Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
16235 публикаций
Поиск: 186 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 1689 с найденным полным текстом
Identifying recurrent changes in biological sequences is important to multiple aspects of biological research-from understanding the molecular basis of convergent phenotypes, to pinpointing the causative sequence changes that give rise to antibiotic resistance and disease. Here, we present RECUR, a method for identifying recurrent amino acid substitutions from multiple sequence alignments that is fast, easy to use, and scalable to thousands of sequences. We demonstrate that RECUR's recurrence detection achieves 100% accuracy on simulated data with known evolutionary histories. We further show
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To construct a finite element model of the mandibular molars distalization with clear aligner, and to explore the characteristics of dentition movement and aligner deformation.
METHODS: The models of mandible, teeth, periodontal membrane and clear aligne were constructed using CBCT and oral scan data, and were divided into 8 groups according to the starting position of the second and first molar teeth. Working condition 1-4: the distance between the second molar and the first molar was 0, 1, 2, 3 mm, respectively. Working condition 5-8: the second molar had moved far to the target po
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myocardial pathology segmentation (MyoPS) is critical for the risk stratification and treatment planning of myocardial infarction (MI). Multi-sequence cardiac magnetic resonance (MS-CMR) images can provide valuable information. For instance, balanced steady-state free precession cine sequences present clear anatomical boundaries, while late gadolinium enhancement and T2-weighted CMR sequences visualize myocardial scar and edema of MI, respectively. Existing methods usually fuse anatomical and pathological information from different CMR sequences for MyoPS, but assume that these images have bee
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To present a computer method that can be used to combine the images from a sequence of fluorescein angiograms of the retinal microcirculation so that a composite image can be generated and a color image illustrating circulation at all points in the vascular network can be computed. This should enable more accurate comparison of retinal vascular occlusions that occur during cardiopulmonary bypass surgery.
METHODS: Photographic negatives of the macular region from two angiographic sequences, one taken before surgery and the other taken just before the end of bypass, were digitized, bac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical studies on atherosclerosis regression/progression performed by intravascular ultrasound analysis would benefit from accurate alignment of sequences of the same patient before and after clinical interventions and at follow-up. In this article, a methodology for automatic alignment of intravascular ultrasound sequences based on the dynamic time warping technique is proposed. The non-rigid alignment is adapted to the specific task by applying it to multidimensional signals describing the morphologic content of the vessel. Moreover, dynamic time warping is embedded into a framework compri
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple sequence alignment (MSA) is a foundational task in computational biology, underpinning protein structure prediction, evolutionary analysis, and domain annotation. Traditional MSA algorithms rely on pairwise amino acid substitution matrices derived from conserved protein families. While effective for aligning closely related sequences, these scoring schemes struggle in the low-identity "twilight zone". Here, we present a new approach for constructing MSAs leveraging amino acid embeddings generated by protein language models (PLMs), which capture rich evolutionary and contextual informa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extent to which an RNA folds into structure ensembles and how different structures in the ensemble regulate eukaryotic gene expression is not fully understood. Here, we coupled chemical probing with direct RNA sequencing to identify structure modifications along a single RNA molecule (sm-PORE-cupine). We used direct signal alignment in addition to base mapping to increase the percentage of mappable sequences and showed that Bernoulli mixture model clustering can separate structure ensembles accurately. We applied sm-PORE-cupine to identify isoform-specific structure ensembles along the SAR
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological sex inference from genomic data is important in population genomics, conservation biology, and forensic science, yet many existing approaches depend on sequence alignment or species-specific markers and may therefore be limited in their transferability across sex chromosome systems. ONYX is an alignment-free framework for biological sex inference based on sex chromosome-derived k-mer collections. It constructs homogametic- and heterogametic-specific k-mer collections from reference genomes and infers chromosomal sex configuration directly from sequencing reads using a unified hetero
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The high variability in envelope regions of some viruses such as HIV allow the virus to establish infection and to escape subsequent immune surveillance. This variability, as well as increasing incorporation of N-linked glycosylation sites, is fundamental to this evasion. It also creates difficulties for multiple sequence alignment methods (MSA) that provide the first step in their analysis. Existing MSA tools often fail to properly align highly variable HIV envelope sequences requiring extensive manual editing that is impractical with even a moderate number of these variable seque
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metal-binding sites (MBSs) are critical determinants of protein stability and biological function, yet methods for comparing their local binding environments lag behind those for whole-structure alignment. Here, we represent MBSs as atomic point clouds surrounding bound metal ligands and align them with a fine-tuned iterative closest point algorithm. Applying this framework to a redundancy-reduced collection of MBSs derived from all metalloproteins in the Protein Data Bank (PDB), we perform pairwise alignments across 23,342 sites to construct a similarity network of metal-binding environments.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genes corresponding to the L10 and L12 equivalent ribosomal proteins (L10e and L12e) of Escherichia coli have been cloned and sequenced from two widely divergent species of archaebacteria, Halobacterium cutirubrum and Sulfolobus solfataricus. The deduced amino acid sequences of the L10e and L12e proteins have been compared to each other and to available eubacterial and eucaryotic sequences. We have identified the human P0 protein as the eucaryotic L10e. The L10e proteins from the three kingdoms were found to be colinear. The eubacterial L10e protein is much shorter than the archaebacterial
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: White spot lesions (WSLs) may develop in adolescents undergoing clear aligner (CA) therapy with poor oral hygiene. The specific effects of CAs on the microbial composition and functional characteristics of supragingival plaques remain unclear. The present study investigated the shift in the supragingival microbial community induced by CAs in adolescents through metagenomic technology.
METHODS: Fifteen adolescents (12-15 years old) with Invisalign appliances were recruited. Supragingival plaque specimens were obtained twice, before treatment (T1) and three months after treatment (T
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Stable isotope analysis of sequential dentine samples is a potentially powerful method to reveal insights into early life-histories of individuals in the past. Dentine incremental growth structures are complex, however, and current approaches that apply horizontal sectioning of demineralized tooth halves or quarters risk combining multiple growth layers and may include unwanted cementum or secondary dentine. They also require destruction of large parts of a tooth. Here, we present a less destructive and relatively straightforward protocol that reduces damage, increases temporal res
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pairwise sequence alignment (PSA) serves as the cornerstone in computational bioinformatics, facilitating multiple sequence alignment and phylogenetic analysis. This paper introduces the FORAlign algorithm, leveraging the Four Russians algorithm with identical upper-bound time and space complexity as the Hirschberg divide-and-conquer PSA algorithm, aimed at accelerating Hirschberg PSA algorithm in parallel. Particularly notable is its capability to achieve up to 16.79 times speedup when aligning sequences with low sequence similarity, compared to the conventional Needleman-Wunsch PSA method us
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioinformatic methods for detecting short tandem repeat expansions in short-read sequencing have identified new repeat expansions in humans, but require alignment information to identify repetitive motif enrichment at genomic locations. We present superSTR, an ultrafast method that does not require alignment. superSTR is used to process whole-genome and whole-exome sequencing data, and perform the first STR analysis of the UK Biobank, efficiently screening and identifying known and potential disease-associated STRs in the exomes of 49,953 biobank participants. We demonstrate the first bioinfor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phylogenetic analyses of non-protein-coding nucleotide sequences such as ribosomal RNA genes, internal transcribed spacers, and introns are often impeded by regions of the alignments that are ambiguously aligned. These regions are characterized by the presence of gaps and their uncertain positions, no matter which optimization criteria are used. This problem is particularly acute in large-scale phylogenetic studies and when aligning highly diverged sequences. Accommodating these regions, where positional homology is likely to be violated, in phylogenetic analyses has been dealt with very diffe
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most viruses are known to spontaneously generate defective viral genomes (DVG) due to errors during replication. These DVGs are subgenomic and contain deletions that render them unable to complete a full replication cycle in the absence of a co-infecting, non-defective helper virus. DVGs, especially of the copyback type, frequently observed with paramyxoviruses, have been recognized to be important triggers of the antiviral innate immune response. DVGs have therefore gained interest for their potential to alter the attenuation and immunogenicity of vaccines. To investigate this potential, accu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scientists working with single-nucleotide variants (SNVs), inferred by next-generation sequencing software, often need further information regarding true variants, artifacts and sequence coverage gaps. In clinical diagnostics, e.g. SNVs must usually be validated by visual inspection or several independent SNV-callers. We here demonstrate that 0.5-60% of relevant SNVs might not be detected due to coverage gaps, or might be misidentified. Even low error rates can overwhelm the true biological signal, especially in clinical diagnostics, in research comparing healthy with affected cells, in archae
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Creating multi-tooth sequences of micro-sampled stable isotope (SI) analytical data can help track 20+ years of individual dietary history. Inferences about individual and population level behavioral patterns require cross-calibration of the timing of dietary changes recorded by each tooth. Dentin sections from contemporaneous tissues (eg, in M1 and M2) reflect dietary signature for the time of growth. Contemporary sections should produce similar values, allowing alignment of temporally overlapping portions of teeth into multi-tooth sequences. Published methods for determining the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating tumor DNA (ctDNA) is emerging as a promising biomarker for postoperative monitoring of cancer patients. Precise estimation of circulating tumor fraction is crucial for evaluating treatment effects and timely detection of disease recurrence. All current ctDNA detection methods that utilize whole-genome sequencing (WGS) data rely on the reference genome alignment of sequencing reads and often apply separate tools for detecting different variant types. However, various bioinformatic analysis confounders and the application of external variant calling tools could be avoided by analyzin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.