homolog by map-based cloning of a maize elongated mesocotyl2 (elm2) mutant. cDNA sequencing of the ho1 homolog in elm2 revealed a 31 bp deletion. De-etiolation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The integration of light and cold signaling is critical for cold acclimation in plants, but the regulatory complexity of the underlying transcriptional network remains poorly understood. To systematically dissect this interplay in tomato (Solanum lycopersicum), we constructed a computational model that merges the core cold-responsive inducer of CBF expression 1 (ICE1)-C-repeat binding factor (CBF)-cold regulated factors (COR) pathway with light-sensitive modules, including the constitutive photomorphogenic 1 (COP1)-elongated hypocotyl 5 (HY5)-MYB domain protein 15 (MYB15) cascade and the phyto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detection of the genomic basis of local adaptation to environmental conditions is challenging in forest trees. Phytochromes (PHY) and cryptochromes (CRY) perceive the red (R)/far-red (FR) and blue light respectively, thus playing a fundamental role in regulating plant growth and development. PHYO and PHYP from conifers are the equivalents of PHYA/PHYC and PHYB in angiosperms, respectively. Norway spruce shows an adaptive latitudinal cline for shade (low R:FR or FR-enriched light) tolerance and requirement of FR light for its growth. We analyzed the exome capture data that included a uniquely l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: N6-methyladenosine (m6A) mRNA modification is essential for mammalian and plant viability. The U6 m6A methyltransferases in other species regulate S-adenosylmethionine (SAM) homeostasis through installing m6A in pre-mRNAs of SAM synthetases. However, U6 m6A methyltransferase has not been characterized in Arabidopsis and little is known about its role in regulating photomorphogenesis and flowering.
RESULTS: Here we characterize that FIONA1 is an Arabidopsis U6 m6A methyltransferase that installs m6A in U6 snRNA and a small subset of poly(A)+ RNA. Disruption of FIONA1 leads to phyto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of a blue-light photoreceptor in the hy4 mutants of Arabidopsis thaliana (L.) Heynh substantially delayed flowering (> 100 d to flower vs. 40-50 d), especially with blue light exposure from lamps lacking much red (R) and/or far-red (FR) light. Red night breaks were promotory but flowering was still later for the hy4-101 mutant. However, with exposure to light from FR-rich lamps, flowering of all mutants was early and no different from the wild type. Thus, flowering of Arabidopsis involves a blue-light photoreceptor and other, often more effective photoreceptors. The latter may involve phy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungi see light of different colors by using photoreceptors such as the White Collar proteins and cryptochromes for blue light, opsins for green light, and phytochromes for red light. Light regulates fungal development, promotes the accumulation of protective pigments and proteins, and regulates tropic growth. The White Collar complex (WCC) is a photoreceptor and a transcription factor that is responsible for regulating transcription after exposure to blue light. In Neurospora crassa, light promotes the interaction of WCCs and their binding to the promoters to activate transcription. In Asperg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The negatively photoregulated PHYA gene has a complex promoter structure in Arabidopsis, with three active transcription start sites. To identify the photoreceptors responsible for regulation of this gene, and to assess the relative roles of the three transcription start sites, we analyzed the changes in PHYA transcript levels in wild-type and photoreceptor mutant seedlings under various irradiation conditions. Continuous far-red or red light exposures each induced a significant decline in transcript levels in wild-type etiolated seedlings. Analysis of mutants specifically lacking either phyA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The near-infrared (NIR) spectral region is attractive for live-cell imaging, due to low autofluorescence and reduced phototoxicity. Some phytochrome-derived fluorescent proteins absorb and emit fluorescence in the NIR, but have short fluorescence lifetimes and relatively low quantum yields, requiring higher laser powers thus limiting their usefulness for live-cell superresolution microscopy. Using the bacterial phytochrome miRFP703 as a template, we screened for variants with longer fluorescence lifetimes, because the quantum yield and fluorescence lifetime are linked. We identified the bright
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
General methods to engineer genetically encoded, reversible, light-mediated control over protein function would be useful in many areas of biomedical research and technology. We describe a system that yields such photo-control over actin assembly. We fused the Rho family GTPase Cdc42 in its GDP-bound form to the photosensory domain of phytochrome B (PhyB) and fused the Cdc42 effector, the Wiskott-Aldrich Syndrome Protein (WASP), to the light-dependent PhyB-binding domain of phytochrome interacting factor 3 (Pif3). Upon red light illumination, the fusion proteins bind each other, activating WAS
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new study characterizes an E3 ubiquitin ligase, LONG PETIOLE 1 (LOP1), as a missing piece in the phytochrome B (phyB)-PIF4 signaling cascade. LOP1 and phyB mutually stabilize each other and restrict PIF4 through proteasomal degradation, resulting in optimized plant growth and development.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dark-grown plants of Sphaerocarpos, incubated in a liquid medium containing sucrose and mineral salts, have a much lower chlorophyll and nitrogen content than do light-grown plants. Two minutes of red light per 12 hours is about two-thirds as effective in increasing chlorophyll and nitrogen content as is continuous white light. These red light-induced increases are mediated by phytochrome, as they are reversible by alternating exposures to red and far-red light. They appear to be related to differences in the ultrastructure of the chloroplasts. Plastids from dark-grown plants are full of starc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The developmental decision for sporulation of Physarum polycephalum plasmodia is under sensory control by environmental factors like visible light or heat shock and endogenous signals like glucose starvation. Several hours after perceiving an inductive stimulus, plasmodia become committed to sporulation; thereby, they lose their unlimited replicative potential and execute a developmental program that involves differentiation into various cell types required to form a mature fruiting body. Plasmodia are multinuclear single cells which spontaneously fuse upon physical contact. Fusion of mutant p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Arabidopsis COP1/SPA E3 ubiquitin ligase is a key negative regulator that represses light signaling in darkness by targeting transcription factors involved in the light response for degradation. The COP1/SPA complex consists of COP1 and members of the four-member SPA protein family (SPA1-SPA4). Genetic analysis indicated that COP1/SPA2 function is particularly strongly repressed by light when compared to complexes carrying the other three SPAs, thereby promoting a light response after exposure of plants to extremely low light. Here, we show that the SPA2 protein is degraded within 5-15 min
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Light is one of the most important environmental factors for orientation of almost all organisms on Earth. Whereas light sensing is of crucial importance in plants to optimize light-dependent energy conservation, in nonphotosynthetic organisms, the synchronization of biological clocks to the length of a day is an important function. Filamentous fungi may use the light signal as an indicator for the exposure of hyphae to air and adapt their physiology to this situation or induce morphogenetic pathways. Although a yes/no decision appears to be sufficient for the light-sensing function in fungi,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most optogenetic tools are controlled by blue light. Red-light-responsive tools enable multiwavelength applications and allow greater biological tissue penetration with reduced toxicity. Current red-light tools are primarily based on phytochromes, large dimeric proteins with a structurally complex mode of interaction with their binding partners. Here we introduce a small red-light-only responsive system composed of a BNp-Red-1.2 (6 kDa) that binds to a cyanobacteriochrome (CBCR) GAF domain NpF2164g6 (17 kDa) with a Kd ≈ 1-5 μM to form a 1:1 complex in the dark. Red light causes dissociation of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is well known that light is a crucial environmental factor that has a fundamental role in plant growth and development from seed germination to fruiting. For this process, plants contain versatile and multifaceted photoreceptor systems to sense variations in the light spectrum and to acclimate to a range of ambient conditions. Five main groups of photoreceptors have been found in higher plants, cryptochromes, phototropins, UVR8, zeitlupes, and phytochromes, but the last one red/far red wavelengths photoreceptor is the most characterized. Among the many responses modulated by phytochromes, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several cell-wall-modifying enzymes have been implicated in hypocotyl elongation; however, whether cell wall biosynthesis enzymes contribute to this process, particularly under warm temperature, remains largely unknown. In Arabidopsis, xyloglucan is a major component of the primary cell wall. Xyloglucan xylosyltransferase 1 (XXT1) and XXT2 are the major enzymes required for xyloglucan biosynthesis. Here, we investigated the roles of XXT1/2 in hypocotyl elongation with a focus under warm temperature using genetic, molecular, and transcriptomic approaches. We show that XXT1/2 are required for wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragments of thalli of the liverwort, Sphaerocarpos donnellii Aust., inoculated into liquid medium containing sucrose and mineral salts, attain a much greater dry weight after 9 days growth in continuous white light than in darkness. Light causes this difference by increasing the rate of growth of the plants. This growth response is mediated by the pigment systems of photosynthesis and phytochrome. An inhibitor of photosynthesis, DCMU, at concentrations which inhibit light-mediated CO(2) fixation, decreases the growth rate of light-grown but not dark-grown plants. Light still slightly increase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования